<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 3285 bps / non-identical: 2300 bps

Full alignment

C  FP102387.1	55092	TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	55043
			|                                                 
  FP085426.1	54748	TTAGTTTTTTGTGGCCCCATCTGTTCTGGAGAATGTTTCATGTGCACTTG	54797

C  FP102387.1	55042	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	54993
			                                                  
  FP085426.1	54798	AGAAGAATGTGTATTCTGCTGCTGTTAGGTGAAACACAGCATTTGTATCT	54847

C  FP102387.1	54992	NTTTTGTCCATTTGGTCTATAGTATAATTGAATATAA-TTTTTCTTGTTT	54944
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  FP085426.1	54848	GTTTTGTCCATTTGGTCTATAGTATAATTGAATATAACTTTTTCTTGTTT	54897

C  FP102387.1	54943	ATTA-TTTTTATTTTCTGTCTAGATATAGGAAATCCAAAGTCTAGGTGTA	54895
			|||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||
  FP085426.1	54898	ATTATTTTTTATTTTCTGTCTAGAAACAGGAAATCCAAAGTCTAGATGTA	54947

C  FP102387.1	54894	CTTTCCATTGCTGAGGGTAAGTATTAAA-TCCCTTACTTTTGTCTTTTTT	54846
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
  FP085426.1	54948	CTTTCCATTGCTGAGGGTAAGTATTAAAGTCCCTTACTTTTGTCTTTCTT	54997

C  FP102387.1	54845	GTTGTTATGGTTGTCTTTCTTTTTGGCTGTGCCTGCGGCATGTAGAAGTT	54796
			|||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	54998	GTTGTTGTGGTTG----TCTTTTTGGCTGTGCCTGCGGCATGTAGAAGTT	55043

C  FP102387.1	54795	CCCAGGCCAGGGATCAATGTGCCAATGACCCAAGCCAATGCAGTGACAAT	54746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 
  FP085426.1	55044	CCCAGGCCAGGGATCAATGTGCCAATGACCCAAGCCACTGCAGTGACAAG	55093

C  FP102387.1	54745	GCTGGATCCTTAACCCACTGTGCCACAAGGGAACTCTCTTGCTCTCTCTC	54696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | 
  FP085426.1	55094	GCTGGATCCTTAACCCACTGTGCCACAAGGGAACTCTCT-GTTCTCTTTT	55142

C  FP102387.1	54695	TTTTTTTCTTTTCAATTCTGTTAATATTTAGGTGCTTCAATGTTGGACGT	54646
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  FP085426.1	55143	TTTTTTCCTTTTCAATTCTGTTAATATTTAGGTGCTTCAATGTTGGATGT	55192

C  FP102387.1	54645	ATATATTTACAATTGTTACAGCCTCTTGATGAATCGACTCCTTTATTATT	54596
			|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||
  FP085426.1	55193	ATATATTTACAATTGTTATAGCCTCTTGATGAATTGACTCCTTTGTCATT	55242

C  FP102387.1	54595	TTATAATGACCTACTTTGTCTCTTTGATAGTGTTTGATTTAAAGTTTATT	54546
			||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||
  FP085426.1	55243	TTATAATGACCTACTTTGTCTCTTTGACATTTTTTGATTTAAAGTTTATT	55292

C  FP102387.1	54545	TTGTATAAGTATAGGCACTGGTTCTCTCTTGGGGGTTACCATTTGCATAA	54496
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||
  FP085426.1	55293	TTGTGTAAGTATAGGCACTGGTTCTCTCTTGGGGACTACCACTTGCATAA	55342

C  FP102387.1	54495	AATATCTTTTTCTATCCCTTGACTTT-----TTTTTTTGCTTTTTTTGCT	54451
			|||||||||||  ||||||| |||||     ||| |||| ||| ||||||
  FP085426.1	55343	AATATCTTTTTTCATCCCTTCACTTTGTTTGTTTGTTTG-TTTGTTTGCT	55391

C  FP102387.1	54450	TTTTAAGGCTGCACCCATGGCATATGGAGGTTCTCAGGCTAGGGGTCAAA	54401
			|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
  FP085426.1	55392	TTTTAAGGCTTCACCCATGGCATATGGAGGTTCTCAGGGTAGGGGTCAAA	55441

