<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 3276 bps / non-identical: 2432 bps

Full alignment

C  FP101904.2	3276	TTGGCCTTAAGTGTTTTTCTAGGACTTTTATACTTTGGGGTCTTATTTTT	3227
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  FP085608.1	1	TTGGCCTTAAGTGTTTTTCTAGGACTTTTATACTTTGGGATCTTATTTTT	50

C  FP101904.2	3226	GAGTCTTTCTTCCATTTTGGGTATATCTGACTGTATGGTATAAGATAAGG	3177
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	51	GAATCTTTCTTCCATTTTGGGTATATCTGACTGTATGGTATAAGATAAGG	100

C  FP101904.2	3176	GTCAATTTCATTCTTTTGAATGTGAATATTCAGTTTTCCAGACAAAATTT	3127
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  FP085608.1	101	GTCAATTTCATTCTTTTGAATGTGAATATTCAGTTTTCCAGGCAAAATTT	150

C  FP101904.2	3126	GTTGAAAAGAGTATTCTTTCTTCATTGTGCATTCTTGACACCCTTAACAA	3077
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	151	GTTGAAAAGAGTATTCTTTCTTCATTGTGCATTCTTGACACCCTTAACAA	200

C  FP101904.2	3076	AGATCAGTTGATTACATATGTGTATATTTTGAAAGGGGGAATCTCTATTC	3027
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	201	AGATCAGTTGATTACATATGTGTATATTTTGAAAGGGGGAATCTCTATTC	250

C  FP101904.2	3026	TGTTCCATAAGTTTACATGTCTATCTTTATGCCAGTGCAGTACTGTTTGA	2977
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	251	TGTTCCATAAGTTTACATGTCTATCTTTATGCCAGTGCAGTACTGTTTGA	300

C  FP101904.2	2976	TTAGTGTGCATTTATATTATATTTTGGAATCAGAAAAGGTGATGTTTCCA	2927
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	301	TTAGTGTGCATTTATATTATATTTTGGAATCAGAAAAGGTGATGTTTCCA	350

C  FP101904.2	2926	GCTGCATTCTTTCTCAAAATTGATTAGCCATTTATGGTCTTCTGAAATTC	2877
			||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  FP085608.1	351	GCTGCATTCTTTCTCAAAATTGATTAGCCATCTATGGTCTTCTGAAATTC	400

C  FP101904.2	2876	CATATAAATGTTAGTTTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAAATACTGTTGGGA	2827
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  FP085608.1	401	CATATAAATGTTAGTTTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAAATGCTGTTGGGA	450

C  FP101904.2	2826	GTTAGGTAGGGAATGTATTGAATAGGCAGATTGCTGTGCATAACATAGAC	2777
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	451	GTTTGGTAGGGAATGTATTGAATAGGCAGATTGCTGTGCATAACATAGAC	500

C  FP101904.2	2776	ATTTTAACAATACTGAGTTTTTAAATCGATGAACATGGGATAACATTCCA	2727
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	501	ATTTTAACAATACTGAGTTTTTAAATCGATGAACATGGGATAACATTCCA	550

C  FP101904.2	2726	TTTGCTTGTCTTCCTTAATTTTTGTCATCAATGTTTTGTAGTTGTCGGTA	2677
			|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
  FP085608.1	551	TTTGCTTGTCTTCCTTAATTTTTGTCATAAATGTTTTGTAGTTGTCAGTA	600

C  FP101904.2	2676	TGCAAGTCTTTCACTCTTAGGTTTATTCCTAAATATTATAGTCTTTTCAG	2627
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	601	TACAAGTCTTTCACTCTTAGGTTTATTCCTAAATATTATAGTCTTTTCAG	650

C  FP101904.2	2626	TATTATTGTATGAGAAATTACTTTTCTAATTTCCTTTTCAAAGGATATCA	2577
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	651	TATTATTGTATGAGAAATTACTTTTCTAATTTCCTTTTCAAAGGATATCA	700

C  FP101904.2	2576	ATGTTGACTTTATATCCTGCTACTTGACTGAAATCATTTGTTTGTTCTAA	2527
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	701	ATGTTGACTTTATATCCTGCTACTTGACTGAAATCATTTGTTTGTTCTAA	750

