<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463313.11	1	GGTGATTTTAGTCAGGGACCCACGACGTAAGTGCACCACCTCTCATGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	181790	GGTGATTTTAGTCAGGGACCCACGACGTAAGTGCACCACCTCTCATGTTC	181839

CU463313.11	51	TGAGTTGCTAGGGGTTGGGAACAAAGGGGCTAGCTTCATTTTGTCTACAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	181840	TGAGTTGCTAGGGGTTGGGAACAAAGGGGCTAGCTTCATTTTGTCTACAA	181889

CU463313.11	101	TTGGTTTTAAAAAAACTTCTCAGTTTTTCTTTGATCACCTCTCTTAATCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	181890	TTGGTTTTAAAAAAACTTCTCAGTTTTTCTTTGATCACCTCTCTTAATCA	181939

CU463313.11	151	TACGAATCTCATATTATTTCCATATAAAAGTGTCTTAGATGTTCTTTTGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	181940	TACGAATCTCATATTATTTCCATATAAAAGTGTCTTAGATGTTCTTTTGA	181989

CU463313.11	201	GACCCATGAATGGAATTGACACATGGGTCATATTCCTTCCCTCCTCATGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	181990	GACCCATGAATGGAATTGACACATGGGTCATATTCCTTCCCTCCTCATGT	182039

CU463313.11	251	GTCCGGTCAACACTGACATCACATTTCCTACATGAAAAAGACAGGGCACT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182040	GTCCGGTCAACACTGACATCACATTTCCTACATGAAAAAGACAGGGCACT	182089

CU463313.11	301	TAAATAAGGACCTGTATAGCACCTGTCTGAAATGTTAAGTTGGAAAATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182090	TAAATAAGGACCTGTATAGCACCTGTCTGAAATGTTAAGTTGGAAAATTT	182139

CU463313.11	351	CCCTGAAGATTTCATGAGCAATTAAGGGGAGTTGGGGGGCCCTGTCCTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182140	CCCTGAAGATTTCATGAGCAATTAAGGGGAGTTGGGGGGCCCTGTCCTAA	182189

CU463313.11	401	AGACTGTGCTGTGCCCTTACTGGGATCTGTGGCCTGATCTCGTCTCCCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182190	AGACTGTGCTGTGCCCTTACTGGGATCTGTGGCCTGATCTCGTCTCCCTG	182239

CU463313.11	451	AATCCCAGAGTTTTTGAAACCTCCATCCCCGTGCTGGGATGCTGTCAGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182240	AATCCCAGAGTTTTTGAAACCTCCATCCCCGTGCTGGGATGCTGTCAGGG	182289

CU463313.11	501	GAAGTAGTCAGGGTTCTCTCTCTGCTGTTGATGGCACCCTAGAGCGGACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182290	GAAGTAGTCAGGGTTCTCTCTCTGCTGTTGATGGCACCCTAGAGCGGACC	182339

CU463313.11	551	CTGGGACTTAATATTTGAATCTGCCTCCTAGACAAGGAATACAGATAATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182340	CTGGGACTTAATATTTGAATCTGCCTCCTAGACAAGGAATACAGATAATA	182389

CU463313.11	601	TACTCTTGGTACCTGAAACTTAACAGTTCTTCTGAAACAGTGCACTGTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182390	TACTCTTGGTACCTGAAACTTAACAGTTCTTCTGAAACAGTGCACTGTGT	182439

CU463313.11	651	CTCAAGCATCAACTGCATTTCTGCCTGAGGGTGAAGGAGAGGATCCACCT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182440	CTCAAGCATCAACTGCATTTCTGCCTGAGGGTGAAGGAGAGGATCCACCT	182489

CU463313.11	701	GGTTTCAGATGTGAAGTTCTATTTTCATATATCAGCAGTGGTCAGAATCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182490	GGTTTCAGATGTGAAGTTCTATTTTCATATATCAGCAGTGGTCAGAATCA	182539

CU463313.11	751	ACAGTTACATGTGGTTCAAACTGAGTACCCAGAGCCTGGGGGTTGGGGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182540	ACAGTTACATGTGGTTCAAACTGAGTACCCAGAGCCTGGGGGTTGGGGCC	182589

CU463313.11	801	AGACAGCGTGAAGGCTGCTAATGTCTCCTGGGGTTAGAAGACAGTCAGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182590	AGACAGCGTGAAGGCTGCTAATGTCTCCTGGGGTTAGAAGACAGTCAGGA	182639

CU463313.11	851	AATAAAGTGTCTGGTGTTGTGCGACTTCCCCAATCTTTGAAGGTTCCATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182640	AATAAAGTGTCTGGTGTTGTGCGACTTCCCCAATCTTTGAAGGTTCCATT	182689

CU463313.11	901	GCTCACCTTCTCGTCTCAATTATCTGTGTGGACTTGTTGGTCCTCACAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182690	GCTCACCTTCTCGTCTCAATTATCTGTGTGGACTTGTTGGTCCTCACAAC	182739

CU463313.11	951	ATCTCTCTGCCCTTTCCATGCACTGTGTAAAGATTATCCTTGTCTAATTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182740	ATCTCTCTGCCCTTTCCATGCACTGTGTAAAGATTATCCTTGTCTAATTC	182789

