<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482129.3	1	GATCACTGTGGCTCCTGTGTTTAGACTGGACTGTGGGGAGTAAGACTGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49163	GATCACTGTGGCTCCTGTGTTTAGACTGGACTGTGGGGAGTAAGACTGCA	49212

FQ482129.3	51	AGCAGGGACACCAGGTAGGAGACAACTGCAGTAATCCTGGGGAGAAGACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49213	AGCAGGGACACCAGGTAGGAGACAACTGCAGTAATCCTGGGGAGAAGACA	49262

FQ482129.3	101	GTGGCTGCCCTGAAGATGGGACAGAAGTAGACAAATTTGGGACATACTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49263	GTGGCTGCCCTGAAGATGGGACAGAAGTAGACAAATTTGGGACATACTGA	49312

FQ482129.3	151	GATACATTTCAGGGGTAGAATTGACAGGCCCAGATGATGGATTGATGATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49313	GATACATTTCAGGGGTAGAATTGACAGGCCCAGATGATGGATTGATGATG	49362

FQ482129.3	201	AGGGGGGTGGAAGATGGGGAGACTGAGACAGAAGCAGGATTCTGATGGGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49363	AGGGGGGTGGAAGATGGGGAGACTGAGACAGAAGCAGGATTCTGATGGGA	49412

FQ482129.3	251	TGGGAGAACCAGAAGTTCAATTTTGGATTTAAATCTATTGGCCAGATATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49413	TGGGAGAACCAGAAGTTCAATTTTGGATTTAAATCTATTGGCCAGATATC	49462

FQ482129.3	301	GAAGTCTTGGATAACATTTCAGTCTTGCCAAGAAATGTCACTTGGCAATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49463	GAAGTCTTGGATAACATTTCAGTCTTGCCAAGAAATGTCACTTGGCAATT	49512

FQ482129.3	351	CTATCAATATATGTGAGTCTAGATTTCAGAGGCAACGTCAGAACTAGATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49513	CTATCAATATATGTGAGTCTAGATTTCAGAGGCAACGTCAGAACTAGATT	49562

FQ482129.3	401	GTCAACAGTGGGAACTGTCAGCACAAAGAAAGCCATGGAGAAGGAAGAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49563	GTCAACAGTGGGAACTGTCAGCACAAAGAAAGCCATGGAGAAGGAAGAAA	49612

FQ482129.3	451	TACCTTACACACACTCCTAAGATCCCTTTGAGGTATTTATGTTTTCCTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49613	TACCTTACACACACTCCTAAGATCCCTTTGAGGTATTTATGTTTTCCTTT	49662

FQ482129.3	501	ATGATAAATGCAATGTATCTCCTATTCTAAATGTCAGAAGCAGCAACCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49663	ATGATAAATGCAATGTATCTCCTATTCTAAATGTCAGAAGCAGCAACCTC	49712

FQ482129.3	551	TTTCTTCTAGAAGCAAAACCCTCCAGACTTAGTTTTCTCTAGAACTCTCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49713	TTTCTTCTAGAAGCAAAACCCTCCAGACTTAGTTTTCTCTAGAACTCTCA	49762

FQ482129.3	601	CTGGGATTCAACCTCCCTGGATTCTATCCCCTATCCAACACAGGATGCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49763	CTGGGATTCAACCTCCCTGGATTCTATCCCCTATCCAACACAGGATGCTT	49812

FQ482129.3	651	GTAACAACCCATTCCACAATATTTTATGGAACTCCTTATATATTTAAATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49813	GTAACAACCCATTCCACAATATTTTATGGAACTCCTTATATATTTAAATC	49862

FQ482129.3	701	CTCTATTTCACTTTTGAAAGCATCTTCCTCTGGGACATTGAAACCTGGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49863	CTCTATTTCACTTTTGAAAGCATCTTCCTCTGGGACATTGAAACCTGGCT	49912

FQ482129.3	751	TTTCCCTAAGAACGTTCATTCTGTCTATGGTGAAGGCTGCCCTTTCTTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49913	TTTCCCTAAGAACGTTCATTCTGTCTATGGTGAAGGCTGCCCTTTCTTCC	49962

FQ482129.3	801	ACACCCATCACTAGGAGCAGGGGGCAGGAGAGGGCGCTGTCCTCTCCCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	49963	ACACCCATCACTAGGAGCAGGGGGCAGGAGAGGGCGCTGTCCTCTCCCCC	50012

FQ482129.3	851	CTTGGCACCACTGATAATCTCCTCCTCTCTTGAAATCCATGCCTTTGCAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50013	CTTGGCACCACTGATAATCTCCTCCTCTCTTGAAATCCATGCCTTTGCAT	50062

FQ482129.3	901	CTTCCATGTTCTGGTCTTCATAACACAATCTCCTCCACCAGCATCTCTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50063	CTTCCATGTTCTGGTCTTCATAACACAATCTCCTCCACCAGCATCTCTAC	50112

FQ482129.3	951	CACGCATCTAACAATTCGTGTATCTAGATCAGTCTTTCTTCACCTCTCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50113	CACGCATCTAACAATTCGTGTATCTAGATCAGTCTTTCTTCACCTCTCCT	50162

FQ482129.3	1001	TCCCTACCTGATATTCTACCAATAAGATCTTGAAAAACTTGATTTGGGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50163	TCCCTACCTGATATTCTACCAATAAGATCTTGAAAAACTTGATTTGGGTA	50212