C  FP101904.2	2526	ATTTTTTGTGTGAAATCTTTAGAGCTTTATATATTTAAGATCATGTCTTC	2477
			|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	751	ATTTTTTGTGTGAAATATTTAGAGCCTTATATATTTAAGATCATGTCTTC	800

C  FP101904.2	2476	TGTGAACAGAGATAATATTACTTCTTCCTTTCCAGTTGGATGTTTTCTTT	2427
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  FP085608.1	801	TGTGAACAGAGATAATATTACTTCTTCCTTTCCTGTTGGATGTTTTCTTT	850

C  FP101904.2	2426	TTATTTATTTCTTTACTTTGACTGACTGTTTTAGCTAGGACTTGCAGTAT	2377
			||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  FP085608.1	851	TTATTTATTCCTTTACTTTGACTGACTGCTTTAGCTAGGACTTGCAGTAT	900

C  FP101904.2	2376	TATGTAGAACAGAGGTGGTGAGAGTAGGCATGCTTGCCTTGTTCCTGATC	2327
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	901	TATGTAGAACAGAGGTGGTGAGAGTAGGCATGCTTGCCTTGTTCCTGATC	950

C  FP101904.2	2326	TTCAGAAAAAGCCTTTTGGCTTTTTTATCATTGAGATGATGTTAGTTGTG	2277
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	951	TTCAGAAAAAGCCTTTTGGCTTTTTTATCATTGAGATGATGTTAGTTGTG	1000

C  FP101904.2	2276	GGCTTTTCATATATGGCTTTTATAATGTTGAGGTAAATTCCCTTCAATAA	2227
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1001	GGCTTTTCATATATGGCTCTTATAATGTTGAGGTAAATTCCCTTCAATAA	1050

C  FP101904.2	2226	CCAGTTTGTTAAGAGGGTGAAAAGGTATTCAGTTTTGTCCAATGCTTTAT	2177
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1051	CCAGTTTGTTAAGAGGGTTAAAAGGTATTCAGTTTTGTCCAATGCTTTAT	1100

C  FP101904.2	2176	CTGCATCTATTGAGATAACCATATGATGGTCATACTTTATTTTGTTAATG	2127
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1101	CTGCATCTATTGAGATAACCATATGATGGTCATACTTTATTTTGTTAATG	1150

C  FP101904.2	2126	TGGTCTGTTATATTAATTGATTTTGGTATGTTGAACCATCCTTGTATGCT	2077
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1151	TGGTCTGTTATATTAATTGATTTTGGTATGTTGAACCATCCTTGTATGCT	1200

C  FP101904.2	2076	GGGGATAAATTCCCCTTGTTTTTTTTTTCCCCATGGCCTGTGATCATTTT	2027
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1201	GGGGATAAATTCCCCTTGTTTTTTTTTTCCCCATGGCCTGTGATCATTTT	1250

C  FP101904.2	2026	AATGTTTTCAATGTGTTGTTGGATTTAACTTTCAAGTATTTTGTTGAGTT	1977
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1251	AATGTTTTCAATGTGTTGTTGGATTTAACTTTCAAGTATTTTGTTGAGTT	1300

C  FP101904.2	1976	TTGCATATATATTTATCAAGGATATTGACCTAGTGATTTATTCTTTTGTG	1927
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1301	TTGCATATATATTTATCAAGGGTATTGACCTAGTGATTTATTCTTTTGTG	1350

C  FP101904.2	1926	CTTTTGTCTGTTTTGGAATCAAGGTAATTCTGGCCTCATAAGGTGATTTT	1877
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1351	CTTTTGTCTGTTTTGGAATCAAGGTAATTCTGGCCTCATAAGGTGATTTT	1400

C  FP101904.2	1876	GAAAGTGTCTTCTCCTCTTATTTTTTGAAAAAGTTTGCCATTAACTTTTC	1827
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  FP085608.1	1401	GAAAGTGTCTTCTCCTCTTATTTTTTGAAAAAGTTTGGCATTAACTTTTC	1450

C  FP101904.2	1826	TTAAATGTTTCATAGACAAATAC---AAAAAAATAGAAAGAAGTAAGAGA	1780
			||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1451	TTAAATGATTCATAGTCAAATACAAAAAAAAAATAGAAAGAAGTAAGAGA	1500

C  FP101904.2	1779	AGAGAGATTCATCACATACAAGAGCACCCTCATAAGGGTATCAGTGGATT	1730
			|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1501	AGAGAGATTCGTCATATACAAGAGCACCCTCATAAGGGTATCAGTGGATT	1550