C  FP102387.1	54400	TTAGAGCTACAGCTGCCAGCTTACACCACAGCCACAGCCACAGCAATGTG	54351
			||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||
  FP085426.1	55442	TTAGAGCTACAGCTGCCAGTTTACA------CCACAGCCACAGCAATGTG	55485

C  FP102387.1	54350	GGATCCAAGCCTCGTCTGTGACCTACACCACAGCTCACAGCAATGCCAGA	54301
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  FP085426.1	55486	GGATCCTAGCCTCGTCTGTGACCTACACCACAGCTCACAACAATGCCAGA	55535

C  FP102387.1	54300	TTCTTAACCCACTGAGCAATGCCAGGGATTGAATCTGCAACCTCATGGTT	54251
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
  FP085426.1	55536	TTCTTAACCCACTGAGCAATGCCAGGGATTGAATCCACAACCTCATGGTT	55585

C  FP102387.1	54250	CCTAGTCAGATTCGTTTCTGCTGCTCCATGATGGGAACTCCCATCCCTTC	54201
			|||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
  FP085426.1	55586	CCTAGAAAGATTTGTTTCTGCTGCTCCATGATGGGAACTTCCATCCATTC	55635

C  FP102387.1	54200	ACTTTCAACTTATGTGTGTCCTTAAACTAAAATGA---------AGGCAG	54160
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||
  FP085426.1	55636	ACTTTCAACTTACGTGTGTCCTTAAACTAAAATGGGTATCGTGTAGGCAG	55685

C  FP102387.1	54159	CATATTAGTAGATTTTTTTT-CTTTTGTACATTCAGCCAGTCTGTCTTTT	54111
			||||||  | | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55686	CATATTGCTGGTTTTTTTTTCCTTTTATCCATTCAGCCAGTCTGTCTTTT	55735

C  FP102387.1	54110	GATTGGGG-ATTTAATCCATTAATATTTAAAGTAACTATTACAGATAAGA	54062
			|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  FP085426.1	55736	GATTGGGGAATTTAATCCATTAATATTTAAAGTAACTATTACAGATAATA	55785

C  FP102387.1	54061	ACCTACTATTGTGATTTAAAAATTATTTTTTTTAATGTTTGTAGTTCTTT	54012
			|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55786	ACCTTCTATTGTGATTTAAAAATTA-TTTTTTTAATGTTTGTAGTTCTTT	55834

C  FP102387.1	54011	TCTTCCTCTCTCGATGTCTTCCTTTGTGATTTGATAGTTTCCTGTAGTGG	53962
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55835	TCTTCCTCTCTCGATGTCTTCCTTTGTGATTTGATAGTTTCCTGTAGTGG	55884

C  FP102387.1	53961	TATGTTTTGATTATATTCTTATTATGTGGTTTGTATCTACCATAAGA---	53915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   
  FP085426.1	55885	TATGTTTTGATTATATTCTTATTATGTGGTTTGTATCCACTACAACATTT	55934

C  FP102387.1	53914	--TTTTTGTTTTGTGGTTACAAAGAAGCTTACCTAAAACACCTTATAGTT	53867
			  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55935	TTTTTTTGTTTTATGGTTACAAAGAAGCTTACCTAAAACACCTTATAGTT	55984

C  FP102387.1	53866	AAAACAGTCAATTTTAAGCTATAACAACTTAACTTCAATTGCATTAAAAA	53817
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55985	AAAACAGTCAATTTTAAGCTATAACAACTTAACTTCAATTGCATTAAAAA	56034

C  FP102387.1	53816	--CTGCACTTTTACTTCTATTTTATATTGCTTTACAATTTACCCCTTTTT	53769
			  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  FP085426.1	56035	CTCTGCACTTTTACTTCTATTTTATATTGCTTTACAATTTACCTCTTTTT	56084

C  FP102387.1	53768	GTATTGTGTATCCATTAACAAATTATTATATCCTTGGTTACTTTTAATAG	53719
			   ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||
  FP085426.1	56085	TGGTTGTGTATCCATTAACAAATTATTACACCTTTGGTTATTTTTAATAG	56134

