<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463286.9	1	GAATTCTTTGTTTACCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATCTGATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50092	GAATTCTTTGTTTACCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATCTGATT	50141

CU463286.9	51	TTCTGGAGTCCACCTTCTTCAGTTCTTTATATATATTAGATATTAGTCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50142	TTCTGGAGTCCACCTTCTTCAGTTCTTTATATATATTAGATATTAGTCCC	50191

CU463286.9	101	CTATCATATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAGTCTGTTGGTGGCCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50192	CTATCATATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAGTCTGTTGGTGGCCT	50241

CU463286.9	151	TTTTGTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTGACAGAAGCTTTGCAATTTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50242	TTTTGTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTGACAGAAGCTTTGCAATTTTA	50291

CU463286.9	201	TGAGGTCCCATTTGTCAACTCTCGATCTTACAGCACAAGCCCTTGCTGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50292	TGAGGTCCCATTTGTCAACTCTCGATCTTACAGCACAAGCCCTTGCTGTT	50341

CU463286.9	251	CTATTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATATTCTCTGGTTTTATGTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50342	CTATTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATATTCTCTGGTTTTATGTGG	50391

CU463286.9	301	AGTTCCTTGATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGGAATGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50392	AGTTCCTTGATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGGAATGA	50441

CU463286.9	351	ATTAATTCACATTCTTCTACATGATAACTGCCAGCTGTGCCAGCACCATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50442	ATTAATTCACATTCTTCTACATGATAACTGCCAGCTGTGCCAGCACCATT	50491

CU463286.9	401	TGTATAAAATGCTGTCTTTTTTCCACCCGATAGTTTTAGCTCCCTTATCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50492	TGTATAAAATGCTGTCTTTTTTCCACCCGATAGTTTTAGCTCCCTTATCA	50541

CU463286.9	451	AAATTCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50542	AAATTCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCA	50591

CU463286.9	501	GTTCCATTGGTCTACCTGTATGTGGATATACAAGTACCATGCAGTTTTTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50592	GTTCCATTGGTCTACCTGTATGTGGATATACAAGTACCATGCAGTTTTTA	50641

CU463286.9	551	TCACAATTGCTCTGTATTACAGCTTTAGGTCAGGCATGGTGATTCCACCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50642	TCACAATTGCTCTGTATTACAGCTTTAGGTCAGGCATGGTGATTCCACCA	50691

CU463286.9	601	GATGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTTCTATCCTAGGTTTTTTGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50692	GATGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTTCTATCCTAGGTTTTTTGTT	50741

CU463286.9	651	ATTCCAGGTGAATTTGCAGATCACTCTTTCTAATTTGTTGAAGAGTTGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50742	ATTCCAGGTGAATTTGCAGATCACTCTTTCTAATTTGTTGAAGAGTTGAG	50791

CU463286.9	701	TTGGAATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGCATCCTTCTGGCCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50792	TTGGAATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGCATCCTTCTGGCCAC	50841

CU463286.9	751	ATAGCCATTTTTACTAGAATGATCCTGCCAACCCATGAGAATGGGAGATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50842	ATAGCCATTTTTACTAGAATGATCCTGCCAACCCATGAGAATGGGAGATC	50891

CU463286.9	801	CCATGCTCGTAATTTATTAATTTAGTGCTGGAAATCTCTTATGCTTCTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50892	CCATGCTCGTAATTTATTAATTTAGTGCTGGAAATCTCTTATGCTTCTAT	50941

CU463286.9	851	TTTTAATACTTCTTTGTTTTAAATCATGCTAATTGCATCTAATTATGTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50942	TTTTAATACTTCTTTGTTTTAAATCATGCTAATTGCATCTAATTATGTAT	50991

CU463286.9	901	TAGAAATGCTGTTAGAACACATTTCCACTGGTAAAGTCTTCCTTTACACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	50992	TAGAAATGCTGTTAGAACACATTTCCACTGGTAAAGTCTTCCTTTACACT	51041

CU463286.9	951	AGTCAAGCTTTTTTTTTTAATCTTTTTTTTTTTAAATTTTTTAAACTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51042	AGTCAAGCTTTTTTTTTTAATCTTTTTTTTTTTAAATTTTTTAAACTCCA	51091

CU463286.9	1001	CATTTTTTTTAATTAGATATTTTCCTCGTTTACATTTTCAATGCTATCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51092	CATTTTTTTTAATTAGATATTTTCCTCGTTTACATTTTCAATGCTATCCC	51141