C  FP101904.2	1729	TACTGGAAGAAATCTTACAGCTAAGGAGAGACTAGGATGAT------ATA	1686
			|||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||
  FP085608.1	1551	TACCAGAAGAAATCTTACAGCTAAGGAGAGACTAGGATGATATACTCATA	1600

C  FP101904.2	1685	GTGCTGAAAGAAAAATAACAGCCAACCAAGAATACTATATTTGGCAAAAC	1636
			| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
  FP085608.1	1601	GCGCTGAAAGAAAAATAACAGCCCACCAAGAATACTATGTTTGGCAAAAC	1650

C  FP101904.2	1635	TATACTTAAAAATGAAGGAAAAAGAAATAATTTGTATACC---------A	1595
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||         |
  FP085608.1	1651	TATACTTAAAAATGAAGGAAAAAGAAATAATTTGAAAACCAAAAAAAAAA	1700

C  FP101904.2	1594	AAAAAAAAAAAAGCTGAAATACTCGTCACCACTAAAACTGCTTTACAAGA	1545
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
  FP085608.1	1701	AAAAAAAAAAAAGCTGAAATACTCGTCACCACTAAACCTGCTTTACAAGG	1750

C  FP101904.2	1544	AAAATTAAATGAAGTTTTTCAAGTTGAAATGAAAGGATGTTGTTAGTAAC	1495
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1751	AAAATTAAATGAAGTTTTTCAAGTTGAAATGAAAGGATGTTGTTAGTAAC	1800

C  FP101904.2	1494	ATAACAACATTTGAAAATATTAAATTCACTGGTAAATGCATATAGATAGT	1445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  FP085608.1	1801	ATAACAACATTTGAAAATATTAAATTCACTGGTAAATACATATAGATAGT	1850

C  FP101904.2	1444	CAAATTCAAAATACCTTAACACTGTAATGATAGTTCATAAACTACTTTTA	1395
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
  FP085608.1	1851	CAAATTCAAAATACCTTAACACTGTAATGGTAGTTAATAAACTACTTTTA	1900

C  FP101904.2	1394	ACTTTA-GGGAAAAAAATCTAAAAA-CAAAACTATTAAAAGTAACCAAGG	1347
			|||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
  FP085608.1	1901	ACTTTAGGGGAAAAAAATTTAAAAAGCAAAACTATTAAAAATAACCAAAG	1950

C  FP101904.2	1346	ATATAATAATTTGTTAATGGATACACAATACAAAAAGGGGTAAATTGTAA	1297
			 | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||
  FP085608.1	1951	GTGTAATAATTTGTTAATGGATACACAACCAAAAAAGAGGTAAATTGTAA	2000

C  FP101904.2	1296	AGCAATATAAAATAGAAGTAAAAGTGC--AGTTTTTAATGCAATTGAAGT	1249
			|||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2001	AGCAATATAAAATAGAAGTAAAAGTGCAGAGTTTTTAATGCAATTGAAGT	2050

C  FP101904.2	1248	TAAGTTGTTATAGCTTAAAATTGACTGTTTTAACTATAAGGTGTTTTAGG	1199
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2051	TAAGTTGTTATAGCTTAAAATTGACTGTTTTAACTATAAGGTGTTTTAGG	2100

C  FP101904.2	1198	TAAGCTTCTTTGTAACC-----ACAAAACAAAAATCTTATGGTAGATACA	1154
			|||||||||||||||||     |||||| |||||| || | || ||||||
  FP085608.1	2101	TAAGCTTCTTTGTAACCATAAAACAAAAAAAAAATGTTGTAGTGGATACA	2150

C  FP101904.2	1153	AACCACATAATAAGAATATAATCAAAACATACCACTACAGGAAACTATCA	1104
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2151	AACCACATAATAAGAATATAATCAAAACATACCACTACAGGAAACTATCA	2200

C  FP101904.2	1103	AATCACAAAGGAAGACATCGAGAGAGGAAGAAAAGAACTACAAACATTAA	1054
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  FP085608.1	2201	AATCACAAAGGAAGACATCGAGAGAGGAAGAAAAGAACTACAAACATT-A	2249

