<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463307.7	1	ACAGGGGAGCTACCTGCCATAAAACCCCAGTGGGCTGCGACTCTGTTTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153449	ACAGGGGAGCTACCTGCCATAAAACCCCAGTGGGCTGCGACTCTGTTTGC	153498

CU463307.7	51	AGTACGCACAAGATAAACTGTTTGGACTCATCTCAGCGTTTCAAGGCAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153499	AGTACGCACAAGATAAACTGTTTGGACTCATCTCAGCGTTTCAAGGCAGC	153548

CU463307.7	101	ACTCTGAATACTCTGTTCTACTAACAACAAAGCCTTCCTGGCAGCATCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153549	ACTCTGAATACTCTGTTCTACTAACAACAAAGCCTTCCTGGCAGCATCAG	153598

CU463307.7	151	TAAGATATCTGGGAGAATTTAAATCTGTATTGCCTGGTAAGATATCATAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153599	TAAGATATCTGGGAGAATTTAAATCTGTATTGCCTGGTAAGATATCATAT	153648

CU463307.7	201	AATGACTGTAATTGTTTATTGGTCAAAGAGAGATAGGGTCGGACCCATTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153649	AATGACTGTAATTGTTTATTGGTCAAAGAGAGATAGGGTCGGACCCATTG	153698

CU463307.7	251	AATATCTCCCAATAATTTTTGAAAACCATTCAGGATGCATAATCCATCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153699	AATATCTCCCAATAATTTTTGAAAACCATTCAGGATGCATAATCCATCTG	153748

CU463307.7	301	TGCGAAACTGAATCTTTTGAGGGGACACATATTTTGCCATAATTTTTGTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153749	TGCGAAACTGAATCTTTTGAGGGGACACATATTTTGCCATAATTTTTGTT	153798

CU463307.7	351	CCTAAATAATTCACTACAACATCCTTTTGCACCTTTTCTGGGGCCACTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153799	CCTAAATAATTCACTACAACATCCTTTTGCACCTTTTCTGGGGCCACTAC	153848

CU463307.7	401	TAAATTCTGTTCCTTCAACTGTGTTACCACAAAGCTATAAGCTTCATCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153849	TAAATTCTGTTCCTTCAACTGTGTTACCACAAAGCTATAAGCTTCATCAA	153898

CU463307.7	451	GCAAGGCATCCCTGGGAGCGGCAAGAAGTGTATCATCCGTATAGTGATAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153899	GCAAGGCATCCCTGGGAGCGGCAAGAAGTGTATCATCCGTATAGTGATAA	153948

CU463307.7	501	CACTTCACGTTTGGAAATCGCTCTCGAACTCCTTCAAGCTGCATCAACAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153949	CACTTCACGTTTGGAAATCGCTCTCGAACTCCTTCAAGCTGCATCAACAT	153998

CU463307.7	551	AGAGTTGACACATAGTGGGACTGTTAGGCCATCCCTTGTGGCAGAACTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	153999	AGAGTTGACACATAGTGGGACTGTTAGGCCATCCCTTGTGGCAGAACTGT	154048

CU463307.7	601	CCACTCAAACCTTTTATCAGGTTCAGCATGATTTTGGGAGGGGACAGTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154049	CCACTCAAACCTTTTATCAGGTTCAGCATGATTTTGGGAGGGGACAGTAA	154098

CU463307.7	651	AGGCAAATCTTACCATATCATTTGGATGCAACGGGATAGAGAAAAAACAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154099	AGGCAAATCTTACCATATCATTTGGATGCAACGGGATAGAGAAAAAACAA	154148

CU463307.7	701	TCTTTAATATCTAAAACTATAATGGGCCAATTTTGGGACAAGGCAGAAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154149	TCTTTAATATCTAAAACTATAATGGGCCAATTTTGGGACAAGGCAGAAGG	154198

CU463307.7	751	CAATGGCAGTCCCCTCTGTACCAGCCCCATCAAGATCATTTGCTTTTTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154199	CAATGGCAGTCCCCTCTGTACCAGCCCCATCAAGATCATTTGCTTTTTTA	154248

CU463307.7	801	TTTCTCTCAAATCATGCAAAAGCCTCCATTTTCCTGATTTTTTTCTTTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154249	TTTCTCTCAAATCATGCAAAAGCCTCCATTTTCCTGATTTTTTTCTTTAT	154298

CU463307.7	851	AACAAATATTGGAGTATTCCAGGGAGATTTAGAAGGTCGAATATGTCCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154299	AACAAATATTGGAGTATTCCAGGGAGATTTAGAAGGTCGAATATGTCCCA	154348

CU463307.7	901	ACTCCAATTGTTCTTGTACCAGCTCTTTCACGGCTTTTAATTTTTCTGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154349	ACTCCAATTGTTCTTGTACCAGCTCTTTCACGGCTTTTAATTTTTCTGAG	154398

CU463307.7	951	GGGAGTGGCCACTGAGGAACCCATACTGGATCCTCAGTCTTCCATGTAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154399	GGGAGTGGCCACTGAGGAACCCATACTGGATCCTCAGTCTTCCATGTAAT	154448