C  FP102387.1	53718	TTTTG-TTTTTAGATTTTTTT-CCCTAAAGTTAAAAGTAGTTTATGAACT	53671
			||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
  FP085426.1	56135	TTTTGCTTTTTAAATTTTTTTCCCCTAAAGTTAAAAGTAGTTTATTAACT	56184

C  FP102387.1	53670	ATCATTACAGTGTTAAGGTATTTTGAATTTGACTATCTATATGCATTTAC	53621
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  FP085426.1	56185	ACCATTACAGTGTTAAGGTATTTTGAATTTGACTATCTATATGTATTTAC	56234

C  FP102387.1	53620	CAGTGAATTTAATATTTTCAAATGTTGTTATGTTACTAACAACATCCTTT	53571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56235	CAGTGAATTTAATATTTTCAAATGTTGTTATGTTACTAACAACATCCTTT	56284

C  FP102387.1	53570	CATTTCAACTTGAAAAACTTCATTTAATTTTTCTTGTAAAGCAGTTTTAG	53521
			||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
  FP085426.1	56285	CATTTCAACTTGAAAAACTTCATTTAATTTTCCTTGTAAAGCAGGTTTAG	56334

C  FP102387.1	53520	TGGTGACGAGTATTTCAGC---------TTTTTTTTTTTTTGGTATACAA	53480
			|||||||||||||||||||         |||||||||||||||| | |||
  FP085426.1	56335	TGGTGACGAGTATTTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTCAA	56384

C  FP102387.1	53479	ATTATTTCTTTTTCCTTCATTTTTAAGTATAGTTTTGCCAAATATAGTAT	53430
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
  FP085426.1	56385	ATTATTTCTTTTTCCTTCATTTTTAAGTATAGTTTTGCCAAACATAGTAT	56434

C  FP102387.1	53429	TCTTGGTTGGCTGTTATTTTTCTTTCAGCAC------TATATCATCCTAG	53386
			||||||| ||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||
  FP085426.1	56435	TCTTGGTGGGCTGTTATTTTTCTTTCAGCGCTATGAGTATATCATCCTAG	56484

C  FP102387.1	53385	TCTCTCCTTAGCTGTAAGATTTCTTCCAGTAAATCCACTGATACCCTTAT	53336
			||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56485	TCTCTCCTTAGCTGTAAGATTTCTTCTGGTAAATCCACTGATACCCTTAT	56534

C  FP102387.1	53335	GAGGGTGCTCTTGTATGTGATGAATCTCTCTTCTCTTACTTCTTTCTA--	53288
			|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  
  FP085426.1	56535	GAGGGTGCTCTTGTATATGACGAATCTCTCTTCTCTTACTTCTTTCTATT	56584

C  FP102387.1	53287	-TTTTTTTGTATTTGTCTATGAAACATTTAAGAAAAGTTAATGGCAAACT	53239
			 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
  FP085426.1	56585	TTTTTTTTGTATTTGACTATGAATCATTTAAGAAAAGTTAATGCCAAACT	56634

C  FP102387.1	53238	TTTTCAAAAAATAAGAGGAGAAGACACTTTCAAAATCACCTTATGAGGCC	53189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56635	TTTTCAAAAAATAAGAGGAGAAGACACTTTCAAAATCACCTTATGAGGCC	56684

C  FP102387.1	53188	AGAATTACCTTGATTCCAAAACAGACAAAAGCACAAAAGAATAAATCACT	53139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56685	AGAATTACCTTGATTCCAAAACAGACAAAAGCACAAAAGAATAAATCACT	56734

C  FP102387.1	53138	AGGTCAATATCCTTGATAAATATATATGCAAAACTCAACAAAATACTTGA	53089
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56735	AGGTCAATACCCTTGATAAATATATATGCAAAACTCAACAAAATACTTGA	56784

C  FP102387.1	53088	AAGTTAAATCCAACAACACATTGAAAACATTAAAATGATCACAGGCCATG	53039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56785	AAGTTAAATCCAACAACACATTGAAAACATTAAAATGATCACAGGCCATG	56834

C  FP102387.1	53038	GGGAAAAAAAAAACAAGGGGAATTTATCCCCAGCATACAAGGATGGTTCA	52989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56835	GGGAAAAAAAAAACAAGGGGAATTTATCCCCAGCATACAAGGATGGTTCA	56884

