<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482133.3	1	GGGGATTCTCCAGGCAAGAATACTAGAGTGGGTTGCCATGCCCTCCTCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194093	GGGGATTCTCCAGGCAAGAATACTAGAGTGGGTTGCCATGCCCTCCTCCA	194142

FQ482133.3	51	GGGGATCTTCCCAACCCAGGGATCAAACCCAGGTTTCCTGCATTGCTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194143	GGGGATCTTCCCAACCCAGGGATCAAACCCAGGTTTCCTGCATTGCTGTT	194192

FQ482133.3	101	ACTATAGGCATATATAGTAGCCTGCCTCAGGGAACCCTGTCCCTCCTCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194193	ACTATAGGCATATATAGTAGCCTGCCTCAGGGAACCCTGTCCCTCCTCCT	194242

FQ482133.3	151	CCTGACCCTTAGACTAAAGTGTGTTTGTTTACATCTCAGGGAGATAACCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194243	CCTGACCCTTAGACTAAAGTGTGTTTGTTTACATCTCAGGGAGATAACCT	194292

FQ482133.3	201	GAGCCTGCCCATCTGTGGAGGGACTGTGACATTCTTGGGTTCTTTGTGTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194293	GAGCCTGCCCATCTGTGGAGGGACTGTGACATTCTTGGGTTCTTTGTGTG	194342

FQ482133.3	251	GGAAATGGCACCACTTGTCTGATGCTTACCGGTGTGGCTCAGAAGTTCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194343	GGAAATGGCACCACTTGTCTGATGCTTACCGGTGTGGCTCAGAAGTTCAT	194392

FQ482133.3	301	GAGGGGCAGGGGGTGGGGGCGGAGGGGGCAGGAATCACGGATAGCTGTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194393	GAGGGGCAGGGGGTGGGGGCGGAGGGGGCAGGAATCACGGATAGCTGTGG	194442

FQ482133.3	351	CATCTTTGTTTACTGATATGGCAGGAGATATTCCATTTCATACCACCTCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194443	CATCTTTGTTTACTGATATGGCAGGAGATATTCCATTTCATACCACCTCT	194492

FQ482133.3	401	GAAATAGCTGTAAGGAAGCAAAACTAACAACCTCCCCTGCCTGAGGCTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194493	GAAATAGCTGTAAGGAAGCAAAACTAACAACCTCCCCTGCCTGAGGCTTG	194542

FQ482133.3	451	CCATTCTAAGAGATATTTGCAAGAATTAAGTAGTCTTTTTACTTTGTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194543	CCATTCTAAGAGATATTTGCAAGAATTAAGTAGTCTTTTTACTTTGTTTC	194592

FQ482133.3	501	CTCACAGCACCGCCATCTCTGATCCATAAAAGAACCTGGCATCCAGGCCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194593	CTCACAGCACCGCCATCTCTGATCCATAAAAGAACCTGGCATCCAGGCCT	194642

FQ482133.3	551	CAACAAGATGGTTATTTAGAGACATTAGTCTGCCATCTTCTTGGTCAGTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194643	CAACAAGATGGTTATTTAGAGACATTAGTCTGCCATCTTCTTGGTCAGTC	194692

FQ482133.3	601	GGCTCTCCAAATAAAGTCGGATTCCTTGCCTTGACACCTTGTCTCTTGGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194693	GGCTCTCCAAATAAAGTCGGATTCCTTGCCTTGACACCTTGTCTCTTGGA	194742

FQ482133.3	651	TTTATTGGCCTACTGTGTGGCAAGCAGAGAGAGCTTGGACTCTGTTACAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194743	TTTATTGGCCTACTGTGTGGCAAGCAGAGAGAGCTTGGACTCTGTTACAG	194792

FQ482133.3	701	TAGTACACACTGGAAAATGTAGGGTGGGTTCAAGCCAAAGGGTACGGTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194793	TAGTACACACTGGAAAATGTAGGGTGGGTTCAAGCCAAAGGGTACGGTAA	194842

FQ482133.3	751	GAAAGATTTGAGACAGGCCAAGAGGGGCGGGCTGACCAGCGAAGGGTAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194843	GAAAGATTTGAGACAGGCCAAGAGGGGCGGGCTGACCAGCGAAGGGTAAA	194892

FQ482133.3	801	CTTTTGGTAGAGGTAAACTTCAGAAAGAGAAGGAAAATATAGGGTGTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194893	CTTTTGGTAGAGGTAAACTTCAGAAAGAGAAGGAAAATATAGGGTGTGGG	194942

FQ482133.3	851	AGAGATGCCTCAGAGAAGAAAGAGCTGAGCAAGTTGGACCAATACAGGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194943	AGAGATGCCTCAGAGAAGAAAGAGCTGAGCAAGTTGGACCAATACAGGGC	194992

FQ482133.3	901	ATGCCTCGCACGGTATGTCAGGGTGAGCAAGCGTAATCTGTCAGGGTGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	194993	ATGCCTCGCACGGTATGTCAGGGTGAGCAAGCGTAATCTGTCAGGGTGAA	195042

FQ482133.3	951	CTAACATGACAGGTGGGGGACAGCAGAGAAGACTGAAAAAGAAAAATCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195043	CTAACATGACAGGTGGGGGACAGCAGAGAAGACTGAAAAAGAAAAATCTG	195092

