<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FO681479.1	1	TGAAGAAGGACTCGTTATCTCTTCTAGCTATTCTTTGAAACTCTGCGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	5811	TGAAGAAGGACTCGTTATCTCTTCTAGCTATTCTTTGAAACTCTGCGTTT	5860

FO681479.1	51	AATTGGATGTACTTTTCCCACTCTCCCTTGCTTTTCCTTTCTTTTCATTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	5861	AATTGGATGTACTTTTCCCACTCTCCCTTGCTTTTCCTTTCTTTTCATTC	5910

FO681479.1	101	TTCTGCTTTTTGTAAAGCTTCCTCAGATAATCACTTTGGCTTCTTGCTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	5911	TTCTGCTTTTTGTAAAGCTTCCTCAGATAATCACTTTGGCTTCTTGCTTT	5960

FO681479.1	151	TCTTTTCTTGGGAGGGTGCTTTTGTTCACTGCCTCCTGTACAGTGTTACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	5961	TCTTTTCTTGGGAGGGTGCTTTTGTTCACTGCCTCCTGTACAGTGTTACA	6010

FO681479.1	201	GACCTCTGTCCATAGTTCTTCTGGCACACTGTTAACTAGATCTAGTTCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6011	GACCTCTGTCCATAGTTCTTCTGGCACACTGTTAACTAGATCTAGTTCCT	6060

FO681479.1	251	TGAGTCTGTTCATTACCTCTACTGTGAATTCATATGGGATTTAAGTCATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6061	TGAGTCTGTTCATTACCTCTACTGTGAATTCATATGGGATTTAAGTCATA	6110

FO681479.1	301	CCTGGCTGGCCTAGTGTTTTTCCCAGTTTTCTTTAGATGAACCCCGAATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6111	CCTGGCTGGCCTAGTGTTTTTCCCAGTTTTCTTTAGATGAACCCCGAATT	6160

FO681479.1	351	TTGCTATGAGAAGCTGATGATCTGAGCCATAGTAAGCTCCAGGTCTTGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6161	TTGCTATGAGAAGCTGATGATCTGAGCCATAGTAAGCTCCAGGTCTTGTT	6210

FO681479.1	401	TTTGCTGACTGTGTACAGCTTCTCCATCTTTGGCTACAAAGAATGTAATC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6211	TTTGCTGACTGTGTACAGCTTCTCCATCTTTGGCTACAAAGAATGTAATC	6260

FO681479.1	451	AATTTGATTTCAGTATTGACCATTTCATGCAAAGATGGGCTCGATAAAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6261	AATTTGATTTCAGTATTGACCATTTCATGCAAAGATGGGCTCGATAAAGG	6310

FO681479.1	501	ACAGAAATGGTATGGACCTAATAGAAGCAGAAGATATTAAGAAGAGGTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6311	ACAGAAATGGTATGGACCTAATAGAAGCAGAAGATATTAAGAAGAGGTGG	6360

FO681479.1	551	CAAGAATATACAGAAGAACTGTACAAAAAAGATCTTAATGACCCAGATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6361	CAAGAATATACAGAAGAACTGTACAAAAAAGATCTTAATGACCCAGATAA	6410

FO681479.1	601	TCCCGATGGTGTTGTCACTCACCTAGAGCCAGACATCCTGGAATGTGAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6411	TCCCGATGGTGTTGTCACTCACCTAGAGCCAGACATCCTGGAATGTGAAG	6460

FO681479.1	651	TCAAGTGGGCCTTAGAAAGCATCACTACGAACAAAGCTAGTGGAGGTGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6461	TCAAGTGGGCCTTAGAAAGCATCACTACGAACAAAGCTAGTGGAGGTGAT	6510

FO681479.1	701	GGAATTCCAGTTGCGCTATTTCAAATTCTGAAAGATGATGCTGTGAAAGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6511	GGAATTCCAGTTGCGCTATTTCAAATTCTGAAAGATGATGCTGTGAAAGT	6560

FO681479.1	751	GCTGCACTCAATATGCCAGCAAATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACAGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6561	GCTGCACTCAATATGCCAGCAAATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACAGG	6610

FO681479.1	801	ACTGGAAAATGTTAGTTTTTGTTTCAATCCCAAAGAAAGGCAATACCAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6611	ACTGGAAAATGTTAGTTTTTGTTTCAATCCCAAAGAAAGGCAATACCAAA	6660

FO681479.1	851	GAATGCTCAGACTACCACACAATTGCACTCATCTCACATGCTAGTTTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6661	GAATGCTCAGACTACCACACAATTGCACTCATCTCACATGCTAGTTTTTT	6710

FO681479.1	901	TTGGAGAAGGAAATGGCAAACCACTCCAGTGTTCTTGTCTGGAGAATCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6711	TTGGAGAAGGAAATGGCAAACCACTCCAGTGTTCTTGTCTGGAGAATCCC	6760

FO681479.1	951	AGGGATGGGGGAGCCTTGGTGGGCTGCTGTCTATGGGGTCACACAGAGTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6761	AGGGATGGGGGAGCCTTGGTGGGCTGCTGTCTATGGGGTCACACAGAGTC	6810

