<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463328.8	1	GAATTCTTCTAATGTAGAAGGCAATGGTGGTGCATGCCTGTAACACTTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102315	GAATTCTTCTAATGTAGAAGGCAATGGTGGTGCATGCCTGTAACACTTGT	102364

CU463328.8	51	CATTGGGAAGCAGAGGAGTTCAAACCTTCCTGAACTAGAGGGGATTCATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102365	CATTGGGAAGCAGAGGAGTTCAAACCTTCCTGAACTAGAGGGGATTCATT	102414

CU463328.8	101	TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102415	TCTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTG	102464

CU463328.8	151	TAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCTAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102465	TAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCTAAC	102514

CU463328.8	201	TCAGAGATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGGTGGGATTAAAGGCGTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102515	TCAGAGATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGGTGGGATTAAAGGCGTGC	102564

CU463328.8	251	GCCACCACACCCAGCAGGATTCATTTCTTAAAGAGCAAAAGCATTGACAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102565	GCCACCACACCCAGCAGGATTCATTTCTTAAAGAGCAAAAGCATTGACAA	102614

CU463328.8	301	AAATTCACATAGCAATTAAATACTTCCTGTCTACAAATCTCATCTGAAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102615	AAATTCACATAGCAATTAAATACTTCCTGTCTACAAATCTCATCTGAAAC	102664

CU463328.8	351	ATTACTGCAATTTTTTCCCCCACACACATAAGTGGACACAGTTCAGATTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102665	ATTACTGCAATTTTTTCCCCCACACACATAAGTGGACACAGTTCAGATTG	102714

CU463328.8	401	TCTCCGGAGAGCTAGGTGTCAAGGCACACCCAAGCAAACCCAGCATTTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102715	TCTCCGGAGAGCTAGGTGTCAAGGCACACCCAAGCAAACCCAGCATTTGG	102764

CU463328.8	451	AAGGTTCAGGCAGGAGGATCAGGAGTTCAAGACCATGGCGGAGGGGAAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102765	AAGGTTCAGGCAGGAGGATCAGGAGTTCAAGACCATGGCGGAGGGGAAGA	102814

CU463328.8	501	CACAGTCTCTTTCTGATGGAATCTCCAGAGAATGAACTGGGGAAAGTTAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102815	CACAGTCTCTTTCTGATGGAATCTCCAGAGAATGAACTGGGGAAAGTTAG	102864

CU463328.8	551	TCAACAGCTGTCAGAGGAGGCGAGCAATGACCGGAAATCTCTAGCTTATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102865	TCAACAGCTGTCAGAGGAGGCGAGCAATGACCGGAAATCTCTAGCTTATT	102914

CU463328.8	601	TACAAAGAAATACAGGAAATAATACAGAGCAGACCAGGGAAGAGTCCTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102915	TACAAAGAAATACAGGAAATAATACAGAGCAGACCAGGGAAGAGTCCTGT	102964

CU463328.8	651	CCTGTACTTAAGTCTAACCCTCATGGTAGGATCCTGCAGATGAACTTGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	102965	CCTGTACTTAAGTCTAACCCTCATGGTAGGATCCTGCAGATGAACTTGGT	103014

CU463328.8	701	GGGTAGGCAGCAGTCACAGACCTCCATTTTTCTCCCCTGTTCTGAGAACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103015	GGGTAGGCAGCAGTCACAGACCTCCATTTTTCTCCCCTGTTCTGAGAACA	103064

CU463328.8	751	GGAGAGTGGCACCTCCCTTCTCTGCAGCACTGAGTACACGTCTAACACTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103065	GGAGAGTGGCACCTCCCTTCTCTGCAGCACTGAGTACACGTCTAACACTC	103114

CU463328.8	801	CGTAGAAACATTAAACAAAACCGGATAGGGCTGGGACACTCGGGAATAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103115	CGTAGAAACATTAAACAAAACCGGATAGGGCTGGGACACTCGGGAATAAC	103164

CU463328.8	851	ACATGGAAACATCTGCCAGGAGTAAGTGAGGGTGGCTTGGATAAAAACTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103165	ACATGGAAACATCTGCCAGGAGTAAGTGAGGGTGGCTTGGATAAAAACTA	103214

CU463328.8	901	TCAGAAGCAGTGTGAGATGGCAAGAATCATGTACCTTATTAGCAAAGTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103215	TCAGAAGCAGTGTGAGATGGCAAGAATCATGTACCTTATTAGCAAAGTAG	103264

CU463328.8	951	AAAAGGAAACAGTAGAAAGCAGAAGGGAAAAGTCCAGAATTCATAAAGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103265	AAAAGGAAACAGTAGAAAGCAGAAGGGAAAAGTCCAGAATTCATAAAGGG	103314

CU463328.8	1001	GGAACTGTGGGCCTAGCGAGCACACACACTGAATAGAAGTGATCAGAGCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103315	GGAACTGTGGGCCTAGCGAGCACACACACTGAATAGAAGTGATCAGAGCT	103364

