<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482109.2	1	GCAGTGAAAATTGAAATGTGAATTAAAACATCTTTGTCTGACAGTATCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191595	GCAGTGAAAATTGAAATGTGAATTAAAACATCTTTGTCTGACAGTATCCT	191644

FQ482109.2	51	GAAACTGCTGAGGTTTGTGTACATGATCTTTCTGTGAATGTTAAAAGATA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191645	GAAACTGCTGAGGTTTGTGTACATGATCTTTCTGTGAATGTTAAAAGATA	191694

FQ482109.2	101	AATACTATTATCAGTCCACATTCAAGTCCAATGTTGCTATAGTCCAATGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191695	AATACTATTATCAGTCCACATTCAAGTCCAATGTTGCTATAGTCCAATGT	191744

FQ482109.2	151	TACTGACCCATGACTGTAGCAACTCACTGATTCTTCTTTGATCATACTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191745	TACTGACCCATGACTGTAGCAACTCACTGATTCTTCTTTGATCATACTAT	191794

FQ482109.2	201	ATTGATTTTGTCAAGTTGAAGTTTAAAGATCAATGTTTCTTCTCTCTCTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191795	ATTGATTTTGTCAAGTTGAAGTTTAAAGATCAATGTTTCTTCTCTCTCTC	191844

FQ482109.2	251	TAGTGAATATCATAATGATTTTCCTTTATACTAACCTAAAACTTCTGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191845	TAGTGAATATCATAATGATTTTCCTTTATACTAACCTAAAACTTCTGAGA	191894

FQ482109.2	301	TTTTTTAAAGACTAGCAGCAGACTGTGAATGTTCAAATAGATAAAATTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191895	TTTTTTAAAGACTAGCAGCAGACTGTGAATGTTCAAATAGATAAAATTCC	191944

FQ482109.2	351	AAAGTACATGTTTACTATTGACTTAACTTCTAAGACAAGCAGAAGCTAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191945	AAAGTACATGTTTACTATTGACTTAACTTCTAAGACAAGCAGAAGCTAAA	191994

FQ482109.2	401	TTTCATCAGCTCAATTTATACAAACATGAAAGTAGATTCCATATTTGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	191995	TTTCATCAGCTCAATTTATACAAACATGAAAGTAGATTCCATATTTGAAT	192044

FQ482109.2	451	TCAAGAGAAGAACAGATAGAAAAATGCCGGAAGCATTACTGGGTGGATGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192045	TCAAGAGAAGAACAGATAGAAAAATGCCGGAAGCATTACTGGGTGGATGC	192094

FQ482109.2	501	TGTGGAGACTTTCACAGATAGTCCAGACGTTTTCTCTTCTAAGTCTGACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192095	TGTGGAGACTTTCACAGATAGTCCAGACGTTTTCTCTTCTAAGTCTGACT	192144

FQ482109.2	551	GTTATTTGTATTTTTATTACTGGTCCAGTCTCAGTCTAAAGGTTTACACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192145	GTTATTTGTATTTTTATTACTGGTCCAGTCTCAGTCTAAAGGTTTACACC	192194

FQ482109.2	601	AGAATTTTGTGGCTCTTCAAGGTTGCAGTCTCATTGCTAAACTGCATTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192195	AGAATTTTGTGGCTCTTCAAGGTTGCAGTCTCATTGCTAAACTGCATTTA	192244

FQ482109.2	651	GGGTCTTGTGCGAAATCATGAAATTGAAACAGTACTTGTTAGACCATAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192245	GGGTCTTGTGCGAAATCATGAAATTGAAACAGTACTTGTTAGACCATAAA	192294

FQ482109.2	701	ATAATTTGATATGTTAATGGAGATTCAGTTTTGGGTTAAAGGAACTTTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192295	ATAATTTGATATGTTAATGGAGATTCAGTTTTGGGTTAAAGGAACTTTGA	192344

FQ482109.2	751	TTTTTTTATTCTGCTCCCAGATTCTACATCAGTTTCTTTTTAATGACCTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192345	TTTTTTTATTCTGCTCCCAGATTCTACATCAGTTTCTTTTTAATGACCTA	192394

FQ482109.2	801	AATGCACTTACTAACCATTTTCACCTATTGAAGTCTTACGGCATTCAAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192395	AATGCACTTACTAACCATTTTCACCTATTGAAGTCTTACGGCATTCAAAC	192444

FQ482109.2	851	AGGACATTTTCAGTGATTTTTCTAGCTGAAAGTGATCATGCAATCCTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192445	AGGACATTTTCAGTGATTTTTCTAGCTGAAAGTGATCATGCAATCCTCTG	192494

FQ482109.2	901	AACATTCCATAGAACTTCACTTGTAACTTTCACTTGTAACCCTTCTTGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192495	AACATTCCATAGAACTTCACTTGTAACTTTCACTTGTAACCCTTCTTGCT	192544

FQ482109.2	951	GGTGTTTTAGTTACAGGTGTATGTAGTGTCTTCCTCAATGAACTAAATTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192545	GGTGTTTTAGTTACAGGTGTATGTAGTGTCTTCCTCAATGAACTAAATTT	192594

