<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1064 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FO681511.2	1064	CAACCTCCACCTTCTGGGTTCAAGGGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAG	1015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	1	CAACCTCCACCTTCTGGGTTCAAGGGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAG	50

C  FO681511.2	1014	TAGCTGGGACTACAGGCGCCCGTCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTT	965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	51	TAGCTGGGACTACAGGCGCCCGTCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTT	100

C  FO681511.2	964	TTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATATTGGCCAGGCGGGTCTCGAACTCCT	915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	101	TTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATATTGGCCAGGCGGGTCTCGAACTCCT	150

C  FO681511.2	914	GACCTTGTGATCCCCCGCCTCTGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA	865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	151	GACCTTGTGATCCCCCGCCTCTGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA	200

C  FO681511.2	864	TGACCGACTAAGCCTGGCGGCTACCTCCACTTCTAACACTCTGGTCCAAG	815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	201	TGACCGACTAAGCCTGGCGGCTACCTCCACTTCTAACACTCTGGTCCAAG	250

C  FO681511.2	814	CCTCATCATTCCTTACCTGGAGTTTTGCAGCTGCCTCCTAAATGATGTCC	765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	251	CCTCATCATTCCTTACCTGGAGTTTTGCAGCTGCCTCCTAAATGATGTCC	300

C  FO681511.2	764	CTGTTCCATGCTTTCCACCCCTTAGTCTATTCTCAACACAGAAGCCAGAG	715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	301	CTGTTCCATGCTTTCCACCCCTTAGTCTATTCTCAACACAGAAGCCAGAG	350

C  FO681511.2	714	TGATCCTTTTAAGTCATTATTCAAATCACATCACCTTTGTCAGATTTTTC	665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	351	TGATCCTTTTAAGTCATTATTCAAATCACATCACCTTTGTCAGATTTTTC	400

C  FO681511.2	664	CAGTGTTTCCTCATCTCATTCAGAATAAAAATCGAAGTTCTGGCCAGGCA	615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	401	CAGTGTTTCCTCATCTCATTCAGAATAAAAATCGAAGTTCTGGCCAGGCA	450

C  FO681511.2	614	TAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGGACTTGGGAGGCCGAAGCAGGCGGA	565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	451	TAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGGACTTGGGAGGCCGAAGCAGGCGGA	500

C  FO681511.2	564	TCACCTGAGGTTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGCGAAACC	515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	501	TCACCTGAGGTTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGCGAAACC	550

C  FO681511.2	514	CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGCATGGTGGCGGGCACCT	465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	551	CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGCATGGTGGCGGGCACCT	600

C  FO681511.2	464	GTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG	415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	601	GTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG	650

C  FO681511.2	414	GAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGATATGACGCCACTGCACTCCAGCCTGG	365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	651	GAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGATATGACGCCACTGCACTCCAGCCTGG	700

C  FO681511.2	364	GCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAAGAGTGTGTAGT	315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	701	GCAACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAGAAAAAAAAAAAAAGAGTGTGTAGT	750

C  FO681511.2	314	GAGAAGAGAAGGGGCTAAAAGGACCTTCCTTGACCCATTAGAGCCAGTAA	265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	751	GAGAAGAGAAGGGGCTAAAAGGACCTTCCTTGACCCATTAGAGCCAGTAA	800

C  FO681511.2	264	AGGAGAGAGCCAAGAAAGAGCAGGGAAGGAACTACCACAGGTGGACAGAG	215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	801	AGGAGAGAGCCAAGAAAGAGCAGGGAAGGAACTACCACAGGTGGACAGAG	850

C  FO681511.2	214	TTTGGAGAGAACAAGGTTAAAACATCAAGAGAAGAGAATTTTGAGCAGGA	165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	851	TTTGGAGAGAACAAGGTTAAAACATCAAGAGAAGAGAATTTTGAGCAGGA	900

C  FO681511.2	164	GAAAATGGCCAAATGTCAGTGCTGCAGAGATGTTAAATAAAAGAAAGACA	115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	901	GAAAATGGCCAAATGTCAGTGCTGCAGAGATGTTAAATAAAAGAAAGACA	950

C  FO681511.2	114	GAAAGTGCCCTGGGTGTGCCAGTTATGACTTTGGTGAGAGCATTGTCAGT	65
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	951	GAAAGTGCCCTGGGTGTGCCAGTTATGACTTTGGTGAGAGCATTGTCAGT	1000

C  FO681511.2	64	GAATGTCAGAGACAGATGCCAGATGACAGTGGAGTGAGGAGGACAGACAA	15
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  FO681509.1	1001	GAATGTCAGAGACAGATGCCAGATGACAGTGGAGTGAGGAGGACAGACAA	1050

C  FO681511.2	14	ACGTGTGAGGCCTG	1
			||||||||||||||
  FO681509.1	1051	ACGTGTGAGGCCTG	1064

Overview

Query
FO681511.2 - 40086 bps
Hit
FO681509.1 - 40576 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1064 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link