<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1384 bps / non-identical: 50 bps

Full alignment

FP245411.8	1	CCGATTCAAATTGTCACTGGATTAGTAGGTTTGAAACTTTTCTGAGTATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34043	CCGATTCAAATTGTCACTGGATTAGTAGGTTTGAAACTTTTCTGAGTATA	34092

FP245411.8	51	TTGAGCACAATCTTAGTACTTTATTCTTGAAACATAAATAAATTTTTGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34093	TTGAGCACAATCTTAGTACTTTATTCTTGAAACATAAATAAATTTTTGAT	34142

FP245411.8	101	TAAAAGTAATGCACTCTAATTTTTAAAAGAATCTACTTGGTCAGGAGTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34143	TAAAAGTAATGCACTCTAATTTTTAAAAGAATCTACTTGGTCAGGAGTGC	34192

FP245411.8	151	ATTGCTTTGCTGGTGTCTGTGATCAGCTGGAGATGGTGGTGAACAGCCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34193	ATTGCTTTGCTGGTGTCTGTGATCAGCTGGAGATGGTGGTGAACAGCCTG	34242

FP245411.8	201	TTTGCATTTCTTGGAAGAAGATCTTTTATTCTGAGGCTCAACCCAGGTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34243	TTTGCATTTCTTGGAAGAAGATCTTTTATTCTGAGGCTCAACCCAGGTCT	34292

FP245411.8	251	CTGCCTTCCTTAGAGACTGAGGCCCATCCTTCAGTTTCCCTGATTCTGGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34293	CTGCCTTCCTTAGAGACTGAGGCCCATCCTTCAGTTTCCCTGATTCTGGA	34342

FP245411.8	301	AGAGCAGAGGGGTTGAATGGAGCAAAAGGTGAGCGAGTGGAAAGTAGGCA	350
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34343	AGAGCAGAGGGGTTGAATGGAGCAAAGGGTGAGCGAGTGGAAAGTAGGCA	34392

FP245411.8	351	TATGGTGGAGGCCTGGGGACAGTGACAATGATCGGAGAGGAGGGAGGGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34393	TATGGTGGAGGCCTGGGGACAGTGACAATGATCGGAGAGGAGGGAGGGAT	34442

FP245411.8	401	GTGGGAGGTGGGAGAGAAAGGGAGGCTGTGAGAAGGAAAGGGAGGGACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34443	GTGGGAGGTGGGAGAGAAAGGGAGGCTGTGAGAAGGAAAGGGAGGGACAG	34492

FP245411.8	451	AGACAGGTGCCCTGGGGGAGCAGGGAACCCAGAGGAGGCTCTGAACAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34493	AGACAGGTGCCCTGGGGGAGCAGGGAACCCAGAGGAGGCTCTGAACAGAG	34542

FP245411.8	501	GGGAAGGCACGGTGCAGGGGAGAGGGGAGGAGGGGGAGGCCGATGGGGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34543	GGGAAGGCACGGTGCAGGGGAGAGGGGAGGAGGGGGAGGCCGATGGGGCA	34592

FP245411.8	551	CTGGGCAGAGGGAGGAAGCCCTCACCTGGAGAATGGCCTGCAGCCTCCCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34593	CTGGGCAGAGGGAGGAAGCCCTCACCTGGAGAATGGCCTGCAGCCTCCCA	34642

FP245411.8	601	CTCAGGGCTTGGCTGTGCTCCTCTAGTCCATCCCAGGGCTGGAAGGGACA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34643	CTCAGGGCTTGGCTGTGCTCCTCTAGTCCATCCCAGGGCTGGAAGGGACA	34692

FP245411.8	651	TCCCTGGTGGTCCACGAAGGTGTCCCAGCAGTGCTTAAATTCTGAAAAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34693	TCCCTGGTGGTCCACGAAGGTGTCCCAGCAGTGCTTAAATTCTGAAAAGG	34742

FP245411.8	701	GACAGGGGAGATAAGTCACACTCCCGCTGTGGGATCGGGGTGGCACCAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34743	GACAGGGGAGATAAGTCACACTCCCGCTGTGGGATCGGGGTGGCACCAAG	34792

FP245411.8	751	GGCCCATGACTCTCAGGACAGACTTCCCACATCCTGGTTTCAGTCCCTCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34793	GGCCCATGACTCTCAGGACAGACTTCCCACATCCTGGTTTCAGTCCCTCC	34842

FP245411.8	801	TTTCCCTCTCCCTCCCCTAGGGACTTAGCTCCTTCATCGGGTACTCCTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34843	TTTCCCTCTCCCTCCCCTAGGGACTTAGCTCCTTCATCGGGTACTCCTTT	34892

