<=>End overlap alignment
Alignment #1
HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps
Full alignment
CU463853.8 1 GAATTCTGTAACAAATTTCAAAGTCCAGTGTAACTGACTGCCTGGCCGGC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16469 GAATTCTGTAACAAATTTCAAAGTCCAGTGTAACTGACTGCCTGGCCGGC 16518 CU463853.8 51 TTAGGTCCTTCCCTGCCCCACGGGCTTCAGGTCCAAGCTCTTTAACTATT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16519 TTAGGTCCTTCCCTGCCCCACGGGCTTCAGGTCCAAGCTCTTTAACTATT 16568 CU463853.8 101 ACTTGCTACATCTAACGGGGCTGTATGTGTCTCTTCTTCCACACTGTGGG 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16569 ACTTGCTACATCTAACGGGGCTGTATGTGTCTCTTCTTCCACACTGTGGG 16618 CU463853.8 151 TTTCGGAAGGTGTGACCACTTACATGGCCACTCTTGTGGAATCTCTGGTT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16619 TTTCGGAAGGTGTGACCACTTACATGGCCACTCTTGTGGAATCTCTGGTT 16668 CU463853.8 201 GTTTTAGGATCAGCAGCCTCATCCACACTGGCCTAATGGCCTGTCTCAGA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16669 GTTTTAGGATCAGCAGCCTCATCCACACTGGCCTAATGGCCTGTCTCAGA 16718 CU463853.8 251 CTTGTTTCAGTTGTGCTGAGTAGTGGGAAATATTTGCTAAAAAACCTTTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16719 CTTGTTTCAGTTGTGCTGAGTAGTGGGAAATATTTGCTAAAAAACCTTTT 16768 CU463853.8 301 GTCTAAAATCTGTTTTCTAAACTCATTCTGCTGAGTCCTGCCATGCACGT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16769 GTCTAAAATCTGTTTTCTAAACTCATTCTGCTGAGTCCTGCCATGCACGT 16818 CU463853.8 351 GGCTGTACCGTGACTGCTGGTCGTGGGAAAAATCTCTCTCTTCCTCTCCC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16819 GGCTGTACCGTGACTGCTGGTCGTGGGAAAAATCTCTCTCTTCCTCTCCC 16868 CU463853.8 401 TCTCTCTGAGACATATTAATCAAGATACTATGCTTTAGCTCAGGCTGGTC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16869 TCTCTCTGAGACATATTAATCAAGATACTATGCTTTAGCTCAGGCTGGTC 16918 CU463853.8 451 TGGAATCCACTATGTGTAGCCCTAACTGGCCTTGACTTTGAGGCAACCCT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16919 TGGAATCCACTATGTGTAGCCCTAACTGGCCTTGACTTTGAGGCAACCCT 16968 CU463853.8 501 CCTGCCTCAGCCTTCCCAGTGCTGGGAGGAATTACAGTGTGAATCACTGT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 16969 CCTGCCTCAGCCTTCCCAGTGCTGGGAGGAATTACAGTGTGAATCACTGT 17018 CU463853.8 551 GCCTGTCTTCTGTATTCCTCATAGATGCATATCAGTTTCATCTCAGTTTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17019 GCCTGTCTTCTGTATTCCTCATAGATGCATATCAGTTTCATCTCAGTTTT 17068 CU463853.8 601 GAAACTTGCTGGCATTGGGTGTCTCCTTCGTGCTTCAGTCAGGGAAGGTA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17069 GAAACTTGCTGGCATTGGGTGTCTCCTTCGTGCTTCAGTCAGGGAAGGTA 17118 CU463853.8 651 AATGTTTGTGCGTGTTTCAAAGAGGCGCTGGCCTCAGGGTCACAAGGGTC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17119 AATGTTTGTGCGTGTTTCAAAGAGGCGCTGGCCTCAGGGTCACAAGGGTC 17168 CU463853.8 701 TTCAGACATCTGAGTGCCTTCCCATAGAACTTGTAAGCACTTTGAAGGCA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17169 TTCAGACATCTGAGTGCCTTCCCATAGAACTTGTAAGCACTTTGAAGGCA 17218 CU463853.8 751 AAGGGTAACTTATGATGCAGCCTCTGAAAAAATGCACACTGTGTGTACAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17219 AAGGGTAACTTATGATGCAGCCTCTGAAAAAATGCACACTGTGTGTACAT 17268 CU463853.8 801 CTGCGACTCATTTGACAGGTAAATGTCAAATAGACTCTGAGCTCTGGGAG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17269 CTGCGACTCATTTGACAGGTAAATGTCAAATAGACTCTGAGCTCTGGGAG 17318 CU463853.8 851 CAGATGTGGCCAGCCTATTCTCAAGGGACAGTCTGCTGTCAGGGCACTGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17319 CAGATGTGGCCAGCCTATTCTCAAGGGACAGTCTGCTGTCAGGGCACTGA 17368 CU463853.8 901 GGGACTAGGTGAGGCAGCTAAGTTGTTTCCTGCCTCCAATCCCTGGCACA 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17369 GGGACTAGGTGAGGCAGCTAAGTTGTTTCCTGCCTCCAATCCCTGGCACA 17418 CU463853.8 951 TACCTGCTTGCTGGTGGAAGCCATCTGCTCTCTGACTCTGGGTACCAGAG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17419 