<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FQ482107.2	2001	GAGAGCGGGGAGGGGGAGGGAAAGGACGGGGGAGGGGGGGAGAGCAAACC	1952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1	GAGAGCGGGGAGGGGGAGGGAAAGGACGGGGGAGGGGGGGAGAGCAAACC	50

C  FQ482107.2	1951	TCCAGGGCTGACAGGCACATCTCTGGCTCATCACCACCTCCCAAGGCATG	1902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	51	TCCAGGGCTGACAGGCACATCTCTGGCTCATCACCACCTCCCAAGGCATG	100

C  FQ482107.2	1901	CATCTCATTGAGCTGTTGCCAGAAGCTGTCAGGGTCACTTGTTGTAAAGA	1852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	101	CATCTCATTGAGCTGTTGCCAGAAGCTGTCAGGGTCACTTGTTGTAAAGA	150

C  FQ482107.2	1851	CAGGGCCAAACCCTGGGGAATGAGATTTAGAGACTGAGGAGAAGGCTCCT	1802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	151	CAGGGCCAAACCCTGGGGAATGAGATTTAGAGACTGAGGAGAAGGCTCCT	200

C  FQ482107.2	1801	CTCTTGCGGCCATCTCCCCAGTCAAGGGCCATCTCCCCAGTCAAGAGGCC	1752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	201	CTCTTGCGGCCATCTCCCCAGTCAAGGGCCATCTCCCCAGTCAAGAGGCC	250

C  FQ482107.2	1751	CCACTGTGTTCCTCAGTTGAACTCGTATTGAGATAACAATATTCTTTATA	1702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	251	CCACTGTGTTCCTCAGTTGAACTCGTATTGAGATAACAATATTCTTTATA	300

C  FQ482107.2	1701	TTTATACTGACAGGATAGGACAAGGCAGGGTGTAGGTTCCTCTGGTGGGA	1652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	301	TTTATACTGACAGGATAGGACAAGGCAGGGTGTAGGTTCCTCTGGTGGGA	350

C  FQ482107.2	1651	AAGTGGACCTCATTTCCTCACAAAATGGTGGTACTTCCTGTGGTCTTGAG	1602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	351	AAGTGGACCTCATTTCCTCACAAAATGGTGGTACTTCCTGTGGTCTTGAG	400

C  FQ482107.2	1601	TGGGCCCTTTTGGGGTATATGTTTAAATATAAAAACAACTGGTGAAGCAA	1552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	401	TGGGCCCTTTTGGGGTATATGTTTAAATATAAAAACAACTGGTGAAGCAA	450

C  FQ482107.2	1551	CACGGATGGAACTAGAGATTATCATACTAAGTGAAATAAGTCAAATATCA	1502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	451	CACGGATGGAACTAGAGATTATCATACTAAGTGAAATAAGTCAAATATCA	500

C  FQ482107.2	1501	TTGTGATATTCCACTTGTACGTGGAACCTAAAAAAATGATACAAATGAAC	1452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	501	TTGTGATATTCCACTTGTACGTGGAACCTAAAAAAATGATACAAATGAAC	550

C  FQ482107.2	1451	TTATTTACAAAACAGAAATAGATTCAAGGACATAAAAAACATATTTATGA	1402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	551	TTATTTACAAAACAGAAATAGATTCAAGGACATAAAAAACATATTTATGA	600

C  FQ482107.2	1401	TTAACAAAGGGAAAGGGAGGGATAAATTAGGAGTTTGGGATTAACAGATA	1352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	601	TTAACAAAGGGAAAGGGAGGGATAAATTAGGAGTTTGGGATTAACAGATA	650

C  FQ482107.2	1351	CACACAACTATATATAAAATAGATAACCAACAAGGACTACTGTATAGCAC	1302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	651	CACACAACTATATATAAAATAGATAACCAACAAGGACTACTGTATAGCAC	700

C  FQ482107.2	1301	AGGGAACTAGATTCAATATCTTGTAATAACTTATAATGGGAAGGAACCTA	1252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	701	AGGGAACTAGATTCAATATCTTGTAATAACTTATAATGGGAAGGAACCTA	750

C  FQ482107.2	1251	AAAATGACATATATAACTGAATCACTTTGCTGTATATCTGAAACACTGTA	1202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	751	AAAATGACATATATAACTGAATCACTTTGCTGTATATCTGAAACACTGTA	800

C  FQ482107.2	1201	AATCAACTATACTTATCAATTACAAAAAAAAAAAACCTGGGTCCTCCATT	1152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	801	AATCAACTATACTTATCAATTACAAAAAAAAAAAACCTGGGTCCTCCATT	850

C  FQ482107.2	1151	TCCTCACAGAAAAGCCAGAGAAATAATAGTGCTTACCTCAGAGAAGCCTA	1102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	851	TCCTCACAGAAAAGCCAGAGAAATAATAGTGCTTACCTCAGAGAAGCCTA	900

C  FQ482107.2	1101	TTGAGATGACTGAGTTGATTTTGTAAATTTCAGAACAGGGTTTTGACACA	1052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	901	TTGAGATGACTGAGTTGATTTTGTAAATTTCAGAACAGGGTTTTGACACA	950

C  FQ482107.2	1051	TAATAAGTGCTAAATTCTTAATTATTCATTTACTCATACCCTTATCAAAT	1002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	951	TAATAAGTGCTAAATTCTTAATTATTCATTTACTCATACCCTTATCAAAT	1000