CU463307.7	1001	AGGTAATGCTCCCTCAGTGGCCCCTAGGAAAAACCTGTTGGGAGCCGCGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154449	AGGTAATGCTCCCTCAGTGGCCCCTAGGAAAAACCTGTTGGGAGCCGCGC	154498

CU463307.7	1051	CCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTGGTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154499	CCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTGGTAA	154548

CU463307.7	1101	ACAAATAATCTGCGCATGTGCCGAGGGTGGTTCTTCACTCCATGTGCTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154549	ACAAATAATCTGCGCATGTGCCGAGGGTGGTTCTTCACTCCATGTGCTCT	154598

CU463307.7	1151	GCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCAGGGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154599	GCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCAGGGAG	154648

CU463307.7	1201	TGACACGTCCTAGGCGAGGGATAACTCTCCTAAAATAGGGACGGGGTTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154649	TGACACGTCCTAGGCGAGGGATAACTCTCCTAAAATAGGGACGGGGTTTC	154698

CU463307.7	1251	GTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154699	GTTTTCTCTCTCTCTTGCTTCTTGCACTCTGGCTCCTGAAGATGTAAGCA	154748

CU463307.7	1301	ATAAAGCTTTGCCGCAGAAGATTCTGGTCTGTGGTGTTCTTCCTGGCCGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154749	ATAAAGCTTTGCCGCAGAAGATTCTGGTCTGTGGTGTTCTTCCTGGCCGG	154798

CU463307.7	1351	GCGTGAGAACGCGTCTAATAACAATTGGTGCCGAATTCCGGGACGAGAAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154799	GCGTGAGAACGCGTCTAATAACAATTGGTGCCGAATTCCGGGACGAGAAA	154848

CU463307.7	1401	AAACTCGGGACTGGCGCAAGGAAGATCCCTCATTCCAGAACCAGAACTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154849	AAACTCGGGACTGGCGCAAGGAAGATCCCTCATTCCAGAACCAGAACTGC	154898

CU463307.7	1451	GGGTCGCGGTAATAAAGGTTCCCGTAAAGCAGACTGTTAAGAAGGATTCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154899	GGGTCGCGGTAATAAAGGTTCCCGTAAAGCAGACTGTTAAGAAGGATTCA	154948

CU463307.7	1501	ACTGTATGAATTCAGAACTTTTCAGCTGGGGAACGAGAGTACCAGTGAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154949	ACTGTATGAATTCAGAACTTTTCAGCTGGGGAACGAGAGTACCAGTGAGT	154998

CU463307.7	1551	ACAGCTTTACGAGGTAAGTCTGATCTTGAACTTTCTAAGGAAATTCAAGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	154999	ACAGCTTTACGAGGTAAGTCTGATCTTGAACTTTCTAAGGAAATTCAAGA	155048

CU463307.7	1601	CAGTCTATCAGAAGTAAAGTGGAATATGTTTGGCCTTGAATTTTTTCTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155049	CAGTCTATCAGAAGTAAAGTGGAATATGTTTGGCCTTGAATTTTTTCTGG	155098

CU463307.7	1651	TGTTAGGAGCCCTTTTGTTCCTTTTCACATGTTATCAAGTGATTAAGATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155099	TGTTAGGAGCCCTTTTGTTCCTTTTCACATGTTATCAAGTGATTAAGATA	155148

CU463307.7	1701	GGGCTGAAAATTCTAGAGGAAATTCAGGACAAGCTATCAGAAGTAAAGTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155149	GGGCTGAAAATTCTAGAGGAAATTCAGGACAAGCTATCAGAAGTAAAGTG	155198

CU463307.7	1751	GGGAGAGAGAGTAGGAACAAAGAGGAAATATGGTACACAAAATAAGTATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155199	GGGAGAGAGAGTAGGAACAAAGAGGAAATATGGTACACAAAATAAGTATA	155248

CU463307.7	1801	CAGGCCTTTCCAAGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTAAGGTTAGGTAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155249	CAGGCCTTTCCAAGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTAAGGTTAGGTAGG	155298

CU463307.7	1851	AATACCTGGAGAGAGATTAGAAGAAAAAGAGGAAAAAGGGAAAAGAAGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155299	AATACCTGGAGAGAGATTAGAAGAAAAAGAGGAAAAAGGGAAAAGAAGAA	155348

CU463307.7	1901	AGATCAATTAGCGGAGGTCTCTAGGAAAAGGAGCCTGTGCTCATCGCTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155349	AGATCAATTAGCGGAGGTCTCTAGGAAAAGGAGCCTGTGCTCATCGCTGG	155398

CU463307.7	1951	ATGGGCTCGGGGAGCCAGCTCTTAGTAGCTCTGAAGCAGATGAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU464136.6	155399	ATGGGCTCGGGGAGCCAGCTCTTAGTAGCTCTGAAGCAGATGAAGAATTC	155448

Overview

Query
CU463307.7 - 92708 bps
Hit
CU464136.6 - 155448 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link