<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463329.5	1	GTTCTTGCACACCTTTACTCCTGGATAGGATTTTTATATACAGTTTTGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147172	GTTCTTGCACACCTTTACTCCTGGATAGGATTTTTATATACAGTTTTGAG	147221

CU463329.5	51	GTGGGTCAGGGATTGACAACAGGTACTTCTCATTGGCTTGGTCTGAGAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147222	GTGGGTCAGGGATTGACAACAGGTACTTCTCATTGGCTTGGTCTGAGAGC	147271

CU463329.5	101	TTAGGGAAAACCTTATTTGCATATGGGGGAGATTGGTGCTGCTCCTATTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147272	TTAGGGAAAACCTTATTTGCATATGGGGGAGATTGGTGCTGCTCCTATTT	147321

CU463329.5	151	GACTAATGGCCACACACCTATCTTTAGGGGGTAGGCTGTGGGAGGCTTTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147322	GACTAATGGCCACACACCTATCTTTAGGGGGTAGGCTGTGGGAGGCTTTA	147371

CU463329.5	201	GCTGTGACAGAAGCCAGGGGTCCAGGAGGCATGGCCAAACTCATACAGTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147372	GCTGTGACAGAAGCCAGGGGTCCAGGAGGCATGGCCAAACTCATACAGTC	147421

CU463329.5	251	TAATGAAGACTGAAGTTACCACTCACTAGGTCTCTGGCATTCAAGGTTTA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147422	TAATGAAGACTGAAGTTACCACTCACTAGGTCTCTGGCATTCAAGGTTTA	147471

CU463329.5	301	TGCTCTACTGGGAACCAGGCTGTATGTGCACAGTTCACCGTCCCACACAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147472	TGCTCTACTGGGAACCAGGCTGTATGTGCACAGTTCACCGTCCCACACAT	147521

CU463329.5	351	GTGCACCAAGCCTTGGCTTCCTGCCATCAGAAATCACAGAAACTTTAAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147522	GTGCACCAAGCCTTGGCTTCCTGCCATCAGAAATCACAGAAACTTTAAGG	147571

CU463329.5	401	ATCAAGAGATAAAGTAATTGATATCGAGACATTCCCCCACCTGGGGATCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147572	ATCAAGAGATAAAGTAATTGATATCGAGACATTCCCCCACCTGGGGATCC	147621

CU463329.5	451	TTCCCATATGAAACCACCAATGCAGACACTATTGTGGAAGCCAACAAGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147622	TTCCCATATGAAACCACCAATGCAGACACTATTGTGGAAGCCAACAAGTG	147671

CU463329.5	501	CTTGCTGACAGGAGCCTGATATAGCTGTCTCCTGAGAGACTCTGCCAGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147672	CTTGCTGACAGGAGCCTGATATAGCTGTCTCCTGAGAGACTCTGCCAGTG	147721

CU463329.5	551	CCTGACATGTACAGAAGTGGATGCTCACAGCCATCCATTGGATGGAGCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147722	CCTGACATGTACAGAAGTGGATGCTCACAGCCATCCATTGGATGGAGCAC	147771

CU463329.5	601	AGGGTCCCAAATGAAGAAGCAAGAGAAACTACCCAAGGGGCTGAAGGCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147772	AGGGTCCCAAATGAAGAAGCAAGAGAAACTACCCAAGGGGCTGAAGGCAA	147821

CU463329.5	651	ATATGGTCCCTGGTTTTCTGGCAGCAGTGCCTAGGGACAGCTTGCTTGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147822	ATATGGTCCCTGGTTTTCTGGCAGCAGTGCCTAGGGACAGCTTGCTTGCC	147871

CU463329.5	701	CTGATGCCAATACCTGTCTTGTTGACATTCATCTGAATCCTAGACCAGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147872	CTGATGCCAATACCTGTCTTGTTGACATTCATCTGAATCCTAGACCAGAT	147921

CU463329.5	751	ACTGCTCTGGCTGACAGAATCAATGAAGTAAAGAAAGGTAAAGGAAAAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147922	ACTGCTCTGGCTGACAGAATCAATGAAGTAAAGAAAGGTAAAGGAAAAGA	147971

CU463329.5	801	AAGACAAGACCAATATCTCTCACTGAAGTGTCAACACTGGTTCCTCACCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	147972	AAGACAAGACCAATATCTCTCACTGAAGTGTCAACACTGGTTCCTCACCT	148021

CU463329.5	851	GGGGTTTCACTTCTGCATCTTAATATCATGGACATTAAGTGGTATGTTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148022	GGGGTTTCACTTCTGCATCTTAATATCATGGACATTAAGTGGTATGTTGA	148071

CU463329.5	901	AGACACCTGTGTGAGCCTGTGTACTCGAGGCTTACTGGGTAGACCTCTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148072	AGACACCTGTGTGAGCCTGTGTACTCGAGGCTTACTGGGTAGACCTCTGG	148121

CU463329.5	951	CCTGGCCTGGTGTGAGAATTCCTGCTAAGGCAAACCATTTCCTCTGCTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148122	CCTGGCCTGGTGTGAGAATTCCTGCTAAGGCAAACCATTTCCTCTGCTTC	148171

