<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482131.2	1	GTTCCTTTGGTTAGAGAATTAAGTTACAGAATAGAAACAAAGGGAAACAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199430	GTTCCTTTGGTTAGAGAATTAAGTTACAGAATAGAAACAAAGGGAAACAA	199479

FQ482131.2	51	TGCTGGCAAAACACTCTGAAATCAGATCACCAGAAAGACCATGGATATAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199480	TGCTGGCAAAACACTCTGAAATCAGATCACCAGAAAGACCATGGATATAA	199529

FQ482131.2	101	CATAATAACAAATTTATATTTTAATCTGAAATATAGGGTCACAAAACAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199530	CATAATAACAAATTTATATTTTAATCTGAAATATAGGGTCACAAAACAAA	199579

FQ482131.2	151	ATTCCAAAAGATGAAAGGTGGAAAAATAAAATTAGAAAATATGAGTAAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199580	ATTCCAAAAGATGAAAGGTGGAAAAATAAAATTAGAAAATATGAGTAAGC	199629

FQ482131.2	201	TGAGAGTATAAGGAAGGACAGATGCACAAAGTAAACAAAGAAAAACAAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199630	TGAGAGTATAAGGAAGGACAGATGCACAAAGTAAACAAAGAAAAACAAAT	199679

FQ482131.2	251	GAAAAATAAGTTGAATATAGCAAGAAAAGTTGATCTTTGTCCCCTCCTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199680	GAAAAATAAGTTGAATATAGCAAGAAAAGTTGATCTTTGTCCCCTCCTTC	199729

FQ482131.2	301	ATCTCTAAACCTGAACCACCACTGCTGCTCAGAGACTAAACATTAGGAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199730	ATCTCTAAACCTGAACCACCACTGCTGCTCAGAGACTAAACATTAGGAGC	199779

FQ482131.2	351	ACTGTTCTACAAGCCTTTTCTGATGCTCCCTCCTTAAAGAACAGAATAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199780	ACTGTTCTACAAGCCTTTTCTGATGCTCCCTCCTTAAAGAACAGAATAGG	199829

FQ482131.2	401	AACTTATGTAATACTCAGGCAAACTTTTAAAAAATGAATACGTCTCCATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199830	AACTTATGTAATACTCAGGCAAACTTTTAAAAAATGAATACGTCTCCATT	199879

FQ482131.2	451	TTCCAAAAAGAGTTGGTCTGAATGGATCAACTGAAAAACAAAAATGACAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199880	TTCCAAAAAGAGTTGGTCTGAATGGATCAACTGAAAAACAAAAATGACAA	199929

FQ482131.2	501	AACTCTGATGAATGAAATCAAATAACTAAGTAAACGGAAAGATAGTCCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199930	AACTCTGATGAATGAAATCAAATAACTAAGTAAACGGAAAGATAGTCCAT	199979

FQ482131.2	551	GTTCATAACCAGAACAATTCAATATAACCAAGATGTCGGTTCTTCTCAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	199980	GTTCATAACCAGAACAATTCAATATAACCAAGATGTCGGTTCTTCTCAAA	200029

FQ482131.2	601	GTAATCTATAGATTCAATGCAGTTTCAATCAAAATACTAGGAAGATATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200030	GTAATCTATAGATTCAATGCAGTTTCAATCAAAATACTAGGAAGATATTT	200079

FQ482131.2	651	TGTAAATGCTGAAAAACTGATTCAAAAGTGTATATGAAGTACCAAAAGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200080	TGTAAATGCTGAAAAACTGATTCAAAAGTGTATATGAAGTACCAAAAGAC	200129

FQ482131.2	701	AGAATAGCCAATACAATATATTGAAAGAGAAGAACAAAATTGGAGGATCG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200130	AGAATAGCCAATACAATATATTGAAAGAGAAGAACAAAATTGGAGGATCG	200179

FQ482131.2	751	ACATTATCCAACTTAAAGACTTATATATAAAGCTACAGTAATCCAGACAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200180	ACATTATCCAACTTAAAGACTTATATATAAAGCTACAGTAATCCAGACAG	200229

FQ482131.2	801	TGTGGTATTGGTGACAAAAAAAAAAAAACAAATAGATCAGTAGAACAGAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200230	TGTGGTATTGGTGACAAAAAAAAAAAAACAAATAGATCAGTAGAACAGAA	200279

FQ482131.2	851	TAGACAGCCCAGAAATAGCCCTACTTGCATATATAGAGTCAACTAATCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200280	TAGACAGCCCAGAAATAGCCCTACTTGCATATATAGAGTCAACTAATCTT	200329

FQ482131.2	901	TGACAAGGGACCAAAGGCAGTATGCTGGAGCAAAGATAAACTTCAACAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200330	TGACAAGGGACCAAAGGCAGTATGCTGGAGCAAAGATAAACTTCAACAAA	200379

FQ482131.2	951	TGGTGTTGCAATACCTGCACATACACTTGGAAAAACTGAACCTTGACCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200380	TGGTGTTGCAATACCTGCACATACACTTGGAAAAACTGAACCTTGACCCA	200429

