<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482091.6	1	GATCCAGCGGATGTTGGCAATTTGATCTCTGGTTCCTCTGTCTTTTCTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64173	GATCCAGCGGATGTTGGCAATTTGATCTCTGGTTCCTCTGTCTTTTCTAA	64222

FQ482091.6	51	AACCAGCTTGAACATCTGCAAGTTCACGGTTGATGTATTGCTGAAGCCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64223	AACCAGCTTGAACATCTGCAAGTTCACGGTTGATGTATTGCTGAAGCCTG	64272

FQ482091.6	101	GCTTGGATCATTTTGAGCATTACTTTACTAGCATGTGAGATGAGTGCAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64273	GCTTGGATCATTTTGAGCATTACTTTACTAGCATGTGAGATGAGTGCAAT	64322

FQ482091.6	151	TGTGCGGTAGTTTGAGCATTCTTTGGCACTGCCTTTCTTTAGGATTGGAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64323	TGTGCGGTAGTTTGAGCATTCTTTGGCACTGCCTTTCTTTAGGATTGGAG	64372

FQ482091.6	201	TGAAAACTGACCTTTTCCAGTCCTGTGGCCACTGCTGAGTTTTCCAAATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64373	TGAAAACTGACCTTTTCCAGTCCTGTGGCCACTGCTGAGTTTTCCAAATT	64422

FQ482091.6	251	TGCTGGCATATTGAGTGAGCACTTTGATAGCATCATCTTTCAGGATTTGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64423	TGCTGGCATATTGAGTGAGCACTTTGATAGCATCATCTTTCAGGATTTGA	64472

FQ482091.6	301	CAGAGCTCAACTGGAATTCTATCATCTCCACTTGCTTTGTTCATAGTGAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64473	CAGAGCTCAACTGGAATTCTATCATCTCCACTTGCTTTGTTCATAGTGAT	64522

FQ482091.6	351	GCTTTCTAAGGCCCACTTGACTTCACATTGCAGGATGTCTGGCTCTAGGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64523	GCTTTCTAAGGCCCACTTGACTTCACATTGCAGGATGTCTGGCTCTAGGT	64572

FQ482091.6	401	GAGTGATCACACCATCGTGATTATCTTGGTCATGAAGTCATTTTTGTACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64573	GAGTGATCACACCATCGTGATTATCTTGGTCATGAAGTCATTTTTGTACA	64622

FQ482091.6	451	GATCTTCTGTGTATTCTTGCCACCTCTTCTTAATATCTTCTGCTTCTTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64623	GATCTTCTGTGTATTCTTGCCACCTCTTCTTAATATCTTCTGCTTCTTAA	64672

FQ482091.6	501	TATCTTCCTCAATAAAGGACATTTCTGTCCTTTATTGAGCCCATCTTTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64673	TATCTTCCTCAATAAAGGACATTTCTGTCCTTTATTGAGCCCATCTTTGC	64722

FQ482091.6	551	ATGAAATGTTCCCTTGGTATCTCTAATTTTCTTGAAGAGGTCTCTAGTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64723	ATGAAATGTTCCCTTGGTATCTCTAATTTTCTTGAAGAGGTCTCTAGTCT	64772

FQ482091.6	601	TTCCCACTCTGTTGTTTTCCTCTATTTCTTTGCATTGATCGCTGAGGAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64773	TTCCCACTCTGTTGTTTTCCTCTATTTCTTTGCATTGATCGCTGAGGAAG	64822

FQ482091.6	651	GCTTTCTTATCTCTTCTTGCTATTCTTTGGAACTCTGCATTCAGATACTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64823	GCTTTCTTATCTCTTCTTGCTATTCTTTGGAACTCTGCATTCAGATACTT	64872

FQ482091.6	701	ATATATTTCCTTTTCTCCTTTGCTTTTCGCTTCTCTTTTCACAGCTATTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64873	ATATATTTCCTTTTCTCCTTTGCTTTTCGCTTCTCTTTTCACAGCTATTT	64922

FQ482091.6	751	GTAAGGCCTCTCCAGACAGCCATTTTGCTTTTTTGCATTTCTTTTCCATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64923	GTAAGGCCTCTCCAGACAGCCATTTTGCTTTTTTGCATTTCTTTTCCATG	64972

FQ482091.6	801	GGGATGGTCTTGATGCCTGTCTCCTGTACAATGTCACGAACCTCCGTCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	64973	GGGATGGTCTTGATGCCTGTCTCCTGTACAATGTCACGAACCTCCGTCCA	65022

FQ482091.6	851	TAGTTCATCAGGCACTCTATGTATCAGATCTAGTCCTTTAAATCTATTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65023	TAGTTCATCAGGCACTCTATGTATCAGATCTAGTCCTTTAAATCTATTTC	65072

FQ482091.6	901	TCACTTCCACTGTATAATCATAAGGAATTTTATTCACTAACATTATTTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65073	TCACTTCCACTGTATAATCATAAGGAATTTTATTCACTAACATTATTTGT	65122

FQ482091.6	951	GTTTAAATTGAAGTATAGTTCATTTACAGTGTTGTGTTAGCTTCAGATGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65123	GTTTAAATTGAAGTATAGTTCATTTACAGTGTTGTGTTAGCTTCAGATGT	65172