C  FP101904.2	1053	AAAAAATAATTTTTAAATCACAATAGTAGGTTCTTATCTGTAATAGTTAC	1004
			|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
  FP085608.1	2250	AAAAAATAATTTTTAAATCACAATAGAAGGTTATTATCTGTAATAGTTAC	2299

C  FP101904.2	1003	TTTAAATATTAATGGATTAAA-TCCCCAATCAAAAGACAGACTGGCTGAA	955
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2300	TTTAAATATTAATGGATTAAATTCCCCAATCAAAAGACAGACTGGCTGAA	2349

C  FP101904.2	954	TGTACAAAA-GAAAAAAAATCTACTAATATGCTGCCT------T---CAT	915
			|| | |||| ||||||||| | |  ||||||||||||      |   |||
  FP085608.1	2350	TGGATAAAAGGAAAAAAAAACCAGCAATATGCTGCCTACACGATACCCAT	2399

C  FP101904.2	914	TTTAGTTTAAGGACACACATAAGTTGAAAGTGAAGGGATGGGAGTTCCCA	865
			|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||
  FP085608.1	2400	TTTAGTTTAAGGACACACGTAAGTTGAAAGTGAATGGATGGAAGTTCCCA	2449

C  FP101904.2	864	TCATGGAGCAGCAGAAACGAATCTGACTAGGAACCATGAGGTTGCAGATT	815
			|||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||
  FP085608.1	2450	TCATGGAGCAGCAGAAACAAATCTTTCTAGGAACCATGAGGTTGTGGATT	2499

C  FP101904.2	814	CAATCCCTGGCATTGCTCAGTGGGTTAAGAATCTGGCATTGCTGTGAGCT	765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  FP085608.1	2500	CAATCCCTGGCATTGCTCAGTGGGTTAAGAATCTGGCATTGTTGTGAGCT	2549

C  FP101904.2	764	GTGGTGTAGGTCACAGACGAGGCTTGGATCCCACATTGCTGTGGCTGTGG	715
			|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||
  FP085608.1	2550	GTGGTGTAGGTCACAGACGAGGCTAGGATCCCACATT------GCTGTGG	2593

C  FP101904.2	714	CTGTGGTGTAAGCTGGCAGCTGTAGCTCTAATTTGACCCCTAGCCTGAGA	665
			||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
  FP085608.1	2594	CTGTGGTGTAAACTGGCAGCTGTAGCTCTAATTTGACCCCTACCCTGAGA	2643

C  FP101904.2	664	ACCTCCATATGCCATGGGTGCAGCCTTAAAAAGCAA--AAA-AAGCAAA-	619
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||| 
  FP085608.1	2644	ACCTCCATATGCCATGGGTGAAGCCTTAAAAAGCAAACAAACAAACAAAC	2693

C  FP101904.2	618	AAAAAAAGTCAAGGGATAGAAAAAGATATTTTATGCAAATGGTAACCCCC	569
			||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||
  FP085608.1	2694	AAACAAAGTGAAGGGATGAAAAAAGATATTTTATGCAAGTGGTAGTCCCC	2743

C  FP101904.2	568	AAGAGAGAACCAGTGCCTATACTTATACAAAATAAACTTTAAATCAAACA	519
			||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
  FP085608.1	2744	AAGAGAGAACCAGTGCCTATACTTACACAAAATAAACTTTAAATCAAAAA	2793

C  FP101904.2	518	CTATCAAAGAGACAAAGTAGGTCATTATAAAATAATAAAGGAGTCGATTC	469
			 | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||
  FP085608.1	2794	ATGTCAAAGAGACAAAGTAGGTCATTATAAAATGACAAAGGAGTCAATTC	2843

C  FP101904.2	468	ATCAAGAGGCTGTAACAATTGTAAATATATACGTCCAACATTGAAGCACC	419
			||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
  FP085608.1	2844	ATCAAGAGGCTATAACAATTGTAAATATATACATCCAACATTGAAGCACC	2893

C  FP101904.2	418	TAAATATTAACAGAATTGAAAAGAAAAAAAGAGAGAGAGCAAGAGAGTTC	369
			||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||||
  FP085608.1	2894	TAAATATTAACAGAATTGAAAAGGAAAAAAAAAAGAGAAC-AGAGAGTTC	2942

C  FP101904.2	368	CCTTGTGGCACAGTGGGTTAAGGATCCAGCATTGTCACTGCATTGGCTTG	319
			|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
  FP085608.1	2943	CCTTGTGGCACAGTGGGTTAAGGATCCAGCCTTGTCACTGCAGTGGCTTG	2992

