<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482108.2	1	AACTACACACAGCCTGATGAGTGCTCTGATAAGAGAAGGTGAGAGGAACT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	113851	AACTACACACAGCCTGATGAGTGCTCTGATAAGAGAAGGTGAGAGGAACT	113900

FQ482108.2	51	CCTCCCAAGGATTAAAGCTGATTAAGCAGTTTTGTTAAGAGTTTTCTTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	113901	CCTCCCAAGGATTAAAGCTGATTAAGCAGTTTTGTTAAGAGTTTTCTTTT	113950

FQ482108.2	101	ATGAGATACTGAGAAATGTTCCTGTGTTTCTAAAGGAGTGAACAAAGTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	113951	ATGAGATACTGAGAAATGTTCCTGTGTTTCTAAAGGAGTGAACAAAGTAC	114000

FQ482108.2	151	TAAGGACAACTTTTGACACTTTTAATTCCAAATCTGTCAATTACAACTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114001	TAAGGACAACTTTTGACACTTTTAATTCCAAATCTGTCAATTACAACTGG	114050

FQ482108.2	201	GAAGTTGGGTTATTTTATATTTCTTGACCTCAGTGTCTTTATCTCTTTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114051	GAAGTTGGGTTATTTTATATTTCTTGACCTCAGTGTCTTTATCTCTTTAA	114100

FQ482108.2	251	ATGAAGAGACTGGAATACATGATCTCTGATGTCCTCCTTGACTCATACAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114101	ATGAAGAGACTGGAATACATGATCTCTGATGTCCTCCTTGACTCATACAT	114150

FQ482108.2	301	TTATAGATTCCATGTATCTGAGTGCTACACTTCTGATGGGAGGGCAGTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114151	TTATAGATTCCATGTATCTGAGTGCTACACTTCTGATGGGAGGGCAGTTT	114200

FQ482108.2	351	AGTGAGAAACCACAGAGCTGCTCCAGCCAAGAATTATGGATGGGTCCTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114201	AGTGAGAAACCACAGAGCTGCTCCAGCCAAGAATTATGGATGGGTCCTTA	114250

FQ482108.2	401	TCTACCTATTGTCTCAAGATTCAGTGAGAAAACCCAATCTTCAAATAAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114251	TCTACCTATTGTCTCAAGATTCAGTGAGAAAACCCAATCTTCAAATAAAA	114300

FQ482108.2	451	TCACAAGGCCTGTTATAAGAGAATTGGCCACAGGCATAAGCAGATGCAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114301	TCACAAGGCCTGTTATAAGAGAATTGGCCACAGGCATAAGCAGATGCAAT	114350

FQ482108.2	501	TCTTTTTCCCACTAGGAATCTGTCTCTGGAGAAAAATACAAGCTATCCGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114351	TCTTTTTCCCACTAGGAATCTGTCTCTGGAGAAAAATACAAGCTATCCGA	114400

FQ482108.2	551	TTACAATCTGGGTCAAAGTAATAAGGGCTCATTTAAATGCTTTGGTCATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114401	TTACAATCTGGGTCAAAGTAATAAGGGCTCATTTAAATGCTTTGGTCATA	114450

FQ482108.2	601	AACTTAAACTCTAAGGAGATCATAGGCCAGAAAAACTGTAAATAGATGGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114451	AACTTAAACTCTAAGGAGATCATAGGCCAGAAAAACTGTAAATAGATGGA	114500

FQ482108.2	651	GGGGTTTAGAGGAGGAATAGAATAGAATTAAATTAAAAATATGTTTTATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114501	GGGGTTTAGAGGAGGAATAGAATAGAATTAAATTAAAAATATGTTTTATA	114550

FQ482108.2	701	GTTATCATCATCAATGAGGAGGCCCACAGAGGCCTGGAGAGCACAGTAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114551	GTTATCATCATCAATGAGGAGGCCCACAGAGGCCTGGAGAGCACAGTAGA	114600

FQ482108.2	751	GTGGCATGTAGAGGATCAGACCCTACTCCTGGGGTCTCCAAATGTGGCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114601	GTGGCATGTAGAGGATCAGACCCTACTCCTGGGGTCTCCAAATGTGGCTT	114650

FQ482108.2	801	CAGTTGGAGAACAGCCCCAGCTACTGGCTGAATTATGTGATGGTTTCTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114651	CAGTTGGAGAACAGCCCCAGCTACTGGCTGAATTATGTGATGGTTTCTAA	114700

FQ482108.2	851	TCTGAGAGCACAGAAAGAATACTACTTGTCCTGTAGTTTCTGGACACTAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114701	TCTGAGAGCACAGAAAGAATACTACTTGTCCTGTAGTTTCTGGACACTAC	114750

FQ482108.2	901	CAGAGTTTGAGGAGTTTTGAGGAGGAAGGGAATGTCACCACGAGAAGGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114751	CAGAGTTTGAGGAGTTTTGAGGAGGAAGGGAATGTCACCACGAGAAGGTG	114800

FQ482108.2	951	ATGAGTCAGGAAAGTCATCTTATCTCCTTTTCATCCCCTGGGTATACTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114801	ATGAGTCAGGAAAGTCATCTTATCTCCTTTTCATCCCCTGGGTATACTTT	114850

