<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FO681524.2	1	GAAAAGAATATGACATCCTTGTATCTACTGTCAGAATTCAGCAAATCTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39190	GAAAAGAATATGACATCCTTGTATCTACTGTCAGAATTCAGCAAATCTTT	39239

FO681524.2	51	TTGCAGATTTGCTTCAGATATTTCTAAAACAGATTGTACTCAGGCTTCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39240	TTGCAGATTTGCTTCAGATATTTCTAAAACAGATTGTACTCAGGCTTCCC	39289

FO681524.2	101	TTTTCTCCCTCCTTCCCTCTCTGGAATGTGAGCTTGATTCTGAACTTTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39290	TTTTCTCCCTCCTTCCCTCTCTGGAATGTGAGCTTGATTCTGAACTTTCT	39339

FO681524.2	151	ATGAATAATTGCAGTGTGAGCTTATACAAATGTACTACATATTTTTATAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39340	ATGAATAATTGCAGTGTGAGCTTATACAAATGTACTACATATTTTTATAC	39389

FO681524.2	201	ATCTATACATAAGGTTTCAAAAAGGTTACATCAATGGAACGGTATTCTAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39390	ATCTATACATAAGGTTTCAAAAAGGTTACATCAATGGAACGGTATTCTAT	39439

FO681524.2	251	CCTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39440	CCTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGC	39489

FO681524.2	301	TGGAGTGCAGTAGTGTGAGTTTGCAGCCTCAAACTCAAGGGCTCGAGTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39490	TGGAGTGCAGTAGTGTGAGTTTGCAGCCTCAAACTCAAGGGCTCGAGTGA	39539

FO681524.2	351	TCCTCCCACTATAGTCTCCCGAGTAGCTGGCGCTACAGGCACGCTAAGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39540	TCCTCCCACTATAGTCTCCCGAGTAGCTGGCGCTACAGGCACGCTAAGTT	39589

FO681524.2	401	TAAAAACTTGTTTTGTTTTGTTTTGTAGAGATGGAGGTTTTTTTTGTTAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39590	TAAAAACTTGTTTTGTTTTGTTTTGTAGAGATGGAGGTTTTTTTTGTTAT	39639

FO681524.2	451	TTTTTTTTCTTTTCTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGCTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39640	TTTTTTTTCTTTTCTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGCTGG	39689

FO681524.2	501	AGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39690	AGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA	39739

FO681524.2	551	AGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTACTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39740	AGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTACTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCA	39789

FO681524.2	601	TCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39790	TCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACC	39839

FO681524.2	651	ATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCCAGTGATCCGCCCACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39840	ATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCCAGTGATCCGCCCACC	39889

FO681524.2	701	TCAGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCGTGAGCCCCCATGCCCGACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39890	TCAGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCGTGAGCCCCCATGCCCGACC	39939

FO681524.2	751	TGGGGTCTTATTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCGAAATCCTGTGCTCCAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39940	TGGGGTCTTATTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCGAAATCCTGTGCTCCAGT	39989

FO681524.2	801	GATGTGCTCACCTCAACCTCCCAGGGTGCTGGATTACAGGTGTGAGCCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	39990	GATGTGCTCACCTCAACCTCCCAGGGTGCTGGATTACAGGTGTGAGCCAC	40039

FO681524.2	851	TGTGCCTGGCTGATGTAACTAATACTCCATTCTACCTCCATTCTACAACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40040	TGTGCCTGGCTGATGTAACTAATACTCCATTCTACCTCCATTCTACAACA	40089

FO681524.2	901	ATGTGCTTTTTCCCTACTCAAATCTTCTCACTTCCTGCATGTTGACGTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40090	ATGTGCTTTTTCCCTACTCAAATCTTCTCACTTCCTGCATGTTGACGTGG	40139

FO681524.2	951	AGCTTCAGCTCATTCACCTGCATTTTTATAATGCGTGCTCTGTTGTGTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40140	AGCTTCAGCTCATTCACCTGCATTTTTATAATGCGTGCTCTGTTGTGTGA	40189

FO681524.2	1001	GTATGCCACCATCTAGTTCTCTTATTTATTTATTTTTTTAGATGCAGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40190	GTATGCCACCATCTAGTTCTCTTATTTATTTATTTTTTTAGATGCAGTTT	40239