FQ482091.6	1001	ACAGCAAGGTGATTCAATTATACATCTATGTATGTATGTATATATATGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65173	ACAGCAAGGTGATTCAATTATACATCTATGTATGTATGTATATATATGTA	65222

FQ482091.6	1051	TGTATCTATCTTAATGTCTGAGCCACCTTAAAGAGCCCATGTATCTAATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65223	TGTATCTATCTTAATGTCTGAGCCACCTTAAAGAGCCCATGTATCTAATT	65272

FQ482091.6	1101	ACCTATATCTATTCCTTTTCAAATTTTCTTCCCTTGTTCTTGCTATTGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65273	ACCTATATCTATTCCTTTTCAAATTTTCTTCCCTTGTTCTTGCTATTGTT	65322

FQ482091.6	1151	TAGTTGCTAAGTCATGTCCGACTCTTTTGCAACCTTATGGATTGTAGCCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65323	TAGTTGCTAAGTCATGTCCGACTCTTTTGCAACCTTATGGATTGTAGCCT	65372

FQ482091.6	1201	GCCAGGCTCCTCTGTTCATGGGATTTCCCAGGCAAGAATACTGGAATGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65373	GCCAGGCTCCTCTGTTCATGGGATTTCCCAGGCAAGAATACTGGAATGGG	65422

FQ482091.6	1251	TTGTCATTTCCTTCTCCAGGGGATCTTCCTGACCCAGGATCGAATCCAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65423	TTGTCATTTCCTTCTCCAGGGGATCTTCCTGACCCAGGATCGAATCCAGG	65472

FQ482091.6	1301	TTTCTTGAGTCTCCTGCATTGGCAGGCAGATTTTATAGTAGTGTGTATAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65473	TTTCTTGAGTCTCCTGCATTGGCAGGCAGATTTTATAGTAGTGTGTATAT	65522

FQ482091.6	1351	GTTAATCCCAAACTTCTAATTTTTCCCTCCTCCCCCTTCCCCGTTCTGTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65523	GTTAATCCCAAACTTCTAATTTTTCCCTCCTCCCCCTTCCCCGTTCTGTA	65572

FQ482091.6	1401	ACCATAAATTTGTTTTCTACATCTGTGGGTCTCTCTCTTTTTTTTTTAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65573	ACCATAAATTTGTTTTCTACATCTGTGGGTCTCTCTCTTTTTTTTTTAAG	65622

FQ482091.6	1451	TCTTTATTGAATTTGTTACAATATTGCTTCTGTGTTTTTTGTTTAGTTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65623	TCTTTATTGAATTTGTTACAATATTGCTTCTGTGTTTTTTGTTTAGTTTT	65672

FQ482091.6	1501	GGTTTTCAGGCCATGAGGCATGTGGGATCTTAGCTTCCTGACCAGGCATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65673	GGTTTTCAGGCCATGAGGCATGTGGGATCTTAGCTTCCTGACCAGGCATC	65722

FQ482091.6	1551	AAACCCACACTCTCTGAATTGGAAGGTGAAGTCTTAATCACCAGACCAGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65723	AAACCCACACTCTCTGAATTGGAAGGTGAAGTCTTAATCACCAGACCAGC	65772

FQ482091.6	1601	AGGTAGGTCCCTGTGGGTCTGTTTTGTAGATAAGTTCATTTTTATCACTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65773	AGGTAGGTCCCTGTGGGTCTGTTTTGTAGATAAGTTCATTTTTATCACTT	65822

FQ482091.6	1651	TTTTTTTTTTAGATTCCACATACAATTGATGTCACATGATATTTAACTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65823	TTTTTTTTTTAGATTCCACATACAATTGATGTCACATGATATTTAACTTT	65872

FQ482091.6	1701	CTCTATCTGGCTTACTTCACTTAGTGTGATAATCTCTAGATCCATCCATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65873	CTCTATCTGGCTTACTTCACTTAGTGTGATAATCTCTAGATCCATCCATG	65922

FQ482091.6	1751	TTACTGGAAATGAAATTATTTCATTCTTTTGTGTGGCTGAGTAATATTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65923	TTACTGGAAATGAAATTATTTCATTCTTTTGTGTGGCTGAGTAATATTCC	65972

FQ482091.6	1801	ATTGTATAAGTATACCACATCTTTTTTATCCATTTATCTGTCAATGTACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	65973	ATTGTATAAGTATACCACATCTTTTTTATCCATTTATCTGTCAATGTACA	66022

FQ482091.6	1851	CTTAGGTTGCTTCCACAACATGTCTATTGTAAATATAGTGCTGTGATGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	66023	CTTAGGTTGCTTCCACAACATGTCTATTGTAAATATAGTGCTGTGATGAA	66072

FQ482091.6	1901	CATTGGGGTACATGTATCTTTTTGAATTATGTGTTTCTCCAGATATGTGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	66073	CATTGGGGTACATGTATCTTTTTGAATTATGTGTTTCTCCAGATATGTGC	66122

FQ482091.6	1951	CCAGGAGTGGGATTGCTAGATCATATGGTAGCTCTACTTTTAGCTTTTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FQ482090.5	66123	CCAGGAGTGGGATTGCTAGATCATATGGTAGCTCTACTTTTAGCTTTTAA	66172

Overview

Query
FQ482091.6 - 231243 bps
Hit
FQ482090.5 - 66172 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link