FO681479.1	1001	GGACACCAGTGAAGTGACTTAGCAGTAGCAGCACATGCTAGTAAAGTAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6811	GGACACCAGTGAAGTGACTTAGCAGTAGCAGCACATGCTAGTAAAGTAAT	6860

FO681479.1	1051	GCTCAAAATTCTCCAAGCCAGGCTTCAGCAATACGTCAACCGTGAACTTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6861	GCTCAAAATTCTCCAAGCCAGGCTTCAGCAATACGTCAACCGTGAACTTG	6910

FO681479.1	1101	CAGATGTTTAAGCTGGTTTTAGAAAAGGCAGAGGAACCAGAAATCAAATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6911	CAGATGTTTAAGCTGGTTTTAGAAAAGGCAGAGGAACCAGAAATCAAATT	6960

FO681479.1	1151	GCCAACATTTGCCAGATCATCGAAAAAGCAAGGGAGTTCCAGAAAAACAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	6961	GCCAACATTTGCCAGATCATCGAAAAAGCAAGGGAGTTCCAGAAAAACAT	7010

FO681479.1	1201	CTATTTCTGCTTTATTGACTACAGTGAAGCCTTTGACTGTGTGGATCACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7011	CTATTTCTGCTTTATTGACTACAGTGAAGCCTTTGACTGTGTGGATCACA	7060

FO681479.1	1251	ATAAACTGGGGAAAATTCTTAAACAGATGGGAATACCAGACCATCTGACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7061	ATAAACTGGGGAAAATTCTTAAACAGATGGGAATACCAGACCATCTGACC	7110

FO681479.1	1301	TGCCTCTTGAGAAACCTGTATGCAGGTCAGGAAGCAACAGTTATGGAACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7111	TGCCTCTTGAGAAACCTGTATGCAGGTCAGGAAGCAACAGTTATGGAACA	7160

FO681479.1	1351	ACAGACTGGTTCTAAATACGAAAAGGAATACGTCAAGGCTGTATATTGTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7161	ACAGACTGGTTCTAAATACGAAAAGGAATACGTCAAGGCTGTATATTGTC	7210

FO681479.1	1401	ACCCTACTTATTTAACTTATATGCAGAGTACATCATGAGAAACACTGGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7211	ACCCTACTTATTTAACTTATATGCAGAGTACATCATGAGAAACACTGGGC	7260

FO681479.1	1451	TGGAAGAAGCACAAGCTGGAATCAAGATTGCTGGGAAAAATATCAATAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7261	TGGAAGAAGCACAAGCTGGAATCAAGATTGCTGGGAAAAATATCAATAAC	7310

FO681479.1	1501	CTCAGATATGCAGATGACACCATCCTTATGGCAGAAAGTGAAGAGGAACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7311	CTCAGATATGCAGATGACACCATCCTTATGGCAGAAAGTGAAGAGGAACT	7360

FO681479.1	1551	AAAAAGCCTCTTGATGAAAGTGAAAGAGGAGAATGAAAAAGTTGGCTTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7361	AAAAAGCCTCTTGATGAAAGTGAAAGAGGAGAATGAAAAAGTTGGCTTAA	7410

FO681479.1	1601	AGCTCAACATTCAGAAAACTAAGATCATGGCATCTGGTTCCATCATTTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7411	AGCTCAACATTCAGAAAACTAAGATCATGGCATCTGGTTCCATCATTTCA	7460

FO681479.1	1651	TGGGAAATAGATGGGGAAATAGGGGAAACAGTATCAGACTTTATTTTTGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7461	TGGGAAATAGATGGGGAAATAGGGGAAACAGTATCAGACTTTATTTTTGG	7510

FO681479.1	1701	GGGCTCCAAAATCACTGCAGATGGTAATTGCAGTTATAAAATTAAAAGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7511	GGGCTCCAAAATCACTGCAGATGGTAATTGCAGTTATAAAATTAAAAGAC	7560

FO681479.1	1751	GCTTACTCCTTGGAAGAAAAGTTATGACCAACCTACACAGCATGTTAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7561	GCTTACTCCTTGGAAGAAAAGTTATGACCAACCTACACAGCATGTTAAAA	7610

FO681479.1	1801	AGCAGAGACATTACTTTGCCAACAAAGGTCCATCTAGTCAAGGCTATGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7611	AGCAGAGACATTACTTTGCCAACAAAGGTCCATCTAGTCAAGGCTATGGT	7660

FO681479.1	1851	TTTTCCAGTGGTCATGTATGGATGTGAGAGTTGAACTGTGAAGAAAGCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7661	TTTTCCAGTGGTCATGTATGGATGTGAGAGTTGAACTGTGAAGAAAGCTG	7710

FO681479.1	1901	AGGGCTGAAGAATTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTGGAGAAGACTCTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7711	AGGGCTGAAGAATTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTGGAGAAGACTCTTG	7760

FO681479.1	1951	AGAGTCCCTTGGACTGCAAGGAGATCCAAACAGTACATCTTAAAGGAGAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482108.2	7761	AGAGTCCCTTGGACTGCAAGGAGATCCAAACAGTACATCTTAAAGGAGAT	7810

FO681479.1	2001	C	2001
			|
FQ482108.2	7811	C	7811

Overview

Query
FO681479.1 - 111494 bps
Hit
FQ482108.2 - 7811 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link