<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU207318.9	1	GAATTCTTTGTTTACCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGTGGTTATTTGATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131562	GAATTCTTTGTTTACCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGTGGTTATTTGATT	131611

CU207318.9	51	TTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTAGATATTAGTCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131612	TTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTAGATATTAGTCCC	131661

CU207318.9	101	CTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131662	CTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCA	131711

CU207318.9	151	TTTTGTCTTATTGACAGTATCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131712	TTTTGTCTTATTGACAGTATCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATTTTA	131761

CU207318.9	201	TGAGGTCCCATTTGTCAATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGGTGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131762	TGAGGTCCCATTTGTCAATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGGTGTT	131811

CU207318.9	251	CTATTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCGAGGCTTTTCCCCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131812	CTATTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCGAGGCTTTTCCCCAC	131861

CU207318.9	301	TTTCTCCTCTATAAGTTTCACTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCCTTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131862	TTTCTCCTCTATAAGTTTCACTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCCTTGA	131911

CU207318.9	351	TCCACTTAGATTTGACTTTAGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTTGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131912	TCCACTTAGATTTGACTTTAGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTTGC	131961

CU207318.9	401	ATTTTTCTACATGATAACCACCAGTTGTGCCAGGACCATTTGTTGAAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	131962	ATTTTTCTACATGATAACCACCAGTTGTGCCAGGACCATTTGTTGAAAAT	132011

CU207318.9	451	GCTGTTTCCCCCCCCCCCCCTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132012	GCTGTTTCCCCCCCCCCCCCTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATC	132061

CU207318.9	501	AAGTGACCATAGGTGTGTGGGTGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132062	AAGTGACCATAGGTGTGTGGGTGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTC	132111

CU207318.9	551	CATTGGTCTACTTGTCTGTCTCTATATCAGTACCATGCAGTTTTTATCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132112	CATTGGTCTACTTGTCTGTCTCTATATCAGTACCATGCAGTTTTTATCAC	132161

CU207318.9	601	AATTGCTCTGTAGTACAGCTTTAGGTCAGGCATGATGATTCCACCAGAGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132162	AATTGCTCTGTAGTACAGCTTTAGGTCAGGCATGATGATTCCACCAGAGA	132211

CU207318.9	651	TTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132212	TTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATTC	132261

CU207318.9	701	CAGATGAATTTGCAGATTGTTCTTTCTAATTTGTTGAAGAATTGAATTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132262	CAGATGAATTTGCAGATTGTTCTTTCTAATTTGTTGAAGAATTGAATTGG	132311

CU207318.9	751	TATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGCAAGATAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132312	TATTTTGATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGCAAGATAG	132361

CU207318.9	801	CCATTTTTACTATATTGATCCTGCCAATCCATGAGCATGGGAGATCTTTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132362	CCATTTTTACTATATTGATCCTGCCAATCCATGAGCATGGGAGATCTTTC	132411

CU207318.9	851	CATCTTCTGAGATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132412	CATCTTCTGAGATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAGAGACTTGAAGTTCTT	132461

CU207318.9	901	TTCATCCCGATCTTTCACTTCCTTAGTTAGAGTCACGCCAAGATATTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132462	TTCATCCCGATCTTTCACTTCCTTAGTTAGAGTCACGCCAAGATATTTTA	132511

CU207318.9	951	TATTATTTGTGACTATTGAGAAGGGTGTTGTTTCCCTAATTTCTTTCTTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132512	TATTATTTGTGACTATTGAGAAGGGTGTTGTTTCCCTAATTTCTTTCTTA	132561

CU207318.9	1001	GCCTGTTTATCCTTTGTGTAGAGAAAGGCCATTGACTTGTTTGAGTTAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132562	GCCTGTTTATCCTTTGTGTAGAGAAAGGCCATTGACTTGTTTGAGTTAAT	132611

CU207318.9	1051	TTTATATCAAACTACTTCACTGAAGCTGTTTATCAGGTTTAGGAGTTCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132612	TTTATATCAAACTACTTCACTGAAGCTGTTTATCAGGTTTAGGAGTTCTC	132661

CU207318.9	1101	TGGTGGAATTTTTAGGGTCACTTATATATACTATCATATCATCTGCAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132662	TGGTGGAATTTTTAGGGTCACTTATATATACTATCATATCATCTGCAAAA	132711