C  FP102387.1	52988	ACATACCAAAATCAATTAATATAACAGACCACATTAACAAAATAAAGTAT	52939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56885	ACATACCAAAATCAATTAATATAACAGACCACATTAACAAAATAAAGTAT	56934

C  FP102387.1	52938	GACCATCATATGGTTATCTCAATAGATGCAGATAAAGCATTGGACAAAAC	52889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56935	GACCATCATATGGTTATCTCAATAGATGCAGATAAAGCATTGGACAAAAC	56984

C  FP102387.1	52888	TGAATACCTTTTCACCCTCTTAACAAACTGGTTATTGAAGGGAATTTACC	52839
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56985	TGAATACCTTTTAACCCTCTTAACAAACTGGTTATTGAAGGGAATTTACC	57034

C  FP102387.1	52838	TCAACATTATAAAAGCCATATATGAAAAGCCCACAACTAACATCATCTCA	52789
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57035	TCAACATTATAAGAGCCATATATGAAAAGCCCACAACTAACATCATCTCA	57084

C  FP102387.1	52788	ATGATAAAAAAGCCAAAAGGCTTTTTCTGAAGATCAGGAACAAGGCAAGC	52739
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57085	ATGATAAAAAAGCCAAAAGGCTTTTTCTGAAGATCAGGAACAAGGCAAGC	57134

C  FP102387.1	52738	ATGCCTACTCTCACCACCTCTGTTCTACATAATACTGCAAGTCCTAGCTA	52689
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57135	ATGCCTACTCTCACCACCTCTGTTCTACATAATACTGCAAGTCCTAGCTA	57184

C  FP102387.1	52688	AAACAGTCAGTCAAAGTAAAGAAATAAATAAAAAGAAAACATCCAACTGG	52639
			|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
  FP085426.1	57185	AAGCAGTCAGTCAAAGTAAAGGAATAAATAAAAAGAAAACATCCAACAGG	57234

C  FP102387.1	52638	AAAGGAAGAAGTAATATTATCTCTGTTCACAGAAGACATGATCTTAAATA	52589
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57235	AAAGGAAGAAGTAATATTATCTCTGTTCACAGAAGACATGATCTTAAATA	57284

C  FP102387.1	52588	TATAAAGCTCTAAAGATTTCACACAAAAAATTTAGAACAAACAAATGATT	52539
			||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57285	TATAAGGCTCTAAATATTTCACACAAAAAATTTAGAACAAACAAATGATT	57334

C  FP102387.1	52538	TCAGTCAAGTAGCAGGATATAAAGTCAACATTGATATCCTTTGAAAAGGA	52489
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57335	TCAGTCAAGTAGCAGGATATAAAGTCAACATTGATATCCTTTGAAAAGGA	57384

C  FP102387.1	52488	AATTAGAAAAGTAATTTCTCATACAATAATACTGAAAAGACTATAATATT	52439
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57385	AATTAGAAAAGTAATTTCTCATACAATAATACTGAAAAGACTATAATATT	57434

C  FP102387.1	52438	TAGGAATAAACCTAAGAGTGAAAGACTTGCATACCGACAACTACAAAACA	52389
			||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
  FP085426.1	57435	TAGGAATAAACCTAAGAGTGAAAGACTTGTATACTGACAACTACAAAACA	57484

C  FP102387.1	52388	TTGATGACAAAAATTAAGGAAGACAAGCAAATGGAATGTTATCCCATGTT	52339
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57485	TTTATGACAAAAATTAAGGAAGACAAGCAAATGGAATGTTATCCCATGTT	57534

C  FP102387.1	52338	CATCGATTTAAAAACTCAGTATTGTTAAAATGTCTATGTTATGCACAGCA	52289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57535	CATCGATTTAAAAACTCAGTATTGTTAAAATGTCTATGTTATGCACAGCA	57584

C  FP102387.1	52288	ATCTGCCTATTCAATACATTCCCTACCTAACTCCCAACAGTATTTCTTCA	52239
			||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
  FP085426.1	57585	ATCTGCCTATTCAATACATTCCCTACCAAACTCCCAACAGCATTTCTTCA	57634

