<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2640 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FP016064.5	84355	GAATTCATCTATACTGTCTCTATAAGAAAAAAAAAGGAAAAACAGTTTTC	84306
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38523	GAATTCATCTATACTGTCTCTATAAGAAAAAAAAAGGAAAAACAGTTTTC	38572

C  FP016064.5	84305	AAACATCTATGGCTGATAAAATAATGATAAACAGTAAACAATTTATAGGG	84256
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38573	AAACATCTATGGCTGATAAAATAATGATAAACAGTAAACAATTTATAGGG	38622

C  FP016064.5	84255	GACATATGTAGAGAGCCTTGAGGCTTTAGTGAAGTCACATCCACAACGAT	84206
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38623	GACATATGTAGAGAGCCTTGAGGCTTTAGTGAAGTCACATCCACAACGAT	38672

C  FP016064.5	84205	TAAACAATTAAGATTGTTTTATAACAAATAATAATACAAATAATTTGAAA	84156
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38673	TAAACAATTAAGATTGTTTTATAACAAATAATAATACAAATAATTTGAAA	38722

C  FP016064.5	84155	CTTATGATGTGTCCATGTTGCAGAAATTAGAACTGATAATTCACCTCTCT	84106
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38723	CTTATGATGTGTCCATGTTGCAGAAATTAGAACTGATAATTCACCTCTCT	38772

C  FP016064.5	84105	TCTTTGCTATAAATTACTGTAATCCTTTACGGATGTGTCACTTAAAAAGC	84056
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38773	TCTTTGCTATAAATTACTGTAATCCTTTACGGATGTGTCACTTAAAAAGC	38822

C  FP016064.5	84055	CCATATTATGAGTTTTTGAAAATGCCCCTCCATGTAGTGTGTAACACAGC	84006
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38823	CCATATTATGAGTTTTTGAAAATGCCCCTCCATGTAGTGTGTAACACAGC	38872

C  FP016064.5	84005	TCTAAGTGAAGTGAAATATCCAGCTAAGGCTTAAATCTGTAAGAATACAG	83956
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38873	TCTAAGTGAAGTGAAATATCCAGCTAAGGCTTAAATCTGTAAGAATACAG	38922

C  FP016064.5	83955	TGTTTAAACCTGTTGATTCATTTATAAAAGAGTCGACTCATAGTGCTTCA	83906
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38923	TGTTTAAACCTGTTGATTCATTTATAAAAGAGTCGACTCATAGTGCTTCA	38972

C  FP016064.5	83905	AACGAGTCGCCTTGATACCGATTCATTAGGTGTTTCGCCATGACGTACGA	83856
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	38973	AACGAGTCGCCTTGATACCGATTCATTAGGTGTTTCGCCATGACGTACGA	39022

C  FP016064.5	83855	ACAAAACCAAGTTATTCACGTGCACGCGCAAACATGGGAGATTTGAAACC	83806
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39023	ACAAAACCAAGTTATTCACGTGCACGCGCAAACATGGGAGATTTGAAACC	39072

C  FP016064.5	83805	TGCGGCCCCGCCCTCTGACACAGATACCCACACACACACACACAAACACA	83756
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39073	TGCGGCCCCGCCCTCTGACACAGATACCCACACACACACACACAAACACA	39122

C  FP016064.5	83755	CACACACAAACATGCCGGTCGATTGAAGTCACACTGCAGATGGATATTAT	83706
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39123	CACACACAAACATGCCGGTCGATTGAAGTCACACTGCAGATGGATATTAT	39172

C  FP016064.5	83705	TGAGTCTCTACCCAAAGATGAAACCTCAGCATAAGCCCAGCTTTAAGCAG	83656
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39173	TGAGTCTCTACCCAAAGATGAAACCTCAGCATAAGCCCAGCTTTAAGCAG	39222

C  FP016064.5	83655	TTGGAAACTACAGGAAACTTCTGGAAACTACATGCTACAAAGAATACTTC	83606
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39223	TTGGAAACTACAGGAAACTTCTGGAAACTACATGCTACAAAGAATACTTC	39272

C  FP016064.5	83605	GTTTGTTAAAGGAAGGATCAGTAAAGACATGTCAGGACATGCATCGGTTT	83556
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39273	GTTTGTTAAAGGAAGGATCAGTAAAGACATGTCAGGACATGCATCGGTTT	39322

C  FP016064.5	83555	CTTCCTCCATTTCTCAAGTGTAAGTACGTGCGATTAAACTTGCCTTGTTT	83506
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39323	CTTCCTCCATTTCTCAAGTGTAAGTACGTGCGATTAAACTTGCCTTGTTT	39372

C  FP016064.5	83505	ACTCTAGCTTGCAAATATATTTAGTTGTGATTTGTTACTTGTAACCGTGT	83456
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39373	ACTCTAGCTTGCAAATATATTTAGTTGTGATTTGTTACTTGTAACCGTGT	39422

