<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2664 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463153.7	1	GAATTCAATTCCCAACAACCACATGAAGGCTCACAACCATCTGTACAGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	141938	GAATTCAATTCCCAACAACCACATGAAGGCTCACAACCATCTGTACAGCT	141987

CU463153.7	51	ACAGTGTACTCATATACATAAAACAAATAAAATAGATCATTTTTTAAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	141988	ACAGTGTACTCATATACATAAAACAAATAAAATAGATCATTTTTTAAAAA	142037

CU463153.7	101	GATAGAAAAATACAAGTACTTTTGAAGCTGACATTCAAAGATATAAAAAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142038	GATAGAAAAATACAAGTACTTTTGAAGCTGACATTCAAAGATATAAAAAC	142087

CU463153.7	151	AGATGAATGAACGAGTTCTAGAAGTAGAAAGGGAAGGGATTGTGGTAGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142088	AGATGAATGAACGAGTTCTAGAAGTAGAAAGGGAAGGGATTGTGGTAGAA	142137

CU463153.7	201	AAGTGGGTGTCGGGTGGAGATGGGGCAGGGATCAAGAGTCTATGAAGCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142138	AAGTGGGTGTCGGGTGGAGATGGGGCAGGGATCAAGAGTCTATGAAGCCT	142187

CU463153.7	251	TGGGAAGGGCTTGGAAGTTGAGCTGGGTTTAAGTGGCCTTGTTGGTTCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142188	TGGGAAGGGCTTGGAAGTTGAGCTGGGTTTAAGTGGCCTTGTTGGTTCTT	142237

CU463153.7	301	GCCTACCATTCCTAGAACCCAGGTTTGAGCCCCAGAACTTCATACAAACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142238	GCCTACCATTCCTAGAACCCAGGTTTGAGCCCCAGAACTTCATACAAACT	142287

CU463153.7	351	GCACTAGTGTGGTGGTGTGCACATGTAATCCCAGTGTTCAAGAAGTTGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142288	GCACTAGTGTGGTGGTGTGCACATGTAATCCCAGTGTTCAAGAAGTTGAC	142337

CU463153.7	401	GCAGGAGGGTCAGAAGTCCGAGGCTATCATCAGCTACATAGTGAGTTTGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142338	GCAGGAGGGTCAGAAGTCCGAGGCTATCATCAGCTACATAGTGAGTTTGA	142387

CU463153.7	451	GGCCAGTCTGGGCTATACTGAAAAAAATAAAAGAAAGTGGGGGACAGTTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142388	GGCCAGTCTGGGCTATACTGAAAAAAATAAAAGAAAGTGGGGGACAGTTG	142437

CU463153.7	501	GAGGTTGATTTGAAATTTGAATATTTCAAGTGTGGGACTGATGAGTGTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142438	GAGGTTGATTTGAAATTTGAATATTTCAAGTGTGGGACTGATGAGTGTGG	142487

CU463153.7	551	TCAGTTACCCCATGCTATGAACACAATCTCTCACACTTTTTTTTTCTCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142488	TCAGTTACCCCATGCTATGAACACAATCTCTCACACTTTTTTTTTCTCTT	142537

CU463153.7	601	CAAAACCAATCAAAGGGGCTGGGCAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGAGCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142538	CAAAACCAATCAAAGGGGCTGGGCAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGAGCTC	142587

CU463153.7	651	GCTCTTGCAGAGGACCCTGGGGTTCCATTCCCTGCACTCACATGGCAGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142588	GCTCTTGCAGAGGACCCTGGGGTTCCATTCCCTGCACTCACATGGCAGAT	142637

CU463153.7	701	CACAACTGTCTGTAACTCAAGTTCCAGGAGATCTGAGTATCAGACATGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142638	CACAACTGTCTGTAACTCAAGTTCCAGGAGATCTGAGTATCAGACATGCA	142687

CU463153.7	751	TGTGGTGTACATACATGCATGCATACGTGCAAACATGCATGCAGGCAGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142688	TGTGGTGTACATACATGCATGCATACGTGCAAACATGCATGCAGGCAGGC	142737

CU463153.7	801	AAACCACTCACACACATCAGCCAGAGTCAGCAAACCTGCTCAGCTTGCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142738	AAACCACTCACACACATCAGCCAGAGTCAGCAAACCTGCTCAGCTTGCTC	142787

CU463153.7	851	ATGTGTCAGCTCCTTTCTGAATGGCAAGCTTCCCTCTGCTTTGTGACTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142788	ATGTGTCAGCTCCTTTCTGAATGGCAAGCTTCCCTCTGCTTTGTGACTGA	142837

