<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482120.8	1	GATCAAATTGCCAACATCTTCTGGATCATGGAAAAAGCAAGAGAGTTCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214188	GATCAAATTGCCAACATCTTCTGGATCATGGAAAAAGCAAGAGAGTTCCA	214237

FQ482120.8	51	GAAAAACATCTATTTCTGCTTTATTGACTATACCAAAGCCTTTGACTGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214238	GAAAAACATCTATTTCTGCTTTATTGACTATACCAAAGCCTTTGACTGTG	214287

FQ482120.8	101	TGAATCACAATAAACTGTGGAAAATTCTTAAAGAGATGGGAATACCAGAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214288	TGAATCACAATAAACTGTGGAAAATTCTTAAAGAGATGGGAATACCAGAC	214337

FQ482120.8	151	CACCTGACCTGCCTCTTGAGAACTCTGAATGCAGGTCAGGAAGCAACAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214338	CACCTGACCTGCCTCTTGAGAACTCTGAATGCAGGTCAGGAAGCAACAGT	214387

FQ482120.8	201	TAGAACTGGACATGGAACAACAGACTGGTTCCAAATAGGAAAAGGAGTAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214388	TAGAACTGGACATGGAACAACAGACTGGTTCCAAATAGGAAAAGGAGTAC	214437

FQ482120.8	251	AAAGCTGTATATTGTCACCCTGCTTATTTTACTTATATGCATAGTACACC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214438	AAAGCTGTATATTGTCACCCTGCTTATTTTACTTATATGCATAGTACACC	214487

FQ482120.8	301	ATGAGAAACACTGGGCTGGAAGAAACACAAGCTGGAATCAAGATTGCTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214488	ATGAGAAACACTGGGCTGGAAGAAACACAAGCTGGAATCAAGATTGCTAG	214537

FQ482120.8	351	GAGAAATATCAAACACCTCAGATATGCAGATGACACCACCTTTATGGCAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214538	GAGAAATATCAAACACCTCAGATATGCAGATGACACCACCTTTATGGCAG	214587

FQ482120.8	401	AAAGTGAAGAGGAACTAAAAAGCTTCTTGATGAGGGTGAAAGTGGAGAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214588	AAAGTGAAGAGGAACTAAAAAGCTTCTTGATGAGGGTGAAAGTGGAGAGT	214637

FQ482120.8	451	GAAAAAGTTGGCTTAAAGCTCAACATTCAGAAAACGAAGATCATGGCATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214638	GAAAAAGTTGGCTTAAAGCTCAACATTCAGAAAACGAAGATCATGGCATC	214687

FQ482120.8	501	CGGTCCCATCACTTCATGGGAAATAGATGGGAAACAGTGGAAACAGTGTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214688	CGGTCCCATCACTTCATGGGAAATAGATGGGAAACAGTGGAAACAGTGTA	214737

FQ482120.8	551	AGACTTTATTTTGGGGGCCTCCAAAATCACTGCAGGTGCTGACTGAAGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214738	AGACTTTATTTTGGGGGCCTCCAAAATCACTGCAGGTGCTGACTGAAGCC	214787

FQ482120.8	601	ATGAAATAAAAAACACTTACTGCTTGTAAGGAAAGTTATGTCCAACCTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214788	ATGAAATAAAAAACACTTACTGCTTGTAAGGAAAGTTATGTCCAACCTAG	214837

FQ482120.8	651	ATAGCATATTCAAAAGCAGAGACATTACTTTGCCAACAACGGTCCGTCTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214838	ATAGCATATTCAAAAGCAGAGACATTACTTTGCCAACAACGGTCCGTCTA	214887

FQ482120.8	701	GTCAAGGCTCTGGTTTTTCCTATGGTCACGTATGGGTGTGAGAGTTGGAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214888	GTCAAGGCTCTGGTTTTTCCTATGGTCACGTATGGGTGTGAGAGTTGGAC	214937

FQ482120.8	751	TGTCAGAAGGCTGAGTGCCAAAGAACTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214938	TGTCAGAAGGCTGAGTGCCAAAGAACTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTG	214987

FQ482120.8	801	GAGAAAACTCTTGAGAGTCCCTTGGACTGCATGGAGATCCAACCAGTCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	214988	GAGAAAACTCTTGAGAGTCCCTTGGACTGCATGGAGATCCAACCAGTCCA	215037

FQ482120.8	851	TTCTGAAAGAGGTCCACCCTGGGATTTCTTTGGCTGGAATGATGCTGAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215038	TTCTGAAAGAGGTCCACCCTGGGATTTCTTTGGCTGGAATGATGCTGAAG	215087

FQ482120.8	901	TTGAAACTCCAGTACTTTGGCCACCTCATGCGAAGACTTGACTCATTGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215088	TTGAAACTCCAGTACTTTGGCCACCTCATGCGAAGACTTGACTCATTGAA	215137

FQ482120.8	951	AAAGACTCTGATGCTGGGAGGGATTGGGGGCAGGAGGAGAAGGGGACGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215138	AAAGACTCTGATGCTGGGAGGGATTGGGGGCAGGAGGAGAAGGGGACGAC	215187