C  FP101904.2	318	GGTCATTGGCACATTGATCCCTGGCCTGGGAACTTCTACATGCCGCAGGC	269
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2993	GGTCATTGGCACATTGATCCCTGGCCTGGGAACTTCTACATGCCGCAGGC	3042

C  FP101904.2	268	ACAGCCAAAAAGAAAGACAACCATAACAACAAAAAAGACAAAAGTAAGGG	219
			||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
  FP085608.1	3043	ACAGCCAA----AAAGACAACCACAACAACAAGAAAGACAAAAGTAAGGG	3088

C  FP101904.2	218	A-TTTAATACTTACCCTCAGCAATGGAAAGTACACCTAGACTTTGGATTT	170
			| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  FP085608.1	3089	ACTTTAATACTTACCCTCAGCAATGGAAAGTACATCTAGACTTTGGATTT	3138

C  FP101904.2	169	CCTATATCTAGACAGAAAAT-AAAAATAATAAACAAGAAAAA-TTATATT	122
			||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
  FP085608.1	3139	CCTGTTTCTAGACAGAAAATAAAAAATAATAAACAAGAAAAAGTTATATT	3188

C  FP101904.2	121	CAATTATACTATAGACCAAATGGACAAAACAGATACAAATG---------	81
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
  FP085608.1	3189	CAATTATACTATAGACCAAATGGACAAAACAGATACAAATGCTGTGTTTC	3238

C  FP101904.2	80	--CTAACAGCAGCAGAATACATATTCTTCTCAAGTGCACATGAAACATTC	33
			  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	3239	ACCTAACAGCAGCAGAATACACATTCTTCTCAAGTGCACATGAAACATTC	3288

C  FP101904.2	32	TCCAGAAGAGATAGGGCCACAACAAATTAAGA	1
			||||||| |||| ||||||||| ||| |||||
  FP085608.1	3289	TCCAGAACAGATGGGGCCACAAAAAACTAAGA	3320

Compact alignment

C  FP101904.2	3276	TTGGCCTTAAGTGTTTTTCTAGGACTTTTATACTTTGGGGTCTTATTTTT	3227
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  FP085608.1	1	TTGGCCTTAAGTGTTTTTCTAGGACTTTTATACTTTGGGATCTTATTTTT	50

C  FP101904.2	3226	GAGTCTTTCTTCCATTTTGGGTATATCTGACTGTATGGTATAAGATAAGG	3177
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	51	GAATCTTTCTTCCATTTTGGGTATATCTGACTGTATGGTATAAGATAAGG	100

C  FP101904.2	3176	GTCAATTTCATTCTTTTGAATGTGAATATTCAGTTTTCCAGACAAAATTT	3127
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  FP085608.1	101	GTCAATTTCATTCTTTTGAATGTGAATATTCAGTTTTCCAGGCAAAATTT	150

skip 200 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	2926	GCTGCATTCTTTCTCAAAATTGATTAGCCATTTATGGTCTTCTGAAATTC	2877
			||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  FP085608.1	351	GCTGCATTCTTTCTCAAAATTGATTAGCCATCTATGGTCTTCTGAAATTC	400

C  FP101904.2	2876	CATATAAATGTTAGTTTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAAATACTGTTGGGA	2827
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  FP085608.1	401	CATATAAATGTTAGTTTTTTTTCTATTTCTGTGAAGAAATGCTGTTGGGA	450

C  FP101904.2	2826	GTTAGGTAGGGAATGTATTGAATAGGCAGATTGCTGTGCATAACATAGAC	2777
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	451	GTTTGGTAGGGAATGTATTGAATAGGCAGATTGCTGTGCATAACATAGAC	500

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	2726	TTTGCTTGTCTTCCTTAATTTTTGTCATCAATGTTTTGTAGTTGTCGGTA	2677
			|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
  FP085608.1	551	TTTGCTTGTCTTCCTTAATTTTTGTCATAAATGTTTTGTAGTTGTCAGTA	600

