<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482122.2	1	GATCATTGTGTTTTCATTTTCATTTGCCTCCAGCTGTGTTTTAATTTCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128239	GATCATTGTGTTTTCATTTTCATTTGCCTCCAGCTGTGTTTTAATTTCCT	128288

FQ482122.2	51	CTAATTTCTCCAGTGACCCGTTAACAACAACTATGTTCTGAAGGCACCAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128289	CTAATTTCTCCAGTGACCCGTTAACAACAACTATGTTCTGAAGGCACCAG	128338

FQ482122.2	101	AGATATGCACAGAAAATTTTAGAAGTTGTTGTTGTTGTCCAGTCAGCTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128339	AGATATGCACAGAAAATTTTAGAAGTTGTTGTTGTTGTCCAGTCAGCTGC	128388

FQ482122.2	151	TCAGGCCTGCCCAGCTTTTTCGACTCTATGGACCACAGCATGCCAGGCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128389	TCAGGCCTGCCCAGCTTTTTCGACTCTATGGACCACAGCATGCCAGGCTC	128438

FQ482122.2	201	CTCTGTCTTTCACTATCTCCCCGAGTTTACTCAAACTCATGTCCATTGAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128439	CTCTGTCTTTCACTATCTCCCCGAGTTTACTCAAACTCATGTCCATTGAG	128488

FQ482122.2	251	TCGCTGATGCCATCTAACCACCTCATCCTTTATTTTCCCCTTTTCTCCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128489	TCGCTGATGCCATCTAACCACCTCATCCTTTATTTTCCCCTTTTCTCCTG	128538

FQ482122.2	301	CCCTCAGTCTTTCCCAGCATCAGGATCTTTTCCACTGAGTCAGCTTTTTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128539	CCCTCAGTCTTTCCCAGCATCAGGATCTTTTCCACTGAGTCAGCTTTTTG	128588

FQ482122.2	351	CATCAGATGGCCAAAGTATTGGAGCTTCAGCTTTAGCATCAGTCCTGCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128589	CATCAGATGGCCAAAGTATTGGAGCTTCAGCTTTAGCATCAGTCCTGCCA	128638

FQ482122.2	401	ATAAATATACAGGGTTGATTTCCTTTAGGATTGACTGGTTTGATCTCCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128639	ATAAATATACAGGGTTGATTTCCTTTAGGATTGACTGGTTTGATCTCCTT	128688

FQ482122.2	451	CCTGTCAAAGGGACGCTCAAGAGTTTCTCCAGCACCACAATTCAAAAGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128689	CCTGTCAAAGGGACGCTCAAGAGTTTCTCCAGCACCACAATTCAAAAGCA	128738

FQ482122.2	501	TCAATTCTTCAGTGCTCAGTCTTCTTTATCATCCAGCTTTCACATCTGTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128739	TCAATTCTTCAGTGCTCAGTCTTCTTTATCATCCAGCTTTCACATCTGTA	128788

FQ482122.2	551	CATGACTACTGGAAAAACCATAGCTTTGAGTATGCACTTTGTTGGCAAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128789	CATGACTACTGGAAAAACCATAGCTTTGAGTATGCACTTTGTTGGCAAAG	128838

FQ482122.2	601	TGATGTCTCTGCTTTTTAATACGCTGTCTAGGTTTGTTGTAGCTTTTCTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128839	TGATGTCTCTGCTTTTTAATACGCTGTCTAGGTTTGTTGTAGCTTTTCTT	128888

FQ482122.2	651	CCAAAGAGCAAGCGTCTTTTAATTTCATGACTGTAGTTATCATCCACAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128889	CCAAAGAGCAAGCGTCTTTTAATTTCATGACTGTAGTTATCATCCACAGT	128938

FQ482122.2	701	GAAAAGTTTTGGAGCCTGAGAAAATAAAATCTGCCACTGTTTGCCCATCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128939	GAAAAGTTTTGGAGCCTGAGAAAATAAAATCTGCCACTGTTTGCCCATCT	128988

FQ482122.2	751	ATTTGCCATGAAGTGATGGGACCAGAGGCCATGATCTTAGTTATTTTAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	128989	ATTTGCCATGAAGTGATGGGACCAGAGGCCATGATCTTAGTTATTTTAAT	129038

FQ482122.2	801	GTTGGATTTTAAGCCACCATTTTCACTGTCCTCTTTTACCTTCATCAAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129039	GTTGGATTTTAAGCCACCATTTTCACTGTCCTCTTTTACCTTCATCAAGA	129088

FQ482122.2	851	GGCTCTGTAGTTCCTCTTCTCTTTCTGCCATTAAAGTGGTATCATCTGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129089	GGCTCTGTAGTTCCTCTTCTCTTTCTGCCATTAAAGTGGTATCATCTGCA	129138

FQ482122.2	901	TATCTGAGATTGTTGATATTTCTCCCAGCAATCTTGATTCCACCTTGTGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129139	TATCTGAGATTGTTGATATTTCTCCCAGCAATCTTGATTCCACCTTGTGC	129188

FQ482122.2	951	TTCATCCAGCCCGGTATTTAGCATGAGGTACTCATCATATAAGTTAAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129189	TTCATCCAGCCCGGTATTTAGCATGAGGTACTCATCATATAAGTTAAATA	129238