C  FP102387.1	52238	CAGAAATAGAAAAAAAACTAACATTTATATGGAATTTCAGAAGACCATAA	52189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
  FP085426.1	57635	CAGAAATAGAAAAAAAACTAACATTTATATGGAATTTCAGAAGACCATAG	57684

C  FP102387.1	52188	ATGGCTAATCAATTTTGAGAAAGAATGCAGCTGGAAACATCACCTTTTCT	52139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57685	ATGGCTAATCAATTTTGAGAAAGAATGCAGCTGGAAACATCACCTTTTCT	57734

C  FP102387.1	52138	GATTCCAAAATATAATATAAATGCACACTAATCAAACAGTACTGCACTGG	52089
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57735	GATTCCAAAATATAATATAAATGCACACTAATCAAACAGTACTGCACTGG	57784

C  FP102387.1	52088	CATAAAGATAGACATGTAAACTTATGGAACAGAATAGAGATTCCCCCTTT	52039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57785	CATAAAGATAGACATGTAAACTTATGGAACAGAATAGAGATTCCCCCTTT	57834

C  FP102387.1	52038	CAAAATATACACATATGTAATCAACTGATCTTTGTTAAGGGTGTCAAGAA	51989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57835	CAAAATATACACATATGTAATCAACTGATCTTTGTTAAGGGTGTCAAGAA	57884

C  FP102387.1	51988	TGCACAATGAAGAAAGAATACTCTTTTCAACAAATTTTGTCTGGAAAACT	51939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  FP085426.1	57885	TGCACAATGAAGAAAGAATACTCTTTTCAACAAATTTTGCCTGGAAAACT	57934

C  FP102387.1	51938	GAATATTCACATTCAAAAGAATGAAATTGACCCTTATCTTATACCATACA	51889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57935	GAATATTCACATTCAAAAGAATGAAATTGACCCTTATCTTATACCATACA	57984

C  FP102387.1	51888	GTCAGATATACCCAAAATGGAAGAAAGACTCAAAAATAAGACCCCAAAGT	51839
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
  FP085426.1	57985	GTCAGATATACCCAAAATGGAAGAAAGATTCAAAAATAAGATCCCAAAGT	58034

C  FP102387.1	51838	ATAAAAGTCCTAGAAAAACACTTAAGGCCAA	51808
			|||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	58035	ATAAAAGTCCTAGAAAAACACTTAAGGCCAA	58065

Compact alignment

C  FP102387.1	55092	TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	55043
			|                                                 
  FP085426.1	54748	TTAGTTTTTTGTGGCCCCATCTGTTCTGGAGAATGTTTCATGTGCACTTG	54797

C  FP102387.1	55042	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN	54993
			                                                  
  FP085426.1	54798	AGAAGAATGTGTATTCTGCTGCTGTTAGGTGAAACACAGCATTTGTATCT	54847

C  FP102387.1	54992	NTTTTGTCCATTTGGTCTATAGTATAATTGAATATAA-TTTTTCTTGTTT	54944
			 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  FP085426.1	54848	GTTTTGTCCATTTGGTCTATAGTATAATTGAATATAACTTTTTCTTGTTT	54897

C  FP102387.1	54943	ATTA-TTTTTATTTTCTGTCTAGATATAGGAAATCCAAAGTCTAGGTGTA	54895
			|||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||
  FP085426.1	54898	ATTATTTTTTATTTTCTGTCTAGAAACAGGAAATCCAAAGTCTAGATGTA	54947

C  FP102387.1	54894	CTTTCCATTGCTGAGGGTAAGTATTAAA-TCCCTTACTTTTGTCTTTTTT	54846
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
  FP085426.1	54948	CTTTCCATTGCTGAGGGTAAGTATTAAAGTCCCTTACTTTTGTCTTTCTT	54997

C  FP102387.1	54845	GTTGTTATGGTTGTCTTTCTTTTTGGCTGTGCCTGCGGCATGTAGAAGTT	54796
			|||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	54998	GTTGTTGTGGTTG----TCTTTTTGGCTGTGCCTGCGGCATGTAGAAGTT	55043

C  FP102387.1	54795	CCCAGGCCAGGGATCAATGTGCCAATGACCCAAGCCAATGCAGTGACAAT	54746
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 
  FP085426.1	55044	CCCAGGCCAGGGATCAATGTGCCAATGACCCAAGCCACTGCAGTGACAAG	55093