CU463286.9	1051	AAAGGTCCCCCATACCCACCCCCCCCCAATCCCCTACCCACCCACTCTCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51142	AAAGGTCCCCCATACCCACCCCCCCCCAATCCCCTACCCACCCACTCTCC	51191

CU463286.9	1101	CTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51192	CTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGT	51241

CU463286.9	1151	CCAATGGGCCTCTCTTTACAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51242	CCAATGGGCCTCTCTTTACAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATAC	51291

CU463286.9	1201	ATATGCAGATAAAGACAAGAGCTCCAGGTACTGGTTAGTTCCTATTGTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51292	ATATGCAGATAAAGACAAGAGCTCCAGGTACTGGTTAGTTCCTATTGTTG	51341

CU463286.9	1251	TTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGCTCCTTGGGTAATTTTTCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51342	TTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGCTCCTTGGGTAATTTTTCTA	51391

CU463286.9	1301	TCTCCGACATTGGGGGCCGTGTGACCCATCCAATAGCTGACTGAGCATCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51392	TCTCCGACATTGGGGGCCGTGTGACCCATCCAATAGCTGACTGAGCATCC	51441

CU463286.9	1351	ACTTCTGTGTTTGGTAGGCCCCGGTATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51442	ACTTCTGTGTTTGGTAGGCCCCGGTATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATAT	51491

CU463286.9	1401	CTGGGTGCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTAAGCAATGGTGTCAGCATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51492	CTGGGTGCTTTCAGCAAAATCTTGCTAGTGTAAGCAATGGTGTCAGCATT	51541

CU463286.9	1451	TGGAAGCTGATTATGGGATGGATCCCTGCATATGGCAATCACTAGATGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51542	TGGAAGCTGATTATGGGATGGATCCCTGCATATGGCAATCACTAGATGGT	51591

CU463286.9	1501	CCATCCTTTCGTCACAGCTCCAAATTTTGCTCTGTAACTCCTTCCATGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51592	CCATCCTTTCGTCACAGCTCCAAATTTTGCTCTGTAACTCCTTCCATGGG	51641

CU463286.9	1551	TGTTTTGTTCCCATTTCTAAGAAAGGGTAAAGTGTCCACACTTTGGTCTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51642	TGTTTTGTTCCCATTTCTAAGAAAGGGTAAAGTGTCCACACTTTGGTCTT	51691

CU463286.9	1601	CGTTCTTCTTGAATTTCATGCGTTTGGCAAGTTGTATCTTATATCTTGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51692	CGTTCTTCTTGAATTTCATGCGTTTGGCAAGTTGTATCTTATATCTTGGG	51741

CU463286.9	1651	TATCCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGCGAGTACATACTGTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51742	TATCCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGCGAGTACATACTGTG	51791

CU463286.9	1701	TGAGTTCCTTTGTGATTGGGTTACTTCACTCAGGATGATACCCTCCAGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51792	TGAGTTCCTTTGTGATTGGGTTACTTCACTCAGGATGATACCCTCCAGGT	51841

CU463286.9	1751	CCATCCATTTGCCTAGGAATTTATTAAATTCATTTTTGTAATAGCTGGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51842	CCATCCATTTGCCTAGGAATTTATTAAATTCATTTTTGTAATAGCTGGAT	51891

CU463286.9	1801	AGGATTCCATTGTGTAAATATGCCACATTTTCTGTATCCATTCCTAGTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51892	AGGATTCCATTGTGTAAATATGCCACATTTTCTGTATCCATTCCTAGTCA	51941

CU463286.9	1851	AGCTTTTTAATCATATGTAATATAGACTGTGAACATTCAAGTCATTCCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51942	AGCTTTTTAATCATATGTAATATAGACTGTGAACATTCAAGTCATTCCAC	51991

CU463286.9	1901	ACAGAGTGGTCTCCTGCTGGGGTTTTCATGGTGCTGGAATATCAAATCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	51992	ACAGAGTGGTCTCCTGCTGGGGTTTTCATGGTGCTGGAATATCAAATCTA	52041

CU463286.9	1951	AGGAAATGGAAATACTCAGCAAAAACTCTTTCCCTAGGCTACAGACTCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU469450.4	52042	AGGAAATGGAAATACTCAGCAAAAACTCTTTCCCTAGGCTACAGACTCAG	52091

Overview

Query
CU463286.9 - 177154 bps
Hit
CU469450.4 - 52091 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link