<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1682 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FP085394.7	1682	TATTACAGTGCAGCCTTATTACCTTTTAATCAAGAAGACATTTTAAAATA	1633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1	TATTACAGTGCAGCCTTATTACCTTTTAATCAAGAAGACATTTTAAAATA	50

C  FP085394.7	1632	AAAGTTAGTAAGAATGTCGTTTAATTTGATTTATTTTAACATTTCATTTA	1583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	51	AAAGTTAGTAAGAATGTCGTTTAATTTGATTTATTTTAACATTTCATTTA	100

C  FP085394.7	1582	TCAGGTACATGTGTTATAATAATGTAACATGATTTCGGCCATTTTTTTTT	1533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	101	TCAGGTACATGTGTTATAATAATGTAACATGATTTCGGCCATTTTTTTTT	150

C  FP085394.7	1532	GGTAAATTTTGTTCACAGAAGTTATTTTAAGACTATGATGTAAACACTTT	1483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	151	GGTAAATTTTGTTCACAGAAGTTATTTTAAGACTATGATGTAAACACTTT	200

C  FP085394.7	1482	AATATATTTCTGTGTGTATAAAATCTGTTTTTTGAATGCAACTTTTAGGG	1433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	201	AATATATTTCTGTGTGTATAAAATCTGTTTTTTGAATGCAACTTTTAGGG	250

C  FP085394.7	1432	TTGAGAGACAAAATTGATTCATTGAAGCATTGCGATTCTTCAACCATTCT	1383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	251	TTGAGAGACAAAATTGATTCATTGAAGCATTGCGATTCTTCAACCATTCT	300

C  FP085394.7	1382	GAATAATTCTCAACTTCAGAATCAGTTCTCTTCAAATTAAGCCTGTGTGG	1333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	301	GAATAATTCTCAACTTCAGAATCAGTTCTCTTCAAATTAAGCCTGTGTGG	350

C  FP085394.7	1332	GTGCATGCTCGAAACAATAATAAACATATAATACATATATATAATAATAT	1283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	351	GTGCATGCTCGAAACAATAATAAACATATAATACATATATATAATAATAT	400

C  FP085394.7	1282	ACATTAAAAATAATAAACCTATACTGCTAAACATGCGTCAATTGGACAAA	1233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	401	ACATTAAAAATAATAAACCTATACTGCTAAACATGCGTCAATTGGACAAA	450

C  FP085394.7	1232	GATGGATAAATGTAAGAATTTTATAGACGCTGCACATTTCATCCATTGTG	1183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	451	GATGGATAAATGTAAGAATTTTATAGACGCTGCACATTTCATCCATTGTG	500

C  FP085394.7	1182	CAACTAGCTTCAGTTTAGAATTGCTAAAGAATGTTATAAAAACAAAAACA	1133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	501	CAACTAGCTTCAGTTTAGAATTGCTAAAGAATGTTATAAAAACAAAAACA	550

C  FP085394.7	1132	ATTCCTAAATATATTTTTTTTCTTTGGCATTACTTAGTTTAAAAGGTTAT	1083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	551	ATTCCTAAATATATTTTTTTTCTTTGGCATTACTTAGTTTAAAAGGTTAT	600

C  FP085394.7	1082	TAACAAACTGCAAAAAAGAAAGCTCTTGCTTTTTTTATTTATATAAATTT	1033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	601	TAACAAACTGCAAAAAAGAAAGCTCTTGCTTTTTTTATTTATATAAATTT	650

C  FP085394.7	1032	AACAATGGTTTGTTCTTTATAATGACTCTTTGTGATTTGGCCCTTTACCG	983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	651	AACAATGGTTTGTTCTTTATAATGACTCTTTGTGATTTGGCCCTTTACCG	700

C  FP085394.7	982	TTTCATTCAGACCTTCTTCATGCTAAATATAGCTTTAAGAAAATAAAATG	933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	701	TTTCATTCAGACCTTCTTCATGCTAAATATAGCTTTAAGAAAATAAAATG	750

C  FP085394.7	932	TTTTGTAATGGCAGTGCTGTCAAACAGATTTCGATTATAATCAAAAGCAT	883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	751	TTTTGTAATGGCAGTGCTGTCAAACAGATTTCGATTATAATCAAAAGCAT	800

C  FP085394.7	882	TGAAACTCAAATTCTGATTCAAAGGTGAAGATCTGTCAGCGCCAACAGCC	833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	801	TGAAACTCAAATTCTGATTCAAAGGTGAAGATCTGTCAGCGCCAACAGCC	850