FQ482133.3	1001	TATACTGCTGAGAAGGACAGAGTATGAAAACATACTCGAAAGCTAAGTGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195093	TATACTGCTGAGAAGGACAGAGTATGAAAACATACTCGAAAGCTAAGTGT	195142

FQ482133.3	1051	CATGTGGGTTACAGCAGGGCACAACCATACCTGACAGAGAATGGAAAGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195143	CATGTGGGTTACAGCAGGGCACAACCATACCTGACAGAGAATGGAAAGGC	195192

FQ482133.3	1101	TAAATAAATACAGAAGTGATGAGGCACAGAAGGCTTGGGTAAGGTGAGAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195193	TAAATAAATACAGAAGTGATGAGGCACAGAAGGCTTGGGTAAGGTGAGAT	195242

FQ482133.3	1151	GGAGCTGGAAAGGGTAATAAATAAAAGTTGAGTCTAAATGTTGACCCCCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195243	GGAGCTGGAAAGGGTAATAAATAAAAGTTGAGTCTAAATGTTGACCCCCC	195292

FQ482133.3	1201	GATGAAACTAAGAATCTGTTCCCATTAACTCATTAACAAGAATTATGTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195293	GATGAAACTAAGAATCTGTTCCCATTAACTCATTAACAAGAATTATGTGG	195342

FQ482133.3	1251	AATATAGTTGTGGTTGATGTGGGTTTTCAATATTGGTAGCATATATTAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195343	AATATAGTTGTGGTTGATGTGGGTTTTCAATATTGGTAGCATATATTAAG	195392

FQ482133.3	1301	CAGGTCCCAATATTGATTGGACCTCCTGGAGAAGGCAATGGCACCCCACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195393	CAGGTCCCAATATTGATTGGACCTCCTGGAGAAGGCAATGGCACCCCACT	195442

FQ482133.3	1351	CCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGATGGAGCAGCCTAGTAGGCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195443	CCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGATGGAGCAGCCTAGTAGGCTG	195492

FQ482133.3	1401	CAGTCCATGGGGTCGCTAAGAGTCGGACACGACTGAGCGACTTCACTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195493	CAGTCCATGGGGTCGCTAAGAGTCGGACACGACTGAGCGACTTCACTTCA	195542

FQ482133.3	1451	CTTTCAATATTGATTATCCCAAATTCTCGGAATCCTACATCAAGGTGTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195543	CTTTCAATATTGATTATCCCAAATTCTCGGAATCCTACATCAAGGTGTTC	195592

FQ482133.3	1501	ATCAACACGTTACCAATCACAGAATTCTATTCTGCCGTTGGTCCTTAAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195593	ATCAACACGTTACCAATCACAGAATTCTATTCTGCCGTTGGTCCTTAAAC	195642

FQ482133.3	1551	CTGCACAGTTGTTAAAATTATATATATATTGAAAAACAGGAACCTTGTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195643	CTGCACAGTTGTTAAAATTATATATATATTGAAAAACAGGAACCTTGTCT	195692

FQ482133.3	1601	ATTTGTCACGCCTTTTATCTCTTGAATCTAGAACAGTCCCAGTGCATAGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195693	ATTTGTCACGCCTTTTATCTCTTGAATCTAGAACAGTCCCAGTGCATAGT	195742

FQ482133.3	1651	AGGGGTTCAATAAGTAGGGGTTGACCATAGGCTGGCACAGTGCTTTCAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195743	AGGGGTTCAATAAGTAGGGGTTGACCATAGGCTGGCACAGTGCTTTCAAA	195792

FQ482133.3	1701	AAGCAATTTGAAAACATGTAGGCTGCCAGTGTGCTCCGTCGCCGCAGCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195793	AAGCAATTTGAAAACATGTAGGCTGCCAGTGTGCTCCGTCGCCGCAGCTG	195842

FQ482133.3	1751	TGTCTGACTCTTTTTGACCCTATTGACTGTTGCCTGCCGGGCTTCTCTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195843	TGTCTGACTCTTTTTGACCCTATTGACTGTTGCCTGCCGGGCTTCTCTGT	195892

FQ482133.3	1801	CCATGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGGTGGGTTGCCACGCCCTCCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195893	CCATGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGGTGGGTTGCCACGCCCTCCTC	195942

FQ482133.3	1851	CAGGGGATCTTCCTGATCCAGGGATTGAACCTGCATCTCCTGTGTCTCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195943	CAGGGGATCTTCCTGATCCAGGGATTGAACCTGCATCTCCTGTGTCTCCT	195992

FQ482133.3	1901	GCACTGCAAGTAGATTCTTTACTCACTGAATCACCTGGGAAGCCCCCAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	195993	GCACTGCAAGTAGATTCTTTACTCACTGAATCACCTGGGAAGCCCCCAAA	196042

FQ482133.3	1951	ACATGTATGACAAGCCTTTAAAATATTCATGCAAAACTTTCCTGGTGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482129.3	196043	ACATGTATGACAAGCCTTTAAAATATTCATGCAAAACTTTCCTGGTGATC	196092

Overview

Query
FQ482133.3 - 49123 bps
Hit
FQ482129.3 - 196092 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link