<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU367883.10	1	GAATTCTCTCTATAGACCTAGCTGGCCTTGAACTCACAGAGGTCTGCCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89266	GAATTCTCTCTATAGACCTAGCTGGCCTTGAACTCACAGAGGTCTGCCTG	89315

CU367883.10	51	CCTCTGCTTCCCAAGTGCTGGAATCAAAGGTGTGTTCCCGTGCTAAACTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89316	CCTCTGCTTCCCAAGTGCTGGAATCAAAGGTGTGTTCCCGTGCTAAACTA	89365

CU367883.10	101	TGTTGGAGTTGATTTAACTTGTGTGACTGACTCCAGGGTGTTCCTCCAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89366	TGTTGGAGTTGATTTAACTTGTGTGACTGACTCCAGGGTGTTCCTCCAGA	89415

CU367883.10	151	AGGGGCAATTGAAGCTTGCTTCAGCCAGGCTTTAGAAGGGACAACACAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89416	AGGGGCAATTGAAGCTTGCTTCAGCCAGGCTTTAGAAGGGACAACACAGA	89465

CU367883.10	201	CACCTTTGACAGCTCTGGACAGCTCTCTGCCGGGTACAATGACAGAACAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89466	CACCTTTGACAGCTCTGGACAGCTCTCTGCCGGGTACAATGACAGAACAT	89515

CU367883.10	251	CTGGCCTTAATTGCAGTGGGCAGGTTTCGGGAGATAGCTCAGTGGTAGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89516	CTGGCCTTAATTGCAGTGGGCAGGTTTCGGGAGATAGCTCAGTGGTAGAG	89565

CU367883.10	301	TTCTTGTCATGCACAAAACTCCAGGTTCCATTCCCAGCACCACAGAATGT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89566	TTCTTGTCATGCACAAAACTCCAGGTTCCATTCCCAGCACCACAGAATGT	89615

CU367883.10	351	CATGGGCTGAATCAGTCCTTTGTTGACTGCAGGGACATGCAGGGTTGCCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89616	CATGGGCTGAATCAGTCCTTTGTTGACTGCAGGGACATGCAGGGTTGCCA	89665

CU367883.10	401	GGAGACAATGGCCTCATGGTTAGGCTTTCCCCACAGAAAGCTCAGCGTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89666	GGAGACAATGGCCTCATGGTTAGGCTTTCCCCACAGAAAGCTCAGCGTGA	89715

CU367883.10	451	CCAAGTCTGCACTTAGGGATCCTTGGCCAGAGTGAATTGATCGCAGTGCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89716	CCAAGTCTGCACTTAGGGATCCTTGGCCAGAGTGAATTGATCGCAGTGCT	89765

CU367883.10	501	CTTGGGAATCAGATATATAATCAGCGACTAAAATCTCATCTGGGGGCTTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89766	CTTGGGAATCAGATATATAATCAGCGACTAAAATCTCATCTGGGGGCTTG	89815

CU367883.10	551	GGAGGGTTAAGAACCTGGGCCTGGCTTGCAGAGGACCCAGGTTCAGTTCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89816	GGAGGGTTAAGAACCTGGGCCTGGCTTGCAGAGGACCCAGGTTCAGTTCC	89865

CU367883.10	601	CAGCTCCCCCATAGCAGCTGACAACTGTTTTAACTCCAGTGTCAGGGGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89866	CAGCTCCCCCATAGCAGCTGACAACTGTTTTAACTCCAGTGTCAGGGGAT	89915

CU367883.10	651	CCAGCACCCTCTTTTGGCCTCTTCAGGCACCACACACATGCAGGGTGCAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89916	CCAGCACCCTCTTTTGGCCTCTTCAGGCACCACACACATGCAGGGTGCAC	89965

CU367883.10	701	ACACACACATGCAGGAAAAACACTCACACATAAAATAAAAATAAATCTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	89966	ACACACACATGCAGGAAAAACACTCACACATAAAATAAAAATAAATCTTT	90015

CU367883.10	751	AAAATCTCACTGGTCTGTAGAAGTGAAAATGTGTAGTTAGTTGAACAGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90016	AAAATCTCACTGGTCTGTAGAAGTGAAAATGTGTAGTTAGTTGAACAGCC	90065

CU367883.10	801	TCAAATCTGTTTGTAGACCTTGGGATGCAGAAAAACCCAACAGTGTGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90066	TCAAATCTGTTTGTAGACCTTGGGATGCAGAAAAACCCAACAGTGTGTGT	90115

CU367883.10	851	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGATGTTTAGTGTGTGGTTGGTTGGTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90116	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGATGTTTAGTGTGTGGTTGGTTGGTG	90165

CU367883.10	901	TGTGTATATATGGAGTGTGGTGTGTGATGTTTGTGTGTGGAATGTGTGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90166	TGTGTATATATGGAGTGTGGTGTGTGATGTTTGTGTGTGGAATGTGTGGT	90215

CU367883.10	951	ATTGTGTAATTGGTGTGCGTGTGTGTGGTTTGTGATGTGTGGTGTATGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90216	ATTGTGTAATTGGTGTGCGTGTGTGTGGTTTGTGATGTGTGGTGTATGTG	90265

