<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482125.7	1	TTACATATGTGTGGGCTTTTTATTTTCATAGATTTCAACCAAAATAATGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	85975	TTACATATGTGTGGGCTTTTTATTTTCATAGATTTCAACCAAAATAATGG	86024

FQ482125.7	51	ATTTAACATAGAAGCAAACGTAAACATCCATTGATCTTCTAATGAGAGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86025	ATTTAACATAGAAGCAAACGTAAACATCCATTGATCTTCTAATGAGAGTG	86074

FQ482125.7	101	ACAAGAAGAGACTTGCAAAAATATAAAAATGTAAAAAGCTCCACTGTTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86075	ACAAGAAGAGACTTGCAAAAATATAAAAATGTAAAAAGCTCCACTGTTCC	86124

FQ482125.7	151	CACTGTAGTGTTTATTTGGGGAAATAGTTATATTCCATGTTAACTGTGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86125	CACTGTAGTGTTTATTTGGGGAAATAGTTATATTCCATGTTAACTGTGTG	86174

FQ482125.7	201	AGTTATTAATATTATTCTAAATAAATGAATAAGCAAATTCTAACTCTATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86175	AGTTATTAATATTATTCTAAATAAATGAATAAGCAAATTCTAACTCTATT	86224

FQ482125.7	251	ATTTCTACTATGCAAAATATCGATGGAAGTAACTATAAACAAAATTACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86225	ATTTCTACTATGCAAAATATCGATGGAAGTAACTATAAACAAAATTACCC	86274

FQ482125.7	301	TTGGGGTCCACACTAATTTGTTGGATTGTATAAATATTCTGACCAAAAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86275	TTGGGGTCCACACTAATTTGTTGGATTGTATAAATATTCTGACCAAAAAT	86324

FQ482125.7	351	GTTTTGAAAATCGCTGCCAGAAGCCCTTGGGCCAGGACTCAGGGAATGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86325	GTTTTGAAAATCGCTGCCAGAAGCCCTTGGGCCAGGACTCAGGGAATGTG	86374

FQ482125.7	401	ACAAAAAGCTCTCGGTGCAGGAGAGGAGGGATCAGGACAACGTCCCAGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86375	ACAAAAAGCTCTCGGTGCAGGAGAGGAGGGATCAGGACAACGTCCCAGGT	86424

FQ482125.7	451	TCCCCGGCGGGCAAGGGTCTCAGGGTCTCAGAATCAAGGGCCGTGTCTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86425	TCCCCGGCGGGCAAGGGTCTCAGGGTCTCAGAATCAAGGGCCGTGTCTGG	86474

FQ482125.7	501	GGCCGGGACGCTCCATCTTGGGGCTTCCGTCTCCAAGAGTTTCACTTTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86475	GGCCGGGACGCTCCATCTTGGGGCTTCCGTCTCCAAGAGTTTCACTTTCT	86524

FQ482125.7	551	CTCTCACAATCTGTGTCCGGCCCTCCTATCTGGACACTTGTGACGCGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86525	CTCTCACAATCTGTGTCCGGCCCTCCTATCTGGACACTTGTGACGCGGCC	86574

FQ482125.7	601	CCAGGACTCACTCCATTGGGTGTCCGATTTCTAGCTGCCAGTATTCATCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86575	CCAGGACTCACTCCATTGGGTGTCCGATTTCTAGCTGCCAGTATTCATCT	86624

FQ482125.7	651	CTGCCGTTCCAGGTCACAAAGTGTTCATCCACCCGCTGAACTCGCTTCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86625	CTGCCGTTCCAGGTCACAAAGTGTTCATCCACCCGCTGAACTCGCTTCTC	86674

FQ482125.7	701	CCCAGACCCCGGAAATGCGGGTCATGGGGTCGAGAACCCTCGTCCTGCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86675	CCCAGACCCCGGAAATGCGGGTCATGGGGTCGAGAACCCTCGTCCTGCTG	86724

FQ482125.7	751	CTGCCGGGTGCGCTGGTCCTGACCGAGACCTGGGCGGGTGAGTGCGGGGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86725	CTGCCGGGTGCGCTGGTCCTGACCGAGACCTGGGCGGGTGAGTGCGGGGT	86774

FQ482125.7	801	CTGGAGGGAACGGGCTCTGCGGGGAGGTGGGTGGGCAGGACCTCCAGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86775	CTGGAGGGAACGGGCTCTGCGGGGAGGTGGGTGGGCAGGACCTCCAGGGA	86824

FQ482125.7	851	AGGAGCAAGCCCGCCGCCCTCGCCCAGATCTGCCCCCTCCCCCTGTCCCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86825	AGGAGCAAGCCCGCCGCCCTCGCCCAGATCTGCCCCCTCCCCCTGTCCCG	86874

FQ482125.7	901	TCCTGTCTCTCCCTTGCTTCCCGCCCCCTCTTCTCTGCCCCCCAAGTCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86875	TCCTGTCTCTCCCTTGCTTCCCGCCCCCTCTTCTCTGCCCCCCAAGTCCT	86924

FQ482125.7	951	GGTCCTTCTCCGACCTTTTCCGTCTCAGGAGCCCGTGGCCCTTCCCTCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86925	GGTCCTTCTCCGACCTTTTCCGTCTCAGGAGCCCGTGGCCCTTCCCTCCT	86974