C  FP101904.2	2676	TGCAAGTCTTTCACTCTTAGGTTTATTCCTAAATATTATAGTCTTTTCAG	2627
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	601	TACAAGTCTTTCACTCTTAGGTTTATTCCTAAATATTATAGTCTTTTCAG	650

skip 100 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	2526	ATTTTTTGTGTGAAATCTTTAGAGCTTTATATATTTAAGATCATGTCTTC	2477
			|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	751	ATTTTTTGTGTGAAATATTTAGAGCCTTATATATTTAAGATCATGTCTTC	800

C  FP101904.2	2476	TGTGAACAGAGATAATATTACTTCTTCCTTTCCAGTTGGATGTTTTCTTT	2427
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  FP085608.1	801	TGTGAACAGAGATAATATTACTTCTTCCTTTCCTGTTGGATGTTTTCTTT	850

C  FP101904.2	2426	TTATTTATTTCTTTACTTTGACTGACTGTTTTAGCTAGGACTTGCAGTAT	2377
			||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  FP085608.1	851	TTATTTATTCCTTTACTTTGACTGACTGCTTTAGCTAGGACTTGCAGTAT	900

skip 100 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	2276	GGCTTTTCATATATGGCTTTTATAATGTTGAGGTAAATTCCCTTCAATAA	2227
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1001	GGCTTTTCATATATGGCTCTTATAATGTTGAGGTAAATTCCCTTCAATAA	1050

C  FP101904.2	2226	CCAGTTTGTTAAGAGGGTGAAAAGGTATTCAGTTTTGTCCAATGCTTTAT	2177
			|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1051	CCAGTTTGTTAAGAGGGTTAAAAGGTATTCAGTTTTGTCCAATGCTTTAT	1100

skip 200 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	1976	TTGCATATATATTTATCAAGGATATTGACCTAGTGATTTATTCTTTTGTG	1927
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1301	TTGCATATATATTTATCAAGGGTATTGACCTAGTGATTTATTCTTTTGTG	1350

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	1876	GAAAGTGTCTTCTCCTCTTATTTTTTGAAAAAGTTTGCCATTAACTTTTC	1827
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  FP085608.1	1401	GAAAGTGTCTTCTCCTCTTATTTTTTGAAAAAGTTTGGCATTAACTTTTC	1450

C  FP101904.2	1826	TTAAATGTTTCATAGACAAATAC---AAAAAAATAGAAAGAAGTAAGAGA	1780
			||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1451	TTAAATGATTCATAGTCAAATACAAAAAAAAAATAGAAAGAAGTAAGAGA	1500

C  FP101904.2	1779	AGAGAGATTCATCACATACAAGAGCACCCTCATAAGGGTATCAGTGGATT	1730
			|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	1501	AGAGAGATTCGTCATATACAAGAGCACCCTCATAAGGGTATCAGTGGATT	1550

C  FP101904.2	1729	TACTGGAAGAAATCTTACAGCTAAGGAGAGACTAGGATGAT------ATA	1686
			|||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||
  FP085608.1	1551	TACCAGAAGAAATCTTACAGCTAAGGAGAGACTAGGATGATATACTCATA	1600

C  FP101904.2	1685	GTGCTGAAAGAAAAATAACAGCCAACCAAGAATACTATATTTGGCAAAAC	1636
			| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
  FP085608.1	1601	GCGCTGAAAGAAAAATAACAGCCCACCAAGAATACTATGTTTGGCAAAAC	1650

C  FP101904.2	1635	TATACTTAAAAATGAAGGAAAAAGAAATAATTTGTATACC---------A	1595
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||         |
  FP085608.1	1651	TATACTTAAAAATGAAGGAAAAAGAAATAATTTGAAAACCAAAAAAAAAA	1700

C  FP101904.2	1594	AAAAAAAAAAAAGCTGAAATACTCGTCACCACTAAAACTGCTTTACAAGA	1545
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
  FP085608.1	1701	AAAAAAAAAAAAGCTGAAATACTCGTCACCACTAAACCTGCTTTACAAGG	1750

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	1494	ATAACAACATTTGAAAATATTAAATTCACTGGTAAATGCATATAGATAGT	1445
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  FP085608.1	1801	ATAACAACATTTGAAAATATTAAATTCACTGGTAAATACATATAGATAGT	1850

C  FP101904.2	1444	CAAATTCAAAATACCTTAACACTGTAATGATAGTTCATAAACTACTTTTA	1395
			||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
  FP085608.1	1851	CAAATTCAAAATACCTTAACACTGTAATGGTAGTTAATAAACTACTTTTA	1900