CU463329.5	1001	AGATGCTGCAGTTGTTTCTACCTCTGTCTCTGCATTGCCACTCTGCCCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148172	AGATGCTGCAGTTGTTTCTACCTCTGTCTCTGCATTGCCACTCTGCCCTG	148221

CU463329.5	1051	CCCTGCAATGAGTCTGGTCAGGGAGAGCAAATGAGAGGTCTCCTAATGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148222	CCCTGCAATGAGTCTGGTCAGGGAGAGCAAATGAGAGGTCTCCTAATGAT	148271

CU463329.5	1101	TAAAGAGTGCTGCTGAGCTTCAGGCAGTGTTTCAGAAGAGCAGACCTCTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148272	TAAAGAGTGCTGCTGAGCTTCAGGCAGTGTTTCAGAAGAGCAGACCTCTT	148321

CU463329.5	1151	CCCAAGTGTTACAGCTCTTAGAACAGAAGCTCTTAGATGATGGAGTAGTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148322	CCCAAGTGTTACAGCTCTTAGAACAGAAGCTCTTAGATGATGGAGTAGTT	148371

CU463329.5	1201	CTAGCACACCTTAAAAACTTCTGGATAAGATTTTTATATACAGTTTTGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148372	CTAGCACACCTTAAAAACTTCTGGATAAGATTTTTATATACAGTTTTGAG	148421

CU463329.5	1251	GTGGGTCAGGGATTGACAACAGGTACTTCTCATTGGCTTGGACTGAGAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148422	GTGGGTCAGGGATTGACAACAGGTACTTCTCATTGGCTTGGACTGAGAGC	148471

CU463329.5	1301	TTTGGGGAAACCTTATTTGCATGTGGGAGGGCTTGGTGCTGCTTCTATGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148472	TTTGGGGAAACCTTATTTGCATGTGGGAGGGCTTGGTGCTGCTTCTATGT	148521

CU463329.5	1351	AACTAATGGTCACACACCTCTCTACAGGGTGTTGTGGGACTGTGGGAGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148522	AACTAATGGTCACACACCTCTCTACAGGGTGTTGTGGGACTGTGGGAGGC	148571

CU463329.5	1401	TGTAGCTGTGACAGGAGATAGAGACACAGGAGCTGTGGTCAAACTCCTTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148572	TGTAGCTGTGACAGGAGATAGAGACACAGGAGCTGTGGTCAAACTCCTTC	148621

CU463329.5	1451	TATCCCAAGAAGACAAAATCACCACCCACCAGGTCTCTAGGGTTCAATGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148622	TATCCCAAGAAGACAAAATCACCACCCACCAGGTCTCTAGGGTTCAATGC	148671

CU463329.5	1501	CTGTGTTCAACTGCAGACTAGGCTGGCAGTACACAGTCCACCAGCCCACA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148672	CTGTGTTCAACTGCAGACTAGGCTGGCAGTACACAGTCCACCAGCCCACA	148721

CU463329.5	1551	CCACGGCACCAAGCCTTGGTTTCCTGCCATCAGAAATCCCAGAAATTTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148722	CCACGGCACCAAGCCTTGGTTTCCTGCCATCAGAAATCCCAGAAATTTGA	148771

CU463329.5	1601	AGGATCAAGAAATGTAGGCTGGAGTTAGTTACTCTGGCAGTAGCCTTGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148772	AGGATCAAGAAATGTAGGCTGGAGTTAGTTACTCTGGCAGTAGCCTTGAC	148821

CU463329.5	1651	CACTATGTCCCTAAAAGGCCAAGAAAGAAGTGCCAGAATCTGAGAAAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148822	CACTATGTCCCTAAAAGGCCAAGAAAGAAGTGCCAGAATCTGAGAAAAAT	148871

CU463329.5	1701	AATGTACTACTGACAGATCTCAAAAATCTCTACAATGTTTTCCTATGACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148872	AATGTACTACTGACAGATCTCAAAAATCTCTACAATGTTTTCCTATGACA	148921

CU463329.5	1751	CTGGGCTAAACTCCCACGTACTCTCAAGAACAAGACATGCAGCACAAGTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148922	CTGGGCTAAACTCCCACGTACTCTCAAGAACAAGACATGCAGCACAAGTC	148971

CU463329.5	1801	TCTGCACATTCACAGGACCTTCTAAAAATATCAACCACCCATGTTATGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	148972	TCTGCACATTCACAGGACCTTCTAAAAATATCAACCACCCATGTTATGGC	149021

CU463329.5	1851	TACCATTTAATATCTCTGAAATTTTGGACCCAGGTATACTTTCTTTTATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	149022	TACCATTTAATATCTCTGAAATTTTGGACCCAGGTATACTTTCTTTTATC	149071

CU463329.5	1901	TTTTTCTTGGGTCCTATGCAGAATCAGCACCCATATCACTGCAAATTTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	149072	TTTTTCTTGGGTCCTATGCAGAATCAGCACCCATATCACTGCAAATTTCA	149121

CU463329.5	1951	CATCAAGTTTTGTAAGCAAAGGAAGATTTTAAATTTAGGGTGAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463830.6	149122	CATCAAGTTTTGTAAGCAAAGGAAGATTTTAAATTTAGGGTGAGGAATTC	149171

Overview

Query
CU463329.5 - 49303 bps
Hit
CU463830.6 - 149171 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link