FQ482129.3	1051	AACTCAGTGGTCTCATTCTTGGGTCCTTCTCCTGGACTGCCAAGCATCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50213	AACTCAGTGGTCTCATTCTTGGGTCCTTCTCCTGGACTGCCAAGCATCAT	50262

FQ482129.3	1101	AGGAGAGTCATATCCTCAGAAGAGGCCTATTACTAATCCTGGTCATCTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50263	AGGAGAGTCATATCCTCAGAAGAGGCCTATTACTAATCCTGGTCATCTAA	50312

FQ482129.3	1151	CCTCAGGAAGCCCTTAAGGTCCCCTAATCTTTGTTTGTTGACTTCCTAGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50313	CCTCAGGAAGCCCTTAAGGTCCCCTAATCTTTGTTTGTTGACTTCCTAGT	50362

FQ482129.3	1201	TCTACTCCTGCAGTACTATATCTACTCCTCCATGTTCTAAATCTACATAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50363	TCTACTCCTGCAGTACTATATCTACTCCTCCATGTTCTAAATCTACATAC	50412

FQ482129.3	1251	CTCCCTAGCTCTTTACTCTCAGTGATGCTATTAGGCTTTTATTGAACTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50413	CTCCCTAGCTCTTTACTCTCAGTGATGCTATTAGGCTTTTATTGAACTTA	50462

FQ482129.3	1301	GGGTCACCTAAGGAGTACTTCTTTATTGTCTTATTTTCCCTTCATGTTTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50463	GGGTCACCTAAGGAGTACTTCTTTATTGTCTTATTTTCCCTTCATGTTTC	50512

FQ482129.3	1351	CTTTTTCTTCTTGAGTCAGAGGACTCTTTCTCCTAAGGTAGACTCTTTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50513	CTTTTTCTTCTTGAGTCAGAGGACTCTTTCTCCTAAGGTAGACTCTTTGT	50562

FQ482129.3	1401	ACTCTGTATTTCACTTCCCCATGTTTACCATTCCCTTTCCCCTCTTCCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50563	ACTCTGTATTTCACTTCCCCATGTTTACCATTCCCTTTCCCCTCTTCCTT	50612

FQ482129.3	1451	GTTTTCAGTATCTCTTTCCATGTGCCTTCATTTTATATACTCAACTTTAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50613	GTTTTCAGTATCTCTTTCCATGTGCCTTCATTTTATATACTCAACTTTAC	50662

FQ482129.3	1501	TTCTCAAAAATAAAAAGCCTTTCCTGGACTCTCTCCCTTAAATGTCCATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50663	TTCTCAAAAATAAAAAGCCTTTCCTGGACTCTCTCCCTTAAATGTCCATT	50712

FQ482129.3	1551	CCACCTCTCACCTTCCTTTTCTGTGTGATGTCTCAAGAAACTAGCCCTCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50713	CCACCTCTCACCTTCCTTTTCTGTGTGATGTCTCAAGAAACTAGCCCTCT	50762

FQ482129.3	1601	AACTAACCACTTTTTCGGGAACTGGTAAAATTTTCCTCACTGTAAAAGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50763	AACTAACCACTTTTTCGGGAACTGGTAAAATTTTCCTCACTGTAAAAGTT	50812

FQ482129.3	1651	GTGGGTTGAAAGAGAGATGGTTCTCGGTTACCTTCAGTATTCACCATTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50813	GTGGGTTGAAAGAGAGATGGTTCTCGGTTACCTTCAGTATTCACCATTCT	50862

FQ482129.3	1701	ACAACTTTGTACTCAGCTCCTCCTTTGCCTCACCTCCCACTCATTCCTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50863	ACAACTTTGTACTCAGCTCCTCCTTTGCCTCACCTCCCACTCATTCCTTA	50912

FQ482129.3	1751	AACCTATGTAAAGCGACTTCTGCCCCTCTGATAAGTGGAAACTGTTTTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50913	AACCTATGTAAAGCGACTTCTGCCCCTCTGATAAGTGGAAACTGTTTTCT	50962

FQ482129.3	1801	CAAAATTTGTAATCGTCTAGTCCTGAACCCAAAGGATCTTCTGAACTCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	50963	CAAAATTTGTAATCGTCTAGTCCTGAACCCAAAGGATCTTCTGAACTCTC	51012

FQ482129.3	1851	ACCTATTAGACTTCTTTGAAGTGTCAGATGTGGCTGCCCGGGCTCTGCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	51013	ACCTATTAGACTTCTTTGAAGTGTCAGATGTGGCTGCCCGGGCTCTGCTT	51062

FQ482129.3	1901	GGCACACCTCTCTTGCCCTACTTTTCTGTCCCTTCAATCTCTCTCCTTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	51063	GGCACACCTCTCTTGCCCTACTTTTCTGTCCCTTCAATCTCTCTCCTTTA	51112

FQ482129.3	1951	TTGGCTTCCCTCCCTTTGACCATCCTCAAGGTTCTTCTGATCACCCTCTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482122.2	51113	TTGGCTTCCCTCCCTTTGACCATCCTCAAGGTTCTTCTGATCACCCTCTC	51162

Overview

Query
FQ482129.3 - 196092 bps
Hit
FQ482122.2 - 51162 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link