FQ482131.2	1001	GATCTTACTTAACTCAAAATGGATCACATCCCTAAATATAAAACCCAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200430	GATCTTACTTAACTCAAAATGGATCACATCCCTAAATATAAAACCCAAAA	200479

FQ482131.2	1051	TTTTAACACTCCTTGGAGATAGCATAGGAGTAAATCTAGATGATGTTGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200480	TTTTAACACTCCTTGGAGATAGCATAGGAGTAAATCTAGATGATGTTGGG	200529

FQ482131.2	1101	AATGGTAATAACTTTCTAGATACAAAACTAAGAGCAGAATTTATAAGAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200530	AATGGTAATAACTTTCTAGATACAAAACTAAGAGCAGAATTTATAAGAGA	200579

FQ482131.2	1151	AATAATTGATAAGCTGACTTCTTTAAAGTTTTCTCCTCTGCAAAGGCACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200580	AATAATTGATAAGCTGACTTCTTTAAAGTTTTCTCCTCTGCAAAGGCACT	200629

FQ482131.2	1201	ATCAAGAGAATTAGAAAATATGCCATGGACTGACAAAACATGTTTGCAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200630	ATCAAGAGAATTAGAAAATATGCCATGGACTGACAAAACATGTTTGCAAA	200679

FQ482131.2	1251	GACACTGTAATCTAAAACATACAAAGAACTCTTAAAATTCAATAATAAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200680	GACACTGTAATCTAAAACATACAAAGAACTCTTAAAATTCAATAATAAGA	200729

FQ482131.2	1301	AAACCAGTTAAAAAATGAGCTAAAGACCTTAACAGATACCTCACCAAAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200730	AAACCAGTTAAAAAATGAGCTAAAGACCTTAACAGATACCTCACCAAAGA	200779

FQ482131.2	1351	AGATATATGGATGGAAAATAAACATTTAAAAAGATGTTCAACATCATATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200780	AGATATATGGATGGAAAATAAACATTTAAAAAGATGTTCAACATCATATG	200829

FQ482131.2	1401	TCATCAAGGAATACGAATTAAAAATTAGATACCACTGCATACCTATTTAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200830	TCATCAAGGAATACGAATTAAAAATTAGATACCACTGCATACCTATTTAG	200879

FQ482131.2	1451	AATGGTCAAAAATCAGAATAGTGACAATACCAAATGCTGACAGGGATATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200880	AATGGTCAAAAATCAGAATAGTGACAATACCAAATGCTGACAGGGATATG	200929

FQ482131.2	1501	AAGCGACTTTGCTGAAGGAAATGCAAAATGGTATAGCCATTTTGGAAGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200930	AAGCGACTTTGCTGAAGGAAATGCAAAATGGTATAGCCATTTTGGAAGAC	200979

FQ482131.2	1551	AATTTGGCTGTTTCTTGTAAGTCTAAACATACTCTTAACATACAATTTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	200980	AATTTGGCTGTTTCTTGTAAGTCTAAACATACTCTTAACATACAATTTGT	201029

FQ482131.2	1601	CAGTCATGCTCCTTGGTATATACTCAGGGGATTCAAAATGTATGTCTACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201030	CAGTCATGCTCCTTGGTATATACTCAGGGGATTCAAAATGTATGTCTACA	201079

FQ482131.2	1651	CTAAAACCTGCACACAGATTTTCACAGCAGCTTCAACTGTAATCATCAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201080	CTAAAACCTGCACACAGATTTTCACAGCAGCTTCAACTGTAATCATCAAA	201129

FQ482131.2	1701	ACTTGGAAGCAAACAAGATGTTCTTCAAACTGTGGTACATCCAGGCAATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201130	ACTTGGAAGCAAACAAGATGTTCTTCAAACTGTGGTACATCCAGGCAATG	201179

FQ482131.2	1751	GTATATCATTCAACACTAAAAAGAAATGAGCTAAAAATCATGAAAAGACA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201180	GTATATCATTCAACACTAAAAAGAAATGAGCTAAAAATCATGAAAAGACA	201229

FQ482131.2	1801	GAGAGGAAACTTAAATGCATATTACTAAATAAAAGAAGCCAATCTGAAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201230	GAGAGGAAACTTAAATGCATATTACTAAATAAAAGAAGCCAATCTGAAAA	201279

FQ482131.2	1851	AGCTATATACTGTATAGTGAAGTGAAGTCACTCAGTCGTGTCCAACTCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201280	AGCTATATACTGTATAGTGAAGTGAAGTCACTCAGTCGTGTCCAACTCTT	201329

FQ482131.2	1901	TGCAACTCCATGACCTGTATAACCTGCCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201330	TGCAACTCCATGACCTGTATAACCTGCCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATT	201379

FQ482131.2	1951	TTCCAGGCAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAGGGGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482120.8	201380	TTCCAGGCAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAGGGGATC	201429

Overview

Query
FQ482131.2 - 81927 bps
Hit
FQ482120.8 - 201429 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link