C  FP101904.2	1394	ACTTTA-GGGAAAAAAATCTAAAAA-CAAAACTATTAAAAGTAACCAAGG	1347
			|||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
  FP085608.1	1901	ACTTTAGGGGAAAAAAATTTAAAAAGCAAAACTATTAAAAATAACCAAAG	1950

C  FP101904.2	1346	ATATAATAATTTGTTAATGGATACACAATACAAAAAGGGGTAAATTGTAA	1297
			 | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||
  FP085608.1	1951	GTGTAATAATTTGTTAATGGATACACAACCAAAAAAGAGGTAAATTGTAA	2000

C  FP101904.2	1296	AGCAATATAAAATAGAAGTAAAAGTGC--AGTTTTTAATGCAATTGAAGT	1249
			|||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2001	AGCAATATAAAATAGAAGTAAAAGTGCAGAGTTTTTAATGCAATTGAAGT	2050

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	1198	TAAGCTTCTTTGTAACC-----ACAAAACAAAAATCTTATGGTAGATACA	1154
			|||||||||||||||||     |||||| |||||| || | || ||||||
  FP085608.1	2101	TAAGCTTCTTTGTAACCATAAAACAAAAAAAAAATGTTGTAGTGGATACA	2150

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	1103	AATCACAAAGGAAGACATCGAGAGAGGAAGAAAAGAACTACAAACATTAA	1054
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  FP085608.1	2201	AATCACAAAGGAAGACATCGAGAGAGGAAGAAAAGAACTACAAACATT-A	2249

C  FP101904.2	1053	AAAAAATAATTTTTAAATCACAATAGTAGGTTCTTATCTGTAATAGTTAC	1004
			|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
  FP085608.1	2250	AAAAAATAATTTTTAAATCACAATAGAAGGTTATTATCTGTAATAGTTAC	2299

C  FP101904.2	1003	TTTAAATATTAATGGATTAAA-TCCCCAATCAAAAGACAGACTGGCTGAA	955
			||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	2300	TTTAAATATTAATGGATTAAATTCCCCAATCAAAAGACAGACTGGCTGAA	2349

C  FP101904.2	954	TGTACAAAA-GAAAAAAAATCTACTAATATGCTGCCT------T---CAT	915
			|| | |||| ||||||||| | |  ||||||||||||      |   |||
  FP085608.1	2350	TGGATAAAAGGAAAAAAAAACCAGCAATATGCTGCCTACACGATACCCAT	2399

C  FP101904.2	914	TTTAGTTTAAGGACACACATAAGTTGAAAGTGAAGGGATGGGAGTTCCCA	865
			|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||
  FP085608.1	2400	TTTAGTTTAAGGACACACGTAAGTTGAAAGTGAATGGATGGAAGTTCCCA	2449

C  FP101904.2	864	TCATGGAGCAGCAGAAACGAATCTGACTAGGAACCATGAGGTTGCAGATT	815
			|||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||
  FP085608.1	2450	TCATGGAGCAGCAGAAACAAATCTTTCTAGGAACCATGAGGTTGTGGATT	2499

C  FP101904.2	814	CAATCCCTGGCATTGCTCAGTGGGTTAAGAATCTGGCATTGCTGTGAGCT	765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  FP085608.1	2500	CAATCCCTGGCATTGCTCAGTGGGTTAAGAATCTGGCATTGTTGTGAGCT	2549

C  FP101904.2	764	GTGGTGTAGGTCACAGACGAGGCTTGGATCCCACATTGCTGTGGCTGTGG	715
			|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||||
  FP085608.1	2550	GTGGTGTAGGTCACAGACGAGGCTAGGATCCCACATT------GCTGTGG	2593

C  FP101904.2	714	CTGTGGTGTAAGCTGGCAGCTGTAGCTCTAATTTGACCCCTAGCCTGAGA	665
			||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
  FP085608.1	2594	CTGTGGTGTAAACTGGCAGCTGTAGCTCTAATTTGACCCCTACCCTGAGA	2643

C  FP101904.2	664	ACCTCCATATGCCATGGGTGCAGCCTTAAAAAGCAA--AAA-AAGCAAA-	619
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||| 
  FP085608.1	2644	ACCTCCATATGCCATGGGTGAAGCCTTAAAAAGCAAACAAACAAACAAAC	2693

