<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU019619.10	1	AAGCTTACATACCTCTAAGGGATTAAAACCATGATTAAATTCCGCAAGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65309	AAGCTTACATACCTCTAAGGGATTAAAACCATGATTAAATTCCGCAAGAA	65358

CU019619.10	51	TCTCGACGAACGCTTGGTCCTCTCCTCTTTTCTCTACTTGAACTTTCAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65359	TCTCGACGAACGCTTGGTCCTCTCCTCTTTTCTCTACTTGAACTTTCAAC	65408

CU019619.10	101	CAAAATCATAGGTGTATATTAGGATTATAAAACTGAACCTATAGGATTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65409	CAAAATCATAGGTGTATATTAGGATTATAAAACTGAACCTATAGGATTAC	65458

CU019619.10	151	ACCCCTAAAATATTAATAAAAATTAATTAAATCTGATTTGGTAAGGAAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65459	ACCCCTAAAATATTAATAAAAATTAATTAAATCTGATTTGGTAAGGAAGC	65508

CU019619.10	201	AAAGTACCTTTACTATTTTCGGCTAACTTTTCTTAACTGGACAACCTAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65509	AAAGTACCTTTACTATTTTCGGCTAACTTTTCTTAACTGGACAACCTAAT	65558

CU019619.10	251	TTCAGTAGGTCATATCTCCCTCATCCGAACTCGAAGCTTAGCAAACTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65559	TTCAGTAGGTCATATCTCCCTCATCCGAACTCGAAGCTTAGCAAACTCTG	65608

CU019619.10	301	TGACGTTGAAAAGACAAGTCAAAGAGATTTCCTAAGGTATCTTGTAGCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65609	TGACGTTGAAAAGACAAGTCAAAGAGATTTCCTAAGGTATCTTGTAGCAC	65658

CU019619.10	351	ATATAAATCATCCTTTTCTAGGAGTTATAGTAGTTTGAAGTTGACCCAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65659	ATATAAATCATCCTTTTCTAGGAGTTATAGTAGTTTGAAGTTGACCCAAA	65708

CU019619.10	401	ACTTATACTTGAGCATAACTTCAGATTTCGCTCTTTCTTATTTCTTCCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65709	ACTTATACTTGAGCATAACTTCAGATTTCGCTCTTTCTTATTTCTTCCAA	65758

CU019619.10	451	AAATCTCACTCACTACGAAGAACGGTTCCAGTCTTGGTTCAAAAAATTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65759	AAATCTCACTCACTACGAAGAACGGTTCCAGTCTTGGTTCAAAAAATTTC	65808

CU019619.10	501	TGGGGTGTTACACTAATGAGTTGGAAAATCTCATGTATATTCACACAATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65809	TGGGGTGTTACACTAATGAGTTGGAAAATCTCATGTATATTCACACAATT	65858

CU019619.10	551	TTTTATTTTTCATTTTCGCATTTATAAGTCCTATTTAAAAAATTGCCCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65859	TTTTATTTTTCATTTTCGCATTTATAAGTCCTATTTAAAAAATTGCCCAA	65908

CU019619.10	601	ATTTCCAAATTTTCGTATGGATTAATTGATCCGACGCGTGGAGCACCAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65909	ATTTCCAAATTTTCGTATGGATTAATTGATCCGACGCGTGGAGCACCAAT	65958

CU019619.10	651	TATTTTCTTTGAAAAACTTTATTAGGAGCTCTGTAATGAGTTATGGAACC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	65959	TATTTTCTTTGAAAAACTTTATTAGGAGCTCTGTAATGAGTTATGGAACC	66008

CU019619.10	701	TTGACGTAGACTCACACAATATTTGAATGTCTATTTCATCATTTACAAGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66009	TTGACGTAGACTCACACAATATTTGAATGTCTATTTCATCATTTACAAGC	66058

CU019619.10	751	CTTTTTTAAGAATCGCCTAAATTTCACGTTTTTTTCGTGTGTATTAGCCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66059	CTTTTTTAAGAATCGCCTAAATTTCACGTTTTTTTCGTGTGTATTAGCCC	66108

CU019619.10	801	ATGGATCTGATGCCCGGAGCACCCAAAAAATTTCCAAAAAAACGTATTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66109	ATGGATCTGATGCCCGGAGCACCCAAAAAATTTCCAAAAAAACGTATTAT	66158

CU019619.10	851	GAAGATCACCATAAGAATTGAGAACCTTCATGTATTTACACACATTTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66159	GAAGATCACCATAAGAATTGAGAACCTTCATGTATTTACACACATTTTTT	66208

CU019619.10	901	TTAACACCATTTCAGCATTTACAAGTCCCTTTTTAAGAATCACCCAAATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66209	TTAACACCATTTCAGCATTTACAAGTCCCTTTTTAAGAATCACCCAAATT	66258

CU019619.10	951	CTCAATTTTTCATGTGTACTGCCCATTGATTCAATGCCCAAAGAACTCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66259	CTCAATTTTTCATGTGTACTGCCCATTGATTCAATGCCCAAAGAACTCAA	66308

CU019619.10	1001	AATTTTTTTTCTTAAAAAACTTTATGAGGACCTCTGTAGTGAGTTGGGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66309	AATTTTTTTTCTTAAAAAACTTTATGAGGACCTCTGTAGTGAGTTGGGTA	66358