FQ482109.2	1001	CTTAAAGGCAAGGAGAGTGTCTTGGTCATGTGTATACTAACCACAGGAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192595	CTTAAAGGCAAGGAGAGTGTCTTGGTCATGTGTATACTAACCACAGGAGA	192644

FQ482109.2	1051	GTATTGTGCCTTTCAATTTTTTTTAAGGCTCACTAAATGCTTATTGAATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192645	GTATTGTGCCTTTCAATTTTTTTTAAGGCTCACTAAATGCTTATTGAATG	192694

FQ482109.2	1101	CAAATAAGCTCCTCTGGTGTATTAATGCTAAGATACAAACTCATTCATTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192695	CAAATAAGCTCCTCTGGTGTATTAATGCTAAGATACAAACTCATTCATTC	192744

FQ482109.2	1151	ATTCACGGAAGAGGTTGTTGTTTAGTCACTAAGTCATGTCTGACTCTTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192745	ATTCACGGAAGAGGTTGTTGTTTAGTCACTAAGTCATGTCTGACTCTTTT	192794

FQ482109.2	1201	GTGGCCCCATGGACTGTAGCCCGATAGTCTCCTCTGTCCATGGGATTTCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192795	GTGGCCCCATGGACTGTAGCCCGATAGTCTCCTCTGTCCATGGGATTTCT	192844

FQ482109.2	1251	TACGTAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCCAGGGGATCTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192845	TACGTAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCCAGGGGATCTTC	192894

FQ482109.2	1301	CCAACCCGGGAATTGAACCTGCATCTCCTGCATTGGCAGGTCACTTCTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192895	CCAACCCGGGAATTGAACCTGCATCTCCTGCATTGGCAGGTCACTTCTTT	192944

FQ482109.2	1351	TACCAAGGAAGCCCCACGGAAGAGGCTACATCTAGGAAAAATGAAAAGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192945	TACCAAGGAAGCCCCACGGAAGAGGCTACATCTAGGAAAAATGAAAAGTA	192994

FQ482109.2	1401	TATAAGGCAGAGAATTTGTGTGTGTAAAAAAACTAGTTGGGAGCAGAGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	192995	TATAAGGCAGAGAATTTGTGTGTGTAAAAAAACTAGTTGGGAGCAGAGTG	193044

FQ482109.2	1451	GAGATATTTGAGTGGGTTAAAGTAGGGCATCCTAATTGTCTTCCCCTTCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193045	GAGATATTTGAGTGGGTTAAAGTAGGGCATCCTAATTGTCTTCCCCTTCC	193094

FQ482109.2	1501	AGGTTGTGGCCACTGTCTACCTATCCTGAACAATGCTTTTACAACTTAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193095	AGGTTGTGGCCACTGTCTACCTATCCTGAACAATGCTTTTACAACTTAGA	193144

FQ482109.2	1551	TCATGTTACTCTTTAAAAACCTCCAACGGTTTCCCATCATTGTACTTGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193145	TCATGTTACTCTTTAAAAACCTCCAACGGTTTCCCATCATTGTACTTGGG	193194

FQ482109.2	1601	TGAACTCCAGAGTCCTTACCCTGCCTTAAAACCCCCTACTGAACTTTCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193195	TGAACTCCAGAGTCCTTACCCTGCCTTAAAACCCCCTACTGAACTTTCCA	193244

FQ482109.2	1651	TCTGTGTCACCTACTGCCTCTTGTCCACTTGCTCTATCCACATTAGACAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193245	TCTGTGTCACCTACTGCCTCTTGTCCACTTGCTCTATCCACATTAGACAT	193294

FQ482109.2	1701	CTTTTTGTTCCTCAAACATGCCAGTCTCACTTTCATTCCAACTTTTCTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193295	CTTTTTGTTCCTCAAACATGCCAGTCTCACTTTCATTCCAACTTTTCTAG	193344

FQ482109.2	1751	GTCTTCCCTCTTCCTACAATACTTTCTCTTGAGTTTCTCTTGGCTGGTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193345	GTCTTCCCTCTTCCTACAATACTTTCTCTTGAGTTTCTCTTGGCTGGTTT	193394

FQ482109.2	1801	CTTCCTGTAATAATAGCAAGTACAGAGGCTCAGAGGTGGTCGCTTACTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193395	CTTCCTGTAATAATAGCAAGTACAGAGGCTCAGAGGTGGTCGCTTACTTG	193444

FQ482109.2	1851	ATCTGCTTAAAAAAGAGCAGAGTTGACCACTGTGGCTGGAGCAGGGTAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193445	ATCTGCTTAAAAAAGAGCAGAGTTGACCACTGTGGCTGGAGCAGGGTAAG	193494

FQ482109.2	1901	CAATGGAAAGAAGAGAGAAATAAAGACTGAGCCAAGGTCAGTGGCAACAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193495	CAATGGAAAGAAGAGAGAAATAAAGACTGAGCCAAGGTCAGTGGCAACAT	193544

FQ482109.2	1951	TGATTGGGACTTGACTGCATTTTTAAGAACTTTGGATTTTATTTTAGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482119.6	193545	TGATTGGGACTTGACTGCATTTTTAAGAACTTTGGATTTTATTTTAGATC	193594

Overview

Query
FQ482109.2 - 108029 bps
Hit
FQ482119.6 - 193594 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link