<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482128.2	49276	GATCCACTCGTGCTTCTTTCCTTCTTGTGTGGCAGTTTTCTTTAAAAAAT	49325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1	GATCCACTCGTGCTTCTTTCCTTCTTGTGTGGCAGTTTTCTTTAAAAAAT	50

FQ482128.2	49326	AAAATTGGTATATAGTTACATTAGTTTCAGATACATGCTGTAATAATTGG	49375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	51	AAAATTGGTATATAGTTACATTAGTTTCAGATACATGCTGTAATAATTGG	100

FQ482128.2	49376	ATATCTATACATACTAGAAAGCGATTACTGCCGCAAGTCCTTTTTGGCTA	49425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	101	ATATCTATACATACTAGAAAGCGATTACTGCCGCAAGTCCTTTTTGGCTA	150

FQ482128.2	49426	ATCACCGTTCTCTGTTAGTTACCAGTCCCTGTATCTATAACAGATTGATG	49475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	151	ATCACCGTTCTCTGTTAGTTACCAGTCCCTGTATCTATAACAGATTGATG	200

FQ482128.2	49476	CTCTAAGGCCAGCTACTTGCATGTTTTTAATATGTATTTCTTTTATTTTA	49525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	201	CTCTAAGGCCAGCTACTTGCATGTTTTTAATATGTATTTCTTTTATTTTA	250

FQ482128.2	49526	TGAAGTTTTAGGATTTTGCTGATGCAGAGGATGTCCTACCTGGTGTTGGT	49575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	251	TGAAGTTTTAGGATTTTGCTGATGCAGAGGATGTCCTACCTGGTGTTGGT	300

FQ482128.2	49576	CAGATCCTTGGAACTTCACATGTTTCCTGCATGAACCTGTGTGAGCAGCT	49625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	301	CAGATCCTTGGAACTTCACATGTTTCCTGCATGAACCTGTGTGAGCAGCT	350

FQ482128.2	49626	GTCAAACTCCGGTGGAGAGGGGATGGGCTGATTAGAAGTTTGGGGACCAA	49675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	351	GTCAAACTCCGGTGGAGAGGGGATGGGCTGATTAGAAGTTTGGGGACCAA	400

FQ482128.2	49676	AGTCAATTAGGTGATCTTTATTAGAAAGATTGCAATAAAATGTTTTAAAG	49725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	401	AGTCAATTAGGTGATCTTTATTAGAAAGATTGCAATAAAATGTTTTAAAG	450

FQ482128.2	49726	CAAATAAAAATAGGTGGGTCTGAGCAAAAACAAGAGGGTACAGAAAGGTT	49775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	451	CAAATAAAAATAGGTGGGTCTGAGCAAAAACAAGAGGGTACAGAAAGGTT	500

FQ482128.2	49776	TAGGGATGTGAAAGTGAATGAGCATCAGTTGACATCTAGCTGTATGTACC	49825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	501	TAGGGATGTGAAAGTGAATGAGCATCAGTTGACATCTAGCTGTATGTACC	550

FQ482128.2	49826	TCTTTCCAGCTACATTACAAAAAACTAAAATTAGGTTTGTCACATATTGA	49875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	551	TCTTTCCAGCTACATTACAAAAAACTAAAATTAGGTTTGTCACATATTGA	600

FQ482128.2	49876	CACCAATGTTGAGGATTTCTAGATGGAGTACCATAATATTTTTAATATTT	49925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	601	CACCAATGTTGAGGATTTCTAGATGGAGTACCATAATATTTTTAATATTT	650

FQ482128.2	49926	GAGGTTTTAATTATACTATTAACACAATTATTGAGTTTTCTTTTTGATAA	49975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	651	GAGGTTTTAATTATACTATTAACACAATTATTGAGTTTTCTTTTTGATAA	700

FQ482128.2	49976	ATTGGTGAAAACATAGGTTGTCTGGGTATATTCTTAGAAGAAGAATAATC	50025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	701	ATTGGTGAAAACATAGGTTGTCTGGGTATATTCTTAGAAGAAGAATAATC	750

FQ482128.2	50026	CTGGTGGTTGTCAGGAGCTGGGAATGAGGAAGTGAAGAAGTATGTAATGG	50075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	751	CTGGTGGTTGTCAGGAGCTGGGAATGAGGAAGTGAAGAAGTATGTAATGG	800

FQ482128.2	50076	GTATTGTTTCACTTTTACAAGGTGAAAGAGCTCATGGGGATGGATGGTGG	50125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	801	GTATTGTTTCACTTTTACAAGGTGAAAGAGCTCATGGGGATGGATGGTGG	850

FQ482128.2	50126	TGATAATTGCTCAGTGTTATGAACATAGTTATTACCACTGAACTGTATGC	50175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	851	TGATAATTGCTCAGTGTTATGAACATAGTTATTACCACTGAACTGTATGC	900

FQ482128.2	50176	CTAGAAGTGGTAAAGATTTGGGGCGGGATAAATTGGAAGATTGGAATTGA	50225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	901	CTAGAAGTGGTAAAGATTTGGGGCGGGATAAATTGGAAGATTGGAATTGA	950

FQ482128.2	50226	TACATACACACCACTAAGTATAAAATAGATAACTAATAAAGACCTGTATA	50275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	951	TACATACACACCACTAAGTATAAAATAGATAACTAATAAAGACCTGTATA	1000

FQ482128.2	50276	GCACAGGAAATTCAGTGCTCCGTAATAGTCTATAAGAGAAGAGGATCCCA	50325
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1001	GCACAGGAAATTCAGTGCTCCGTAATAGTCTATAAGAGAAGAGGATCCCA	1050

