<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU468015.2	1	CCTTGGGTCTCTAGGTGAGGCCCTCCTAAAGCAATCTGACTTGGTGGTCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	234961	CCTTGGGTCTCTAGGTGAGGCCCTCCTAAAGCAATCTGACTTGGTGGTCA	235010

CU468015.2	51	GGACACTGACTTTCCCAAGCCACTCCCATGGTCTGCAGTGGCCTGTACAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235011	GGACACTGACTTTCCCAAGCCACTCCCATGGTCTGCAGTGGCCTGTACAC	235060

CU468015.2	101	CTAACCAATGTGCCCTGCCAGTACCAAGTCATGGTCCCTCCGTCCTCAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235061	CTAACCAATGTGCCCTGCCAGTACCAAGTCATGGTCCCTCCGTCCTCAGC	235110

CU468015.2	151	CAGGCTCACCACTCTAAATGCTCCTGGCCAGCCTTCCTGCACATCCCTTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235111	CAGGCTCACCACTCTAAATGCTCCTGGCCAGCCTTCCTGCACATCCCTTG	235160

CU468015.2	201	CACACTGCCTTAGAATATGTCACCTTCACAAGTGTACACACCTTATACCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235161	CACACTGCCTTAGAATATGTCACCTTCACAAGTGTACACACCTTATACCC	235210

CU468015.2	251	CGACCCAAGCATCCACCGCTCCCCCACACTCTCATCATACCGACACCCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235211	CGACCCAAGCATCCACCGCTCCCCCACACTCTCATCATACCGACACCCCT	235260

CU468015.2	301	CACTCAGAAGCCCTCCCCCTCCCTCGTCCCCACTGGAAGGTGAAGTGATG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235261	CACTCAGAAGCCCTCCCCCTCCCTCGTCCCCACTGGAAGGTGAAGTGATG	235310

CU468015.2	351	TGGGTTCTTCCCACCACTGACTTCCTCTCCCTACCTACCCACTTCTCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235311	TGGGTTCTTCCCACCACTGACTTCCTCTCCCTACCTACCCACTTCTCCTC	235360

CU468015.2	401	TTCCTACCTGTTTCCCTGTCCAGGAGGCTGCAGCAGCAACAGCCCCAGCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235361	TTCCTACCTGTTTCCCTGTCCAGGAGGCTGCAGCAGCAACAGCCCCAGCA	235410

CU468015.2	451	GCCGCAGCTTACACTGGTGGGTGGGCCTCTCTGGCTGAGAAGATGCAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235411	GCCGCAGCTTACACTGGTGGGTGGGCCTCTCTGGCTGAGAAGATGCAGAG	235460

CU468015.2	501	GGGCTGGACCACACAGCAGTCTCCCTCCCACTAGCTCCTCAGACCCAGGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235461	GGGCTGGACCACACAGCAGTCTCCCTCCCACTAGCTCCTCAGACCCAGGC	235510

CU468015.2	551	TGGTTGGCTCAGTAGACAGGCCCTGCCTTCCTCACCTTCTTCTCTTCAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235511	TGGTTGGCTCAGTAGACAGGCCCTGCCTTCCTCACCTTCTTCTCTTCAGC	235560

CU468015.2	601	CAAGTGTTGCTCCAGCAGGACCTACACAATTTCGGAGGTCCCTGAATTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235561	CAAGTGTTGCTCCAGCAGGACCTACACAATTTCGGAGGTCCCTGAATTAT	235610

CU468015.2	651	GGACCCCAAATCAGAAGTTCCCGGCTCTAATAGCAACCAGTACCCCACCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235611	GGACCCCAAATCAGAAGTTCCCGGCTCTAATAGCAACCAGTACCCCACCC	235660

CU468015.2	701	CCTTTCAGCCTAAGAGACTGTGGGATAATGTGAGGGCAGGGAGAGAGGGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235661	CCTTTCAGCCTAAGAGACTGTGGGATAATGTGAGGGCAGGGAGAGAGGGC	235710

CU468015.2	751	GGGAGACAAAGCAAGAGCAGGTCATGGCCAAGTAGGCCAGATCGGCTGAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235711	GGGAGACAAAGCAAGAGCAGGTCATGGCCAAGTAGGCCAGATCGGCTGAG	235760

CU468015.2	801	GAAAGAAAGCGGCCGTCACAGAAGGGCAGGGGCAGCCCAAGGCGCCAAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235761	GAAAGAAAGCGGCCGTCACAGAAGGGCAGGGGCAGCCCAAGGCGCCAAGG	235810

CU468015.2	851	GAAAAACTGTCTCCATCTCTTGATGGCATTTGTTGGGGGCTGAGGGGCAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235811	GAAAAACTGTCTCCATCTCTTGATGGCATTTGTTGGGGGCTGAGGGGCAC	235860

CU468015.2	901	CACCCCCAAGCCAGAACAGACAGGGCCCTATTGTCTCAGTCTAAATTCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235861	CACCCCCAAGCCAGAACAGACAGGGCCCTATTGTCTCAGTCTAAATTCCT	235910

CU468015.2	951	CCTCCCAGGCAAAGGGAGATTCACTGTACAGCCCCTCACCCGGTCCTGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235911	CCTCCCAGGCAAAGGGAGATTCACTGTACAGCCCCTCACCCGGTCCTGGC	235960