FP245411.8	851	CCTATTGGAATCTGGGCCAGCCCAGTTCTCATTTTTTCTGGAAGCCCCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34893	CCTATTGGAATCTGGGCCAGCCCAGTTCTCATTTTTTCTGGAAGCCCCAA	34942

FP245411.8	901	GTTCTGCTTCCACTTCCAGCCACCCTCCCCACCCTCCCCAGGTCCACATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34943	GTTCTGCTTCCACTTCCAGCCACCCTCCCCACCCTCCCCAGGTCCACATC	34992

FP245411.8	951	TCCTGGCCTGGCCTCTCTCTTCCCATCGACCCCAAAGTCAGGTCCAGAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34993	TCCTGGCCTGGCCTCTCTCTTCCCATCGACCCCAAAGTCAGGTCCAGAGT	35042

FP245411.8	1001	GCAGCCATCGCCTCTGCAGGCAGAGGATCAAGGCCTTTCCCACAGGGATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35043	GCAGCCATCGCCTCTGCAGGCAGAGGATCAAGGCCTTTCCCACAGGGATG	35092

FP245411.8	1051	CCGACCCTCCCCACTTTCTAGTAACTTCCCGGGGCCCTCTCCTGCCCTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35093	CCGACCCTCCCCACTTTCTAGTAACTTCCCGGGGCCCTCTCCTGCCCTGG	35142

FP245411.8	1101	CTGACCCCATCCTACTCCAGGCTTCCATTCTCACCACTGTATGTCATTAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35143	CTGACCCCATCCTACTCCAGGCTTCCATTCTCACCACTGTATGTCATTAT	35192

FP245411.8	1151	TGAAATTTTGGCCCCAGCCTCGGCCAGGGTGCGCAGCCCCTCCTGACATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35193	TGAAATTTTGGCCCCAGCCTCGGCCAGGGTGCGCAGCCCCTCCTGACATC	35242

FP245411.8	1201	TTCCTTGATCATCATAGATGCGGGCAGCGAAGATGCACAGGCTCACGTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35243	TTCCTTGATCATCATAGATGCGGGCAGCGAAGATGCACAGGCTCACGTGT	35292

FP245411.8	1251	TTCTTATTTGAAATGAATTTAGCCATTTCCTGGGCACAGCTGAAGCAGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35293	TTCTTATTTGAAATGAATTTAGCCATTTCCTGGGCACAGCTGAAGCAGGG	35342

FP245411.8	1301	GCTCCAGGAGGTGAAGCAGGTAACCCTGTAGTCCTGGTGCAGGTCCAGCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35343	GCTCCAGGAGGTGAAGCAGGTAACCCTGTAGTCCTGGTGCAGGTCCAGCT	35392

FP245411.8	1351	TCCAAAAGGGAATCACGTCCAGGAAGCACAGCTC	1384
			||||||||||||||||||||||||||||||||||
FP245402.5	35393	TCCAAAAGGGAATCACGTCCAGGAAGCACAGCTC	35426

Compact alignment

skip 300 bps 100% identity alignment

FP245411.8	301	AGAGCAGAGGGGTTGAATGGAGCAAAAGGTGAGCGAGTGGAAAGTAGGCA	350
			|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
FP245402.5	34343	AGAGCAGAGGGGTTGAATGGAGCAAAGGGTGAGCGAGTGGAAAGTAGGCA	34392

skip 1034 bps 100% identity alignment

Overview

Query
FP245411.8 - 28497 bps
Hit
FP245402.5 - 35426 bps
Total alignments
26
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1384 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.931377138411384134043354261
287.89330532979910330123383239191
384.262504881429714784110465109531
488.7118329631953490115697159971
587.51793031397814280115694159971
687.2517729631953490-1764779441
787.211753022248222783115694159981
886.391692961398414279116152164451
985.811652962248922784110475107701
1086.816528631983483116152164391
1186.331602762427024545-1374440211
1284.621603151396614280-1764779581
1387.311582601317213431121177214361
1485.811552911637116661127382276771
1585.761542841537215655-114828151151
1685.21492751538115655127838281141
1783.851483211395114271-127379277001
1884.6414627950985376-127383276621
1984.431422832318923471113994142821
2082.7713729650945389-189211871
2185.7713725181518401113304135491
2282.41353071397514281-125408257141
2384.791342621856218823111779120411
2477.11344881612616613113062135501
2582.4813229250985389-1764779371
2681.671323151568015994-1764779571
Short-link