<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU457807.2	1	GATCACAAGTGCATAAACTTCAACTAATTCTCCATGATCTGATTGCTGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	59958	GATCACAAGTGCATAAACTTCAACTAATTCTCCATGATCTGATTGCTGAA	60007

CU457807.2	51	GATATCGTAGTAAATGAAGTTTTTTAAGTGGCTGCAATGATCGAGAAGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60008	GATATCGTAGTAAATGAAGTTTTTTAAGTGGCTGCAATGATCGAGAAGTT	60057

CU457807.2	101	GCCTCCTTTTTGGAACGATTTTAAGAATTATCTAAAGCACAAGTGTAAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60058	GCCTCCTTTTTGGAACGATTTTAAGAATTATCTAAAGCACAAGTGTAAAG	60107

CU457807.2	151	AAATGAAGCTTGAAGATCTTGTGATAGGGATCAAGATTGAGGAAGATAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60108	AAATGAAGCTTGAAGATCTTGTGATAGGGATCAAGATTGAGGAAGATAAC	60157

CU457807.2	201	AAAAACGCCGAAAAAAGGTCTCGTAAGAGCTCAACAATCATTGGAGTTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60158	AAAAACGCCGAAAAAAGGTCTCGTAAGAGCTCAACAATCATTGGAGTTAA	60207

CU457807.2	251	TATTGTTGAAGAAGCTCCTACCAAAGACAAAAAGAGAAAGAAGTCCAATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60208	TATTGTTGAAGAAGCTCCTACCAAAGACAAAAAGAGAAAGAAGTCCAATG	60257

CU457807.2	301	GGCAGAAGTCAGAACAGGCAAAGAAGAAATTCAAAGGAAACTATTACAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60258	GGCAGAAGTCAGAACAGGCAAAGAAGAAATTCAAAGGAAACTATTACAAC	60307

CU457807.2	351	GGTGGAAAGGATGGTCCTAGATTTTTTGATTGTCATGCTCCAAGAAAGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60308	GGTGGAAAGGATGGTCCTAGATTTTTTGATTGTCATGCTCCAAGAAAGGA	60357

CU457807.2	401	CAAATACAAAGGCAAAGGCAAAAGTCAAGCAAACATCGTGTATAAGATAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60358	CAAATACAAAGGCAAAGGCAAAAGTCAAGCAAACATCGTGTATAAGATAA	60407

CU457807.2	451	AAGATGTCGATGACTTGTGTGCAATGATCTCGAAGTGTAACTTAGTTGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60408	AAGATGTCGATGACTTGTGTGCAATGATCTCGAAGTGTAACTTAGTTGAA	60457

CU457807.2	501	AATCCTAAGGAGTGATTTCTCGACTCAGATGTAACTCGACACATTTGTTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60458	AATCCTAAGGAGTGATTTCTCGACTCAGATGTAACTCGACACATTTGTTC	60507

CU457807.2	551	TGCAAAAGATTCCTTTGCAATGTACACTCCTACTGAGTATGATGAAGATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60508	TGCAAAAGATTCCTTTGCAATGTACACTCCTACTGAGTATGATGAAGATT	60557

CU457807.2	601	TTTTCATGGAAAACACAACAACAACAACAAGAATTGGAGGAACTGGGAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60558	TTTTCATGGAAAACACAACAACAACAACAAGAATTGGAGGAACTGGGAAA	60607

CU457807.2	651	TGACATCCGGTAAGGTATTCACTTTGAGCAGTGTTTTGCATGTCCCTACT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60608	TGACATCCGGTAAGGTATTCACTTTGAGCAGTGTTTTGCATGTCCCTACT	60657

CU457807.2	701	ATTAGGAAGAGTTTAGTTTCTGCTACACTACTCGATAAGAACAGGTTTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60658	ATTAGGAAGAGTTTAGTTTCTGCTACACTACTCGATAAGAACAGGTTTAA	60707

CU457807.2	751	GTGTGTCCTAGTTAGTGATAAATTTGTAATAAGTAAGAATGAAATCTTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60708	GTGTGTCCTAGTTAGTGATAAATTTGTAATAAGTAAGAATGAAATCTTCA	60757

CU457807.2	801	TAATAAAGGGCTACCTCAATGAGGGTCTTTTCAAACTGAATGTAATGGTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60758	TAATAAAGGGCTACCTCAATGAGGGTCTTTTCAAACTGAATGTAATGGTT	60807

CU457807.2	851	GTTGATAGTATTAATAAGAATTATGATTTTATTTATTTATTGGAGTCAAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60808	GTTGATAGTATTAATAAGAATTATGATTTTATTTATTTATTGGAGTCAAG	60857

CU457807.2	901	TGATTTATGGCATGCCTGTTTGAGACATGTAAATTACAAAACCTTGAGAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60858	TGATTTATGGCATGCCTGTTTGAGACATGTAAATTACAAAACCTTGAGAA	60907

CU457807.2	951	AATTGGTTACTCTAGAAGTATTTTCCTAATTATAAATGCGATATCAAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60908	AATTGGTTACTCTAGAAGTATTTTCCTAATTATAAATGCGATATCAAAAT	60957

CU457807.2	1001	GCAAAAATTAGTGTGGAAAGTAAGTTTGTTAAACATCCTTATAAGTCTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	60958	GCAAAAATTAGTGTGGAAAGTAAGTTTGTTAAACATCCTTATAAGTCTAT	61007

