High Throughput Gene Targeting: Create Design

This custom vector design tool is provided by the EUCOMM consortium as a service to the research community. When using this tool, the user agrees not to submit more than five designs per day for creation without prior discussion with the High Throughput Gene Targeting Group at the Sanger Institute.

Design Type Oligo Select Method Artificial Intron Design
5' retrieval block size U block size Min 5' spacer Critical Exon Min 3' spacer D block size 3' retrieval block size
 
       
Subtype Domain Disrupted
Gene Build Gene
Start Exon End Exon
Target Start Target End
Primer Length Design Comment
Created by dk3
Valid After Annotation
not done
oligos on fwd strand oligos as ordered View gene and design in Ensembl UCSC BLAT recombineering primers
Design ID: 175932
Chr: 11
Strand: 1
Status: Ordered
BACs: RP24-502G9 : RP24-395I22 : RP24-75E14 : RP24-75I12 : RP24-75A10 : RP24-503K4 : RP24-233O7 : RP24-240G17 : RP24-327L12 : RP24-189P4 :
Instance: Plate 155: Well F03: BACs RP24-75E14 RP24-75I12 RP24-502G9 RP24-395I22
Oligos on GRCm38:
Type Start End Length Seq
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Oligos:
Type Start End Length Seq
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done inserting candidate regions
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DESIGN COMPLETE
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Created display features
Inserted short and long range genomic sequence arms

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