C  FP102387.1	54745	GCTGGATCCTTAACCCACTGTGCCACAAGGGAACTCTCTTGCTCTCTCTC	54696
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | 
  FP085426.1	55094	GCTGGATCCTTAACCCACTGTGCCACAAGGGAACTCTCT-GTTCTCTTTT	55142

C  FP102387.1	54695	TTTTTTTCTTTTCAATTCTGTTAATATTTAGGTGCTTCAATGTTGGACGT	54646
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  FP085426.1	55143	TTTTTTCCTTTTCAATTCTGTTAATATTTAGGTGCTTCAATGTTGGATGT	55192

C  FP102387.1	54645	ATATATTTACAATTGTTACAGCCTCTTGATGAATCGACTCCTTTATTATT	54596
			|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||
  FP085426.1	55193	ATATATTTACAATTGTTATAGCCTCTTGATGAATTGACTCCTTTGTCATT	55242

C  FP102387.1	54595	TTATAATGACCTACTTTGTCTCTTTGATAGTGTTTGATTTAAAGTTTATT	54546
			||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||
  FP085426.1	55243	TTATAATGACCTACTTTGTCTCTTTGACATTTTTTGATTTAAAGTTTATT	55292

C  FP102387.1	54545	TTGTATAAGTATAGGCACTGGTTCTCTCTTGGGGGTTACCATTTGCATAA	54496
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||
  FP085426.1	55293	TTGTGTAAGTATAGGCACTGGTTCTCTCTTGGGGACTACCACTTGCATAA	55342

C  FP102387.1	54495	AATATCTTTTTCTATCCCTTGACTTT-----TTTTTTTGCTTTTTTTGCT	54451
			|||||||||||  ||||||| |||||     ||| |||| ||| ||||||
  FP085426.1	55343	AATATCTTTTTTCATCCCTTCACTTTGTTTGTTTGTTTG-TTTGTTTGCT	55391

C  FP102387.1	54450	TTTTAAGGCTGCACCCATGGCATATGGAGGTTCTCAGGCTAGGGGTCAAA	54401
			|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
  FP085426.1	55392	TTTTAAGGCTTCACCCATGGCATATGGAGGTTCTCAGGGTAGGGGTCAAA	55441

C  FP102387.1	54400	TTAGAGCTACAGCTGCCAGCTTACACCACAGCCACAGCCACAGCAATGTG	54351
			||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||
  FP085426.1	55442	TTAGAGCTACAGCTGCCAGTTTACA------CCACAGCCACAGCAATGTG	55485

C  FP102387.1	54350	GGATCCAAGCCTCGTCTGTGACCTACACCACAGCTCACAGCAATGCCAGA	54301
			|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  FP085426.1	55486	GGATCCTAGCCTCGTCTGTGACCTACACCACAGCTCACAACAATGCCAGA	55535

C  FP102387.1	54300	TTCTTAACCCACTGAGCAATGCCAGGGATTGAATCTGCAACCTCATGGTT	54251
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
  FP085426.1	55536	TTCTTAACCCACTGAGCAATGCCAGGGATTGAATCCACAACCTCATGGTT	55585

C  FP102387.1	54250	CCTAGTCAGATTCGTTTCTGCTGCTCCATGATGGGAACTCCCATCCCTTC	54201
			|||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
  FP085426.1	55586	CCTAGAAAGATTTGTTTCTGCTGCTCCATGATGGGAACTTCCATCCATTC	55635

C  FP102387.1	54200	ACTTTCAACTTATGTGTGTCCTTAAACTAAAATGA---------AGGCAG	54160
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||
  FP085426.1	55636	ACTTTCAACTTACGTGTGTCCTTAAACTAAAATGGGTATCGTGTAGGCAG	55685

C  FP102387.1	54159	CATATTAGTAGATTTTTTTT-CTTTTGTACATTCAGCCAGTCTGTCTTTT	54111
			||||||  | | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55686	CATATTGCTGGTTTTTTTTTCCTTTTATCCATTCAGCCAGTCTGTCTTTT	55735

