<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU326400.10	1	GATCTTTTTTGGTTGACTGGTAGTTTAATAAACAATCTTTGTCTGTCAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68402	GATCTTTTTTGGTTGACTGGTAGTTTAATAAACAATCTTTGTCTGTCAAG	68451

CU326400.10	51	ATCTTGAGTTACATCATGAAACGGTTGCAGTACTTACAAATAAAGTTGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68452	ATCTTGAGTTACATCATGAAACGGTTGCAGTACTTACAAATAAAGTTGTT	68501

CU326400.10	101	AGTGCCTTAGTATGTAATAATGTTTCTTTTTTCGTCAGACATGCTTCCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68502	AGTGCCTTAGTATGTAATAATGTTTCTTTTTTCGTCAGACATGCTTCCAA	68551

CU326400.10	151	ATTTGTAAGGTCGACAGAATCAGCTTGTTAAAAATTTTACATCAGCTGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68552	ATTTGTAAGGTCGACAGAATCAGCTTGTTAAAAATTTTACATCAGCTGCA	68601

CU326400.10	201	AGCAATGCTACTTTGAGAACAATTTGTCTGTGTATCTTTTGATTGGATCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68602	AGCAATGCTACTTTGAGAACAATTTGTCTGTGTATCTTTTGATTGGATCA	68651

CU326400.10	251	TGTAACTGCAATGGTTTCTGATTTGTCATATATTTTAGTGGCAAATTTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68652	TGTAACTGCAATGGTTTCTGATTTGTCATATATTTTAGTGGCAAATTTTG	68701

CU326400.10	301	TTTTGAGGCTATTACACTATTTTCCTTCCTCATTCTTTGGTATTTCTGGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68702	TTTTGAGGCTATTACACTATTTTCCTTCCTCATTCTTTGGTATTTCTGGG	68751

CU326400.10	351	TTTGTTTGTGCAGATTCTAGTATAATGTTCTATTATTTCCAGGATACAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68752	TTTGTTTGTGCAGATTCTAGTATAATGTTCTATTATTTCCAGGATACAAT	68801

CU326400.10	401	GTCATAATACTTTATTACTCGTTGTTTTCTGGGTAGTGTTATCTTTATGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68802	GTCATAATACTTTATTACTCGTTGTTTTCTGGGTAGTGTTATCTTTATGG	68851

CU326400.10	451	CACGCTCCTTACGAAAAGCTATCACAGTTTGCTCTGTCTTCCGAAAAAGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68852	CACGCTCCTTACGAAAAGCTATCACAGTTTGCTCTGTCTTCCGAAAAAGC	68901

CU326400.10	501	TACTCTTCCATTCTTGCTGTCGCTTCAAATGCCATCAGATTGACCTACAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68902	TACTCTTCCATTCTTGCTGTCGCTTCAAATGCCATCAGATTGACCTACAA	68951

CU326400.10	551	TAGCACATATGTTCCGCTATATTTGGGAATGGAGTCCTCAATTTCATATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	68952	TAGCACATATGTTCCGCTATATTTGGGAATGGAGTCCTCAATTTCATATG	69001

CU326400.10	601	AAAACTATAAACCAGGGGGTGTGATGTTTTCTCGACAGTTCAGTTCCAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69002	AAAACTATAAACCAGGGGGTGTGATGTTTTCTCGACAGTTCAGTTCCAGG	69051

CU326400.10	651	AGAGAGTCAGAGACATTATCTTGGGGAGTATCATCTGACGTTGTTTTGCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69052	AGAGAGTCAGAGACATTATCTTGGGGAGTATCATCTGACGTTGTTTTGCT	69101

CU326400.10	701	GGGAAAGCTTGAAAGTGCATTGAGGAATCACAACTTGGAAGAGGCTTGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69102	GGGAAAGCTTGAAAGTGCATTGAGGAATCACAACTTGGAAGAGGCTTGGG	69151

CU326400.10	751	AAACCTACAAGGATTTCAAACGTCTTTACGGTTTCCCTGACCCCTTTCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69152	AAACCTACAAGGATTTCAAACGTCTTTACGGTTTCCCTGACCCCTTTCTT	69201

CU326400.10	801	GTAGATAAGCTTCTCACTAAGTTGTCGTACTCATCTGATTCTAGATGGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69202	GTAGATAAGCTTCTCACTAAGTTGTCGTACTCATCTGATTCTAGATGGCT	69251

CU326400.10	851	TAAAAAGGCATGCAATATAGTCGGATCTATTTTGAAAGAGAAAAGGGAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69252	TAAAAAGGCATGCAATATAGTCGGATCTATTTTGAAAGAGAAAAGGGAGA	69301

CU326400.10	901	TGCTACGCACAGAGTTAATGACCAAGCTCTGCCTATCGTTGGCTAGAACT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69302	TGCTACGCACAGAGTTAATGACCAAGCTCTGCCTATCGTTGGCTAGAACT	69351

CU326400.10	951	CAAATGCCCATTCAAGCATCATCAATTCTCAGACTGATGTTGGAGAAAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69352	CAAATGCCCATTCAAGCATCATCAATTCTCAGACTGATGTTGGAGAAAGG	69401