CU463328.8	1051	ATGGTAAAGACAGAAGGATCCTTAAAAAAAAAATCCATTGTGCTCCCAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103365	ATGGTAAAGACAGAAGGATCCTTAAAAAAAAAATCCATTGTGCTCCCAGT	103414

CU463328.8	1101	AACAGATATTTTAATTCTGGAGAGAGGGAGCAAGATAGACAAGAATGTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103415	AACAGATATTTTAATTCTGGAGAGAGGGAGCAAGATAGACAAGAATGTTA	103464

CU463328.8	1151	CAAGCAGACATAGCAGGAGAGATAGTGGAAAACACTCTCTGCTCAGTTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103465	CAAGCAGACATAGCAGGAGAGATAGTGGAAAACACTCTCTGCTCAGTTCT	103514

CU463328.8	1201	CAACCAGAGCAGTTTAGTTTTTTTTTCAAAGACCTCTACTGAGCTGGTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103515	CAACCAGAGCAGTTTAGTTTTTTTTTCAAAGACCTCTACTGAGCTGGTGG	103564

CU463328.8	1251	TTTGTTAGCCCCAGCCCCTCCAGTAACCACTCTCTCAGGACAGTCAGAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103565	TTTGTTAGCCCCAGCCCCTCCAGTAACCACTCTCTCAGGACAGTCAGAGC	103614

CU463328.8	1301	ATTGGAATATATGCTGACACCTGGCCAGATGGAAAACACAGGAAGGAAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103615	ATTGGAATATATGCTGACACCTGGCCAGATGGAAAACACAGGAAGGAAGA	103664

CU463328.8	1351	GGCTTTAAATCAGACAGTGCAGATTTCAGTGTGGTAGACAACTTGTCAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103665	GGCTTTAAATCAGACAGTGCAGATTTCAGTGTGGTAGACAACTTGTCAGA	103714

CU463328.8	1401	CCCAGAGTCTGCACAGACCATTGACACGGGTTCCATCCAGTTTAAGTGTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103715	CCCAGAGTCTGCACAGACCATTGACACGGGTTCCATCCAGTTTAAGTGTG	103764

CU463328.8	1451	TGCTCACAAGATGACAGGAAGATCCTTATAGAGGTCCGGTCATGTTTCAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103765	TGCTCACAAGATGACAGGAAGATCCTTATAGAGGTCCGGTCATGTTTCAA	103814

CU463328.8	1501	AATGAGACTGTAGAAGACATGTCCAGAGTGTCAGTAGCATATGAGAACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103815	AATGAGACTGTAGAAGACATGTCCAGAGTGTCAGTAGCATATGAGAACTG	103864

CU463328.8	1551	ACTCATGGGGGGTGCCTAGAGGTGGAACCTCTACCTTCTGTGGTGTCAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103865	ACTCATGGGGGGTGCCTAGAGGTGGAACCTCTACCTTCTGTGGTGTCAAA	103914

CU463328.8	1601	CTGTGAAGGATTGCCCAGGGGCACAGTATACTCCCAAAGGCATCAAGGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103915	CTGTGAAGGATTGCCCAGGGGCACAGTATACTCCCAAAGGCATCAAGGCT	103964

CU463328.8	1651	GCAAGCAGCAAGAAGGTGAGATTTCATTTTGTCTTTATGTCCTACAGGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	103965	GCAAGCAGCAAGAAGGTGAGATTTCATTTTGTCTTTATGTCCTACAGGAC	104014

CU463328.8	1701	TGCCTGTCGCCCCAGCTCATCTAACCCTCCTCAATTTATGATACATTTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	104015	TGCCTGTCGCCCCAGCTCATCTAACCCTCCTCAATTTATGATACATTTGG	104064

CU463328.8	1751	TTCTACAAGGCTGCTGTCTTGTCACAGCAGGCAATGCATTCAGCCCAGGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	104065	TTCTACAAGGCTGCTGTCTTGTCACAGCAGGCAATGCATTCAGCCCAGGG	104114

CU463328.8	1801	TAAGCCAGTTCTACAAGGACATCACACTTCATTTTTTTGTACCAGGTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	104115	TAAGCCAGTTCTACAAGGACATCACACTTCATTTTTTTGTACCAGGTTTT	104164

CU463328.8	1851	ACTCATGTTTTGTACATGAATCAACCACCTACCATGGTAAGAGATATCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	104165	ACTCATGTTTTGTACATGAATCAACCACCTACCATGGTAAGAGATATCAA	104214

CU463328.8	1901	AACACTAGACAAATGCATATCTTCAGTAAGGAAGTGTGACTTTGTAGTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	104215	AACACTAGACAAATGCATATCTTCAGTAAGGAAGTGTGACTTTGTAGTTC	104264

CU463328.8	1951	AGTGAAAAGAAAAGTTTAGTTAGTGATGGAGATTTCTAAGCCAGCCTCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU466552.10	104265	AGTGAAAAGAAAAGTTTAGTTAGTGATGGAGATTTCTAAGCCAGCCTCTT	104314

Overview

Query
CU463328.8 - 139280 bps
Hit
CU466552.10 - 104314 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link