FQ482125.7	1001	CCCAGTTCCGTCACCTCAGGCCCGGGACCCGAACCAGGAGGATGTCGGGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	86975	CCCAGTTCCGTCACCTCAGGCCCGGGACCCGAACCAGGAGGATGTCGGGC	87024

FQ482125.7	1051	CGGGTCTCACCCCTCCCCGCCCCCAGGCTCCCACTCCCTGAGGTATTTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87025	CGGGTCTCACCCCTCCCCGCCCCCAGGCTCCCACTCCCTGAGGTATTTCT	87074

FQ482125.7	1101	ACACCGCCGTGTCCCGACCCGGCCTCGAGGAGCCCCGCTTTATCATCGTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87075	ACACCGCCGTGTCCCGACCCGGCCTCGAGGAGCCCCGCTTTATCATCGTC	87124

FQ482125.7	1151	GGCTACGTGGACGACATGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCCCGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87125	GGCTACGTGGACGACATGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCCCGGA	87174

FQ482125.7	1201	TCCGAGGATGGAGCCGCGGGCACGGTGGGTGGAGCAGGAGCGGCCGGAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87175	TCCGAGGATGGAGCCGCGGGCACGGTGGGTGGAGCAGGAGCGGCCGGAGT	87224

FQ482125.7	1251	ATTGGGATCAGGCGACGCAGAGAACTAAGGACACCAAACAGACTTTCCGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87225	ATTGGGATCAGGCGACGCAGAGAACTAAGGACACCAAACAGACTTTCCGA	87274

FQ482125.7	1301	GCGAACCTGAACAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87275	GCGAACCTGAACAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGTGA	87324

FQ482125.7	1351	GCGACGCGGGCCCGGGTCCAGGTCACGACCCCCATCCCCAGGGACCGGCG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87325	GCGACGCGGGCCCGGGTCCAGGTCACGACCCCCATCCCCAGGGACCGGCG	87374

FQ482125.7	1401	GGGTCGCCCCGAGTCTGCGGTTCCGAGGGTCACCCCAACACTTTGAGACC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87375	GGGTCGCCCCGAGTCTGCGGTTCCGAGGGTCACCCCAACACTTTGAGACC	87424

FQ482125.7	1451	CGCCCCTCCCCCCGACCCGGGAGGAGCTCGCGGGGACTTGACCCGGTTTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87425	CGCCCCTCCCCCCGACCCGGGAGGAGCTCGCGGGGACTTGACCCGGTTTC	87474

FQ482125.7	1501	ATTTCAGTTTGGGTTTAATCCCTGCGGATGGTCGGGACGGGTCAGGGTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87475	ATTTCAGTTTGGGTTTAATCCCTGCGGATGGTCGGGACGGGTCAGGGTCT	87524

FQ482125.7	1551	CACACCCTCCAGGAGATGTACGGCTGCGACGTGGGGTCGGACGGGGGTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87525	CACACCCTCCAGGAGATGTACGGCTGCGACGTGGGGTCGGACGGGGGTTT	87574

FQ482125.7	1601	CCTGCGCGGTATGATCAGTTCGCCTACGATGGCAGAGATTACATCGCTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87575	CCTGCGCGGTATGATCAGTTCGCCTACGATGGCAGAGATTACATCGCTCT	87624

FQ482125.7	1651	GAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCGGCGGACCCGGCGGCTCAGGTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87625	GAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCGGCGGACCCGGCGGCTCAGGTCT	87674

FQ482125.7	1701	CCAAACGCAAGATTGAGCAGAGTGGTGCTGCGAAGGGCGAGAGGAACTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87675	CCAAACGCAAGATTGAGCAGAGTGGTGCTGCGAAGGGCGAGAGGAACTAC	87724

FQ482125.7	1751	CTGAACCGCGAGTGCGTGGAGGGGCTCCGCAGATACCTAGAGACCGGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87725	CTGAACCGCGAGTGCGTGGAGGGGCTCCGCAGATACCTAGAGACCGGAAA	87774

FQ482125.7	1801	GGACACGCTGCTGCGCACAGGTACGAAGGGCGCAGCGCCTCCCTGATCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87775	GGACACGCTGCTGCGCACAGGTACGAAGGGCGCAGCGCCTCCCTGATCTC	87824

FQ482125.7	1851	CCCTCAGGCTGGAGCTGGCTTCCCACGAGGAGAAGAAAGTGGTGTCCCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87825	CCCTCAGGCTGGAGCTGGCTTCCCACGAGGAGAAGAAAGTGGTGTCCCTG	87874

FQ482125.7	1901	TGGGAACAGCGCCCCAGGTTCTTGTCAGGAGAGGGAGGAATGCGCCCAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87875	TGGGAACAGCGCCCCAGGTTCTTGTCAGGAGAGGGAGGAATGCGCCCAGA	87924

FQ482125.7	1951	TTTTCAGTGAAAAAGTTGGCTTAAAGCTCAACATTCAGAAAACGAAGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482118.7	87925	TTTTCAGTGAAAAAGTTGGCTTAAAGCTCAACATTCAGAAAACGAAGATC	87974

Overview

Query
FQ482125.7 - 112930 bps
Hit
FQ482118.7 - 87974 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link