<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU467494.10	1	GATCTGAATCCCGATGGTCGTAATTCACCTACATGACATGGTAGGCGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77199	GATCTGAATCCCGATGGTCGTAATTCACCTACATGACATGGTAGGCGTTC	77248

CU467494.10	51	CCTCATGCTCCTGGAACTCTGGCGCCTGCCTAAGGTACCACCTCCCACAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77249	CCTCATGCTCCTGGAACTCTGGCGCCTGCCTAAGGTACCACCTCCCACAG	77298

CU467494.10	101	CCTCCACAAGAGAAGCATGGTCATTAGTCACATAAGCAAAGGCCCAAGCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77299	CCTCCACAAGAGAAGCATGGTCATTAGTCACATAAGCAAAGGCCCAAGCT	77348

CU467494.10	151	TCTAACCTTCAGGCTAAACTCCTCCCCAGTTACCTAGCAACAGTGAAGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77349	TCTAACCTTCAGGCTAAACTCCTCCCCAGTTACCTAGCAACAGTGAAGAC	77398

CU467494.10	201	CATAAAAAGGGGTGCCCCCACATTGCTCTCTTACTCCTTTGTCCTCTCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77399	CATAAAAAGGGGTGCCCCCACATTGCTCTCTTACTCCTTTGTCCTCTCAC	77448

CU467494.10	251	ATCACATCTCTCTTCTCTCACTTCTCTCCTCTTCCCTTTCTTTGTCTTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77449	ATCACATCTCTCTTCTCTCACTTCTCTCCTCTTCCCTTTCTTTGTCTTTT	77498

CU467494.10	301	CCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTCCCTTCTTCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77499	CCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTCCCTTCTTCCT	77548

CU467494.10	351	ACCCTCTCTCTTTCCCCTGCATTTCTATAATAAAGCTCTAAAACCATAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77549	ACCCTCTCTCTTTCCCCTGCATTTCTATAATAAAGCTCTAAAACCATAGA	77598

CU467494.10	401	GAGTCTCTGCTCTGCTCCTTCAAGTTCCACTGCGCACTCTGGTCAGTGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77599	GAGTCTCTGCTCTGCTCCTTCAAGTTCCACTGCGCACTCTGGTCAGTGTT	77648

CU467494.10	451	GGGAACTTCTTCCCTCTTCCCTCTCTCCCAAAACCCTGGTGGCTTTAGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77649	GGGAACTTCTTCCCTCTTCCCTCTCTCCCAAAACCCTGGTGGCTTTAGCA	77698

CU467494.10	501	AAGTAGCTCCGGGCGGGGGCGGGGGATCCCCAGGCAGGGCTACCCCTTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77699	AAGTAGCTCCGGGCGGGGGCGGGGGATCCCCAGGCAGGGCTACCCCTTGA	77748

CU467494.10	551	CCACCGCTGAAGAGTGGGATAGAGGAATGCCCATCCAGGGATGAGTGGAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77749	CCACCGCTGAAGAGTGGGATAGAGGAATGCCCATCCAGGGATGAGTGGAT	77798

CU467494.10	601	AGGGTAGAATACAACCCTCCCATGCCTGACTGACCAGAGAATAGGGAAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77799	AGGGTAGAATACAACCCTCCCATGCCTGACTGACCAGAGAATAGGGAAAC	77848

CU467494.10	651	TCTGACAGAGTGTGGGCATCTTTTTCCTATCTCATTTCTCCTCGGGCCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77849	TCTGACAGAGTGTGGGCATCTTTTTCCTATCTCATTTCTCCTCGGGCCCC	77898

CU467494.10	701	ATTCCAGGGCCTCTCCATTTTTTGTTACCCACAGGATAGAGCCGTTTATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77899	ATTCCAGGGCCTCTCCATTTTTTGTTACCCACAGGATAGAGCCGTTTATA	77948

CU467494.10	751	GGACTAAAGGGGCGGGGCAATAATGAAGTAATGTTTTTGTACACTGTGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77949	GGACTAAAGGGGCGGGGCAATAATGAAGTAATGTTTTTGTACACTGTGAA	77998

CU467494.10	801	GATGAGTCTCTGTCCTACCTTGCCTACCTAAAGCACCTTCTGAGTGGTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	77999	GATGAGTCTCTGTCCTACCTTGCCTACCTAAAGCACCTTCTGAGTGGTAA	78048

CU467494.10	851	AATAAAAACCCTATGTCCTGTAGCAAAGGAGAGTAGAAGGCAGGATTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78049	AATAAAAACCCTATGTCCTGTAGCAAAGGAGAGTAGAAGGCAGGATTCTG	78098

CU467494.10	901	GGCAGAGAGAGGAACTCTGGGAAGAGAGAAGCATGGGGGATTTGCCACCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78099	GGCAGAGAGAGGAACTCTGGGAAGAGAGAAGCATGGGGGATTTGCCACCC	78148

CU467494.10	951	AGACGTGGAGGAAGCAGGATGTGTGAAACTGAGGAGAGGTGACCAGCCAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78149	AGACGTGGAGGAAGCAGGATGTGTGAAACTGAGGAGAGGTGACCAGCCAC	78198

CU467494.10	1001	GTGGCAGAACTTAGAATAGTATGACTGGGATAACTGAATTATGAGATAGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78199	GTGGCAGAACTTAGAATAGTATGACTGGGATAACTGAATTATGAGATAGC	78248

CU467494.10	1051	TGGGAACAGGCCTAGCATAAAGCCTAAGCATTCATAAATAAATGTAAGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78249	TGGGAACAGGCCTAGCATAAAGCCTAAGCATTCATAAATAAATGTAAGTC	78298

