<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  FP102116.1	33880	GGGGAGACCCAGGACATGCTGGAGGGACTATGTCTCTTGGCTGGCCTGGG	33831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18239	GGGGAGACCCAGGACATGCTGGAGGGACTATGTCTCTTGGCTGGCCTGGG	18288

C  FP102116.1	33830	AACATCTCGGGTTCCCCCCGGAGGAAATATCTGGGGTTCCTTCCAAGACT	33781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18289	AACATCTCGGGTTCCCCCCGGAGGAAATATCTGGGGTTCCTTCCAAGACT	18338

C  FP102116.1	33780	GCTGCCCCCGCAACCCAGCCCCGGAAAAGCAGTTGAAAATGTATGAATGA	33731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18339	GCTGCCCCCGCAACCCAGCCCCGGAAAAGCAGTTGAAAATGTATGAATGA	18388

C  FP102116.1	33730	ATTAATTCACGGGAGTATTAATATATCCCTTTAAGGACCTGTCAGGAACA	33681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18389	ATTAATTCACGGGAGTATTAATATATCCCTTTAAGGACCTGTCAGGAACA	18438

C  FP102116.1	33680	GAACTGTTCCTTTTAATAAGGTATCGCCCAGGGACAGACCTCTCTTTCTG	33631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18439	GAACTGTTCCTTTTAATAAGGTATCGCCCAGGGACAGACCTCTCTTTCTG	18488

C  FP102116.1	33630	GGTCTATAAAAATATATCTTGTAAGTTGTTTTTTTAATTGATTTGTAATA	33581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18489	GGTCTATAAAAATATATCTTGTAAGTTGTTTTTTTAATTGATTTGTAATA	18538

C  FP102116.1	33580	ATTATTATTATTATTTATTTTATGTAAGTATTTTTTCACTAAACCTGTCC	33531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18539	ATTATTATTATTATTTATTTTATGTAAGTATTTTTTCACTAAACCTGTCC	18588

C  FP102116.1	33530	GGGGTAAGTTATGGGTTATGGGGTTTGATTTACTGTAAAACTCAAAGACA	33481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18589	GGGGTAAGTTATGGGTTATGGGGTTTGATTTACTGTAAAACTCAAAGACA	18638

C  FP102116.1	33480	TGTTATACAAAATGAGTAAAAGATAGTGAGAATCAGAGTATTAGTTTAGT	33431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18639	TGTTATACAAAATGAGTAAAAGATAGTGAGAATCAGAGTATTAGTTTAGT	18688

C  FP102116.1	33430	TACTTGTTTTAGATCATGCTGGTTTGAGATTTAGTTCATGCAGTGAAGGT	33381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18689	TACTTGTTTTAGATCATGCTGGTTTGAGATTTAGTTCATGCAGTGAAGGT	18738

C  FP102116.1	33380	GAGATTTACCACTGAACCATAAATAAATGGAAAAGAGTAAAAATGTACAC	33331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18739	GAGATTTACCACTGAACCATAAATAAATGGAAAAGAGTAAAAATGTACAC	18788

C  FP102116.1	33330	AAGCTTTTCAGAATTAAGGCAAGGCGTTTATTTTGTAAAGCACATTTCAT	33281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18789	AAGCTTTTCAGAATTAAGGCAAGGCGTTTATTTTGTAAAGCACATTTCAT	18838

C  FP102116.1	33280	ACTAAATGTTTATTCAGAGTGCTTTACATGAGAAAATTGTTAAAACGAAT	33231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18839	ACTAAATGTTTATTCAGAGTGCTTTACATGAGAAAATTGTTAAAACGAAT	18888

C  FP102116.1	33230	TAGAAAATAATCACAAAATAAGTATAAACGTTTATATTTTAAATAAAACA	33181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18889	TAGAAAATAATCACAAAATAAGTATAAACGTTTATATTTTAAATAAAACA	18938

C  FP102116.1	33180	AAGAAAAAAATGTTTAAAATAATTAAATCTAAAAATATGTAATATTTTTT	33131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18939	AAGAAAAAAATGTTTAAAATAATTAAATCTAAAAATATGTAATATTTTTT	18988

C  FP102116.1	33130	TATATAATTATATAACATACATTTTTATAATAAAAAAAAAACACATTTAA	33081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	18989	TATATAATTATATAACATACATTTTTATAATAAAAAAAAAACACATTTAA	19038

C  FP102116.1	33080	TTGCTTAATTACATTTTTTTATTAATATAAGTGAGATCCAAGATGATGAC	33031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19039	TTGCTTAATTACATTTTTTTATTAATATAAGTGAGATCCAAGATGATGAC	19088

C  FP102116.1	33030	CTGCCACAGATAACTGTCCCTGGCGTCTGGCTTAGATCAAGACTTTTTAT	32981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19089	CTGCCACAGATAACTGTCCCTGGCGTCTGGCTTAGATCAAGACTTTTTAT	19138

C  FP102116.1	32980	TACGTTTGACTGAACATCAAATCTGTTGGAGACGTTCAATAGATTAATAA	32931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19139	TACGTTTGACTGAACATCAAATCTGTTGGAGACGTTCAATAGATTAATAA	19188

C  FP102116.1	32930	GTAGCGAAAAAGTCCACAGAGAGGGGGTGATCACCAGAATGGAGAAGTCC	32881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19189	GTAGCGAAAAAGTCCACAGAGAGGGGGTGATCACCAGAATGGAGAAGTCC	19238

C  FP102116.1	32880	CAGAGTAAAATGAGAAAATATGATACACCGGTGTTTTGGAATGTGGAAAA	32831
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19239	CAGAGTAAAATGAGAAAATATGATACACCGGTGTTTTGGAATGTGGAAAA	19288