CU463153.7	901	TCTAGTCTGTACATCATAGGATAGCTATGAGGGCTAAGTGACTGTAAATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142838	TCTAGTCTGTACATCATAGGATAGCTATGAGGGCTAAGTGACTGTAAATC	142887

CU463153.7	951	CAAAAGCCCCCAGCTCAGAGCTTGGTATTTGTTCAATGTCCTTAGTCATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142888	CAAAAGCCCCCAGCTCAGAGCTTGGTATTTGTTCAATGTCCTTAGTCATC	142937

CU463153.7	1001	AGGGAAATGAAAATGAAAACGACCCTGAGATTTCACCTTACACCCATCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142938	AGGGAAATGAAAATGAAAACGACCCTGAGATTTCACCTTACACCCATCAG	142987

CU463153.7	1051	AATGGCTAAGATAAAAAAACTCAAGAGACAACTCATGCTGGTGAGGATGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	142988	AATGGCTAAGATAAAAAAACTCAAGAGACAACTCATGCTGGTGAGGATGT	143037

CU463153.7	1101	GGAGAAAGGGGAACACTCCTCATTGCTGGTGGGAGTGCAGACTTGTACAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143038	GGAGAAAGGGGAACACTCCTCATTGCTGGTGGGAGTGCAGACTTGTACAA	143087

CU463153.7	1151	CCACTCCGGAAATCAATTTGGCAGTTTCTCAGAAAATTGGAAATAGCTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143088	CCACTCCGGAAATCAATTTGGCAGTTTCTCAGAAAATTGGAAATAGCTCA	143137

CU463153.7	1201	CTACCTGAAGACCCTGCTGAAGTGGTAACTCTTGGGAATATACTCAAAAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143138	CTACCTGAAGACCCTGCTGAAGTGGTAACTCTTGGGAATATACTCAAAAG	143187

CU463153.7	1251	ATGTTCTACCATACCACAAGGACACATGTTCCACTATGTTCATAGCTGTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143188	ATGTTCTACCATACCACAAGGACACATGTTCCACTATGTTCATAGCTGTT	143237

CU463153.7	1301	TTATTCATAATAGCCAGAAACTGGAAACAACCCAGATGTCCCTCAACCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143238	TTATTCATAATAGCCAGAAACTGGAAACAACCCAGATGTCCCTCAACCAA	143287

CU463153.7	1351	AGAATGGATACAGAAAATGTGCTGTTTGTACAATGGAATACTACTCAGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143288	AGAATGGATACAGAAAATGTGCTGTTTGTACAATGGAATACTACTCAGCT	143337

CU463153.7	1401	GTTAAAAACAAGGACATGAATTTTGCAGGCAAATGGATGGAACTAGAAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143338	GTTAAAAACAAGGACATGAATTTTGCAGGCAAATGGATGGAACTAGAAAA	143387

CU463153.7	1451	TATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAGACCTAAAAGAACTTGCATGGTGTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143388	TATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAGACCTAAAAGAACTTGCATGGTGTGC	143437

CU463153.7	1501	ACTCACTGATAAGTGGATACTACTCATGAAGTACAGGATACTCATGCTAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143438	ACTCACTGATAAGTGGATACTACTCATGAAGTACAGGATACTCATGCTAC	143487

CU463153.7	1551	ACTCCATAGACCCAAAGGAGCTAAACAAGAAGGAAGGTCCAAGCGAAGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143488	ACTCCATAGACCCAAAGGAGCTAAACAAGAAGGAAGGTCCAAGCGAAGAT	143537

CU463153.7	1601	GCTTGAATCTCAGTAGGAAGGGAGTATGAAATAGTCATAGGAGGCAGATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143538	GCTTGAATCTCAGTAGGAAGGGAGTATGAAATAGTCATAGGAGGCAGATG	143587

CU463153.7	1651	GAGGCAGGGAACTGGGTAGGGGGAGGAAATGGGAAGGGGAATGGGGGTTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143588	GAGGCAGGGAACTGGGTAGGGGGAGGAAATGGGAAGGGGAATGGGGGTTC	143637

CU463153.7	1701	TGGATCAGGTGTGGAGAGAGACAAGAGAGGGCTAGTGGGCCAGGAGAATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143638	TGGATCAGGTGTGGAGAGAGACAAGAGAGGGCTAGTGGGCCAGGAGAATG	143687

CU463153.7	1751	AATGGAAATCGGTGACTGGTGGGGGTGAGGAGGGGGTTGTGGTGTCTCTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143688	AATGGAAATCGGTGACTGGTGGGGGTGAGGAGGGGGTTGTGGTGTCTCTA	143737

CU463153.7	1801	GAACAAGGTGCTTTTAACAACTTCATTGTTAGGGGTCTGCAAACCTCATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143738	GAACAAGGTGCTTTTAACAACTTCATTGTTAGGGGTCTGCAAACCTCATT	143787