FQ482120.8	1001	AGAGGATGAGTTGGCTGGATGGCATCACTGACTCGATGGACGTGAGTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215188	AGAGGATGAGTTGGCTGGATGGCATCACTGACTCGATGGACGTGAGTCTG	215237

FQ482120.8	1051	AGTGAACTCTGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCGTGCTGCGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215238	AGTGAACTCTGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCGTGCTGCGAT	215287

FQ482120.8	1101	TCATGAGGTCTCAAAGAGTCGGACACGACCGAGCGACTGAACTGAACTGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215288	TCATGAGGTCTCAAAGAGTCGGACACGACCGAGCGACTGAACTGAACTGA	215337

FQ482120.8	1151	ACTGAATAGGAAGAAATAATTTTTTTTTCAATTCAGAATGTTCACTCATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215338	ACTGAATAGGAAGAAATAATTTTTTTTTCAATTCAGAATGTTCACTCATT	215387

FQ482120.8	1201	TTTATCTTTTTCATTTTTTAAAGAAATTCTTTGCAAAAATTACATAAAAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215388	TTTATCTTTTTCATTTTTTAAAGAAATTCTTTGCAAAAATTACATAAAAC	215437

FQ482120.8	1251	CATGTCAGAAACATTTTTTATTTCAACTGTTCCAGATATTTTTCCTAAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215438	CATGTCAGAAACATTTTTTATTTCAACTGTTCCAGATATTTTTCCTAAGT	215487

FQ482120.8	1301	AAATTCATTGTTTGTTCTTTTATATTCATAACCAATATTCTCCTGAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215488	AAATTCATTGTTTGTTCTTTTATATTCATAACCAATATTCTCCTGAAAAA	215537

FQ482120.8	1351	GATAACTTTCAGCTGCTCTGTGTATATGTGTACATGTGTGTGTGTGTATA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215538	GATAACTTTCAGCTGCTCTGTGTATATGTGTACATGTGTGTGTGTGTATA	215587

FQ482120.8	1401	CTTGCATGAGTGTGTGTATTTTGTGTGTTGGCCTGCATCCTGGTACATGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215588	CTTGCATGAGTGTGTGTATTTTGTGTGTTGGCCTGCATCCTGGTACATGT	215637

FQ482120.8	1451	AACACTGCATATGAATTGTCATTAAATTTATATTTTCCTTCTTTTTCTGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215638	AACACTGCATATGAATTGTCATTAAATTTATATTTTCCTTCTTTTTCTGT	215687

FQ482120.8	1501	TCTCTAACACTTATATGGACCTTTTCACTTTATTTTTCTGATCAGGGTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215688	TCTCTAACACTTATATGGACCTTTTCACTTTATTTTTCTGATCAGGGTTT	215737

FQ482120.8	1551	GCATTTTGGCAAATTTCTCTGACAACATTTATACTCCAATATGCTTCTAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215738	GCATTTTGGCAAATTTCTCTGACAACATTTATACTCCAATATGCTTCTAA	215787

FQ482120.8	1601	ATGACTGCTTTCTCACAGTCTTTCATATTCCTTTAATCTGTACACCATCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215788	ATGACTGCTTTCTCACAGTCTTTCATATTCCTTTAATCTGTACACCATCT	215837

FQ482120.8	1651	TTTGGCATACCCTACCCCTCAATGTCTGTTATTTTGCTTCATAAGCATCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215838	TTTGGCATACCCTACCCCTCAATGTCTGTTATTTTGCTTCATAAGCATCA	215887

FQ482120.8	1701	TCTATATTAAGTTGTCTCTATTTCTGTTTTCCTACCCTCTACCCTCGTTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215888	TCTATATTAAGTTGTCTCTATTTCTGTTTTCCTACCCTCTACCCTCGTTC	215937

FQ482120.8	1751	TTTTCCACCCCTTTATTTTTTCAGAACAGATGTTCCTTCCCTATAAGCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215938	TTTTCCACCCCTTTATTTTTTCAGAACAGATGTTCCTTCCCTATAAGCAC	215987

FQ482120.8	1801	TGTCTTCTACTCTGTAGAGTCTTGCCAGAATTTCAGTGTGCATTTTATAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	215988	TGTCTTCTACTCTGTAGAGTCTTGCCAGAATTTCAGTGTGCATTTTATAA	216037

FQ482120.8	1851	AACAAAAAAGAAGAGACTGATGGGTACATGATTACACTCTGTACTTATTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	216038	AACAAAAAAGAAGAGACTGATGGGTACATGATTACACTCTGTACTTATTT	216087

FQ482120.8	1901	TCTGAAAACTAGCCATTGTTAGTACATCTACCATATATTCAAAGTTCAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	216088	TCTGAAAACTAGCCATTGTTAGTACATCTACCATATATTCAAAGTTCAAA	216137

FQ482120.8	1951	GGCCATTACACGCAGTTGATATCTCCCCAAACCTTAGGAGATAAGCTAAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482093.12	216138	GGCCATTACACGCAGTTGATATCTCCCCAAACCTTAGGAGATAAGCTAAC	216187

Overview

Query
FQ482120.8 - 201429 bps
Hit
FQ482093.12 - 216187 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link