CU463313.11	1001	AAGTGCTGATTTTTTGCCCTCATATCTTGTTTCAATCCAGACATGGCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182790	AAGTGCTGATTTTTTGCCCTCATATCTTGTTTCAATCCAGACATGGCCAT	182839

CU463313.11	1051	GTAATGGTCATACCAAGAACCTCCTCTCTCATGTTTGTGTAAATAATTCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182840	GTAATGGTCATACCAAGAACCTCCTCTCTCATGTTTGTGTAAATAATTCT	182889

CU463313.11	1101	TATCATTTCTTTTATGCCTTATCAATAAATACTGATCATGCAATGGCTGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182890	TATCATTTCTTTTATGCCTTATCAATAAATACTGATCATGCAATGGCTGG	182939

CU463313.11	1151	GCAGAAGAGAGAATAGGGTGGGACATCTGCCAATCAGAGGAAGAGATTTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182940	GCAGAAGAGAGAATAGGGTGGGACATCTGCCAATCAGAGGAAGAGATTTG	182989

CU463313.11	1201	GAGAAAGACCATGGAAACACCCCTGAAGCCAAATGAGCCATATCAATAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	182990	GAGAAAGACCATGGAAACACCCCTGAAGCCAAATGAGCCATATCAATAAT	183039

CU463313.11	1251	AATATGCATGAGACATGGCATGTTGGCCAGATTAGCATAGAAGGTGAAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183040	AATATGCATGAGACATGGCATGTTGGCCAGATTAGCATAGAAGGTGAAGG	183089

CU463313.11	1301	TAGATCATTTAACTGCTCAGCTATTGAGGTGCAGTTGTAAATGAGTCTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183090	TAGATCATTTAACTGCTCAGCTATTGAGGTGCAGTTGTAAATGAGTCTTG	183139

CU463313.11	1351	GTGTCTCTGTGAAGTTTTTGGTGATTACCATAATGTAAAGAAATACAACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183140	GTGTCTCTGTGAAGTTTTTGGTGATTACCATAATGTAAAGAAATACAACT	183189

CU463313.11	1401	GCTGGACTCATACACTGCCAATATTTATATTAACAATAGTTAACTTGCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183190	GCTGGACTCATACACTGCCAATATTTATATTAACAATAGTTAACTTGCAC	183239

CU463313.11	1451	TGATGTTTTTATTGTTTAATAACCCTTGCAAAGGCTCCCAGTAATGCATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183240	TGATGTTTTTATTGTTTAATAACCCTTGCAAAGGCTCCCAGTAATGCATT	183289

CU463313.11	1501	GAACAAGTGCAGTGAGTGCGGCTAGCCCGTGTCTTACCTGATGCAGGAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183290	GAACAAGTGCAGTGAGTGCGGCTAGCCCGTGTCTTACCTGATGCAGGAAG	183339

CU463313.11	1551	AAAATGATTTCAGCTCCACACACTCTGAAACTGACTGTGGATTTTTATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183340	AAAATGATTTCAGCTCCACACACTCTGAAACTGACTGTGGATTTTTATTT	183389

CU463313.11	1601	ATTACCTTCATCATTTTGATGTATGTTCCTTCTACACCTAATTTTTTTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183390	ATTACCTTCATCATTTTGATGTATGTTCCTTCTACACCTAATTTTTTTGA	183439

CU463313.11	1651	GTCTTGCTTATCACAAACAGAATGAACTTTATCAAAAGCCTTCCTAGCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183440	GTCTTGCTTATCACAAACAGAATGAACTTTATCAAAAGCCTTCCTAGCAT	183489

CU463313.11	1701	CAGCTGAAACGACAATGTTGCTTTAATCCTTCATTGTGGTAGGCTGTGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183490	CAGCTGAAACGACAATGTTGCTTTAATCCTTCATTGTGGTAGGCTGTGCT	183539

CU463313.11	1751	TTCATACTTATTTACTTACATACATCCAACCGTCCTTGCATCTGGAAGAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183540	TTCATACTTATTTACTTACATACATCCAACCGTCCTTGCATCTGGAAGAT	183589

CU463313.11	1801	GACTCATGCTTGGGTGTGGCCTATGAAGATTTGGTGGGCCTTTGATTTGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183590	GACTCATGCTTGGGTGTGGCCTATGAAGATTTGGTGGGCCTTTGATTTGC	183639

CU463313.11	1851	TACCATTTTATTGGAAACTTTGACATGTCTGTTCATAGAGGCTATGATGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183640	TACCATTTTATTGGAAACTTTGACATGTCTGTTCATAGAGGCTATGATGC	183689

CU463313.11	1901	TGGTTTATCTTTGACTGGATTTTTGCCTATTTGTTTCAGGGAATAATGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183690	TGGTTTATCTTTGACTGGATTTTTGCCTATTTGTTTCAGGGAATAATGGC	183739

CU463313.11	1951	CTCCCTAGAAAGGGTTGACAAAGCACTATCCACTTCAGTTTGTAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468138.7	183740	CTCCCTAGAAAGGGTTGACAAAGCACTATCCACTTCAGTTTGTAGAATTC	183789

Overview

Query
CU463313.11 - 69816 bps
Hit
CU468138.7 - 183789 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link