<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU467613.3	1	GAATTCTTTTAAAATTCAAATTTAAATATTATGAAGTAGTCACCTATAGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31469	GAATTCTTTTAAAATTCAAATTTAAATATTATGAAGTAGTCACCTATAGT	31518

CU467613.3	51	ATATAGTTTACTACATGCTCTTGTTCATAAAGTCTTATAGTTACCCAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31519	ATATAGTTTACTACATGCTCTTGTTCATAAAGTCTTATAGTTACCCAAAA	31568

CU467613.3	101	AGAACACCCAATTTGAAGTTCTCTCAAGATGAATTCCATATTTATCACAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31569	AGAACACCCAATTTGAAGTTCTCTCAAGATGAATTCCATATTTATCACAC	31618

CU467613.3	151	ATATCAAAATTATATCCATAAAGGGATTTTATATATATGGTATATGTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31619	ATATCAAAATTATATCCATAAAGGGATTTTATATATATGGTATATGTTTT	31668

CU467613.3	201	ATATATGGGTATATGTATATACCACATATATGATATCCTATATACAATTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31669	ATATATGGGTATATGTATATACCACATATATGATATCCTATATACAATTA	31718

CU467613.3	251	ATTATACACACACATACGTACATACACACATATAAATATAGTAGGAATTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31719	ATTATACACACACATACGTACATACACACATATAAATATAGTAGGAATTA	31768

CU467613.3	301	GATTTTGAACTGTATTTTCTTGACTAAAGTAAGAAAATTACAATATTTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31769	GATTTTGAACTGTATTTTCTTGACTAAAGTAAGAAAATTACAATATTTGG	31818

CU467613.3	351	AAAGCTACAGATCATGGGTCATGAATGTGAATTCCATGGGCCTGCTTTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31819	AAAGCTACAGATCATGGGTCATGAATGTGAATTCCATGGGCCTGCTTTTG	31868

CU467613.3	401	TGTTTCTTCATCACTACAGATTTAATGAATAGACGAATAAGGATTGGTCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31869	TGTTTCTTCATCACTACAGATTTAATGAATAGACGAATAAGGATTGGTCC	31918

CU467613.3	451	AGATGACAATTTTGATGATACAGAAAAATACAATTCAAAGGGAATTATCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31919	AGATGACAATTTTGATGATACAGAAAAATACAATTCAAAGGGAATTATCA	31968

CU467613.3	501	CTTCTAGATACCAAAATAATTAGGACAAACAAAATGAAAGTAAGCTTGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	31969	CTTCTAGATACCAAAATAATTAGGACAAACAAAATGAAAGTAAGCTTGCA	32018

CU467613.3	551	ATTTACATTATATTACTGAATATGTTTATTTATATACATGTTGCTATGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32019	ATTTACATTATATTACTGAATATGTTTATTTATATACATGTTGCTATGCT	32068

CU467613.3	601	TGTTTTAAAGAAGAATAATATTGAAACATGAAACAATTAATGACACTCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32069	TGTTTTAAAGAAGAATAATATTGAAACATGAAACAATTAATGACACTCAA	32118

CU467613.3	651	AATTATAGTTAGTATGCAGAATGACTGTGATATGAACAAAGAAGTAAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32119	AATTATAGTTAGTATGCAGAATGACTGTGATATGAACAAAGAAGTAAAAA	32168

CU467613.3	701	ATGCCTTTTATAAAATAACTAAAAAGAAATATATTTCAAATGCATACAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32169	ATGCCTTTTATAAAATAACTAAAAAGAAATATATTTCAAATGCATACAAA	32218

CU467613.3	751	TATAGAGATTTGAACAAAAATGAATTTAAGCATGTGTTTATTTATTGTAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32219	TATAGAGATTTGAACAAAAATGAATTTAAGCATGTGTTTATTTATTGTAT	32268

CU467613.3	801	GTATACATGTTTGTACATGAATGTGGGTATTTGCATGTGAAGGCTTGTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32269	GTATACATGTTTGTACATGAATGTGGGTATTTGCATGTGAAGGCTTGTGA	32318

CU467613.3	851	GAGGAAAATTAGAAAATGGCAGGAATCATTTCTTAAAATTGTTTTAAAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32319	GAGGAAAATTAGAAAATGGCAGGAATCATTTCTTAAAATTGTTTTAAAGC	32368

CU467613.3	901	AGGGTATCTTATTTTTCTGCTGCTGTGATGAACATATGAACTTCTGGCAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32369	AGGGTATCTTATTTTTCTGCTGCTGTGATGAACATATGAACTTCTGGCAA	32418

CU467613.3	951	ATCCTCATGTCTCCCATCTTACTGGAGGAGTATTGGGATTACAGATATGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32419	ATCCTCATGTCTCCCATCTTACTGGAGGAGTATTGGGATTACAGATATGG	32468

CU467613.3	1001	TCCACTATCCCCACATGTGGCCTTATTGCGTTTTTAATTATATAGGCTCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32469	TCCACTATCCCCACATGTGGCCTTATTGCGTTTTTAATTATATAGGCTCC	32518

