<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CU459062.7	2000	GCATAGGCTAAGAATCAACTTCAAAAATGCATTCAAAATAATATCACCTT	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1	GCATAGGCTAAGAATCAACTTCAAAAATGCATTCAAAATAATATCACCTT	50

C  CU459062.7	1950	CTCTATCATCCTGATAGCGTTTACAGTTTAAACTTGACTTGTGGATTTAC	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	51	CTCTATCATCCTGATAGCGTTTACAGTTTAAACTTGACTTGTGGATTTAC	100

C  CU459062.7	1900	CCAGAAACAATGCATAAGTAGGATGATGGAGATATGCTTTTTGCAGCATA	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	101	CCAGAAACAATGCATAAGTAGGATGATGGAGATATGCTTTTTGCAGCATA	150

C  CU459062.7	1850	GCATGAGAGAACAATTTATCTGTTTCTTCATTTGATAATTGCTTTGAAGA	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	151	GCATGAGAGAACAATTTATCTGTTTCTTCATTTGATAATTGCTTTGAAGA	200

C  CU459062.7	1800	TTAAATGTCGCTCAATAAATGGTCCAGAGGGGACCACTAAGAATTACTGC	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	201	TTAAATGTCGCTCAATAAATGGTCCAGAGGGGACCACTAAGAATTACTGC	250

C  CU459062.7	1750	AAATAGATTAACCGAGCCACCAACCGCCCTAAAAGGCTAAAACCTCCTAT	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	251	AAATAGATTAACCGAGCCACCAACCGCCCTAAAAGGCTAAAACCTCCTAT	300

C  CU459062.7	1700	TTTCGTATAGTTCCTACAACAGTCGCAACTGCTATGCATCAACTCGGGCT	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	301	TTTCGTATAGTTCCTACAACAGTCGCAACTGCTATGCATCAACTCGGGCT	350

C  CU459062.7	1650	AGTGGGTTGACAGCAAAACCCAAAAAATTAGCCCAAGAACAGCAAAAATT	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	351	AGTGGGTTGACAGCAAAACCCAAAAAATTAGCCCAAGAACAGCAAAAATT	400

C  CU459062.7	1600	AAGAAAAATAGCTTAGCAACATCATTAGGTACCTTTTGAGGAGGAATGCC	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	401	AAGAAAAATAGCTTAGCAACATCATTAGGTACCTTTTGAGGAGGAATGCC	450

C  CU459062.7	1550	CAACAAAGTGCCCAACTCATCAAAACTGTCACAGATTAATGAGGGGATTT	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	451	CAACAAAGTGCCCAACTCATCAAAACTGTCACAGATTAATGAGGGGATTT	500

C  CU459062.7	1500	AGCTTGAGATAATAGAAAAGCATGAGCTATGAAAAATCTAAATCACAAAA	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	501	AGCTTGAGATAATAGAAAAGCATGAGCTATGAAAAATCTAAATCACAAAA	550

C  CU459062.7	1450	AACAAGGGAAAGATAAGCTTCCTTTCTACCTTATATTTGTATAAAGTTTG	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	551	AACAAGGGAAAGATAAGCTTCCTTTCTACCTTATATTTGTATAAAGTTTG	600

C  CU459062.7	1400	CTAGCACTCAAGAGATTGTGCTCAATCATAGCACGATCCAGAACTGTGAA	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	601	CTAGCACTCAAGAGATTGTGCTCAATCATAGCACGATCCAGAACTGTGAA	650

C  CU459062.7	1350	GTTATCAGGTAAAAGTGCTTGCTGTAGGAAACACAAAAAAATAAGATAAA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	651	GTTATCAGGTAAAAGTGCTTGCTGTAGGAAACACAAAAAAATAAGATAAA	700

C  CU459062.7	1300	CAGCGAATATCAGATAATGTATTTTGACATTTTGAAAAAAAAAGCAATAC	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	701	CAGCGAATATCAGATAATGTATTTTGACATTTTGAAAAAAAAAGCAATAC	750

C  CU459062.7	1250	CCAAAAAAGGGGGGAACCTGATGTGGTTTCAACTCTTCTGCAAAAGCATC	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	751	CCAAAAAAGGGGGGAACCTGATGTGGTTTCAACTCTTCTGCAAAAGCATC	800

C  CU459062.7	1200	AATTTCAGGTTTTCTCAAGATTCTCTCTAGATAGACCTGAATATTTCAAA	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	801	AATTTCAGGTTTTCTCAAGATTCTCTCTAGATAGACCTGAATATTTCAAA	850

C  CU459062.7	1150	TTAAACAAAACTTTATTTTTAAAAAAAATAGTATCTACGTAAAAAATCTG	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	851	TTAAACAAAACTTTATTTTTAAAAAAAATAGTATCTACGTAAAAAATCTG	900

C  CU459062.7	1100	ACACAACACTATATGCACATAAAAAATCCACACTCAAATGCAAAGAGCTT	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	901	ACACAACACTATATGCACATAAAAAATCCACACTCAAATGCAAAGAGCTT	950

C  CU459062.7	1050	ATAGCATAAAGGAAACTCGGTACAAGTAAAGAGAGTGGAGACAGAGCTAT	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	951	ATAGCATAAAGGAAACTCGGTACAAGTAAAGAGAGTGGAGACAGAGCTAT	1000