FQ482108.2	1001	GGTCTGGTTTCAGTTCATGTTGCTCTTTTTCAGACTGGAGGAAGGAACAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114851	GGTCTGGTTTCAGTTCATGTTGCTCTTTTTCAGACTGGAGGAAGGAACAG	114900

FQ482108.2	1051	TTTGAACGTGGTAAGTGGTTCTTTATTTATCTTTTTGACCCCCTTCTAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114901	TTTGAACGTGGTAAGTGGTTCTTTATTTATCTTTTTGACCCCCTTCTAAC	114950

FQ482108.2	1101	CTGCCCTCTGAGATCTCCTCTGAGACCCTGCTTATCCTTCCTAACATCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	114951	CTGCCCTCTGAGATCTCCTCTGAGACCCTGCTTATCCTTCCTAACATCCT	115000

FQ482108.2	1151	CTCCTAGTTGAAGAGACAGGCACTACTGTTCTGGTAAAGAGAAGGAGGAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115001	CTCCTAGTTGAAGAGACAGGCACTACTGTTCTGGTAAAGAGAAGGAGGAC	115050

FQ482108.2	1201	ATGAAAAGCATTCAATGTTAGCCTGAACTGACAACTGCTGCTAGGATTAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115051	ATGAAAAGCATTCAATGTTAGCCTGAACTGACAACTGCTGCTAGGATTAG	115100

FQ482108.2	1251	CTACTCTGGTCGTGCCTCCCCTTTCAAATGCTGACAAAGCTTCCCTGTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115101	CTACTCTGGTCGTGCCTCCCCTTTCAAATGCTGACAAAGCTTCCCTGTCT	115150

FQ482108.2	1301	GTGGGGTCCACTTGGTTCTGAAACAGAAATTAACATAGCCCCTCAGCTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115151	GTGGGGTCCACTTGGTTCTGAAACAGAAATTAACATAGCCCCTCAGCTGA	115200

FQ482108.2	1351	GGAGACCCCACACTAAGTAAAAAGGGCTCAAAATAGCAATTCGGCTGTTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115201	GGAGACCCCACACTAAGTAAAAAGGGCTCAAAATAGCAATTCGGCTGTTC	115250

FQ482108.2	1401	TTTGTAGAGAGGTCAGCTCACAGGGAGCCTGTGACTGAGGAAAATAGGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115251	TTTGTAGAGAGGTCAGCTCACAGGGAGCCTGTGACTGAGGAAAATAGGAC	115300

FQ482108.2	1451	TAATTTGCAGAGAACATGGCAGGAACACCGTTCTTCAGTAAACATTTCAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115301	TAATTTGCAGAGAACATGGCAGGAACACCGTTCTTCAGTAAACATTTCAA	115350

FQ482108.2	1501	GATCCTGCACACACTGGCACTTTGTCAAAACACTGACCATGGCAAAGATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115351	GATCCTGCACACACTGGCACTTTGTCAAAACACTGACCATGGCAAAGATA	115400

FQ482108.2	1551	AGACAAGTAGCATAGAATGGGTAGCAAGAATAAGTAGCAAGAGAACACAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115401	AGACAAGTAGCATAGAATGGGTAGCAAGAATAAGTAGCAAGAGAACACAT	115450

FQ482108.2	1601	CAAACCCTCCTCCCGCCCAGCTCCACCTCCCCCAACACACACACCTTCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115451	CAAACCCTCCTCCCGCCCAGCTCCACCTCCCCCAACACACACACCTTCAG	115500

FQ482108.2	1651	AGGAGAGGTGTTCTTTTCACCACTCCTTACACATTTGCTCTGTTTTGTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115501	AGGAGAGGTGTTCTTTTCACCACTCCTTACACATTTGCTCTGTTTTGTTA	115550

FQ482108.2	1701	AAGTTTCCCCTGTACAACAGTTTTCTGAAATATACAGTCTTGGCTTTATC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115551	AAGTTTCCCCTGTACAACAGTTTTCTGAAATATACAGTCTTGGCTTTATC	115600

FQ482108.2	1751	CTTTCCTTTTTATTTCTTCCAGTTCTTGTGATTGAAAATCATGAAAATGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115601	CTTTCCTTTTTATTTCTTCCAGTTCTTGTGATTGAAAATCATGAAAATGT	115650

FQ482108.2	1801	TCATCAGAACAATTCTGACTTCAGAAAGGAACCTCAGGCAGTATTATGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115651	TCATCAGAACAATTCTGACTTCAGAAAGGAACCTCAGGCAGTATTATGTA	115700

FQ482108.2	1851	AAGAGCAAGGAGGTGGCAACCTTCTCAAACTTGATCAGAAAGGATTCACT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115701	AAGAGCAAGGAGGTGGCAACCTTCTCAAACTTGATCAGAAAGGATTCACT	115750

FQ482108.2	1901	AAGGGGAGACATTACTGGGAGGTGGACATTGAGGACACTGATGAATGGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115751	AAGGGGAGACATTACTGGGAGGTGGACATTGAGGACACTGATGAATGGAC	115800

FQ482108.2	1951	TCTAGGCATTTATGAGGAGCCCACAGAGAAGAGTGAGCTACTCAGTGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482126.2	115801	TCTAGGCATTTATGAGGAGCCCACAGAGAAGAGTGAGCTACTCAGTGATC	115850

Overview

Query
FQ482108.2 - 7811 bps
Hit
FQ482126.2 - 115850 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link