<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

FQ482119.6	1	GATCTGGCCATCCAAGATTAGCCTTTGGACGGGTCCTCGTTTTTAGTGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155218	GATCTGGCCATCCAAGATTAGCCTTTGGACGGGTCCTCGTTTTTAGTGCT	155267

FQ482119.6	51	CAGCAGCCCAGGGCAGTGAGAAAATCGTTGTAGATGTGGTCTTGGCGTAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155268	CAGCAGCCCAGGGCAGTGAGAAAATCGTTGTAGATGTGGTCTTGGCGTAT	155317

FQ482119.6	101	TTGCAGTAGCAGAAATTTGCCAGGAGGCGGCAGCACTGTTTGATCTGGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155318	TTGCAGTAGCAGAAATTTGCCAGGAGGCGGCAGCACTGTTTGATCTGGTG	155367

FQ482119.6	151	CCTTAGCAGCCGCAGTTCCCGCCATGGCCACAGGGAGGCAGTGCAAGAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155368	CCTTAGCAGCCGCAGTTCCCGCCATGGCCACAGGGAGGCAGTGCAAGAGC	155417

FQ482119.6	201	ACGCCGCCTCACCTGAGAGGCGGTTGAGTTGGCGGTTCTCAGCGCAAAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155418	ACGCCGCCTCACCTGAGAGGCGGTTGAGTTGGCGGTTCTCAGCGCAAAAG	155467

FQ482119.6	251	CAGTTTTATTAACGTTACTGCTGTGATTACAGAGGCCATTCAGCAAATAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155468	CAGTTTTATTAACGTTACTGCTGTGATTACAGAGGCCATTCAGCAAATAT	155517

FQ482119.6	301	TTGTTTGAAAGGGTCAAATCTATGTGTGTGAAGTGTTAGACGCTCAGGCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155518	TTGTTTGAAAGGGTCAAATCTATGTGTGTGAAGTGTTAGACGCTCAGGCG	155567

FQ482119.6	351	TGTCCAACTATTTGCGACCCCATGGACTGCAGCCCGCCAGGCTCCTCTGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155568	TGTCCAACTATTTGCGACCCCATGGACTGCAGCCCGCCAGGCTCCTCTGT	155617

FQ482119.6	401	CCATGGAATCCTCCAGGTCAGAATACTGAATAGGGGTGACATTCCCTTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155618	CCATGGAATCCTCCAGGTCAGAATACTGAATAGGGGTGACATTCCCTTCT	155667

FQ482119.6	451	CCAGGGGATCTTCCTGACCCGGGGATCGAACCCGGGGATTGAACCCGGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155668	CCAGGGGATCTTCCTGACCCGGGGATCGAACCCGGGGATTGAACCCGGGT	155717

FQ482119.6	501	CTCCTGCATTGCAGGCAAATTCTTTACCGTATGGGCTACCAGGGAAGCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155718	CTCCTGCATTGCAGGCAAATTCTTTACCGTATGGGCTACCAGGGAAGCTC	155767

FQ482119.6	551	CAGAGAAGCTTGGCAGGTGCCACAGCCTTGGGTGTAGGCTACTTCTGGCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155768	CAGAGAAGCTTGGCAGGTGCCACAGCCTTGGGTGTAGGCTACTTCTGGCC	155817

FQ482119.6	601	CTTTGCAGTGGAAAGTGGCTAGAGAAAACACACTACCGTGCTGACTGGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155818	CTTTGCAGTGGAAAGTGGCTAGAGAAAACACACTACCGTGCTGACTGGCC	155867

FQ482119.6	651	TCGCTTTAAACTCACACCCGTAAGTACCACTGGGACCCTTACCAGCCTCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155868	TCGCTTTAAACTCACACCCGTAAGTACCACTGGGACCCTTACCAGCCTCT	155917

FQ482119.6	701	GTTTCCCCCGTTCATTGCCTCTAGCTCTCTCCTGGATGCCTATTTGACAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155918	GTTTCCCCCGTTCATTGCCTCTAGCTCTCTCCTGGATGCCTATTTGACAC	155967

FQ482119.6	751	TTTGAACTCACTCGGCAAGACTTCCAACTGTTGATGGATTTGCTTCCCAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	155968	TTTGAACTCACTCGGCAAGACTTCCAACTGTTGATGGATTTGCTTCCCAC	156017

FQ482119.6	801	TTCACTGACCAAATGAAGCAGCTGGAAGAGACCCTTCACCATGTCCCACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156018	TTCACTGACCAAATGAAGCAGCTGGAAGAGACCCTTCACCATGTCCCACC	156067

FQ482119.6	851	AGCATCCACATGCTTACAGTGAAGAGGAACTGCCCTGGTTCCTACAGGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156068	AGCATCCACATGCTTACAGTGAAGAGGAACTGCCCTGGTTCCTACAGGCA	156117

FQ482119.6	901	AATCTGCCTGTGCCCTGGATGGAATCCCGTCTCATCTCCAGGGAAACCGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156118	AATCTGCCTGTGCCCTGGATGGAATCCCGTCTCATCTCCAGGGAAACCGG	156167

FQ482119.6	951	AATCCGGCAGTGGTCCACGTTTACGCTACATCATCAGTTTTCCTCTCTAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156168	AATCCGGCAGTGGTCCACGTTTACGCTACATCATCAGTTTTCCTCTCTAC	156217