FQ482128.2	50326	AAGTGTATGTATAACTGATTCAGTTTACTGTATACTTGAAACTAACACAT	50375
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1051	AAGTGTATGTATAACTGATTCAGTTTACTGTATACTTGAAACTAACACAT	1100

FQ482128.2	50376	TGTAAATCAACTATACCCCAATAAATTTTTTTAATGGTAAAAACATGCTA	50425
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1101	TGTAAATCAACTATACCCCAATAAATTTTTTTAATGGTAAAAACATGCTA	1150

FQ482128.2	50426	ATTTTATGTGTATTTCACCACAGTTTAAAAAATTGGAGAAAAAGTACCCT	50475
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1151	ATTTTATGTGTATTTCACCACAGTTTAAAAAATTGGAGAAAAAGTACCCT	1200

FQ482128.2	50476	TTGCTCCTTTCTGTCACTGTCAGAAAGGTGATTCCCCACTAGCATGTATA	50525
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1201	TTGCTCCTTTCTGTCACTGTCAGAAAGGTGATTCCCCACTAGCATGTATA	1250

FQ482128.2	50526	GAGTATGCTGTGCTAAAGCTGTATTGTACATGTGTTTGGTAGGGGGCATT	50575
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1251	GAGTATGCTGTGCTAAAGCTGTATTGTACATGTGTTTGGTAGGGGGCATT	1300

FQ482128.2	50576	TGACTTTCTTTCAAGCTATAAACCTTGGGCTTCCCTGGTGGCTCAGATGG	50625
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1301	TGACTTTCTTTCAAGCTATAAACCTTGGGCTTCCCTGGTGGCTCAGATGG	1350

FQ482128.2	50626	TAAATCCTCTGTCTGCAATGCAGGAGACCCGGGTTCGATCCCTGGGTTGG	50675
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1351	TAAATCCTCTGTCTGCAATGCAGGAGACCCGGGTTCGATCCCTGGGTTGG	1400

FQ482128.2	50676	GAAGATCTGGAGAAGGAAATGGCAGCCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAA	50725
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1401	GAAGATCTGGAGAAGGAAATGGCAGCCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAA	1450

FQ482128.2	50726	AATCCCATTGATCACGGAGCCTGGTAGGCTACCGTCCATGGGGTCGCAAA	50775
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1451	AATCCCATTGATCACGGAGCCTGGTAGGCTACCGTCCATGGGGTCGCAAA	1500

FQ482128.2	50776	GAGTCAGACATGACTGAGCGACTTCACTTTCTTTCACTTTCAAGCTATAA	50825
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1501	GAGTCAGACATGACTGAGCGACTTCACTTTCTTTCACTTTCAAGCTATAA	1550

FQ482128.2	50826	ACCAGTCTGATTCCCTGTACCCATTTGAAGTTGTGTTCCAAAATACTTCT	50875
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1551	ACCAGTCTGATTCCCTGTACCCATTTGAAGTTGTGTTCCAAAATACTTCT	1600

FQ482128.2	50876	CCAAAAGTAGAATTTCAGAGTTAAAGGATCTGGGCTTTTAAAAGTAATAG	50925
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1601	CCAAAAGTAGAATTTCAGAGTTAAAGGATCTGGGCTTTTAAAAGTAATAG	1650

FQ482128.2	50926	TGTATGTTCCATAATGTTGTCCCACTTTATTTTTTAATGTTAGTTTACTT	50975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1651	TGTATGTTCCATAATGTTGTCCCACTTTATTTTTTAATGTTAGTTTACTT	1700

FQ482128.2	50976	AGTTGGCTGTGCCAGGTCTTAGTTGAAGCATCCAGGGTCTTTAGTTGTGG	51025
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1701	AGTTGGCTGTGCCAGGTCTTAGTTGAAGCATCCAGGGTCTTTAGTTGTGG	1750

FQ482128.2	51026	CATGTGGGATCTAGTTCCCTGACCACAGGGATTGAACCTGTGTCCCCAGC	51075
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1751	CATGTGGGATCTAGTTCCCTGACCACAGGGATTGAACCTGTGTCCCCAGC	1800

FQ482128.2	51076	GTTAAGCGTGTGGAGTCTTAGCCACTGGACCACTAGGGGAGCCTCGTCCC	51125
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1801	GTTAAGCGTGTGGAGTCTTAGCCACTGGACCACTAGGGGAGCCTCGTCCC	1850

FQ482128.2	51126	AGTTTATACTCCAAATGACAGTCTCCTTCAGACTACCTATTTGTCTATGT	51175
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1851	AGTTTATACTCCAAATGACAGTCTCCTTCAGACTACCTATTTGTCTATGT	1900

FQ482128.2	51176	CTACCATCACTGTTCTAGCTGGAGTGTACCAATTTCTGTATCTAATAAGT	51225
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1901	CTACCATCACTGTTCTAGCTGGAGTGTACCAATTTCTGTATCTAATAAGT	1950

FQ482128.2	51226	CATTTTTTTAAAATTGCACATCTTTTGCATTTATTTTTCTGTGGAACATT	51275
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482114.7	1951	CATTTTTTTAAAATTGCACATCTTTTGCATTTATTTTTCTGTGGAACATT	2000

FQ482128.2	51276	T	51276
			|
FQ482114.7	2001	T	2001

Overview

Query
FQ482128.2 - 51276 bps
Hit
FQ482114.7 - 153702 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link