<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482111.2	1	TTTTGTGAAAACCTTATATACCTTAAGTGTTCTTGCTCAAACACACCTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	142830	TTTTGTGAAAACCTTATATACCTTAAGTGTTCTTGCTCAAACACACCTCC	142879

FQ482111.2	51	CCAAATTCCTTGAAACTAGTCTGGACAAGGTGAAACAGAGATACGATCAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	142880	CCAAATTCCTTGAAACTAGTCTGGACAAGGTGAAACAGAGATACGATCAA	142929

FQ482111.2	101	AGTTAGCCCATGATTCATGTGTCACAAAACTAGATAAACAGTGGACATTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	142930	AGTTAGCCCATGATTCATGTGTCACAAAACTAGATAAACAGTGGACATTT	142979

FQ482111.2	151	ATCAACAGGACTGTGGTCATATCCCGACAAACTTAATGGAATTTACGACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	142980	ATCAACAGGACTGTGGTCATATCCCGACAAACTTAATGGAATTTACGACT	143029

FQ482111.2	201	TTGTTCTGTTATAGAGATAATTAGCATATTCTTTTAGGCAACGGCGAGTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143030	TTGTTCTGTTATAGAGATAATTAGCATATTCTTTTAGGCAACGGCGAGTC	143079

FQ482111.2	251	CAAGTACAAGTCCTGAGGCTCTTTTATCCGGGGGTCTGGTTTTCCATTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143080	CAAGTACAAGTCCTGAGGCTCTTTTATCCGGGGGTCTGGTTTTCCATTGG	143129

FQ482111.2	301	TATGCCATTTCTATAGACGCCCGGCACAAAGTTCAGAGTCCATTGGGAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143130	TATGCCATTTCTATAGACGCCCGGCACAAAGTTCAGAGTCCATTGGGAGG	143179

FQ482111.2	351	CTGACCATGCGTGTAGCCTAATGTTCGCAGCCTGGCCTAAGACGGAGTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143180	CTGACCATGCGTGTAGCCTAATGTTCGCAGCCTGGCCTAAGACGGAGTCC	143229

FQ482111.2	401	AGCTCTGTCTGTTTCCTCCTTCAATATTTTCCACGTTTGCACAAAATATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143230	AGCTCTGTCTGTTTCCTCCTTCAATATTTTCCACGTTTGCACAAAATATT	143279

FQ482111.2	451	TAAAAGTGTGGAACTAAATTACAAGAGATAGAGAATTACTCCCTTCCTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143280	TAAAAGTGTGGAACTAAATTACAAGAGATAGAGAATTACTCCCTTCCTTT	143329

FQ482111.2	501	TCATATATTCTCCCAAGGTTTGGGCTCTGCATGAAAGAGATGCTCAAATC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143330	TCATATATTCTCCCAAGGTTTGGGCTCTGCATGAAAGAGATGCTCAAATC	143379

FQ482111.2	551	ATTACTGGTGAACTGGCTGTGACCTTTTGGGAAGCGTTTTCCAGTCCATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143380	ATTACTGGTGAACTGGCTGTGACCTTTTGGGAAGCGTTTTCCAGTCCATC	143429

FQ482111.2	601	CACTCCTTCCCTGAACCTCCGAGAAAGGACTTTGGTGCCCTGGTCCTTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143430	CACTCCTTCCCTGAACCTCCGAGAAAGGACTTTGGTGCCCTGGTCCTTCT	143479

FQ482111.2	651	AATCTCAGTTAACTGCCTCATAAACACCGTTAAGTAGTCCAAGGTTCAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143480	AATCTCAGTTAACTGCCTCATAAACACCGTTAAGTAGTCCAAGGTTCAGG	143529

FQ482111.2	701	AATACTTACCTCATTTTATAAGCAGTGTATATTCATTTACTACATCTATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143530	AATACTTACCTCATTTTATAAGCAGTGTATATTCATTTACTACATCTATT	143579

FQ482111.2	751	CATTCTTAAGAGGCAGTGAAGTAGCATTGCCCATCTGTTTCCCTCTTTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143580	CATTCTTAAGAGGCAGTGAAGTAGCATTGCCCATCTGTTTCCCTCTTTAT	143629

FQ482111.2	801	AATATTTCCTACCTTCTAATTTTGACTCTTTTCTACTATTGTTTTTTTCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143630	AATATTTCCTACCTTCTAATTTTGACTCTTTTCTACTATTGTTTTTTTCC	143679

FQ482111.2	851	TCTCTCTCTGATTCTCTAATTAATAGACTCTGACCTCCATTGCCTCTGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143680	TCTCTCTCTGATTCTCTAATTAATAGACTCTGACCTCCATTGCCTCTGTT	143729

FQ482111.2	901	ATCTTCTCTTTTCTTAGAATCAGTGCCCACAGCTGATTTCTCGACTTCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143730	ATCTTCTCTTTTCTTAGAATCAGTGCCCACAGCTGATTTCTCGACTTCCT	143779

FQ482111.2	951	ACAGACTTGAAGAAGCCTTTGGCCCCATCATGGCCCATCAACAGTTTACC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143780	ACAGACTTGAAGAAGCCTTTGGCCCCATCATGGCCCATCAACAGTTTACC	143829

