<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
FO681524.2 1 GAAAAGAATATGACATCCTTGTATCTACTGTCAGAATTCAGCAAATCTTT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39190 GAAAAGAATATGACATCCTTGTATCTACTGTCAGAATTCAGCAAATCTTT 39239 FO681524.2 51 TTGCAGATTTGCTTCAGATATTTCTAAAACAGATTGTACTCAGGCTTCCC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39240 TTGCAGATTTGCTTCAGATATTTCTAAAACAGATTGTACTCAGGCTTCCC 39289 FO681524.2 101 TTTTCTCCCTCCTTCCCTCTCTGGAATGTGAGCTTGATTCTGAACTTTCT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39290 TTTTCTCCCTCCTTCCCTCTCTGGAATGTGAGCTTGATTCTGAACTTTCT 39339 FO681524.2 151 ATGAATAATTGCAGTGTGAGCTTATACAAATGTACTACATATTTTTATAC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39340 ATGAATAATTGCAGTGTGAGCTTATACAAATGTACTACATATTTTTATAC 39389 FO681524.2 201 ATCTATACATAAGGTTTCAAAAAGGTTACATCAATGGAACGGTATTCTAT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39390 ATCTATACATAAGGTTTCAAAAAGGTTACATCAATGGAACGGTATTCTAT 39439 FO681524.2 251 CCTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39440 CCTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 39489 FO681524.2 301 TGGAGTGCAGTAGTGTGAGTTTGCAGCCTCAAACTCAAGGGCTCGAGTGA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39490 TGGAGTGCAGTAGTGTGAGTTTGCAGCCTCAAACTCAAGGGCTCGAGTGA 39539 FO681524.2 351 TCCTCCCACTATAGTCTCCCGAGTAGCTGGCGCTACAGGCACGCTAAGTT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39540 TCCTCCCACTATAGTCTCCCGAGTAGCTGGCGCTACAGGCACGCTAAGTT 39589 FO681524.2 401 TAAAAACTTGTTTTGTTTTGTTTTGTAGAGATGGAGGTTTTTTTTGTTAT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39590 TAAAAACTTGTTTTGTTTTGTTTTGTAGAGATGGAGGTTTTTTTTGTTAT 39639 FO681524.2 451 TTTTTTTTCTTTTCTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGCTGG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39640 TTTTTTTTCTTTTCTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTCACCCAGGCTGG 39689 FO681524.2 501 AGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39690 AGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 39739 FO681524.2 551 AGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTACTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39740 AGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTACTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCA 39789 FO681524.2 601 TCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACC 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39790 TCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACC 39839 FO681524.2 651 ATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCCAGTGATCCGCCCACC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39840 ATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTAACCTCCAGTGATCCGCCCACC 39889 FO681524.2 701 TCAGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCGTGAGCCCCCATGCCCGACC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39890 TCAGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGCGTGAGCCCCCATGCCCGACC 39939 FO681524.2 751 TGGGGTCTTATTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCGAAATCCTGTGCTCCAGT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39940 TGGGGTCTTATTATGTTGTCCAGGCTGGTCTCGAAATCCTGTGCTCCAGT 39989 FO681524.2 801 GATGTGCTCACCTCAACCTCCCAGGGTGCTGGATTACAGGTGTGAGCCAC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 39990 GATGTGCTCACCTCAACCTCCCAGGGTGCTGGATTACAGGTGTGAGCCAC 40039 FO681524.2 851 TGTGCCTGGCTGATGTAACTAATACTCCATTCTACCTCCATTCTACAACA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40040 TGTGCCTGGCTGATGTAACTAATACTCCATTCTACCTCCATTCTACAACA 40089 FO681524.2 901 ATGTGCTTTTTCCCTACTCAAATCTTCTCACTTCCTGCATGTTGACGTGG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40090 ATGTGCTTTTTCCCTACTCAAATCTTCTCACTTCCTGCATGTTGACGTGG 40139 FO681524.2 951 AGCTTCAGCTCATTCACCTGCATTTTTATAATGCGTGCTCTGTTGTGTGA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40140 