CU467494.10	1101	TGCCATCATTATTCAGAGCAAGGGAGGACAAGCAGGAATCTTCGACAGAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78299	TGCCATCATTATTCAGAGCAAGGGAGGACAAGCAGGAATCTTCGACAGAT	78348

CU467494.10	1151	AACAGGAACAGGAGCAAGCAGACACAGAGCAAGCCTTTCCTTCTTCCAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78349	AACAGGAACAGGAGCAAGCAGACACAGAGCAAGCCTTTCCTTCTTCCAGG	78398

CU467494.10	1201	TCTTCATGTAGGCTTCCAGCAGAAGGCGTGGCCCAGATCAGAAAGTGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78399	TCTTCATGTAGGCTTCCAGCAGAAGGCGTGGCCCAGATCAGAAAGTGGGA	78448

CU467494.10	1251	GGGGCTCCTGCTCAAATATTCTGTACTACAGGTGTGTCTTCCTACCTCAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78449	GGGGCTCCTGCTCAAATATTCTGTACTACAGGTGTGTCTTCCTACCTCAA	78498

CU467494.10	1301	AGAAAAGGATCAGAAATTGATCTTCAAATTAAGCAAAAACGTCTCACAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78499	AGAAAAGGATCAGAAATTGATCTTCAAATTAAGCAAAAACGTCTCACAGG	78548

CU467494.10	1351	TGGTGTCTTCCATTTTGGGGTTTTAGTTAACCCCACACGTAGCTGACATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78549	TGGTGTCTTCCATTTTGGGGTTTTAGTTAACCCCACACGTAGCTGACATC	78598

CU467494.10	1401	AAAGAACCAACACCATGGTTTCTGTCCGAGTTCTGGAACTGCTTTGTTTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78599	AAAGAACCAACACCATGGTTTCTGTCCGAGTTCTGGAACTGCTTTGTTTG	78648

CU467494.10	1451	GGGCTTTGCAGCTCCTTTTAGCACCCATGGCTCTGCCTCCTGCCTCCCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78649	GGGCTTTGCAGCTCCTTTTAGCACCCATGGCTCTGCCTCCTGCCTCCCCT	78698

CU467494.10	1501	CTTACAGGGAGTTTTCTTCCCACGGGTGGAGAAGCACGTGAAGATCTTCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78699	CTTACAGGGAGTTTTCTTCCCACGGGTGGAGAAGCACGTGAAGATCTTCT	78748

CU467494.10	1551	GGATGTAAGTTTGATGAGAGCAGGGCGGTCTGAGACCTGAGAGCCCTGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78749	GGATGTAAGTTTGATGAGAGCAGGGCGGTCTGAGACCTGAGAGCCCTGGA	78798

CU467494.10	1601	GAAGTGCAGACAGGAAGGAGGCCCTGGGGCAGCTCAGCAGCCTGGATCCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78799	GAAGTGCAGACAGGAAGGAGGCCCTGGGGCAGCTCAGCAGCCTGGATCCC	78848

CU467494.10	1651	CTTTACCCTCAGCTCTGTGGGCTCAGACGCTGTCGTTTTTGTTTCTTCCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78849	CTTTACCCTCAGCTCTGTGGGCTCAGACGCTGTCGTTTTTGTTTCTTCCA	78898

CU467494.10	1701	CCAGGCGGCGCCGTTGCCCAAGAATGTGATGCTTCTCTTTCATCTTCAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78899	CCAGGCGGCGCCGTTGCCCAAGAATGTGATGCTTCTCTTTCATCTTCAAC	78948

CU467494.10	1751	AGGTGAGACCCTGGAGGGTCTGCAGTTGGAGGGAAGATGGGAAAGGGCAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78949	AGGTGAGACCCTGGAGGGTCTGCAGTTGGAGGGAAGATGGGAAAGGGCAC	78998

CU467494.10	1801	ACCTTTCTCTGCAGGAATGCTCTGGATATTGGGGTTCATGGTCTGTTACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	78999	ACCTTTCTCTGCAGGAATGCTCTGGATATTGGGGTTCATGGTCTGTTACA	79048

CU467494.10	1851	AATCATCATTCAAACGTCTGAGTACAGTTTATCTTGTTCATAGGGAATTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	79049	AATCATCATTCAAACGTCTGAGTACAGTTTATCTTGTTCATAGGGAATTA	79098

CU467494.10	1901	AAAACTAACATCGGCTTAAGTGCAAAGATGAGCACACACTGTGTCTTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	79099	AAAACTAACATCGGCTTAAGTGCAAAGATGAGCACACACTGTGTCTTTTT	79148

CU467494.10	1951	CCTGAGATGAGGCTATGATCAGTATGTTGTATTTTTAATTCTATGACTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463841.14	79149	CCTGAGATGAGGCTATGATCAGTATGTTGTATTTTTAATTCTATGACTCT	79198

Overview

Query
CU467494.10 - 201775 bps
Hit
CU463841.14 - 79198 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001999200012000177199791981
297.922530274612969157141127401
391.2338154076413031220527401
492.62418541142819681273932801
595.812022234315845181871273950721
688.751554251644670471851273953081
793.0111781520221237311357251161
894.255122634738451019115079113911
996.981544417254182363548915079222791
1088.1130034949485525350016510114671
1190.2612180179093548753395124196421281
1299.193447735489135489131997674831
1390.9987012291515616384132734339641
1493.76118115011667618176134208356811
1594.45514463271811924445135720419961
1691.296674945473810191147108565931
1790.2203130254397847002147108501491
1888.05145024034855250954151612539971
1990.03172825675093453500154091566691
2096.13851497603548745246169400791981
2190.9987012291515616384177936791661
Short-link