CU326400.10	1001	AAATCTCCCACCTATTGACATGCTAGGGATGATAATATTTCACATGGTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69402	AAATCTCCCACCTATTGACATGCTAGGGATGATAATATTTCACATGGTGA	69451

CU326400.10	1051	AGTCTGATACTGGAATGATTGTGTCATCAAACATTTTGATTGAGATATAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69452	AGTCTGATACTGGAATGATTGTGTCATCAAACATTTTGATTGAGATATAT	69501

CU326400.10	1101	GGTAGCTCTCATCAATTAACTACAAAGAAATCCACTGAGTTAAATAAACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69502	GGTAGCTCTCATCAATTAACTACAAAGAAATCCACTGAGTTAAATAAACA	69551

CU326400.10	1151	TAATACACTTCTTTTTAATCTTGTTCTTGATGCTTGTGCAAGATTTGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69552	TAATACACTTCTTTTTAATCTTGTTCTTGATGCTTGTGCAAGATTTGGAT	69601

CU326400.10	1201	CATCCAGTAAAGGCCATCAGATTATTGAGTTAATGGCCCAAGTTGGAGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69602	CATCCAGTAAAGGCCATCAGATTATTGAGTTAATGGCCCAAGTTGGAGTG	69651

CU326400.10	1251	ACAGCTGATGCTCATACTATTTCAATTATTTCCTTGATCCATGAGATGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69652	ACAGCTGATGCTCATACTATTTCAATTATTTCCTTGATCCATGAGATGAA	69701

CU326400.10	1301	TGGTATGCGGGATGAATTAAAGAAATTTAAGAAGCATATAGATCAGGTTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69702	TGGTATGCGGGATGAATTAAAGAAATTTAAGAAGCATATAGATCAGGTTT	69751

CU326400.10	1351	CAGTTCCATTATTTTCCTGCTATCAGCAATTCTATGAAAGTCTCTTGTGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69752	CAGTTCCATTATTTTCCTGCTATCAGCAATTCTATGAAAGTCTCTTGTGT	69801

CU326400.10	1401	TTACATTTCAAGTTTAACGATATTGATGCTGCTTCTAATCTTGTACAAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69802	TTACATTTCAAGTTTAACGATATTGATGCTGCTTCTAATCTTGTACAAGA	69851

CU326400.10	1451	TATTTATGGATTTCAAGTGTCGCATCATCAGCAGGGAAATGAAACACAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69852	TATTTATGGATTTCAAGTGTCGCATCATCAGCAGGGAAATGAAACACAAC	69901

CU326400.10	1501	CACCTAAACCGTGCCTTGTTTCAATTGGCTCTGATAATCTGAGAACGGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69902	CACCTAAACCGTGCCTTGTTTCAATTGGCTCTGATAATCTGAGAACGGGA	69951

CU326400.10	1551	TTGAAATTACGAATTTTTCCCCATTCATTGTCAAGGGATTCTGTTTTCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	69952	TTGAAATTACGAATTTTTCCCCATTCATTGTCAAGGGATTCTGTTTTCAA	70001

CU326400.10	1601	TGTGGGACGTAATCAGGTGCTTGTTATGTATAAGAATGGGAAACTAGCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70002	TGTGGGACGTAATCAGGTGCTTGTTATGTATAAGAATGGGAAACTAGCCC	70051

CU326400.10	1651	TTAGCAACAGAGCATTGGCCAAACTTATTATACAGTACAAGAGGTGTGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70052	TTAGCAACAGAGCATTGGCCAAACTTATTATACAGTACAAGAGGTGTGGG	70101

CU326400.10	1701	AGAATTAATGATCTGTCAAAGCTTCTCTGTAGTATCCAGAAGAAGGGCTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70102	AGAATTAATGATCTGTCAAAGCTTCTCTGTAGTATCCAGAAGAAGGGCTC	70151

CU326400.10	1751	AGTTGAATCTAGCAGAATGTGCTCTGATGTGGTTTCTGCCTGCATTTGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70152	AGTTGAATCTAGCAGAATGTGCTCTGATGTGGTTTCTGCCTGCATTTGCA	70201

CU326400.10	1801	TGGGTTGGCTTGAAATTGCTCATGATATTTTGGATGATTTGGATTCTGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70202	TGGGTTGGCTTGAAATTGCTCATGATATTTTGGATGATTTGGATTCTGAA	70251

CU326400.10	1851	GGAAATCCGCTGGACGCTAGTTCATACATGTCTCTGTTGACTGCATATTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70252	GGAAATCCGCTGGACGCTAGTTCATACATGTCTCTGTTGACTGCATATTG	70301

CU326400.10	1901	CAACAGAAATAAGCTAAGGGAGGCAGAGGCACTACTAAAGCAATTAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70302	CAACAGAAATAAGCTAAGGGAGGCAGAGGCACTACTAAAGCAATTAAAAA	70351

CU326400.10	1951	GATCAGGTGTCATATTAGCATCTGATCCATTGTTAGCTCCTGCATCTATG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468256.3	70352	GATCAGGTGTCATATTAGCATCTGATCCATTGTTAGCTCCTGCATCTATG	70401

Overview

Query
CU326400.10 - 129890 bps
Hit
CU468256.3 - 70401 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001950200012000168402704011
287.97153316126056126371-1339937141
Short-link