<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
FQ482109.2 1 GCAGTGAAAATTGAAATGTGAATTAAAACATCTTTGTCTGACAGTATCCT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191595 GCAGTGAAAATTGAAATGTGAATTAAAACATCTTTGTCTGACAGTATCCT 191644 FQ482109.2 51 GAAACTGCTGAGGTTTGTGTACATGATCTTTCTGTGAATGTTAAAAGATA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191645 GAAACTGCTGAGGTTTGTGTACATGATCTTTCTGTGAATGTTAAAAGATA 191694 FQ482109.2 101 AATACTATTATCAGTCCACATTCAAGTCCAATGTTGCTATAGTCCAATGT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191695 AATACTATTATCAGTCCACATTCAAGTCCAATGTTGCTATAGTCCAATGT 191744 FQ482109.2 151 TACTGACCCATGACTGTAGCAACTCACTGATTCTTCTTTGATCATACTAT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191745 TACTGACCCATGACTGTAGCAACTCACTGATTCTTCTTTGATCATACTAT 191794 FQ482109.2 201 ATTGATTTTGTCAAGTTGAAGTTTAAAGATCAATGTTTCTTCTCTCTCTC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191795 ATTGATTTTGTCAAGTTGAAGTTTAAAGATCAATGTTTCTTCTCTCTCTC 191844 FQ482109.2 251 TAGTGAATATCATAATGATTTTCCTTTATACTAACCTAAAACTTCTGAGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191845 TAGTGAATATCATAATGATTTTCCTTTATACTAACCTAAAACTTCTGAGA 191894 FQ482109.2 301 TTTTTTAAAGACTAGCAGCAGACTGTGAATGTTCAAATAGATAAAATTCC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191895 TTTTTTAAAGACTAGCAGCAGACTGTGAATGTTCAAATAGATAAAATTCC 191944 FQ482109.2 351 AAAGTACATGTTTACTATTGACTTAACTTCTAAGACAAGCAGAAGCTAAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191945 AAAGTACATGTTTACTATTGACTTAACTTCTAAGACAAGCAGAAGCTAAA 191994 FQ482109.2 401 TTTCATCAGCTCAATTTATACAAACATGAAAGTAGATTCCATATTTGAAT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 191995 TTTCATCAGCTCAATTTATACAAACATGAAAGTAGATTCCATATTTGAAT 192044 FQ482109.2 451 TCAAGAGAAGAACAGATAGAAAAATGCCGGAAGCATTACTGGGTGGATGC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192045 TCAAGAGAAGAACAGATAGAAAAATGCCGGAAGCATTACTGGGTGGATGC 192094 FQ482109.2 501 TGTGGAGACTTTCACAGATAGTCCAGACGTTTTCTCTTCTAAGTCTGACT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192095 TGTGGAGACTTTCACAGATAGTCCAGACGTTTTCTCTTCTAAGTCTGACT 192144 FQ482109.2 551 GTTATTTGTATTTTTATTACTGGTCCAGTCTCAGTCTAAAGGTTTACACC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192145 GTTATTTGTATTTTTATTACTGGTCCAGTCTCAGTCTAAAGGTTTACACC 192194 FQ482109.2 601 AGAATTTTGTGGCTCTTCAAGGTTGCAGTCTCATTGCTAAACTGCATTTA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192195 AGAATTTTGTGGCTCTTCAAGGTTGCAGTCTCATTGCTAAACTGCATTTA 192244 FQ482109.2 651 GGGTCTTGTGCGAAATCATGAAATTGAAACAGTACTTGTTAGACCATAAA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192245 GGGTCTTGTGCGAAATCATGAAATTGAAACAGTACTTGTTAGACCATAAA 192294 FQ482109.2 701 ATAATTTGATATGTTAATGGAGATTCAGTTTTGGGTTAAAGGAACTTTGA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192295 ATAATTTGATATGTTAATGGAGATTCAGTTTTGGGTTAAAGGAACTTTGA 192344 FQ482109.2 751 TTTTTTTATTCTGCTCCCAGATTCTACATCAGTTTCTTTTTAATGACCTA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192345 TTTTTTTATTCTGCTCCCAGATTCTACATCAGTTTCTTTTTAATGACCTA 192394 FQ482109.2 801 AATGCACTTACTAACCATTTTCACCTATTGAAGTCTTACGGCATTCAAAC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192395 AATGCACTTACTAACCATTTTCACCTATTGAAGTCTTACGGCATTCAAAC 192444 FQ482109.2 851 AGGACATTTTCAGTGATTTTTCTAGCTGAAAGTGATCATGCAATCCTCTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192445 AGGACATTTTCAGTGATTTTTCTAGCTGAAAGTGATCATGCAATCCTCTG 192494 FQ482109.2 901 AACATTCCATAGAACTTCACTTGTAACTTTCACTTGTAACCCTTCTTGCT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192495 AACATTCCATAGAACTTCACTTGTAACTTTCACTTGTAACCCTTCTTGCT 192544 FQ482109.2 951 GGTGTTTTAGTTACAGGTGTATGTAGTGTCTTCCTCAATGAACTAAATTT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192545 GGTGTTTTAGTTACAGGTGTATGTAGTGTCTTCCTCAATGAACTAAATTT 192594 FQ482109.2 