CU019619.10	1051	ACTTTAAGTATACTCACACCATTTTTAATGCCCAATTCCGTATTTACAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66359	ACTTTAAGTATACTCACACCATTTTTAATGCCCAATTCCGTATTTACAAG	66408

CU019619.10	1101	CATTTTTTAATCACACAAATTTCCTGATTTTTTATATGGCCCATGGATCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66409	CATTTTTTAATCACACAAATTTCCTGATTTTTTATATGGCCCATGGATCT	66458

CU019619.10	1151	AGCGCCCAGAGAACCCAATTTTTTTTAATCAAAAACCTTTATGAGGACCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66459	AGCGCCCAGAGAACCCAATTTTTTTTAATCAAAAACCTTTATGAGGACCT	66508

CU019619.10	1201	CCGTAATGAGTTGGGGAACCTCCACGTATATCACTCCATTTTTTGATCAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66509	CCGTAATGAGTTGGGGAACCTCCACGTATATCACTCCATTTTTTGATCAC	66558

CU019619.10	1251	CCACTTCCACATTTTCAAGCCCTCTTTTAATAATCACCCAAATTCTCTCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66559	CCACTTCCACATTTTCAAGCCCTCTTTTAATAATCACCCAAATTCTCTCA	66608

CU019619.10	1301	TTTTTCATGTGTAGCCCATGAATTAGGCGTCCGGAACACTCAAATTTTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66609	TTTTTCATGTGTAGCCCATGAATTAGGCGTCCGGAACACTCAAATTTTTT	66658

CU019619.10	1351	CTCGAAAATCGTCATGAGTACCTTTGTAATGAATTGGGGAACCTTCATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66659	CTCGAAAATCGTCATGAGTACCTTTGTAATGAATTGGGGAACCTTCATAT	66708

CU019619.10	1401	ATACACGCATATTTTTTTTAACGCCCATTTTATGAGCCCTTCTTTTTAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66709	ATACACGCATATTTTTTTTAACGCCCATTTTATGAGCCCTTCTTTTTAAT	66758

CU019619.10	1451	TGACCAAATTCCTGGGATTTTCGTGTTCATTTTCCCATAAATCTTGTGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66759	TGACCAAATTCCTGGGATTTTCGTGTTCATTTTCCCATAAATCTTGTGCA	66808

CU019619.10	1501	TTGAGAACCCAAAGATTGTTTTTAGAAAAACATTAAGGGGACCTATGTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66809	TTGAGAACCCAAAGATTGTTTTTAGAAAAACATTAAGGGGACCTATGTAA	66858

CU019619.10	1551	TGAGTTGGGGAACCTTCATGTGTATTCACATCATATTTTAACGCTCTTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66859	TGAGTTGGGGAACCTTCATGTGTATTCACATCATATTTTAACGCTCTTTC	66908

CU019619.10	1601	CGCATTTACAAGCCCTTTTTATGAATAGCCTATGTTTCTTCGACTTTTTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66909	CGCATTTACAAGCCCTTTTTATGAATAGCCTATGTTTCTTCGACTTTTTG	66958

CU019619.10	1651	TGTATATTATTAGCCCATGGATCTGGCGCTTATAGCACTCAAAAAACCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	66959	TGTATATTATTAGCCCATGGATCTGGCGCTTATAGCACTCAAAAAACCTT	67008

CU019619.10	1701	TCTCAAAAATTTTTATGAGGACCTCCGTAATGAGTTGGGGAACCTTCATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	67009	TCTCAAAAATTTTTATGAGGACCTCCGTAATGAGTTGGGGAACCTTCATA	67058

CU019619.10	1751	TATATCCATATCATTTTAACGTCCATTTCTGAATTTACAAACCCGCTGTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	67059	TATATCCATATCATTTTAACGTCCATTTCTGAATTTACAAACCCGCTGTT	67108

CU019619.10	1801	AAGAATCGCTCAATTTTCTCAATTTTTGTATGTATTAGCCCATGGATCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	67109	AAGAATCGCTCAATTTTCTCAATTTTTGTATGTATTAGCCCATGGATCTA	67158

CU019619.10	1851	GCGCCCGAAGCACCCAAAAGAAATTCAAAAGAATTTATGAGGACCTCCTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	67159	GCGCCCGAAGCACCCAAAAGAAATTCAAAAGAATTTATGAGGACCTCCTT	67208

CU019619.10	1901	ATAAGTTGAGAAACCTTCACGTGAGCTATCACCATCTTTTAACACCCATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	67209	ATAAGTTGAGAAACCTTCACGTGAGCTATCACCATCTTTTAACACCCATT	67258

CU019619.10	1951	TGTGCATTTACAAGCCTTTTTTCCAAGAATTGCCTAAATTTCCCAATTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570870.3	67259	TGTGCATTTACAAGCCTTTTTTCCAAGAATTGCCTAAATTTCCCAATTTT	67308

Overview

Query
CU019619.10 - 85242 bps
Hit
CU570870.3 - 67308 bps
Total alignments
4
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001918200012000165309673081
290.74395417031756166487665401
388.89335322312283167009670621
490.74385411791232167011670641
Short-link