C  FP102387.1	54110	GATTGGGG-ATTTAATCCATTAATATTTAAAGTAACTATTACAGATAAGA	54062
			|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
  FP085426.1	55736	GATTGGGGAATTTAATCCATTAATATTTAAAGTAACTATTACAGATAATA	55785

C  FP102387.1	54061	ACCTACTATTGTGATTTAAAAATTATTTTTTTTAATGTTTGTAGTTCTTT	54012
			|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55786	ACCTTCTATTGTGATTTAAAAATTA-TTTTTTTAATGTTTGTAGTTCTTT	55834

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	53961	TATGTTTTGATTATATTCTTATTATGTGGTTTGTATCTACCATAAGA---	53915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   
  FP085426.1	55885	TATGTTTTGATTATATTCTTATTATGTGGTTTGTATCCACTACAACATTT	55934

C  FP102387.1	53914	--TTTTTGTTTTGTGGTTACAAAGAAGCTTACCTAAAACACCTTATAGTT	53867
			  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	55935	TTTTTTTGTTTTATGGTTACAAAGAAGCTTACCTAAAACACCTTATAGTT	55984

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	53816	--CTGCACTTTTACTTCTATTTTATATTGCTTTACAATTTACCCCTTTTT	53769
			  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  FP085426.1	56035	CTCTGCACTTTTACTTCTATTTTATATTGCTTTACAATTTACCTCTTTTT	56084

C  FP102387.1	53768	GTATTGTGTATCCATTAACAAATTATTATATCCTTGGTTACTTTTAATAG	53719
			   ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||
  FP085426.1	56085	TGGTTGTGTATCCATTAACAAATTATTACACCTTTGGTTATTTTTAATAG	56134

C  FP102387.1	53718	TTTTG-TTTTTAGATTTTTTT-CCCTAAAGTTAAAAGTAGTTTATGAACT	53671
			||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
  FP085426.1	56135	TTTTGCTTTTTAAATTTTTTTCCCCTAAAGTTAAAAGTAGTTTATTAACT	56184

C  FP102387.1	53670	ATCATTACAGTGTTAAGGTATTTTGAATTTGACTATCTATATGCATTTAC	53621
			| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
  FP085426.1	56185	ACCATTACAGTGTTAAGGTATTTTGAATTTGACTATCTATATGTATTTAC	56234

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	53570	CATTTCAACTTGAAAAACTTCATTTAATTTTTCTTGTAAAGCAGTTTTAG	53521
			||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
  FP085426.1	56285	CATTTCAACTTGAAAAACTTCATTTAATTTTCCTTGTAAAGCAGGTTTAG	56334

C  FP102387.1	53520	TGGTGACGAGTATTTCAGC---------TTTTTTTTTTTTTGGTATACAA	53480
			|||||||||||||||||||         |||||||||||||||| | |||
  FP085426.1	56335	TGGTGACGAGTATTTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTCAA	56384

C  FP102387.1	53479	ATTATTTCTTTTTCCTTCATTTTTAAGTATAGTTTTGCCAAATATAGTAT	53430
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
  FP085426.1	56385	ATTATTTCTTTTTCCTTCATTTTTAAGTATAGTTTTGCCAAACATAGTAT	56434

C  FP102387.1	53429	TCTTGGTTGGCTGTTATTTTTCTTTCAGCAC------TATATCATCCTAG	53386
			||||||| ||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||
  FP085426.1	56435	TCTTGGTGGGCTGTTATTTTTCTTTCAGCGCTATGAGTATATCATCCTAG	56484

C  FP102387.1	53385	TCTCTCCTTAGCTGTAAGATTTCTTCCAGTAAATCCACTGATACCCTTAT	53336
			||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56485	TCTCTCCTTAGCTGTAAGATTTCTTCTGGTAAATCCACTGATACCCTTAT	56534

C  FP102387.1	53335	GAGGGTGCTCTTGTATGTGATGAATCTCTCTTCTCTTACTTCTTTCTA--	53288
			|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  
  FP085426.1	56535	GAGGGTGCTCTTGTATATGACGAATCTCTCTTCTCTTACTTCTTTCTATT	56584