CU207318.9	1151	AGTGATATTTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTATATCCCCTTGATCTCCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132712	AGTGATATTTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTATATCCCCTTGATCTCCTT	132761

CU207318.9	1201	TTGTTGTTGAATTGCTCTGGCTAGGACTTCAAGTACAATGTTGAATAGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132762	TTGTTGTTGAATTGCTCTGGCTAGGACTTCAAGTACAATGTTGAATAGGT	132811

CU207318.9	1251	AGGGAGAAAGTGGGCAGCCTTGTCTAGTCCCTGATTTTAGTGGGAATGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132812	AGGGAGAAAGTGGGCAGCCTTGTCTAGTCCCTGATTTTAGTGGGAATGCT	132861

CU207318.9	1301	TCCAGCTTCTCACCATTTACTTTGATGTTGGCTACTGGTTTGATGTAGAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132862	TCCAGCTTCTCACCATTTACTTTGATGTTGGCTACTGGTTTGATGTAGAT	132911

CU207318.9	1351	TGCTTCTATCATGTTTAGGTATGGGCCCTGAATTCCTGATCTTTCCAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132912	TGCTTCTATCATGTTTAGGTATGGGCCCTGAATTCCTGATCTTTCCAAGA	132961

CU207318.9	1401	CTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAAATGCTTTCTCCGCATCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	132962	CTTTTATCATGAATGGGTGTTGGATTTTGTCAAATGCTTTCTCCGCATCT	133011

CU207318.9	1451	AACGAGATGATCATGTGGTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATAGTGGATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133012	AACGAGATGATCATGTGGTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATAGTGGATT	133061

CU207318.9	1501	ATGTTGATGGATTTCCATATATTAAACCATCCCTGCATAAAAATTTAATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133062	ATGTTGATGGATTTCCATATATTAAACCATCCCTGCATAAAAATTTAATG	133111

CU207318.9	1551	TAATTTCATTCTTATAAACCATTTTGTTTATTTATACATATCATTTTATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133112	TAATTTCATTCTTATAAACCATTTTGTTTATTTATACATATCATTTTATT	133161

CU207318.9	1601	TTTAAATTTTTTATTAGATATTTTCTTTAGTTACACTTCAAATGTTATCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133162	TTTAAATTTTTTATTAGATATTTTCTTTAGTTACACTTCAAATGTTATCC	133211

CU207318.9	1651	CCTTTCCTGGTTTCCTATCCAAAACCCCCTATCCCATCCCTCCTTCCCCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133212	CCTTTCCTGGTTTCCTATCCAAAACCCCCTATCCCATCCCTCCTTCCCCT	133261

CU207318.9	1701	GCTCTCCAACCCACCCACTCCTGCTTCTGTATCCTGGCATTCCCCTTCTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133262	GCTCTCCAACCCACCCACTCCTGCTTCTGTATCCTGGCATTCCCCTTCTC	133311

CU207318.9	1751	TGGAGCATAGAGCCTTCACAGGACTAAGGGCCTCTCCTCCCATTGACATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133312	TGGAGCATAGAGCCTTCACAGGACTAAGGGCCTCTCCTCCCATTGACATC	133361

CU207318.9	1801	CAACAAGGCCATCCTCTGCTGGAGCTATGAGTCCCTCCATGTGTACTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133362	CAACAAGGCCATCCTCTGCTGGAGCTATGAGTCCCTCCATGTGTACTTTT	133411

CU207318.9	1851	TGGTTGGTGGTTTAGTCCCTGGGAGCTCTGGGGGTACTTGTTGGTTCTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133412	TGGTTGGTGGTTTAGTCCCTGGGAGCTCTGGGGGTACTTGTTGGTTCTTT	133461

CU207318.9	1901	TTGTTGTTCCTCCTATTGGGCTGCAAACTCCTTCAGCATCTTTGGTCCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133462	TTGTTGTTCCTCCTATTGGGCTGCAAACTCCTTCAGCATCTTTGGTCCTT	133511

CU207318.9	1951	TCTCTAGCTCCTCCATTGAGGACTTTGTCCAATGGTTGGCTGAGAGCATT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU468014.15	133512	TCTCTAGCTCCTCCATTGAGGACTTTGTCCAATGGTTGGCTGAGAGCATT	133561

Overview

Query
CU207318.9 - 219685 bps
Hit
CU468014.15 - 133561 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link