TACCTGCTTGCTGGTGGAAGCCATCTGCTCTCTGACTCTGGGTACCAGAG 17468 CU463853.8 1001 CTGTTGTAGTATTGCCGAATGTTTCTCAGGCTCAACTGGAAAATCTTCAT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17469 CTGTTGTAGTATTGCCGAATGTTTCTCAGGCTCAACTGGAAAATCTTCAT 17518 CU463853.8 1051 CCGATTGGTGAAAACCTCGGTCTCGTGAGTGAAGTACTGTGCATTTTCCC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17519 CCGATTGGTGAAAACCTCGGTCTCGTGAGTGAAGTACTGTGCATTTTCCC 17568 CU463853.8 1101 TCAGCCAGTCAGCACAAGGCTCTGCCTTCATGCTCCTGCTGTCGTAGTGG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17569 TCAGCCAGTCAGCACAAGGCTCTGCCTTCATGCTCCTGCTGTCGTAGTGG 17618 CU463853.8 1151 ATGAAGGGCTGGTTATCTAAGAAGCCACTGGCGAAAAATGAAGGAACTCC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17619 ATGAAGGGCTGGTTATCTAAGAAGCCACTGGCGAAAAATGAAGGAACTCC 17668 CU463853.8 1201 CGGGCCCGGCTCAGTCACAGCTGAGTAACAGTAATGCAGAGAGTGTGACC 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17669 CGGGCCCGGCTCAGTCACAGCTGAGTAACAGTAATGCAGAGAGTGTGACC 17718 CU463853.8 1251 CTGAGGTTAGAATAGGACTTAGTGTGAGGTACCGAGTGAGGGCCCAGCTC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17719 CTGAGGTTAGAATAGGACTTAGTGTGAGGTACCGAGTGAGGGCCCAGCTC 17768 CU463853.8 1301 TAGAAGAGACAGGACACACAAACATGAATGAGAACACTTCATAACAACCC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17769 TAGAAGAGACAGGACACACAAACATGAATGAGAACACTTCATAACAACCC 17818 CU463853.8 1351 ACCAGCCAAGAGAATCGGATTCCTTACTGCGCACTGGGATAATTCAGAGA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17819 ACCAGCCAAGAGAATCGGATTCCTTACTGCGCACTGGGATAATTCAGAGA 17868 CU463853.8 1401 ACCAACAAAGTGTGCGCGTAAGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17869 ACCAACAAAGTGTGCGCGTAAGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAG 17918 CU463853.8 1451 AGCATTGGTCACTCTTATAGAGGACCTGAGTTCAATTCCCAGCATCCACG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17919 AGCATTGGTCACTCTTATAGAGGACCTGAGTTCAATTCCCAGCATCCACG 17968 CU463853.8 1501 TGTCCTCTCCCAACCATCTGTACCTCCAGCTTCAGGGGATCTGATGCCTT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 17969 TGTCCTCTCCCAACCATCTGTACCTCCAGCTTCAGGGGATCTGATGCCTT 18018 CU463853.8 1551 TTGGCCCCTCCAGGGCACTGTCCGTGTGTTGCGCATAGATGAAGCTGCAG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18019 TTGGCCCCTCCAGGGCACTGTCCGTGTGTTGCGCATAGATGAAGCTGCAG 18068 CU463853.8 1601 TAATTGAGCTCAGGACCTTTGGAAGACCAGTTAGTGCTCTTAACTGCTGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18069 TAATTGAGCTCAGGACCTTTGGAAGACCAGTTAGTGCTCTTAACTGCTGA 18118 CU463853.8 1651 GCCATCTCTCCAGCCCTCCCCCCTTTTTAAAATATGTTTGTTTTTTAATC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18119 GCCATCTCTCCAGCCCTCCCCCCTTTTTAAAATATGTTTGTTTTTTAATC 18168 CU463853.8 1701 TTTATTTTTGAGACAGGGTCTCATGTAGCTGAGGCTGGCCTTGAACTTCT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18169 TTTATTTTTGAGACAGGGTCTCATGTAGCTGAGGCTGGCCTTGAACTTCT 18218 CU463853.8 1751 GATCTTTCTGCCTGCACCTCCCAAATGCTGGGATCACAGGTGTGCACCAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18219 GATCTTTCTGCCTGCACCTCCCAAATGCTGGGATCACAGGTGTGCACCAT 18268 CU463853.8 1801 TATACCCAGCACATACAAAATAATAATAATTGTAAACTGGAGTTCCAGAG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18269 TATACCCAGCACATACAAAATAATAATAATTGTAAACTGGAGTTCCAGAG 18318 CU463853.8 1851 ACAAGATGTGATATTTGTCTTTCTGAGGCTTGCTTCTTTCAGTTGTATCC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18319 ACAAGATGTGATATTTGTCTTTCTGAGGCTTGCTTCTTTCAGTTGTATCC 18368 CU463853.8 1901 ATCTCTCCCAATATCATAATTTAATTTTGCTTAAAAAGGGCATAGAATTT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18369 ATCTCTCCCAATATCATAATTTAATTTTGCTTAAAAAGGGCATAGAATTT 18418 CU463853.8 1951 CATTTTATAGCTAAATAAGACTTCATTGTATTGTATCAAATTCTAGAGTG 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CU468049.4 18419 CATTTTATAGCTAAATAAGACTTCATTGTATTGTATCAAATTCTAGAGTG 18468