CU467613.3	1051	AGTGATAAACCTTGGGCTACATGGCTTGGATCACAAGCCTTTTACCAACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32519	AGTGATAAACCTTGGGCTACATGGCTTGGATCACAAGCCTTTTACCAACT	32568

CU467613.3	1101	GAATTGTTTCCCAGCCCAACAAAAACAAATTTAAGACAAGAATTAGAAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32569	GAATTGTTTCCCAGCCCAACAAAAACAAATTTAAGACAAGAATTAGAAGA	32618

CU467613.3	1151	ATTGGCCATTGAGGTTACTTTTCATAAGTGATAATATAAAGGAATTTAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32619	ATTGGCCATTGAGGTTACTTTTCATAAGTGATAATATAAAGGAATTTAAA	32668

CU467613.3	1201	GATTTGAATGGGGCAGCTGAGGTGATAGACAGTAGATCTAGTGAGTCATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32669	GATTTGAATGGGGCAGCTGAGGTGATAGACAGTAGATCTAGTGAGTCATA	32718

CU467613.3	1251	TTTCAGAATAAAGGAGGCAGAAGGGAAATGTGTACATTTGTGTGTGCTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32719	TTTCAGAATAAAGGAGGCAGAAGGGAAATGTGTACATTTGTGTGTGCTGA	32768

CU467613.3	1301	TAACACTGAGCAATTAGAAATTGATACACATAGTCTACAAGGATTTAAAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32769	TAACACTGAGCAATTAGAAATTGATACACATAGTCTACAAGGATTTAAAC	32818

CU467613.3	1351	ATTTGGAACTCTGCTGTTTCTCTAAGTTGAAAAGTCCTTTATATAGATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32819	ATTTGGAACTCTGCTGTTTCTCTAAGTTGAAAAGTCCTTTATATAGATAT	32868

CU467613.3	1401	TTTTAAACAGCATGTCCACAATCTACAAATATCTTAGGCCTGAAATTCTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32869	TTTTAAACAGCATGTCCACAATCTACAAATATCTTAGGCCTGAAATTCTA	32918

CU467613.3	1451	ACAACTTACTTAAACCTTCTGCCTTGTTCTTCTATGATGCTTTTTATCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32919	ACAACTTACTTAAACCTTCTGCCTTGTTCTTCTATGATGCTTTTTATCTT	32968

CU467613.3	1501	GCCATAGGATGGGCTGGAGAACCTGGAAACAACAAAAGAAGTCCTGACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	32969	GCCATAGGATGGGCTGGAGAACCTGGAAACAACAAAAGAAGTCCTGACAT	33018

CU467613.3	1551	GACATCTTATCACCCAGGTTTTGTGAAATGTTCCAGGTTCCACGAGATTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33019	GACATCTTATCACCCAGGTTTTGTGAAATGTTCCAGGTTCCACGAGATTC	33068

CU467613.3	1601	CTGGTCTTATTCTCATTGTGAGAAAGATAGATGTATCAAAGTGCCTCAGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33069	CTGGTCTTATTCTCATTGTGAGAAAGATAGATGTATCAAAGTGCCTCAGC	33118

CU467613.3	1651	CCTATCTAAAACACAGACCTACTGCACTCTGCCTGTGCTACCTTGTTCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33119	CCTATCTAAAACACAGACCTACTGCACTCTGCCTGTGCTACCTTGTTCAA	33168

CU467613.3	1701	GTGGTTTGGAGGAACTCTGTTTTCTCCAAATTGGTGTTAATCTATACTAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33169	GTGGTTTGGAGGAACTCTGTTTTCTCCAAATTGGTGTTAATCTATACTAT	33218

CU467613.3	1751	ATAATATGTTGTCACTACTAAATACCATCATGTCAAGCTAATGGTATTAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33219	ATAATATGTTGTCACTACTAAATACCATCATGTCAAGCTAATGGTATTAC	33268

CU467613.3	1801	TGCTGAAGCATTTTTAAAGAAAATATACCAAAATCCAGAGAATAGCTAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33269	TGCTGAAGCATTTTTAAAGAAAATATACCAAAATCCAGAGAATAGCTAAC	33318

CU467613.3	1851	CTGAATTAACCAGCCATTAATTAAGCAACATTCCCTAGGTACACTGCTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33319	CTGAATTAACCAGCCATTAATTAAGCAACATTCCCTAGGTACACTGCTAA	33368

CU467613.3	1901	TCTCTCAATACTACAACCATGCTGAGACGACATTATACAGAGAGAAAACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33369	TCTCTCAATACTACAACCATGCTGAGACGACATTATACAGAGAGAAAACA	33418

CU467613.3	1951	AGAACTTTGTCTCTGTATTACTTCTAACTCTCTATTGTTTCCTCCATTGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU570767.2	33419	AGAACTTTGTCTCTGTATTACTTCTAACTCTCTATTGTTTCCTCCATTGT	33468

Overview

Query
CU467613.3 - 166433 bps
Hit
CU570767.2 - 33468 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link