FO681524.2	1051	CACACTTGTCGCCCTGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATTTCGGCTCACTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40240	CACACTTGTCGCCCTGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATTTCGGCTCACTGC	40289

FO681524.2	1101	AACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40290	AACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT	40339

FO681524.2	1151	AGCTGGAACTACAGGCATGAGCCACCACCCCAGCTAATTTTTGTATTTTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40340	AGCTGGAACTACAGGCATGAGCCACCACCCCAGCTAATTTTTGTATTTTT	40389

FO681524.2	1201	AGTAGAGACAGGGTTTCATCATATTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40390	AGTAGAGACAGGGTTTCATCATATTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA	40439

FO681524.2	1251	CCTCGTGATCCACCTGCCTCGGCCTTCCAACGTGCTCTTTCTCATTTTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40440	CCTCGTGATCCACCTGCCTCGGCCTTCCAACGTGCTCTTTCTCATTTTTT	40489

FO681524.2	1301	TGCTATTACAATACCAGTTTTTGATGCTCTCAAACGTCAGGGAGGCACCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40490	TGCTATTACAATACCAGTTTTTGATGCTCTCAAACGTCAGGGAGGCACCT	40539

FO681524.2	1351	TGCCTGCCTGTGTTCCTGTGGGCAGGAGACGCAGGGGCTGCCTTGTAAGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40540	TGCCTGCCTGTGTTCCTGTGGGCAGGAGACGCAGGGGCTGCCTTGTAAGC	40589

FO681524.2	1401	AGGCGAATATGACCCCAGAAGGGGACGGCTGGTCTGAGGGACTGGGTGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40590	AGGCGAATATGACCCCAGAAGGGGACGGCTGGTCTGAGGGACTGGGTGTG	40639

FO681524.2	1451	CTCAAATGTAAAGCCCAGTTTGTTGGGTTGGCCCGCGCACAGGAGTCGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40640	CTCAAATGTAAAGCCCAGTTTGTTGGGTTGGCCCGCGCACAGGAGTCGAG	40689

FO681524.2	1501	AATCTGGTCCTGACATAGCAGAGGCATGGTGGGCGTGTGTGGAACACCTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40690	AATCTGGTCCTGACATAGCAGAGGCATGGTGGGCGTGTGTGGAACACCTG	40739

FO681524.2	1551	ACTATTTTCATTGTTTTGTTTTCTGCTTCCGATGTGCCATTTTATGGTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40740	ACTATTTTCATTGTTTTGTTTTCTGCTTCCGATGTGCCATTTTATGGTGT	40789

FO681524.2	1601	GGAAGTAAAGTCCAGCTGTGTTTGTTTTGATTTTTTCTTGAGATGGAGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40790	GGAAGTAAAGTCCAGCTGTGTTTGTTTTGATTTTTTCTTGAGATGGAGTT	40839

FO681524.2	1651	TGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTTACTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40840	TGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTTACTGC	40889

FO681524.2	1701	AACCTCTGTCCCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40890	AACCTCTGTCCCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT	40939

FO681524.2	1751	AGCTGGGATTGTAGGCCTGTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40940	AGCTGGGATTGTAGGCCTGTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT	40989

FO681524.2	1801	TAGTAGAGATGGGGTTTTACTATGTTGGCCAGGCTGATCTTAAATTCCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	40990	TAGTAGAGATGGGGTTTTACTATGTTGGCCAGGCTGATCTTAAATTCCCA	41039

FO681524.2	1851	ACCTCAGGTGATCCACCCCGCTTGGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	41040	ACCTCAGGTGATCCACCCCGCTTGGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGG	41089

FO681524.2	1901	CGTGAGCCACTGTGCTGGCCAAAGTCCAGTTTTATTAAATAAGAAACCAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	41090	CGTGAGCCACTGTGCTGGCCAAAGTCCAGTTTTATTAAATAAGAAACCAA	41139

FO681524.2	1951	GACCGGATATATGGGGGCTCATGCCTGTGATCTCAGCATGTTGGGAGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO681525.1	41140	GACCGGATATATGGGGGCTCATGCCTGTGATCTCAGCATGTTGGGAGATC	41189

Overview

Query
FO681524.2 - 29911 bps
Hit
FO681525.1 - 41189 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link