C  FQ482107.2	1001	ATGTGATAAGCTCCTGTTGAATGTCAGTCACCATGAGATTTATATCAGAC	952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1001	ATGTGATAAGCTCCTGTTGAATGTCAGTCACCATGAGATTTATATCAGAC	1050

C  FQ482107.2	951	TCAAACCCGCTCCTTAGGGAAGTTTCAATCCAAATTTTATTTGATGATCA	902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1051	TCAAACCCGCTCCTTAGGGAAGTTTCAATCCAAATTTTATTTGATGATCA	1100

C  FQ482107.2	901	TTTCAACCTTGGGAGATAGTCAGGATGAGTACTGACCCATTTTATGAATG	852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1101	TTTCAACCTTGGGAGATAGTCAGGATGAGTACTGACCCATTTTATGAATG	1150

C  FQ482107.2	851	ATGATGTTGAGGAAGGAGAGGTTAAACAAACAGGCTAAGGACACACAGTA	802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1151	ATGATGTTGAGGAAGGAGAGGTTAAACAAACAGGCTAAGGACACACAGTA	1200

C  FQ482107.2	801	AGATTGGTCAACCCAGGTCAGATAATCTGACTTCTAAGTCAGTGGAGGAA	752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1201	AGATTGGTCAACCCAGGTCAGATAATCTGACTTCTAAGTCAGTGGAGGAA	1250

C  FQ482107.2	751	GGAATATGATTTAAGTAGCTGTCTCAGATATTTCACAGAGGCCTGGACAC	702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1251	GGAATATGATTTAAGTAGCTGTCTCAGATATTTCACAGAGGCCTGGACAC	1300

C  FQ482107.2	701	ACCAAGTTCCCCATCTTCATCCCAATCTCTGTCACAGGAAATGGAGAGAA	652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1301	ACCAAGTTCCCCATCTTCATCCCAATCTCTGTCACAGGAAATGGAGAGAA	1350

C  FQ482107.2	651	TTGAAAATGACTTATTAGGATGGACGCCTAACAACTCAGAGGCTGCCTGC	602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1351	TTGAAAATGACTTATTAGGATGGACGCCTAACAACTCAGAGGCTGCCTGC	1400

C  FQ482107.2	601	CTAAGCACCTGTCATGATTAAACTCCTATGGCAAGTGCTGTCATATTGGA	552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1401	CTAAGCACCTGTCATGATTAAACTCCTATGGCAAGTGCTGTCATATTGGA	1450

C  FQ482107.2	551	AACAGTGGAAGAAGTGGCTGACAGTTCCCTATATGCACAGCTGCTGCTGC	502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1451	AACAGTGGAAGAAGTGGCTGACAGTTCCCTATATGCACAGCTGCTGCTGC	1500

C  FQ482107.2	501	TGCTAAGTTGCTTCAGTCATGTCCAACTCTGTGCGACCCCATAGATGGCA	452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1501	TGCTAAGTTGCTTCAGTCATGTCCAACTCTGTGCGACCCCATAGATGGCA	1550

C  FQ482107.2	451	GCCCGCCAGGCTTCCCTGTCCCTGGCATTCTCCAGGCAAGAACAATGGAG	402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1551	GCCCGCCAGGCTTCCCTGTCCCTGGCATTCTCCAGGCAAGAACAATGGAG	1600

C  FQ482107.2	401	TGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAATGCATGAAAGTAAAAAGTGAAAGTGAA	352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1601	TGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAATGCATGAAAGTAAAAAGTGAAAGTGAA	1650

C  FQ482107.2	351	GTCGCTCAGTCATGTCCAACTCTTCACGACCCCATGGACTGCAGCCTACC	302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1651	GTCGCTCAGTCATGTCCAACTCTTCACGACCCCATGGACTGCAGCCTACC	1700

C  FQ482107.2	301	GGCTCCTCCATCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTACTGGAGTGGGGTGC	252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1701	GGCTCCTCCATCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTACTGGAGTGGGGTGC	1750

C  FQ482107.2	251	CATTGCCTTCTATGCTATATGCATAGAGGTGCCAATAAAGGACAAGGATC	202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1751	CATTGCCTTCTATGCTATATGCATAGAGGTGCCAATAAAGGACAAGGATC	1800

C  FQ482107.2	201	CTAGGAAGTGCCTCCATTCTATTATGGAAGTGAAGCCATGAGGCCCACTT	152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1801	CTAGGAAGTGCCTCCATTCTATTATGGAAGTGAAGCCATGAGGCCCACTT	1850

C  FQ482107.2	151	CCCTACCAGTGACATTACCTCTTGCCCTGGACTTGCCTCCACTCTCCTGG	102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1851	CCCTACCAGTGACATTACCTCTTGCCCTGGACTTGCCTCCACTCTCCTGG	1900

C  FQ482107.2	101	CCAGACCATAGTTACCTGGATCATGGAACGGCACCAGGACATACTGAGTG	52
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1901	CCAGACCATAGTTACCTGGATCATGGAACGGCACCAGGACATACTGAGTG	1950

C  FQ482107.2	51	GGCTCCATGGGGGTGCCCCGTCGCTGCTCCACAATGTGACGGGCCTGGAT	2
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FQ482128.2	1951	GGCTCCATGGGGGTGCCCCGTCGCTGCTCCACAATGTGACGGGCCTGGAT	2000

C  FQ482107.2	1	C	1
			|
  FQ482128.2	2001	C	2001

Overview

Query
FQ482107.2 - 130238 bps
Hit
FQ482128.2 - 51276 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link