CU367883.10	1001	TGTGTAATGTGTGGTTTTTGTGTATGGAGTGGAGTGTGTGGTATATGTAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90266	TGTGTAATGTGTGGTTTTTGTGTATGGAGTGGAGTGTGTGGTATATGTAG	90315

CU367883.10	1051	TGTGTGGTGTGTGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTAAAGTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90316	TGTGTGGTGTGTGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTAAAGTGG	90365

CU367883.10	1101	AGTGTGTGGTATTTGTATAAGTCATGTGTATGATGTATGTTTTTGTGTAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90366	AGTGTGTGGTATTTGTATAAGTCATGTGTATGATGTATGTTTTTGTGTAG	90415

CU367883.10	1151	TTGTGTGTGTGGTGTGTGCTTAGCTGTTTGGGGTATGTGTGTCTGTGTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90416	TTGTGTGTGTGGTGTGTGCTTAGCTGTTTGGGGTATGTGTGTCTGTGTGA	90465

CU367883.10	1201	CCTGATTCTCCATCCAAGCTTGCAAAGACCAGCCCAGCCATTTATCACAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90466	CCTGATTCTCCATCCAAGCTTGCAAAGACCAGCCCAGCCATTTATCACAG	90515

CU367883.10	1251	TGACAGCAATGGGGAAGAGGAAGAAGGAACCGAAGCAAAGTGTGTCTTGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90516	TGACAGCAATGGGGAAGAGGAAGAAGGAACCGAAGCAAAGTGTGTCTTGA	90565

CU367883.10	1301	GAAGCCACACCCAGGTTTTAGGTGTATAGTGTTCTTTCCCTGAGCAACTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90566	GAAGCCACACCCAGGTTTTAGGTGTATAGTGTTCTTTCCCTGAGCAACTC	90615

CU367883.10	1351	TTTTAGTGCCCATGCTTAAATATATATTAAAATCATTTAATAATATCCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90616	TTTTAGTGCCCATGCTTAAATATATATTAAAATCATTTAATAATATCCAA	90665

CU367883.10	1401	CTCTAGAGCCTGGAGAGATGACTTAATGGCTAAGACACTTGCTTCTCTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90666	CTCTAGAGCCTGGAGAGATGACTTAATGGCTAAGACACTTGCTTCTCTTT	90715

CU367883.10	1451	CAAAGGACCTGAGTTCTAGTCTCAGCATCTACATCAGGTAACACAGAGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90716	CAAAGGACCTGAGTTCTAGTCTCAGCATCTACATCAGGTAACACAGAGCC	90765

CU367883.10	1501	ATCTGTAACTCCAGACCCAGGGTATCTGACAGTCTCTTCTAACATGCAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90766	ATCTGTAACTCCAGACCCAGGGTATCTGACAGTCTCTTCTAACATGCAAG	90815

CU367883.10	1551	GGCTCCTCCTGCACACAGGTAGCACGTGCACACACATACAGTCACACACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90816	GGCTCCTCCTGCACACAGGTAGCACGTGCACACACATACAGTCACACACA	90865

CU367883.10	1601	AACATAGTCATAAAATAAATTTTAAAAATAATTTCTAACTTTGTTTTTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90866	AACATAGTCATAAAATAAATTTTAAAAATAATTTCTAACTTTGTTTTTAA	90915

CU367883.10	1651	GAAAAAAAGCCATTAGGTCATCTGAGACTTTGTTTATGTGTGGTATGTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90916	GAAAAAAAGCCATTAGGTCATCTGAGACTTTGTTTATGTGTGGTATGTGT	90965

CU367883.10	1701	GTGGTGTGTGGAGTGTGTATGTGGTTATGTGTGGTATGTACGTGGTGTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	90966	GTGGTGTGTGGAGTGTGTATGTGGTTATGTGTGGTATGTACGTGGTGTGT	91015

CU367883.10	1751	GGGGTTTTTGTATGTGTATGTATGTATGGTGTGTGTATGTAGTATGTATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	91016	GGGGTTTTTGTATGTGTATGTATGTATGGTGTGTGTATGTAGTATGTATA	91065

CU367883.10	1801	TGTATGTGTGGTGTGTGTGTGAATGTGTATGTATGGTGTGTGCACATGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	91066	TGTATGTGTGGTGTGTGTGTGAATGTGTATGTATGGTGTGTGCACATGTG	91115

CU367883.10	1851	AAGTTATGTGGGTGTGCATGTGAAGGTTACAGGCCAGCCTCCGGTGCTAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	91116	AAGTTATGTGGGTGTGCATGTGAAGGTTACAGGCCAGCCTCCGGTGCTAC	91165

CU367883.10	1901	TCTTTAGGTGACATCTTTTTTCTAGACAAGGTTTCTCACTGGCCTGAAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	91166	TCTTTAGGTGACATCTTTTTTCTAGACAAGGTTTCTCACTGGCCTGAAGC	91215

CU367883.10	1951	TTTGCCAAGTAGGTCATGCTAACTGGCTAGTGAGCTTCAGGGGACACCTG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU467500.8	91216	TTTGCCAAGTAGGTCATGCTAACTGGCTAGTGAGCTTCAGGGGACACCTG	91265

Overview

Query
CU367883.10 - 243242 bps
Hit
CU467500.8 - 91265 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link