C  FP102116.1	32830	ACTGTATCTGATGGAGCAGTTAAAAGATTTAACTTGAGCCATCACCATAC	32781
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19289	ACTGTATCTGATGGAGCAGTTAAAAGATTTAACTTGAGCCATCACCATAC	19338

C  FP102116.1	32780	TGGTAGATCTGTCTTTGTGGGATAGCAGCGTAATTAATATAAGTGAGATC	32731
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19339	TGGTAGATCTGTCTTTGTGGGATAGCAGCGTAATTAATATAAGTGAGATC	19388

C  FP102116.1	32730	CGAGACGTGACTCGCCACAGATAATCTGTTGCAGGGGGGTAAAGTCTCTG	32681
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19389	CGAGACGTGACTCGCCACAGATAATCTGTTGCAGGGGGGTAAAGTCTCTG	19438

C  FP102116.1	32680	GCTGAGATCAAGATCTTTTATTTGTTTGGCTAGCTGTAGGCTGTACTCAC	32631
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19439	GCTGAGATCAAGATCTTTTATTTGTTTGGCTAGCTGTAGGCTGTACTCAC	19488

C  FP102116.1	32630	ACTATGTAAAGTTGTCTTGAACCGTTCCGAATCACGCTTGTCCCCACTCT	32581
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19489	ACTATGTAAAGTTGTCTTGAACCGTTCCGAATCACGCTTGTCCCCACTCT	19538

C  FP102116.1	32580	AGTCTCCCCCGACGGCCCGCACTCACATTGTATTCAATCCTGGGCACGCT	32531
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19539	AGTCTCCCCCGACGGCCCGCACTCACATTGTATTCAATCCTGGGCACGCT	19588

C  FP102116.1	32530	TACATCATCGATGATGCGCTGTTCAGTAAGAAGCGCTCTCTCTCAGCACA	32481
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19589	TACATCATCGATGATGCGCTGTTCAGTAAGAAGCGCTCTCTCTCAGCACA	19638

C  FP102116.1	32480	GTGGAGATTTCTTTAGTTATATCGCTTTAGTCATTTGGGATGCGGTGACA	32431
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19639	GTGGAGATTTCTTTAGTTATATCGCTTTAGTCATTTGGGATGCGGTGACA	19688

C  FP102116.1	32430	CGCAGTCAAATAATTCGACAAACTAATCAGCCACTTTTGACGCTCATAAG	32381
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19689	CGCAGTCAAATAATTCGACAAACTAATCAGCCACTTTTGACGCTCATAAG	19738

C  FP102116.1	32380	CAATCATAAAGTCCTCGTGCTGCAGGAATTAGGAGGTTTGCTGAAGGTGC	32331
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19739	CAATCATAAAGTCCTCGTGCTGCAGGAATTAGGAGGTTTGCTGAAGGTGC	19788

C  FP102116.1	32330	AGCTGTGGTGCAATGAGGGGTTTGCCTCTTTAATAATCTACGAAAGTTTG	32281
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19789	AGCTGTGGTGCAATGAGGGGTTTGCCTCTTTAATAATCTACGAAAGTTTG	19838

C  FP102116.1	32280	CGTTCACTGAACAGTAAGGCCGTACTCACACTAGGTACAGTTGCCTCGAA	32231
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19839	CGTTCACTGAACAGTAAGGCCGTACTCACACTAGGTACAGTTGCCTCGAA	19888

C  FP102116.1	32230	CTGTAAAAGCACGCTTGTCCCTCCTCCCGTCTCCCCCGATGGCCCGCACT	32181
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19889	CTGTAAAAGCACGCTTGTCCCTCCTCCCGTCTCCCCCGATGGCCCGCACT	19938

C  FP102116.1	32180	CACACCACAAACGGGCCTCGGCACGCTTACGTCATCGCTGCTGCGCTGTT	32131
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19939	CACACCACAAACGGGCCTCGGCACGCTTACGTCATCGCTGCTGCGCTGTT	19988

C  FP102116.1	32130	CAGTGAGAAGCCCTCTCTCACTCAGCAGCACAATGGAGATTTCTCTAGTT	32081
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	19989	CAGTGAGAAGCCCTCTCTCACTCAGCAGCACAATGGAGATTTCTCTAGTT	20038

C  FP102116.1	32080	ATACAGTTTCAGTTATTTGATATGCGGTGACACGCAGTCAGATATTTCGC	32031
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	20039	ATACAGTTTCAGTTATTTGATATGCGGTGACACGCAGTCAGATATTTCGC	20088

C  FP102116.1	32030	CGAACAGATCTGCCACTTTTGCCACTCATAAACAATCATAAAGCTCTCGT	31981
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	20089	CGAACAGATCTGCCACTTTTGCCACTCATAAACAATCATAAAGCTCTCGT	20138

C  FP102116.1	31980	GCTGCAGGAATGAGGAGGTCTGCTGAAGGTGCAGCTGTCGTGCAGTGAGG	31931
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	20139	GCTGCAGGAATGAGGAGGTCTGCTGAAGGTGCAGCTGTCGTGCAGTGAGG	20188

C  FP102116.1	31930	GGTTTGCGTCTTTAATAAACTACGGCAGTTTGCGTTCACTGAACAGTAAG	31881
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914615.3	20189	GGTTTGCGTCTTTAATAAACTACGGCAGTTTGCGTTCACTGAACAGTAAG	20238

Overview

Query
FP102116.1 - 33880 bps
Hit
CU914615.3 - 20238 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100020003188133880-118239202381
Short-link