CU468015.2	1001	CTCCAAAGGTCAAGGGGGATGACACATGCCCACTCTGACCCTCAGCCCCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	235961	CTCCAAAGGTCAAGGGGGATGACACATGCCCACTCTGACCCTCAGCCCCC	236010

CU468015.2	1051	TTGTCTAGTCCGGGGGTGGCATGTCAATTCCACCCATGAGGCCGAGGCAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236011	TTGTCTAGTCCGGGGGTGGCATGTCAATTCCACCCATGAGGCCGAGGCAC	236060

CU468015.2	1101	AAACTGGCAGAGCCTGGGGCTTAGCCCCCTAACCCTAGGCTGGGACAGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236061	AAACTGGCAGAGCCTGGGGCTTAGCCCCCTAACCCTAGGCTGGGACAGGA	236110

CU468015.2	1151	AGAGAATTGTCTTCAGCAGGAAAGAACCCGCAGAGTCAGGAACCCACACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236111	AGAGAATTGTCTTCAGCAGGAAAGAACCCGCAGAGTCAGGAACCCACACA	236160

CU468015.2	1201	GAATGGGCATTGAGAGGAAGGAAACACCAAGGGGGTCCCCACCCCAGACC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236161	GAATGGGCATTGAGAGGAAGGAAACACCAAGGGGGTCCCCACCCCAGACC	236210

CU468015.2	1251	AAGCATCTGGGCATCCAGGCCCCAGGCTCTCTATTCCCACCCTCCTGGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236211	AAGCATCTGGGCATCCAGGCCCCAGGCTCTCTATTCCCACCCTCCTGGGG	236260

CU468015.2	1301	GAGCCCAGATCCCCTTCACCTGGGAATAAGCCAAGCCACGCTGAGGAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236261	GAGCCCAGATCCCCTTCACCTGGGAATAAGCCAAGCCACGCTGAGGAAAT	236310

CU468015.2	1351	GGATCTTTTATTTCTATAAATACAGGGACCACCCGCTCAAGGGTAGTTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236311	GGATCTTTTATTTCTATAAATACAGGGACCACCCGCTCAAGGGTAGTTAA	236360

CU468015.2	1401	AAGAGGGGCTGGGGCCTCAAAGAACCTAGGCTCCCAGGGGATACCCCAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236361	AAGAGGGGCTGGGGCCTCAAAGAACCTAGGCTCCCAGGGGATACCCCAAC	236410

CU468015.2	1451	ACTGATCATAGGGACTGGGGGATCCCCAAACCTGAGATGGGCCTTGCAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236411	ACTGATCATAGGGACTGGGGGATCCCCAAACCTGAGATGGGCCTTGCAGG	236460

CU468015.2	1501	CCACAGATATTCCCCAACACTGACACTTCAAAAGTGGAATTGTCCCCATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236461	CCACAGATATTCCCCAACACTGACACTTCAAAAGTGGAATTGTCCCCATA	236510

CU468015.2	1551	GGGGAGCCTCAGAACACCCCCTCTTTTGGGTGCCCCTCTTGGTGGGGAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236511	GGGGAGCCTCAGAACACCCCCTCTTTTGGGTGCCCCTCTTGGTGGGGAGG	236560

CU468015.2	1601	CTAGCCACAGGGAAGTTGAGAAAAGAGGGAAACGGGGATAACAGAAGCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236561	CTAGCCACAGGGAAGTTGAGAAAAGAGGGAAACGGGGATAACAGAAGCTA	236610

CU468015.2	1651	AAAATGTCCTGAGTGGCCTGGAAGAAGACCCCTGAAGTGGGCAGGGGCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236611	AAAATGTCCTGAGTGGCCTGGAAGAAGACCCCTGAAGTGGGCAGGGGCTG	236660

CU468015.2	1701	GGTTCTCCTCCGATACAGCCAGACCCGGAGAAGCAACAGCAGCGGTGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236661	GGTTCTCCTCCGATACAGCCAGACCCGGAGAAGCAACAGCAGCGGTGAAG	236710

CU468015.2	1751	CCACAGTTAAAAACCTGGCACTTGCTTCCCAACCTCAGCCGTGGCAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236711	CCACAGTTAAAAACCTGGCACTTGCTTCCCAACCTCAGCCGTGGCAGAAA	236760

CU468015.2	1801	GGGAGAGCGTGGAGGCGTCCCCAAGTGAGGACATGAGGTAGGGGACCAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236761	GGGAGAGCGTGGAGGCGTCCCCAAGTGAGGACATGAGGTAGGGGACCAGG	236810

CU468015.2	1851	ACTTGTCATTCACAGAGGAGCAGGGGGGGAGGGGGGAGGGGAGCCCTGGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236811	ACTTGTCATTCACAGAGGAGCAGGGGGGGAGGGGGGAGGGGAGCCCTGGT	236860

CU468015.2	1901	GGGGGTCGGGCAGTGTGGGAATGACAAGATGGTTGCAGGCATGCCAGAGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236861	GGGGGTCGGGCAGTGTGGGAATGACAAGATGGTTGCAGGCATGCCAGAGC	236910

CU468015.2	1951	CTGGCATCTGCTTCCCAAGGCCACCGCTTGATCTCTGGGCTGGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463834.5	236911	CTGGCATCTGCTTCCCAAGGCCACCGCTTGATCTCTGGGCTGGGGAATTC	236960

Overview

Query
CU468015.2 - 48503 bps
Hit
CU463834.5 - 236960 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link