CU463153.7	1851	AATATTAATTTCTGGAGAGTTCATAAGTTTCTTCTCGGTCACTGTATTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143788	AATATTAATTTCTGGAGAGTTCATAAGTTTCTTCTCGGTCACTGTATTAT	143837

CU463153.7	1901	CTGAGTGTATCCCCCGACTTTGAAGGTTGTTTCTGTGTTCCACCTCAGTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143838	CTGAGTGTATCCCCCGACTTTGAAGGTTGTTTCTGTGTTCCACCTCAGTG	143887

CU463153.7	1951	TCAGCCTTATAATGTCTTTAAATCTCCTTCTTATGATGGCCCTCCTGTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143888	TCAGCCTTATAATGTCTTTAAATCTCCTTCTTATGATGGCCCTCCTGTCT	143937

CU463153.7	2001	CCCACACATTAGAAACTGTGGGGATAGTCAGATGGTGGTGGAGCACACCT	2050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143938	CCCACACATTAGAAACTGTGGGGATAGTCAGATGGTGGTGGAGCACACCT	143987

CU463153.7	2051	TTAAATCCAGCCCTCGAGAGGCAGAGGCGGGCAGATCTCTATGAGCCTGG	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	143988	TTAAATCCAGCCCTCGAGAGGCAGAGGCGGGCAGATCTCTATGAGCCTGG	144037

CU463153.7	2101	TCTACAAAGCAAGTCCGGGATAGCCAGGTCTGGTTTCACTGAGAAACCCT	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144038	TCTACAAAGCAAGTCCGGGATAGCCAGGTCTGGTTTCACTGAGAAACCCT	144087

CU463153.7	2151	GTCTTGAAAAAAAAATTTTTTTTTAGACTTTTTATTTTATGTGGATGAGT	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144088	GTCTTGAAAAAAAAATTTTTTTTTAGACTTTTTATTTTATGTGGATGAGT	144137

CU463153.7	2201	GCTTTGCCTGTGTGTATGTATGTATGTGCATCATGTGTGTGCCTACAGGT	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144138	GCTTTGCCTGTGTGTATGTATGTATGTGCATCATGTGTGTGCCTACAGGT	144187

CU463153.7	2251	GGTTGTAAGCCACCATGTGGGTGCTGGGAACTGAACACGGGCCTTCTGTA	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144188	GGTTGTAAGCCACCATGTGGGTGCTGGGAACTGAACACGGGCCTTCTGTA	144237

CU463153.7	2301	AGAACAGCAAGTGCTCTTGACTGCTGAACCATTCTCTCCAGCCCTGCCCC	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144238	AGAACAGCAAGTGCTCTTGACTGCTGAACCATTCTCTCCAGCCCTGCCCC	144287

CU463153.7	2351	GTTTATGTGTTGGTTTGCTTATTTATTAAAATATTTATCTTTTTATAAGG	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144288	GTTTATGTGTTGGTTTGCTTATTTATTAAAATATTTATCTTTTTATAAGG	144337

CU463153.7	2401	TGTGCTTATTTTATGTATATGAGTGTTTTGTCTGAAGTGTACCACATATG	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144338	TGTGCTTATTTTATGTATATGAGTGTTTTGTCTGAAGTGTACCACATATG	144387

CU463153.7	2451	GGTCTGGTGCCCCTGGAGGCCAGAAGAGGACATTGGGTTCCCTGAAAGTG	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144388	GGTCTGGTGCCCCTGGAGGCCAGAAGAGGACATTGGGTTCCCTGAAAGTG	144437

CU463153.7	2501	AAGTTACAGTTGGTTGTGCTCCACTGGGTGGGCACTGGGAATGCAACTCT	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144438	AAGTTACAGTTGGTTGTGCTCCACTGGGTGGGCACTGGGAATGCAACTCT	144487

CU463153.7	2551	GGTCCTCTTCCTCTTCTCGAGCAGTGAGTGCTCTTAACCACTGAACCATC	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144488	GGTCCTCTTCCTCTTCTCGAGCAGTGAGTGCTCTTAACCACTGAACCATC	144537

CU463153.7	2601	TCTCCAGCCCCTTTATTTTTCTTTTAAAGAGTCTCACTATGTAGTTAGGA	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463831.7	144538	TCTCCAGCCCCTTTATTTTTCTTTTAAAGAGTCTCACTATGTAGTTAGGA	144587

CU463153.7	2651	GTGTCCTGGAATTC	2664
			||||||||||||||
CU463831.7	144588	GTGTCCTGGAATTC	144601

Overview

Query
CU463153.7 - 164479 bps
Hit
CU463831.7 - 144601 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2664 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link