C  FP101904.2	618	AAAAAAAGTCAAGGGATAGAAAAAGATATTTTATGCAAATGGTAACCCCC	569
			||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||
  FP085608.1	2694	AAACAAAGTGAAGGGATGAAAAAAGATATTTTATGCAAGTGGTAGTCCCC	2743

C  FP101904.2	568	AAGAGAGAACCAGTGCCTATACTTATACAAAATAAACTTTAAATCAAACA	519
			||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
  FP085608.1	2744	AAGAGAGAACCAGTGCCTATACTTACACAAAATAAACTTTAAATCAAAAA	2793

C  FP101904.2	518	CTATCAAAGAGACAAAGTAGGTCATTATAAAATAATAAAGGAGTCGATTC	469
			 | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||
  FP085608.1	2794	ATGTCAAAGAGACAAAGTAGGTCATTATAAAATGACAAAGGAGTCAATTC	2843

C  FP101904.2	468	ATCAAGAGGCTGTAACAATTGTAAATATATACGTCCAACATTGAAGCACC	419
			||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
  FP085608.1	2844	ATCAAGAGGCTATAACAATTGTAAATATATACATCCAACATTGAAGCACC	2893

C  FP101904.2	418	TAAATATTAACAGAATTGAAAAGAAAAAAAGAGAGAGAGCAAGAGAGTTC	369
			||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||||
  FP085608.1	2894	TAAATATTAACAGAATTGAAAAGGAAAAAAAAAAGAGAAC-AGAGAGTTC	2942

C  FP101904.2	368	CCTTGTGGCACAGTGGGTTAAGGATCCAGCATTGTCACTGCATTGGCTTG	319
			|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
  FP085608.1	2943	CCTTGTGGCACAGTGGGTTAAGGATCCAGCCTTGTCACTGCAGTGGCTTG	2992

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP101904.2	268	ACAGCCAAAAAGAAAGACAACCATAACAACAAAAAAGACAAAAGTAAGGG	219
			||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
  FP085608.1	3043	ACAGCCAA----AAAGACAACCACAACAACAAGAAAGACAAAAGTAAGGG	3088

C  FP101904.2	218	A-TTTAATACTTACCCTCAGCAATGGAAAGTACACCTAGACTTTGGATTT	170
			| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  FP085608.1	3089	ACTTTAATACTTACCCTCAGCAATGGAAAGTACATCTAGACTTTGGATTT	3138

C  FP101904.2	169	CCTATATCTAGACAGAAAAT-AAAAATAATAAACAAGAAAAA-TTATATT	122
			||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
  FP085608.1	3139	CCTGTTTCTAGACAGAAAATAAAAAATAATAAACAAGAAAAAGTTATATT	3188

C  FP101904.2	121	CAATTATACTATAGACCAAATGGACAAAACAGATACAAATG---------	81
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
  FP085608.1	3189	CAATTATACTATAGACCAAATGGACAAAACAGATACAAATGCTGTGTTTC	3238

C  FP101904.2	80	--CTAACAGCAGCAGAATACATATTCTTCTCAAGTGCACATGAAACATTC	33
			  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  FP085608.1	3239	ACCTAACAGCAGCAGAATACACATTCTTCTCAAGTGCACATGAAACATTC	3288

C  FP101904.2	32	TCCAGAAGAGATAGGGCCACAACAAATTAAGA	1
			||||||| |||| ||||||||| ||| |||||
  FP085608.1	3289	TCCAGAACAGATGGGGCCACAAAAAACTAAGA	3320

Overview

Query
FP101904.2 - 98057 bps
Hit
FP085608.1 - 108124 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 3276 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
194.882578327613276-1133201
293.5274235325906162592-150051535861
390.99262937318398387713126426301311
492.06240633266275666081-146650499861
590.7233833468398387328122422257421
694.51227727719479397563-123644264131
791.52223930898766490752126426295181
890.63215430958766490758122422254941
997.45200822049479396996-120210224091
1090.03167424847767380156127666301311
1191.91164022168010782322126426286491
1292.72163521327149873629-142414445571
1391.45163222568010782362122422246651
1493.57152119269320895133-122436243471
1592.94150820767361375688-140056421491
1692.59140418459328995133-126440282621
1789.31137420997767379771123667257421
1893.06133917345452556258142414441421
1990.9133118887568577572-137881397701
2089.95109316468238784032128519301311
Short-link