1001 CTTAAAGGCAAGGAGAGTGTCTTGGTCATGTGTATACTAACCACAGGAGA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192595 CTTAAAGGCAAGGAGAGTGTCTTGGTCATGTGTATACTAACCACAGGAGA 192644 FQ482109.2 1051 GTATTGTGCCTTTCAATTTTTTTTAAGGCTCACTAAATGCTTATTGAATG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192645 GTATTGTGCCTTTCAATTTTTTTTAAGGCTCACTAAATGCTTATTGAATG 192694 FQ482109.2 1101 CAAATAAGCTCCTCTGGTGTATTAATGCTAAGATACAAACTCATTCATTC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192695 CAAATAAGCTCCTCTGGTGTATTAATGCTAAGATACAAACTCATTCATTC 192744 FQ482109.2 1151 ATTCACGGAAGAGGTTGTTGTTTAGTCACTAAGTCATGTCTGACTCTTTT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192745 ATTCACGGAAGAGGTTGTTGTTTAGTCACTAAGTCATGTCTGACTCTTTT 192794 FQ482109.2 1201 GTGGCCCCATGGACTGTAGCCCGATAGTCTCCTCTGTCCATGGGATTTCT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192795 GTGGCCCCATGGACTGTAGCCCGATAGTCTCCTCTGTCCATGGGATTTCT 192844 FQ482109.2 1251 TACGTAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCCAGGGGATCTTC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192845 TACGTAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCCAGGGGATCTTC 192894 FQ482109.2 1301 CCAACCCGGGAATTGAACCTGCATCTCCTGCATTGGCAGGTCACTTCTTT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192895 CCAACCCGGGAATTGAACCTGCATCTCCTGCATTGGCAGGTCACTTCTTT 192944 FQ482109.2 1351 TACCAAGGAAGCCCCACGGAAGAGGCTACATCTAGGAAAAATGAAAAGTA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192945 TACCAAGGAAGCCCCACGGAAGAGGCTACATCTAGGAAAAATGAAAAGTA 192994 FQ482109.2 1401 TATAAGGCAGAGAATTTGTGTGTGTAAAAAAACTAGTTGGGAGCAGAGTG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 192995 TATAAGGCAGAGAATTTGTGTGTGTAAAAAAACTAGTTGGGAGCAGAGTG 193044 FQ482109.2 1451 GAGATATTTGAGTGGGTTAAAGTAGGGCATCCTAATTGTCTTCCCCTTCC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193045 GAGATATTTGAGTGGGTTAAAGTAGGGCATCCTAATTGTCTTCCCCTTCC 193094 FQ482109.2 1501 AGGTTGTGGCCACTGTCTACCTATCCTGAACAATGCTTTTACAACTTAGA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193095 AGGTTGTGGCCACTGTCTACCTATCCTGAACAATGCTTTTACAACTTAGA 193144 FQ482109.2 1551 TCATGTTACTCTTTAAAAACCTCCAACGGTTTCCCATCATTGTACTTGGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193145 TCATGTTACTCTTTAAAAACCTCCAACGGTTTCCCATCATTGTACTTGGG 193194 FQ482109.2 1601 TGAACTCCAGAGTCCTTACCCTGCCTTAAAACCCCCTACTGAACTTTCCA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193195 TGAACTCCAGAGTCCTTACCCTGCCTTAAAACCCCCTACTGAACTTTCCA 193244 FQ482109.2 1651 TCTGTGTCACCTACTGCCTCTTGTCCACTTGCTCTATCCACATTAGACAT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193245 TCTGTGTCACCTACTGCCTCTTGTCCACTTGCTCTATCCACATTAGACAT 193294 FQ482109.2 1701 CTTTTTGTTCCTCAAACATGCCAGTCTCACTTTCATTCCAACTTTTCTAG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193295 CTTTTTGTTCCTCAAACATGCCAGTCTCACTTTCATTCCAACTTTTCTAG 193344 FQ482109.2 1751 GTCTTCCCTCTTCCTACAATACTTTCTCTTGAGTTTCTCTTGGCTGGTTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193345 GTCTTCCCTCTTCCTACAATACTTTCTCTTGAGTTTCTCTTGGCTGGTTT 193394 FQ482109.2 1801 CTTCCTGTAATAATAGCAAGTACAGAGGCTCAGAGGTGGTCGCTTACTTG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193395 CTTCCTGTAATAATAGCAAGTACAGAGGCTCAGAGGTGGTCGCTTACTTG 193444 FQ482109.2 1851 ATCTGCTTAAAAAAGAGCAGAGTTGACCACTGTGGCTGGAGCAGGGTAAG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193445 ATCTGCTTAAAAAAGAGCAGAGTTGACCACTGTGGCTGGAGCAGGGTAAG 193494 FQ482109.2 1901 CAATGGAAAGAAGAGAGAAATAAAGACTGAGCCAAGGTCAGTGGCAACAT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193495 CAATGGAAAGAAGAGAGAAATAAAGACTGAGCCAAGGTCAGTGGCAACAT 193544 FQ482109.2 1951 TGATTGGGACTTGACTGCATTTTTAAGAACTTTGGATTTTATTTTAGATC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FQ482119.6 193545 TGATTGGGACTTGACTGCATTTTTAAGAACTTTGGATTTTATTTTAGATC 193594