C  FP102387.1	53287	-TTTTTTTGTATTTGTCTATGAAACATTTAAGAAAAGTTAATGGCAAACT	53239
			 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
  FP085426.1	56585	TTTTTTTTGTATTTGACTATGAATCATTTAAGAAAAGTTAATGCCAAACT	56634

skip 100 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	53138	AGGTCAATATCCTTGATAAATATATATGCAAAACTCAACAAAATACTTGA	53089
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56735	AGGTCAATACCCTTGATAAATATATATGCAAAACTCAACAAAATACTTGA	56784

skip 200 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	52888	TGAATACCTTTTCACCCTCTTAACAAACTGGTTATTGAAGGGAATTTACC	52839
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	56985	TGAATACCTTTTAACCCTCTTAACAAACTGGTTATTGAAGGGAATTTACC	57034

C  FP102387.1	52838	TCAACATTATAAAAGCCATATATGAAAAGCCCACAACTAACATCATCTCA	52789
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57035	TCAACATTATAAGAGCCATATATGAAAAGCCCACAACTAACATCATCTCA	57084

skip 100 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	52688	AAACAGTCAGTCAAAGTAAAGAAATAAATAAAAAGAAAACATCCAACTGG	52639
			|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
  FP085426.1	57185	AAGCAGTCAGTCAAAGTAAAGGAATAAATAAAAAGAAAACATCCAACAGG	57234

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	52588	TATAAAGCTCTAAAGATTTCACACAAAAAATTTAGAACAAACAAATGATT	52539
			||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57285	TATAAGGCTCTAAATATTTCACACAAAAAATTTAGAACAAACAAATGATT	57334

skip 100 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	52438	TAGGAATAAACCTAAGAGTGAAAGACTTGCATACCGACAACTACAAAACA	52389
			||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
  FP085426.1	57435	TAGGAATAAACCTAAGAGTGAAAGACTTGTATACTGACAACTACAAAACA	57484

C  FP102387.1	52388	TTGATGACAAAAATTAAGGAAGACAAGCAAATGGAATGTTATCCCATGTT	52339
			|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP085426.1	57485	TTTATGACAAAAATTAAGGAAGACAAGCAAATGGAATGTTATCCCATGTT	57534

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	52288	ATCTGCCTATTCAATACATTCCCTACCTAACTCCCAACAGTATTTCTTCA	52239
			||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
  FP085426.1	57585	ATCTGCCTATTCAATACATTCCCTACCAAACTCCCAACAGCATTTCTTCA	57634

C  FP102387.1	52238	CAGAAATAGAAAAAAAACTAACATTTATATGGAATTTCAGAAGACCATAA	52189
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
  FP085426.1	57635	CAGAAATAGAAAAAAAACTAACATTTATATGGAATTTCAGAAGACCATAG	57684

skip 200 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	51988	TGCACAATGAAGAAAGAATACTCTTTTCAACAAATTTTGTCTGGAAAACT	51939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
  FP085426.1	57885	TGCACAATGAAGAAAGAATACTCTTTTCAACAAATTTTGCCTGGAAAACT	57934

skip 50 bps 100% identity alignment

C  FP102387.1	51888	GTCAGATATACCCAAAATGGAAGAAAGACTCAAAAATAAGACCCCAAAGT	51839
			|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
  FP085426.1	57985	GTCAGATATACCCAAAATGGAAGAAAGATTCAAAAATAAGATCCCAAAGT	58034

skip 31 bps 100% identity alignment

Overview

Query
FP102387.1 - 93936 bps
Hit
FP085426.1 - 58065 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 3285 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
192.25261032855180855092-154748580651
290.985192702165286723061302399591
379.76357877618357591335130201377831
490.69276437628389187652126479302041
590.57275337618757591335126479302041
696.22272830975511658212-130201332951
788.41270540788725891335130201342031
893.93189723075926661572-147672499781
974.99171549228273187652132989377831
1085.8171227925511657907-126479292901
1192.72165721327760179732112052141951
1292.8158320767971681791114460165531
1390.14147621208178883907116839189391
1474.39142940405511659155-132914368681
1585.57113721641661418777123656258591
1692.58102212845787259155-128909301741
1792.34101512845787259155-136487377531
1890.8796113019125892558126479277491
1985.9694916199094092558130201317891
2093.1890011645704958212-134200353441
Short-link