C  CU459062.7	1000	GCAAATTGTATGAAGCAGCAAGTGAAGTACCTTCTGCAAGATTGGGTAGA	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1001	GCAAATTGTATGAAGCAGCAAGTGAAGTACCTTCTGCAAGATTGGGTAGA	1050

C  CU459062.7	950	TTTTCAATTTGGAGCAACGCTCATCCTGTTATCCAAAATAAGTAAAAAAG	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1051	TTTTCAATTTGGAGCAACGCTCATCCTGTTATCCAAAATAAGTAAAAAAG	1100

C  CU459062.7	900	AAAAATTGTTATAGCAAAACTGAACAAATAGCACATAGGAGGGGATCAGT	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1101	AAAAATTGTTATAGCAAAACTGAACAAATAGCACATAGGAGGGGATCAGT	1150

C  CU459062.7	850	GTAGGCAGTCATTTGAGACCCATTAAAAAAATACAAATATGACTACATAG	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1151	GTAGGCAGTCATTTGAGACCCATTAAAAAAATACAAATATGACTACATAG	1200

C  CU459062.7	800	TGGCAGATCTCAACTGGAAGTTGCCCGAGAAAACTAATTAACCTCAAATT	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1201	TGGCAGATCTCAACTGGAAGTTGCCCGAGAAAACTAATTAACCTCAAATT	1250

C  CU459062.7	750	TTCAAAGGTTATCGTAACAGCAAAATATTAGCAGGTATTAGACAACAGAA	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1251	TTCAAAGGTTATCGTAACAGCAAAATATTAGCAGGTATTAGACAACAGAA	1300

C  CU459062.7	700	TGACATGTCCACCAAATATAAAATCACCTATTTATGGTTAGTTGTTACCA	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1301	TGACATGTCCACCAAATATAAAATCACCTATTTATGGTTAGTTGTTACCA	1350

C  CU459062.7	650	TTTCCTTGGTGCAATGCACCTGCCCTTTACCATGAGTGGTCTCACAATCT	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1351	TTTCCTTGGTGCAATGCACCTGCCCTTTACCATGAGTGGTCTCACAATCT	1400

C  CU459062.7	600	TGGCAAACGAGAGCAAATATCAAACCATTGAATTAGAAGTTCATACAGCT	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1401	TGGCAAACGAGAGCAAATATCAAACCATTGAATTAGAAGTTCATACAGCT	1450

C  CU459062.7	550	ATTAGTTATTACAAACAGTGCTACTAAAGTGAGAAGCACAAGAAAGATGC	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1451	ATTAGTTATTACAAACAGTGCTACTAAAGTGAGAAGCACAAGAAAGATGC	1500

C  CU459062.7	500	GAACTCTGGGGGCATAAGGAAGAAGGCAATGCGTAATCTTCTTTGAATTT	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1501	GAACTCTGGGGGCATAAGGAAGAAGGCAATGCGTAATCTTCTTTGAATTT	1550

C  CU459062.7	450	AGCAGCCCACGATTTCCAGAAAGGAATATATCTTACAACTGGGGGTCTAC	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1551	AGCAGCCCACGATTTCCAGAAAGGAATATATCTTACAACTGGGGGTCTAC	1600

C  CU459062.7	400	GCAGACCTTACTCAGTTAACCTACCTCATAAGGATGGAAAGGATTATAGC	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1601	GCAGACCTTACTCAGTTAACCTACCTCATAAGGATGGAAAGGATTATAGC	1650

C  CU459062.7	350	TTATAACATCATAATTACAAATGACATTACTAACTTCAATAATTCAAGAT	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1651	TTATAACATCATAATTACAAATGACATTACTAACTTCAATAATTCAAGAT	1700

C  CU459062.7	300	ACAGCCGTGATAATATTAATCCCAATACTCAAATATATAAAAATACCATT	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1701	ACAGCCGTGATAATATTAATCCCAATACTCAAATATATAAAAATACCATT	1750

C  CU459062.7	250	AAATCATTCATTCAACAACTCCACAGAGGATAACTTCCACAACAACCTAC	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1751	AAATCATTCATTCAACAACTCCACAGAGGATAACTTCCACAACAACCTAC	1800

C  CU459062.7	200	CCATTAGTTGCACTCTTTACAATAACAATCAAAACATTTAAAGCTCTAAG	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1801	CCATTAGTTGCACTCTTTACAATAACAATCAAAACATTTAAAGCTCTAAG	1850

C  CU459062.7	150	TCATTGCATCCTTACTTTGTACAGTGTGGCAAGTACACGAGATCGTTGAG	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1851	TCATTGCATCCTTACTTTGTACAGTGTGGCAAGTACACGAGATCGTTGAG	1900

C  CU459062.7	100	GACCTGCTGCAGCCAAAATTGTGCACGTCACAGCAGCTGCCAGAGCTTGC	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1901	GACCTGCTGCAGCCAAAATTGTGCACGTCACAGCAGCTGCCAGAGCTTGC	1950

C  CU459062.7	50	TCTAAGGCAGCTTCATCGATTTCTCTGTAGCGTAAAGAATCATTAAGCTT	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  CU914526.3	1951	TCTAAGGCAGCTTCATCGATTTCTCTGTAGCGTAAAGAATCATTAAGCTT	2000

Overview

Query
CU459062.7 - 150168 bps
Hit
CU914526.3 - 66727 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001927200012000-1120001
285.8839818974889828-113588136721
387.564599108886789776-113675145581
Short-link