<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1496 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC098784.2	1	CGACCCAATGGTATGCTAATTCTGAAAAAGACATTTTTTGAAATGCTATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45589	CGACCCAATGGTATGCTAATTCTGAAAAAGACATTTTTTGAAATGCTATG	45638

AC098784.2	51	ATTAGTGGCATTTACCAATTTCCTTGACGTAAATTCTTTTTTCATGGCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45639	ATTAGTGGCATTTACCAATTTCCTTGACGTAAATTCTTTTTTCATGGCCA	45688

AC098784.2	101	TAATCAAGATGCCAACGAGACATCCCTGAATGCAGGGTTGGGAAGCGTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45689	TAATCAAGATGCCAACGAGACATCCCTGAATGCAGGGTTGGGAAGCGTTG	45738

AC098784.2	151	GACAGACTTGTCTTCACTCATAAGCACCAGGCATCTGATAGCTCACGTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45739	GACAGACTTGTCTTCACTCATAAGCACCAGGCATCTGATAGCTCACGTAT	45788

AC098784.2	201	ACATCTTATTACCTTCCATTTTAGAGTGAATAATCATTTCTACTTCAGTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45789	ACATCTTATTACCTTCCATTTTAGAGTGAATAATCATTTCTACTTCAGTA	45838

AC098784.2	251	TTTTGGCACAGGTAAAAGCAGTCCCATTACTGCGCGTATACCCAAAGGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45839	TTTTGGCACAGGTAAAAGCAGTCCCATTACTGCGCGTATACCCAAAGGAA	45888

AC098784.2	301	TATAAATCATTCTATTGCAAAGATACATGCACACATGTGTTCATCGCAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45889	TATAAATCATTCTATTGCAAAGATACATGCACACATGTGTTCATCGCAGC	45938

AC098784.2	351	ACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCCAAATGCCCATCAATGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45939	ACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCCAAATGCCCATCAATGA	45988

AC098784.2	401	TAGACTGGATAAAGAAAATGTGAGACATATACACCACGGAATACTATGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	45989	TAGACTGGATAAAGAAAATGTGAGACATATACACCACGGAATACTATGAA	46038

AC098784.2	451	GCCATAAAAAGAAACAAGATCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGGAGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46039	GCCATAAAAAGAAACAAGATCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGGAGCT	46088

AC098784.2	501	GGAAACCATTATCCTCAGGAAACTAACACAGGAACAGGAAATCAAACGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46089	GGAAACCATTATCCTCAGGAAACTAACACAGGAACAGGAAATCAAACGCT	46138

AC098784.2	551	GCATGTTCTCACTTACAAGTGGGTGCTGAACAATGAGAATGCGTGAACAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46139	GCATGTTCTCACTTACAAGTGGGTGCTGAACAATGAGAATGCGTGAACAC	46188

AC098784.2	601	AGGGAGGGGAACAACACACACTGGGGCCTGTCGGGGGGGGGTGGGGTAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46189	AGGGAGGGGAACAACACACACTGGGGCCTGTCGGGGGGGGGTGGGGTAGG	46238

AC098784.2	651	GGTAGGGAGAGCATTAGGAAAAATAGCTAATGTATGCTGGGCTTAATACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46239	GGTAGGGAGAGCATTAGGAAAAATAGCTAATGTATGCTGGGCTTAATACC	46288

AC098784.2	701	TAGGTGATGGGTTGACAGGTGCAGGAAACCACCATGGCGCACATTGACCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46289	TAGGTGATGGGTTGACAGGTGCAGGAAACCACCATGGCGCACATTGACCT	46338

AC098784.2	751	ATGCAATAAGCCCACACATTCTGCACATGTACCCCGGAACTTAAAATAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46339	ATGCAATAAGCCCACACATTCTGCACATGTACCCCGGAACTTAAAATAAA	46388

AC098784.2	801	AATAAAAATTAAAATTAAATTATGACACCATGATCCTAGCATATCCAAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46389	AATAAAAATTAAAATTAAATTATGACACCATGATCCTAGCATATCCAAAA	46438

AC098784.2	851	AAGACAAAAATGCCAATATCAAATGTCGGAGAAAATAGGGCTGAATTAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46439	AAGACAAAAATGCCAATATCAAATGTCGGAGAAAATAGGGCTGAATTAAA	46488

AC098784.2	901	AATCCAATACAATGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46489	AATCCAATACAATGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACT	46538

AC098784.2	951	TTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46539	TTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAG	46588

AC098784.2	1001	CCTGGCCAAACGTGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46589	CCTGGCCAAACGTGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG	46638

AC098784.2	1051	CCGGGTGTGGTGGCACTCGCCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46639	CCGGGTGTGGTGGCACTCGCCTGTAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGG	46688

AC098784.2	1101	CAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46689	CAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAATGAGCTGAGATC	46738

AC098784.2	1151	ATGCCACTGAACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46739	ATGCCACTGAACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAA	46788

AC098784.2	1201	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTCAAAAGCTCAGGCAGCAAAAGCAAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46789	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTCAAAAGCTCAGGCAGCAAAAGCAAAA	46838

AC098784.2	1251	ATAGGCAAATGAGATCATAGCAAACTGCAAACCTTCTGCACAATCAAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46839	ATAGGCAAATGAGATCATAGCAAACTGCAAACCTTCTGCACAATCAAGGA	46888

AC098784.2	1301	AACAAACAGCAGAGTGAAGAGACCACCTACAGAATGGGAAAGAATATTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46889	AACAAACAGCAGAGTGAAGAGACCACCTACAGAATGGGAAAGAATATTTG	46938

AC098784.2	1351	CAAGCAAGAGATTAATCTCCAGAAAATACAAGGAGCTCAAACAATGCAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46939	CAAGCAAGAGATTAATCTCCAGAAAATACAAGGAGCTCAAACAATGCAGA	46988

AC098784.2	1401	GGTTTTGAAGGATGGTGATGAGAAGGTTCTGCTACTTACAGAAAGGAAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	46989	GGTTTTGAAGGATGGTGATGAGAAGGTTCTGCTACTTACAGAAAGGAAGT	47038

AC098784.2	1451	TTAGGAGAAACAAAACCACAAACCTAGGTGGTGGGATGGCTTGATC	1496
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC011515.4	47039	TTAGGAGAAACAAAACCACAAACCTAGGTGGTGGGATGGCTTGATC	47084

Overview

Query
AC098784.2 - 5878 bps
Hit
AC011515.4 - 47084 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1496 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link