C  FP016064.5	83455	GTACTGTCTCAGGTTAACTTGTTATATTCTCATATCGTGTGCAAAGCCAC	83406
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39423	GTACTGTCTCAGGTTAACTTGTTATATTCTCATATCGTGTGCAAAGCCAC	39472

C  FP016064.5	83405	GTTAAAAACACGACGCGTGCTGCTTTGTTTACGTTCCCGTGGAGGAGTGT	83356
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39473	GTTAAAAACACGACGCGTGCTGCTTTGTTTACGTTCCCGTGGAGGAGTGT	39522

C  FP016064.5	83355	AATGTGTGTGTTTTGAGTTTCTGCTCAATAAAATAGTTAGTCGTCTGTAT	83306
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39523	AATGTGTGTGTTTTGAGTTTCTGCTCAATAAAATAGTTAGTCGTCTGTAT	39572

C  FP016064.5	83305	TTACATTCATCCACTGGCAGCTAAACTCCACGCCTTACACTATCAAGCGT	83256
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39573	TTACATTCATCCACTGGCAGCTAAACTCCACGCCTTACACTATCAAGCGT	39622

C  FP016064.5	83255	ATATAAACTCTGACTACTTCTATATTGTTGATTAGCTGCTGGCTATTCGC	83206
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39623	ATATAAACTCTGACTACTTCTATATTGTTGATTAGCTGCTGGCTATTCGC	39672

C  FP016064.5	83205	TCTGTCTCTGGCTGAAAGCAGTTAGTGTCAACCAATCGCAACAGACTGTC	83156
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39673	TCTGTCTCTGGCTGAAAGCAGTTAGTGTCAACCAATCGCAACAGACTGTC	39722

C  FP016064.5	83155	ATTGGTCCAATCAGCGCAGATTAGCTTCGCGCTAAGGAGGGGTTTGGGAA	83106
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39723	ATTGGTCCAATCAGCGCAGATTAGCTTCGCGCTAAGGAGGGGTTTGGGAA	39772

C  FP016064.5	83105	CAAATGAATCACTAGACGATTCATACAGGAGTCGCTGGAATAATTAGGTA	83056
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39773	CAAATGAATCACTAGACGATTCATACAGGAGTCGCTGGAATAATTAGGTA	39822

C  FP016064.5	83055	AAAATAAATGCAGATTATAAGACCATGAAAGTGTTTTTTGACCTTGCATG	83006
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39823	AAAATAAATGCAGATTATAAGACCATGAAAGTGTTTTTTGACCTTGCATG	39872

C  FP016064.5	83005	CATATTAGACTGTTGTTGGAGACCCTTACAACCAAAATAAGACCCTATTT	82956
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39873	CATATTAGACTGTTGTTGGAGACCCTTACAACCAAAATAAGACCCTATTT	39922

C  FP016064.5	82955	CATGTATTATATGGGCTCTTTAATGACAGCTCATTACCTACATATGATCT	82906
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39923	CATGTATTATATGGGCTCTTTAATGACAGCTCATTACCTACATATGATCT	39972

C  FP016064.5	82905	TGCAGATATCATTCACAATGATGTAGTCGTTAAAATAACTAATCTAGCAT	82856
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	39973	TGCAGATATCATTCACAATGATGTAGTCGTTAAAATAACTAATCTAGCAT	40022

C  FP016064.5	82855	TTTCTCTTAGCAACATCAGATGATTCAGAAACTAATTCACTGTAATAACA	82806
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40023	TTTCTCTTAGCAACATCAGATGATTCAGAAACTAATTCACTGTAATAACA	40072

C  FP016064.5	82805	TTTTGAAATGTTATTTCTCAAAGAAAAGAACATCATCAGGGCTTGAAATT	82756
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40073	TTTTGAAATGTTATTTCTCAAAGAAAAGAACATCATCAGGGCTTGAAATT	40122

C  FP016064.5	82755	GCATTTTCCATTTTGGTCGCATATGCGCCTGAAATTTAAGCTATGCGACC	82706
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40123	GCATTTTCCATTTTGGTCGCATATGCGCCTGAAATTTAAGCTATGCGACC	40172

C  FP016064.5	82705	TCATAATATATTTGGGAGCATGTGTGCGACTGCATATAATGGCTGTAGTG	82656
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40173	TCATAATATATTTGGGAGCATGTGTGCGACTGCATATAATGGCTGTAGTG	40222

C  FP016064.5	82655	CGACCTGTTTTTTTTTTTTTCTTCTTTCTAAAAACGTGCTCAATCGGTCT	82606
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40223	CGACCTGTTTTTTTTTTTTTCTTCTTTCTAAAAACGTGCTCAATCGGTCT	40272

C  FP016064.5	82605	TCCTTGCCGCTATATTGGTTCATATATTAACTGTCAATCACGCAAGACTT	82556
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40273	TCCTTGCCGCTATATTGGTTCATATATTAACTGTCAATCACGCAAGACTT	40322