AGCTTCAGCTCATTCACCTGCATTTTTATAATGCGTGCTCTGTTGTGTGA 40189 FO681524.2 1001 GTATGCCACCATCTAGTTCTCTTATTTATTTATTTTTTTAGATGCAGTTT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40190 GTATGCCACCATCTAGTTCTCTTATTTATTTATTTTTTTAGATGCAGTTT 40239 FO681524.2 1051 CACACTTGTCGCCCTGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATTTCGGCTCACTGC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40240 CACACTTGTCGCCCTGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATTTCGGCTCACTGC 40289 FO681524.2 1101 AACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40290 AACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 40339 FO681524.2 1151 AGCTGGAACTACAGGCATGAGCCACCACCCCAGCTAATTTTTGTATTTTT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40340 AGCTGGAACTACAGGCATGAGCCACCACCCCAGCTAATTTTTGTATTTTT 40389 FO681524.2 1201 AGTAGAGACAGGGTTTCATCATATTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40390 AGTAGAGACAGGGTTTCATCATATTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA 40439 FO681524.2 1251 CCTCGTGATCCACCTGCCTCGGCCTTCCAACGTGCTCTTTCTCATTTTTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40440 CCTCGTGATCCACCTGCCTCGGCCTTCCAACGTGCTCTTTCTCATTTTTT 40489 FO681524.2 1301 TGCTATTACAATACCAGTTTTTGATGCTCTCAAACGTCAGGGAGGCACCT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40490 TGCTATTACAATACCAGTTTTTGATGCTCTCAAACGTCAGGGAGGCACCT 40539 FO681524.2 1351 TGCCTGCCTGTGTTCCTGTGGGCAGGAGACGCAGGGGCTGCCTTGTAAGC 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40540 TGCCTGCCTGTGTTCCTGTGGGCAGGAGACGCAGGGGCTGCCTTGTAAGC 40589 FO681524.2 1401 AGGCGAATATGACCCCAGAAGGGGACGGCTGGTCTGAGGGACTGGGTGTG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40590 AGGCGAATATGACCCCAGAAGGGGACGGCTGGTCTGAGGGACTGGGTGTG 40639 FO681524.2 1451 CTCAAATGTAAAGCCCAGTTTGTTGGGTTGGCCCGCGCACAGGAGTCGAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40640 CTCAAATGTAAAGCCCAGTTTGTTGGGTTGGCCCGCGCACAGGAGTCGAG 40689 FO681524.2 1501 AATCTGGTCCTGACATAGCAGAGGCATGGTGGGCGTGTGTGGAACACCTG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40690 AATCTGGTCCTGACATAGCAGAGGCATGGTGGGCGTGTGTGGAACACCTG 40739 FO681524.2 1551 ACTATTTTCATTGTTTTGTTTTCTGCTTCCGATGTGCCATTTTATGGTGT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40740 ACTATTTTCATTGTTTTGTTTTCTGCTTCCGATGTGCCATTTTATGGTGT 40789 FO681524.2 1601 GGAAGTAAAGTCCAGCTGTGTTTGTTTTGATTTTTTCTTGAGATGGAGTT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40790 GGAAGTAAAGTCCAGCTGTGTTTGTTTTGATTTTTTCTTGAGATGGAGTT 40839 FO681524.2 1651 TGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTTACTGC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40840 TGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTTACTGC 40889 FO681524.2 1701 AACCTCTGTCCCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40890 AACCTCTGTCCCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGT 40939 FO681524.2 1751 AGCTGGGATTGTAGGCCTGTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40940 AGCTGGGATTGTAGGCCTGTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 40989 FO681524.2 1801 TAGTAGAGATGGGGTTTTACTATGTTGGCCAGGCTGATCTTAAATTCCCA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 40990 TAGTAGAGATGGGGTTTTACTATGTTGGCCAGGCTGATCTTAAATTCCCA 41039 FO681524.2 1851 ACCTCAGGTGATCCACCCCGCTTGGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 41040 ACCTCAGGTGATCCACCCCGCTTGGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGG 41089 FO681524.2 1901 CGTGAGCCACTGTGCTGGCCAAAGTCCAGTTTTATTAAATAAGAAACCAA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 41090 CGTGAGCCACTGTGCTGGCCAAAGTCCAGTTTTATTAAATAAGAAACCAA 41139 FO681524.2 1951 GACCGGATATATGGGGGCTCATGCCTGTGATCTCAGCATGTTGGGAGATC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| FO681525.1 41140 GACCGGATATATGGGGGCTCATGCCTGTGATCTCAGCATGTTGGGAGATC 41189