CU457807.2	1051	TGAAATAAATTCCAAAATTTCAGACTTAATTCACACAGATATATGTGATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61008	TGAAATAAATTCCAAAATTTCAGACTTAATTCACACAGATATATGTGATA	61057

CU457807.2	1101	TGAAGTCGACACCATCTCGTGGTGGAAAAAAGTATTTTATGACTTTAATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61058	TGAAGTCGACACCATCTCGTGGTGGAAAAAAGTATTTTATGACTTTAATT	61107

CU457807.2	1151	GAAGAGTGCACTCGATTTTGTTATATATATTTGCTTAATAGTAAGGATGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61108	GAAGAGTGCACTCGATTTTGTTATATATATTTGCTTAATAGTAAGGATGA	61157

CU457807.2	1201	AGCAATTGATGCATTTAAGCAATACAAAAATGAAGTGGAGAACAAATTGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61158	AGCAATTGATGCATTTAAGCAATACAAAAATGAAGTGGAGAACAAATTGA	61207

CU457807.2	1251	ATCTAAAGATAAAAATAATTCAGAGTGATAGGGGTGGAGAATATGAATCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61208	ATCTAAAGATAAAAATAATTCAGAGTGATAGGGGTGGAGAATATGAATCT	61257

CU457807.2	1301	CATTTTGCAGTGATATGTTTAGAATATGGTATTATTCATCAAACTACTAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61258	CATTTTGCAGTGATATGTTTAGAATATGGTATTATTCATCAAACTACTAC	61307

CU457807.2	1351	ACCTTATACATCACAGTCAAATGGTTTGGCGGAACAGAAGAATAGAATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61308	ACCTTATACATCACAGTCAAATGGTTTGGCGGAACAGAAGAATAGAATAT	61357

CU457807.2	1401	TAAAGGAAATGATGAATGTCTTGATGATCAATTTTGGTTCACCACGAAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61358	TAAAGGAAATGATGAATGTCTTGATGATCAATTTTGGTTCACCACGAAAC	61407

CU457807.2	1451	CTTTTGGGAGAAGTCATCCCTACAGCAAATAAGATGCTCAATAGGGTACC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61408	CTTTTGGGAGAAGTCATCCCTACAGCAAATAAGATGCTCAATAGGGTACC	61457

CU457807.2	1501	CCATCGAAAAATTCAATCAATTTCATACGAGTTGTGGAACTGAAGGAAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61458	CCATCGAAAAATTCAATCAATTTCATACGAGTTGTGGAACTGAAGGAAAC	61507

CU457807.2	1551	CCAACTTGAAATATGTCAAAGTGTGGGGGTATTTAGCAAAGGTAGAGGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61508	CCAACTTGAAATATGTCAAAGTGTGGGGGTATTTAGCAAAGGTAGAGGTT	61557

CU457807.2	1601	TCTTTACCGAAGAGGGTTGAAATTCGATCCAAAACAGTACACCGTGTATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61558	TCTTTACCGAAGAGGGTTGAAATTCGATCCAAAACAGTACACCGTGTATT	61607

CU457807.2	1651	TATTGGATATGTTGTGAACAGTAAGGCCTGCCAATTTTAGGTTCACAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61608	TATTGGATATGTTGTGAACAGTAAGGCCTGCCAATTTTAGGTTCACAAAT	61657

CU457807.2	1701	CTGATAATCCTGAGATTCATGTTAATATAATAATTGAGTCAGATAATGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61658	CTGATAATCCTGAGATTCATGTTAATATAATAATTGAGTCAGATAATGCA	61707

CU457807.2	1751	GAGTTTTTTGAAAACAGTTATCCGTATAAAACCGAATGTGAGTCGATAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61708	GAGTTTTTTGAAAACAGTTATCCGTATAAAACCGAATGTGAGTCGATAAG	61757

CU457807.2	1801	TGAAATACCTAAACGGCCACAAGAAGAATCAACGAAAAATATACGAACTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61758	TGAAATACCTAAACGGCCACAAGAAGAATCAACGAAAAATATACGAACTA	61807

CU457807.2	1851	GTGAGGATCTTAGGAATAGTAATCCCCAATAGAAACCTGCTTCTTTCAGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61808	GTGAGGATCTTAGGAATAGTAATCCCCAATAGAAACCTGCTTCTTTCAGA	61857

CU457807.2	1901	CAAGATTTTGTGACACTATTTTTTGAAAATGAGCCTCAAACTTTTAAAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61858	CAAGATTTTGTGACACTATTTTTTGAAAATGAGCCTCAAACTTTTAAAGC	61907

CU457807.2	1951	AGCTATGTCTTCGTCTGAGTCAACTTATTGGAAAGAAACACTCAATAGTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU572404.1	61908	AGCTATGTCTTCGTCTGAGTCAACTTATTGGAAAGAAACACTCAATAGTG	61957

Overview

Query
CU457807.2 - 95662 bps
Hit
CU572404.1 - 61957 bps
Total alignments
5
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001912200012000159958619571
283.147511759890110659124610263761
383.7820244786739119127279277221
486.831082061419914404127556277601
581.2225975940504808158397591471
Short-link