C  FP016064.5	82555	TTCGCTGTCAGATGACGGGGAGCTTTTGTGACTGTGTGGATTGCAAACGA	82506
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40323	TTCGCTGTCAGATGACGGGGAGCTTTTGTGACTGTGTGGATTGCAAACGA	40372

C  FP016064.5	82505	CTGAAGAGTGAAAAGTACACAGAATCTCAATGCGTTGCATTCACTGCGTG	82456
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40373	CTGAAGAGTGAAAAGTACACAGAATCTCAATGCGTTGCATTCACTGCGTG	40422

C  FP016064.5	82455	TTCAGCGCAAATGTCCGCTAAATGTACAATCTAATACTGTACACACCATC	82406
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40423	TTCAGCGCAAATGTCCGCTAAATGTACAATCTAATACTGTACACACCATC	40472

C  FP016064.5	82405	GCCAAAGAAGCTCGCCTTTACTAAATTTAAACTGATGCGGCTTATAACAC	82356
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40473	GCCAAAGAAGCTCGCCTTTACTAAATTTAAACTGATGCGGCTTATAACAC	40522

C  FP016064.5	82355	AGAACAGTATTGCGCGAGTGGTCATCGCAAGAATCCTGCTCTTAATTTTC	82306
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40523	AGAACAGTATTGCGCGAGTGGTCATCGCAAGAATCCTGCTCTTAATTTTC	40572

C  FP016064.5	82305	TATTTAATTATGACTGCTTTGCAGCTTTCAGCCTTAAATTGAATGATTTA	82256
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40573	TATTTAATTATGACTGCTTTGCAGCTTTCAGCCTTAAATTGAATGATTTA	40622

C  FP016064.5	82255	TTATAATCTTTTGTTTGTTTTGTAGCAGAAGTAGTATTTATTAAATTGAC	82206
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40623	TTATAATCTTTTGTTTGTTTTGTAGCAGAAGTAGTATTTATTAAATTGAC	40672

C  FP016064.5	82205	ATGCATATAAAAACAATTGTACATCATAAGACCAAGCCCCTATAAATAGT	82156
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40673	ATGCATATAAAAACAATTGTACATCATAAGACCAAGCCCCTATAAATAGT	40722

C  FP016064.5	82155	CAAAGCATGTCCTACCTCTGTTTTCTCTCCACTTTAAGCATTAGCACATC	82106
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40723	CAAAGCATGTCCTACCTCTGTTTTCTCTCCACTTTAAGCATTAGCACATC	40772

C  FP016064.5	82105	CAATCGCCGTAACTTTAAACAATTGATAACTGATTTGTGAAACAAATATA	82056
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40773	CAATCGCCGTAACTTTAAACAATTGATAACTGATTTGTGAAACAAATATA	40822

C  FP016064.5	82055	AAAAAAAATGTGATACTTACAAATCTTCCTTGAGACTAAGAGCTATTTTT	82006
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40823	AAAAAAAATGTGATACTTACAAATCTTCCTTGAGACTAAGAGCTATTTTT	40872

C  FP016064.5	82005	TCCTTGCTTCCATCAGATCCCTGAGAATGCATGCGTGACTGTGCTTCCTC	81956
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40873	TCCTTGCTTCCATCAGATCCCTGAGAATGCATGCGTGACTGTGCTTCCTC	40922

C  FP016064.5	81955	CAGATATGATGCTTGGACATCAGTTACTCTGAAAGAGACAAAATGGACTT	81906
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40923	CAGATATGATGCTTGGACATCAGTTACTCTGAAAGAGACAAAATGGACTT	40972

C  FP016064.5	81905	AAAGGTGCCTTATTATACCCCTTTTTCAAGATTTAAGTTAAGCCTTTTGT	81856
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	40973	AAAGGTGCCTTATTATACCCCTTTTTCAAGATTTAAGTTAAGCCTTTTGT	41022

C  FP016064.5	81855	GTTTCCAGAATGTGTCTGTAAAGTTTCAACTCAAAACGCCCATCAGATTA	81806
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	41023	GTTTCCAGAATGTGTCTGTAAAGTTTCAACTCAAAACGCCCATCAGATTA	41072

C  FP016064.5	81805	TTTATTAAACCTTAAGGCCTGGCAACACAGAGACGTTTTTTTGCTCAGGT	81756
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	41073	TTTATTAAACCTTAAGGCCTGGCAACACAGAGACGTTTTTTTGCTCAGGT	41122

C  FP016064.5	81755	TTTCTGTCAACGTTTAACGCCTCGTGACTAAATGAAGGCG	81716
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FP017157.8	41123	TTTCTGTCAACGTTTAACGCCTCGTGACTAAATGAAGGCG	41162

Overview

Query
FP016064.5 - 84355 bps
Hit
FP017157.8 - 41162 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2640 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100026408171684355-138523411621
Short-link