FQ482122.2	1001	AACAGGGTGACAATATACAGCCTTGACTTACTTCCTTTCCCAGTTTTGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129239	AACAGGGTGACAATATACAGCCTTGACTTACTTCCTTTCCCAGTTTTGAA	129288

FQ482122.2	1051	CCAGTCCATTGTTCCATGTCTGGTTTTAACTGTTACTTCTTGACATGCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129289	CCAGTCCATTGTTCCATGTCTGGTTTTAACTGTTACTTCTTGACATGCAT	129338

FQ482122.2	1101	ACAGGCTTTTCAGAAAGCAGGTAAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129339	ACAGGCTTTTCAGAAAGCAGGTAAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTGA	129388

FQ482122.2	1151	AGAATTTTTCATAGTTTGGTGTGATCCACATAGTAAAAGGCTTTTGTATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129389	AGAATTTTTCATAGTTTGGTGTGATCCACATAGTAAAAGGCTTTTGTATA	129438

FQ482122.2	1201	GTCAGTGAAACAGATGTTTTTCTGGAATTCTCTTGCCTTTTCTATGATCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129439	GTCAGTGAAACAGATGTTTTTCTGGAATTCTCTTGCCTTTTCTATGATCC	129488

FQ482122.2	1251	ATTGGATGTTGGCAGTTTGATCTCTGGCTACTCTGCCTTTTCTGAATCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129489	ATTGGATGTTGGCAGTTTGATCTCTGGCTACTCTGCCTTTTCTGAATCTA	129538

FQ482122.2	1301	GCTTGTACACCTGGAAGTTCTCAGTTCACATACTGTTGAAGCCTAGCTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129539	GCTTGTACACCTGGAAGTTCTCAGTTCACATACTGTTGAAGCCTAGCTTG	129588

FQ482122.2	1351	AAGGATTTTTGAGCATTACCTTGAAATCGTGAAAGTGAAGTTGCTCAGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129589	AAGGATTTTTGAGCATTACCTTGAAATCGTGAAAGTGAAGTTGCTCAGTT	129638

FQ482122.2	1401	GTGTCTGACTCTTTGCGACCCCATAGACTGTAGCCTACCAGGCTCCTCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129639	GTGTCTGACTCTTTGCGACCCCATAGACTGTAGCCTACCAGGCTCCTCTG	129688

FQ482122.2	1451	TCCATGGGATTTTCCAGGCAATAGTACTGGAGTGGATTGCCATTTACCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129689	TCCATGGGATTTTCCAGGCAATAGTACTGGAGTGGATTGCCATTTACCTT	129738

FQ482122.2	1501	GCTAGCATGTAAAATGAGTACAATTGTATGGTAGTTTGAACATTCTAGCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129739	GCTAGCATGTAAAATGAGTACAATTGTATGGTAGTTTGAACATTCTAGCC	129788

FQ482122.2	1551	TTGACTTACTTTGGGATTGGAATGAAAACTGACTTTTTCCAGTCTCGTGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129789	TTGACTTACTTTGGGATTGGAATGAAAACTGACTTTTTCCAGTCTCGTGG	129838

FQ482122.2	1601	CCATTACTGAGTTTTCCAAATTTGCTTGCATATTGAGTGTGGCATTTTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129839	CCATTACTGAGTTTTCCAAATTTGCTTGCATATTGAGTGTGGCATTTTAA	129888

FQ482122.2	1651	CAACATTGTCTTTTAGGATTTGAAATAGCTCAGCTGGAATTCCATCATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129889	CAACATTGTCTTTTAGGATTTGAAATAGCTCAGCTGGAATTCCATCATCT	129938

FQ482122.2	1701	CCACTAGCTTTGGTTATAGTAATGCTTCCTGAGGCCCACTTGACTTCACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129939	CCACTAGCTTTGGTTATAGTAATGCTTCCTGAGGCCCACTTGACTTCACA	129988

FQ482122.2	1751	CTCTAGGATGTCTGGTTCTAGGTGAGTGACCACACCGTTATGGTTATCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	129989	CTCTAGGATGTCTGGTTCTAGGTGAGTGACCACACCGTTATGGTTATCTG	130038

FQ482122.2	1801	GGTCATTAAGACCTTTTTTGTATAGTTCTTCTGTGTCTTCTTACTATCTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	130039	GGTCATTAAGACCTTTTTTGTATAGTTCTTCTGTGTCTTCTTACTATCTC	130088

FQ482122.2	1851	TTCTTAATAGCTTCAGCTTCTGTTAGGTCCTTGCTGTTTCTGTCCTTTAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	130089	TTCTTAATAGCTTCAGCTTCTGTTAGGTCCTTGCTGTTTCTGTCCTTTAG	130138

FQ482122.2	1901	TGTGCCCGTCTTTGCATGAAATGTTCCCTGGGTATCTCCAGTTTTCTTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	130139	TGTGCCCGTCTTTGCATGAAATGTTCCCTGGGTATCTCCAGTTTTCTTGA	130188

FQ482122.2	1951	AGAGATCTCTAGTCTTTCCCATTCTACTGTTTTCCTCTATTTCTTTGCAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482107.2	130189	AGAGATCTCTAGTCTTTCCCATTCTACTGTTTTCCTCTATTTCTTTGCAT	130238

Overview

Query
FQ482122.2 - 51162 bps
Hit
FQ482107.2 - 130238 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link