FQ482119.6	1001	TGTGTTATTCTCAGTAGCACCCAAACCTGTTGCTATTGACCCCATCATAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156218	TGTGTTATTCTCAGTAGCACCCAAACCTGTTGCTATTGACCCCATCATAA	156267

FQ482119.6	1051	TTTAGAATCCCTCTCTGGCCCCAAGTACCTGTCAGCTATGCCTCACCTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156268	TTTAGAATCCCTCTCTGGCCCCAAGTACCTGTCAGCTATGCCTCACCTCT	156317

FQ482119.6	1101	CTCCTCCTTTTCCAGTAAAATTCCTGGAGTTTTCCATGCTTGCTGTGTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156318	CTCCTCCTTTTCCAGTAAAATTCCTGGAGTTTTCCATGCTTGCTGTGTCC	156367

FQ482119.6	1151	AAAGTCTTTCCTGTCCATTCTCAGGCAAACCCACTGCTATCAGGCTTTTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156368	AAAGTCTTTCCTGTCCATTCTCAGGCAAACCCACTGCTATCAGGCTTTTG	156417

FQ482119.6	1201	GTCAGACTATTCCGAAAAATCTCTTGACCTCCATCATTTAAATCCAATGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156418	GTCAGACTATTCCGAAAAATCTCTTGACCTCCATCATTTAAATCCAATGG	156467

FQ482119.6	1251	TCAGCTCTCTGTTCTCAACTCTGTCTCTTGGGGCAAGAGACACATTGATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156468	TCAGCTCTCTGTTCTCAACTCTGTCTCTTGGGGCAAGAGACACATTGATG	156517

FQ482119.6	1301	TCTTTGCTTTCCCTGGAGACACATTCTTACTTTTGGCTCCAGGTCACCAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156518	TCTTTGCTTTCCCTGGAGACACATTCTTACTTTTGGCTCCAGGTCACCAC	156567

FQ482119.6	1351	CTTCTGCCTCCTCCCTTCTTAGTCCTTTTCTGATTCCACTTCTTCTCCCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156568	CTTCTGCCTCCTCCCTTCTTAGTCCTTTTCTGATTCCACTTCTTCTCCCC	156617

FQ482119.6	1401	AGTCTCTTATTCTTAAACTCATGGGCATCCTTACAATCTCCTACTCTGCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156618	AGTCTCTTATTCTTAAACTCATGGGCATCCTTACAATCTCCTACTCTGCC	156667

FQ482119.6	1451	CATGGTCTTCCTCGCTCAGGCAGTGGCAGCCCCATCCTTCCAGCTCCCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156668	CATGGTCTTCCTCGCTCAGGCAGTGGCAGCCCCATCCTTCCAGCTCCCAC	156717

FQ482119.6	1501	AGGCCAAAATCATTTCTGGCACGTTTGGCTCCTTCTACTGCTTCACATCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156718	AGGCCAAAATCATTTCTGGCACGTTTGGCTCCTTCTACTGCTTCACATCC	156767

FQ482119.6	1551	CACATCTAATCCTGCAGGAAATCCTGGTAAGCGCTACCTTCAAAATACAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156768	CACATCTAATCCTGCAGGAAATCCTGGTAAGCGCTACCTTCAAAATACAT	156817

FQ482119.6	1601	CCAGTTCCAACCACATCTCGTCGCCTTTACTGCTACCCCAGGCTAAACCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156818	CCAGTTCCAACCACATCTCGTCGCCTTTACTGCTACCCCAGGCTAAACCA	156867

FQ482119.6	1651	CCAGCATCTCCCCTGTATCGTGGCCACAGCCTCCTAACGGGGCTTTCTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156868	CCAGCATCTCCCCTGTATCGTGGCCACAGCCTCCTAACGGGGCTTTCTTG	156917

FQ482119.6	1701	TCCATGAGCGACCTCCTGCGATTTAATCTCAGTACAGCAGCTGGAGGGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156918	TCCATGAGCGACCTCCTGCGATTTAATCTCAGTACAGCAGCTGGAGGGGT	156967

FQ482119.6	1751	CCTTTTGTAAAAAGCCTGACCATGTCACTCCTCTGCTCTAAGCTCTCCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	156968	CCTTTTGTAAAAAGCCTGACCATGTCACTCCTCTGCTCTAAGCTCTCCAA	157017

FQ482119.6	1801	GGGATCCCCATTTCAACTGGAATACAAGCCAAAGTTCTTAGAAGGGTGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	157018	GGGATCCCCATTTCAACTGGAATACAAGCCAAAGTTCTTAGAAGGGTGTG	157067

FQ482119.6	1851	CAAGACCCGAAACCAACCCTATCCAGTGGACACAGAACAGGAGTCACATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	157068	CAAGACCCGAAACCAACCCTATCCAGTGGACACAGAACAGGAGTCACATG	157117

FQ482119.6	1901	TGGAGTTTTAAGTTCCCTGGTAACCATGATAAAAAAGTAGAAGGAAACAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	157118	TGGAGTTTTAAGTTCCCTGGTAACCATGATAAAAAAGTAGAAGGAAACAA	157167

FQ482119.6	1951	GTGACATGGCTGTAGTAGTATATTTTATTTAACACAGTATCTCTACAATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FO393396.1	157168	GTGACATGGCTGTAGTAGTATATTTTATTTAACACAGTATCTCTACAATA	157217

Overview

Query
FQ482119.6 - 193594 bps
Hit
FO393396.1 - 157217 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link