FQ482111.2	1001	GGTAAGCTTCAAGAAGAAATGATTTGCCCCATATGCTTGGATATTCTGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143830	GGTAAGCTTCAAGAAGAAATGATTTGCCCCATATGCTTGGATATTCTGCA	143879

FQ482111.2	1051	GGACCCTGCTACCATTGACTGCGGGCACAACTTCTGCCTCAGTTGCATCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143880	GGACCCTGCTACCATTGACTGCGGGCACAACTTCTGCCTCAGTTGCATCA	143929

FQ482111.2	1101	CTCAGAGCGGGGAAGCAGCAGACAGCGTTCTTAAATGTCCCCTCTGCAAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143930	CTCAGAGCGGGGAAGCAGCAGACAGCGTTCTTAAATGTCCCCTCTGCAAC	143979

FQ482111.2	1151	AAAATTGTGAAGAGGGACACGATCACGCCCAACTGGCTCTTGGTAAATCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	143980	AAAATTGTGAAGAGGGACACGATCACGCCCAACTGGCTCTTGGTAAATCT	144029

FQ482111.2	1201	GGTGGAGAAAATCCAAGCTATGGATCCCTCGGACATGCAGCCAGAAACCG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144030	GGTGGAGAAAATCCAAGCTATGGATCCCTCGGACATGCAGCCAGAAACCG	144079

FQ482111.2	1251	AAGAGCTGAGATGTCTAAGGCATGGAGAGAAATGTCATTACTTCTGTGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144080	AAGAGCTGAGATGTCTAAGGCATGGAGAGAAATGTCATTACTTCTGTGAA	144129

FQ482111.2	1301	GTCGATGGCAAGTTCCTCTGCGTGGTGTGTCGTGAATCCAAGGACCACAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144130	GTCGATGGCAAGTTCCTCTGCGTGGTGTGTCGTGAATCCAAGGACCACAA	144179

FQ482111.2	1351	AACCCACAACACAACTCTGATAGAAGAAGCTGCCCAGAATTATCAGGTAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144180	AACCCACAACACAACTCTGATAGAAGAAGCTGCCCAGAATTATCAGGTAG	144229

FQ482111.2	1401	GCATTTCGGGGTCCCTTCCCTGTTCCCCCATCAGATCAAGAGTTCAGTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144230	GCATTTCGGGGTCCCTTCCCTGTTCCCCCATCAGATCAAGAGTTCAGTGA	144279

FQ482111.2	1451	GGACCTGGAAACTGTCATTTCCTCCCTCTGGGTTTGTACCCATGGCCCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144280	GGACCTGGAAACTGTCATTTCCTCCCTCTGGGTTTGTACCCATGGCCCCA	144329

FQ482111.2	1501	TCTTTGCACCTGAGTAGAAAATGTGCAGTCAGGCCCGTAGGTTCAAAAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144330	TCTTTGCACCTGAGTAGAAAATGTGCAGTCAGGCCCGTAGGTTCAAAAGT	144379

FQ482111.2	1551	CTAAGGTTGGAAAACTGATATTTGTTGCAACCAAGGTATAATGGAGAATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144380	CTAAGGTTGGAAAACTGATATTTGTTGCAACCAAGGTATAATGGAGAATG	144429

FQ482111.2	1601	GAAAGAACACGGAATTTCGAGTCAGAGGTGTAGGTTCAGGTTCAGACTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144430	GAAAGAACACGGAATTTCGAGTCAGAGGTGTAGGTTCAGGTTCAGACTCA	144479

FQ482111.2	1651	TGAACTTTTTATAGAGCCTTCAAGGAGTCACTTTACCTCTCTGAGCTCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144480	TGAACTTTTTATAGAGCCTTCAAGGAGTCACTTTACCTCTCTGAGCTCCA	144529

FQ482111.2	1701	GGTGCCTCCTCTTTAAATGGGTCAAACAAATTGTACTTCTTAAGAGTTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144530	GGTGCCTCCTCTTTAAATGGGTCAAACAAATTGTACTTCTTAAGAGTTGT	144579

FQ482111.2	1751	AGGTATGACAAATGAGAGAAAGTTTGTGGAAGTCCTTTGATAACCCCAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144580	AGGTATGACAAATGAGAGAAAGTTTGTGGAAGTCCTTTGATAACCCCAAA	144629

FQ482111.2	1801	GCACATCCAAATATTAGTCATAATTTATTAGTTATAATTTATTACATTCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144630	GCACATCCAAATATTAGTCATAATTTATTAGTTATAATTTATTACATTCC	144679

FQ482111.2	1851	TTTCTTGTAGGTCACTTAGGCTCCATAGTTCTTCCTCCCCGTCACACCCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144680	TTTCTTGTAGGTCACTTAGGCTCCATAGTTCTTCCTCCCCGTCACACCCC	144729

FQ482111.2	1901	AGCCCCCAGCTTGAACAGGAAAGGGGGATCTATTAATAATGACACAAGGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144730	AGCCCCCAGCTTGAACAGGAAAGGGGGATCTATTAATAATGACACAAGGA	144779

FQ482111.2	1951	CTTGCCCTCCATCCCAAGAAATAAGGAGGGCATCATGAGGTCAGGAGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482148.1	144780	CTTGCCCTCCATCCCAAGAAATAAGGAGGGCATCATGAGGTCAGGAGATC	144829

Overview

Query
FQ482111.2 - 64776 bps
Hit
FQ482148.1 - 144829 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link