C  FP085394.7	832	TAGTGTTTCGTGTGTCCACATATAGCACAGAAGTACTCACAGTGACCCGA	783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	851	TAGTGTTTCGTGTGTCCACATATAGCACAGAAGTACTCACAGTGACCCGA	900

C  FP085394.7	782	GTTCGATTCCCAGCTTGAGGTCTTTTGCTGATCCTTTCCATTTCTCTGCT	733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	901	GTTCGATTCCCAGCTTGAGGTCTTTTGCTGATCCTTTCCATTTCTCTGCT	950

C  FP085394.7	732	CTCCTCACTTTCCTGTTTGTAATCTCTACAGCAGGGGTTTTCAAGCTGTG	683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	951	CTCCTCACTTTCCTGTTTGTAATCTCTACAGCAGGGGTTTTCAAGCTGTG	1000

C  FP085394.7	682	GGGCACCAGCACCTATTAAGGGGGCTGTGAGACATTTGAGGCGTGCACTC	633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1001	GGGCACCAGCACCTATTAAGGGGGCTGTGAGACATTTGAGGCGTGCACTC	1050

C  FP085394.7	632	AAGGAAATTATGATGACGATTTTAACGCGTTCACAAGAGTGAATCTGATT	583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1051	AAGGAAATTATGATGACGATTTTAACGCGTTCACAAGAGTGAATCTGATT	1100

C  FP085394.7	582	AATGTTAGCTGCACATCTAACTATCTGGCCCCTGTAGAGTTAATGCATTT	533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1101	AATGTTAGCTGCACATCTAACTATCTGGCCCCTGTAGAGTTAATGCATTT	1150

C  FP085394.7	532	GAGTAAAACATAAACAACAAAAAAAAGGACCTGGTGCTTTTTAAAATGAT	483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1151	GAGTAAAACATAAACAACAAAAAAAAGGACCTGGTGCTTTTTAAAATGAT	1200

C  FP085394.7	482	TGATGGCGAATGAAAGTAAAACTGGTGAGCCATCTGAATAAAATCAGCAG	433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1201	TGATGGCGAATGAAAGTAAAACTGGTGAGCCATCTGAATAAAATCAGCAG	1250

C  FP085394.7	432	GATGCCCTTTCAGATCTTTCACTAACTTGAGACACTACTGATTACGCTTA	383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1251	GATGCCCTTTCAGATCTTTCACTAACTTGAGACACTACTGATTACGCTTA	1300

C  FP085394.7	382	CATTTAATTTTTTCTATTACATCACTATTTGCCTTAATAGACAATAATAT	333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1301	CATTTAATTTTTTCTATTACATCACTATTTGCCTTAATAGACAATAATAT	1350

C  FP085394.7	332	AATTAAGTTGTTTACGTGAAGTGCTTTCATGTAAGAGTTTCATGTAATTT	283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1351	AATTAAGTTGTTTACGTGAAGTGCTTTCATGTAAGAGTTTCATGTAATTT	1400

C  FP085394.7	282	CAGTTCGGCAGTTTCACCTTCACTCATGAACATTCATGCTCCTGTGACAA	233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1401	CAGTTCGGCAGTTTCACCTTCACTCATGAACATTCATGCTCCTGTGACAA	1450

C  FP085394.7	232	ACCGGAGGATTATCCGCAAATAAGGTGTAAGATTTACACGTGTCCTAAAA	183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1451	ACCGGAGGATTATCCGCAAATAAGGTGTAAGATTTACACGTGTCCTAAAA	1500

C  FP085394.7	182	GGTTGAAAACCCCTGCTCTACAGTTCTATACATTTTTAAAGCTGAAAACC	133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1501	GGTTGAAAACCCCTGCTCTACAGTTCTATACATTTTTAAAGCTGAAAACC	1550

C  FP085394.7	132	CCCAAAAATAATTCTTTTAAAAATAAAAAAGTCAAGGTCAATTTGAAGAG	83
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1551	CCCAAAAATAATTCTTTTAAAAATAAAAAAGTCAAGGTCAATTTGAAGAG	1600

C  FP085394.7	82	CCCAGAAAATGGGGAAAATGTAGGTCAAGGATTGTTTTGGAATCATAATC	33
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1601	CCCAGAAAATGGGGAAAATGTAGGTCAAGGATTGTTTTGGAATCATAATC	1650

C  FP085394.7	32	TGATCCAATTCTGGAAGTCACGATCTGAATTC	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP101875.6	1651	TGATCCAATTCTGGAAGTCACGATCTGAATTC	1682

Overview

Query
FP085394.7 - 94004 bps
Hit
FP101875.6 - 36728 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1682 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link