<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463346.12	1	TTGAAGAGAGCTGTGTGAGGTGTTTCAGACATTGGCAAGAGTAGTGGGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137350	TTGAAGAGAGCTGTGTGAGGTGTTTCAGACATTGGCAAGAGTAGTGGGAA	137399

CU463346.12	51	AATGTACTCCTCATATTTGTTGTTTTTAAAGCATTTTTATTAAATTATTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137400	AATGTACTCCTCATATTTGTTGTTTTTAAAGCATTTTTATTAAATTATTT	137449

CU463346.12	101	TATTTAGTTACATTCCAAAGGTTGCCCCATTTCTCAGTCCCCCTCCAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137450	TATTTAGTTACATTCCAAAGGTTGCCCCATTTCTCAGTCCCCCTCCAAGA	137499

CU463346.12	151	GTTCTTCACTCCATCCCTGTTACCACTGTCCAGCCTAGCAAGGCTGGCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137500	GTTCTTCACTCCATCCCTGTTACCACTGTCCAGCCTAGCAAGGCTGGCTG	137549

CU463346.12	201	TGGCTTGAGTGGAGCCACCTGCTGTGCTGCTCTTTTGATGTGCCACTATC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137550	TGGCTTGAGTGGAGCCACCTGCTGTGCTGCTCTTTTGATGTGCCACTATC	137599

CU463346.12	251	TGCCTGAGGCCTAACCTGCCAGAGGCCTAACCGGTTCTCTTCCAAGAATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137600	TGCCTGAGGCCTAACCTGCCAGAGGCCTAACCGGTTCTCTTCCAAGAATC	137649

CU463346.12	301	TTCCGGAGTTAACACCTAACTGCGATCTTCTGTAAGTTCCCACTAAAAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137650	TTCCGGAGTTAACACCTAACTGCGATCTTCTGTAAGTTCCCACTAAAAGG	137699

CU463346.12	351	CTGAACCTATCTACTTCTAAGGAACTTGCTTGGCCAGGGACGGGCTTCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137700	CTGAACCTATCTACTTCTAAGGAACTTGCTTGGCCAGGGACGGGCTTCCC	137749

CU463346.12	401	CTTTTCTTTATAAAGCATGTTTGCTGACATTAAAATTGAACCTTGAACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137750	CTTTTCTTTATAAAGCATGTTTGCTGACATTAAAATTGAACCTTGAACAG	137799

CU463346.12	451	AAAGCTTGTCTTGGTTCCTTCCTTATCTCGCACAGCCCAGCCCAGCCCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137800	AAAGCTTGTCTTGGTTCCTTCCTTATCTCGCACAGCCCAGCCCAGCCCTT	137849

CU463346.12	501	CTTCTCTTCCAGGTTTCCAAAATGCCTTTCCAGACTAGAACCCAGGTCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137850	CTTCTCTTCCAGGTTTCCAAAATGCCTTTCCAGACTAGAACCCAGGTCTG	137899

CU463346.12	551	TGATCTGCTGGCCGGACACAACACATCCCCCCTCCACTTTGTCTATGCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137900	TGATCTGCTGGCCGGACACAACACATCCCCCCTCCACTTTGTCTATGCAA	137949

CU463346.12	601	CGGTGCTCCTTCATCCACCCATTCACCCTCCCTCACCCAGCCACTGCCAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	137950	CGGTGCTCCTTCATCCACCCATTCACCCTCCCTCACCCAGCCACTGCCAC	137999

CU463346.12	651	CTCACACTGCCCCCTGTGCACTCCCCTTTCTTGGGGCATCATGTCTCTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138000	CTCACACTGCCCCCTGTGCACTCCCCTTTCTTGGGGCATCATGTCTCTAT	138049

CU463346.12	701	AGGATTAGGTGCAACAAGTCCCTTCCAGTCCATGCCAGCACCGAGGCACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138050	AGGATTAGGTGCAACAAGTCCCTTCCAGTCCATGCCAGCACCGAGGCACC	138099

CU463346.12	751	TTGGGCACGGAGTCTGCGGACACCCTCAAGGCCCCCACAGGACTCTCCAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138100	TTGGGCACGGAGTCTGCGGACACCCTCAAGGCCCCCACAGGACTCTCCAC	138149

CU463346.12	801	TGGATATTAGGACCTCTGGTGAGTGGATCACAACTTCTGCCAGGAAGCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138150	TGGATATTAGGACCTCTGGTGAGTGGATCACAACTTCTGCCAGGAAGCAG	138199

CU463346.12	851	GTTCAAACACCTGATATCTGGGCACCTTCCCTGCAAGAGGAGAGCTGGCC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138200	GTTCAAACACCTGATATCTGGGCACCTTCCCTGCAAGAGGAGAGCTGGCC	138249

CU463346.12	901	TGCAGAGAGTACTCTGAACACTGAAACTCAGGAGAAAGCTAGTCTCCCAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138250	TGCAGAGAGTACTCTGAACACTGAAACTCAGGAGAAAGCTAGTCTCCCAG	138299

CU463346.12	951	GTCTGATGATAGAGGATAACATAATCACCTGAGGAACAAGCTCTAACCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138300	GTCTGATGATAGAGGATAACATAATCACCTGAGGAACAAGCTCTAACCAG	138349

CU463346.12	1001	AGACAACTACAACAACTAACTCCAGAGATTACCAGATGGCGAAAGGCAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138350	AGACAACTACAACAACTAACTCCAGAGATTACCAGATGGCGAAAGGCAAA	138399

CU463346.12	1051	TGTAAGAATCTTACTAACAGAAACCAAGACCACTCACCATCATAAGAACG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138400	TGTAAGAATCTTACTAACAGAAACCAAGACCACTCACCATCATAAGAACG	138449

CU463346.12	1101	CAGCACTCCCACCCCACTGAGTCCTGGGCACCCCAACACACCCGAAAAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138450	CAGCACTCCCACCCCACTGAGTCCTGGGCACCCCAACACACCCGAAAAGA	138499

CU463346.12	1151	TAGTCCCAGATTTAAAAGCATAGCTCATGACGATGGTAGAGGATATCAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138500	TAGTCCCAGATTTAAAAGCATAGCTCATGACGATGGTAGAGGATATCAAG	138549

CU463346.12	1201	AAGGACTTTAATAACTCATTAAGAGACAGCCGGCCACCTTCCTGGTGAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138550	AAGGACTTTAATAACTCATTAAGAGACAGCCGGCCACCTTCCTGGTGAGA	138599

CU463346.12	1251	GCACGGGGGTCTGCCAGGCCTGAGAGGTTTGTGGCACAGGCGCCGGCGGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138600	GCACGGGGGTCTGCCAGGCCTGAGAGGTTTGTGGCACAGGCGCCGGCGGG	138649

CU463346.12	1301	AGCCTTCTTGGCTCCGGGACTCCGCGGAGGGCAGGCTGCACGGGTGACCG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138650	AGCCTTCTTGGCTCCGGGACTCCGCGGAGGGCAGGCTGCACGGGTGACCG	138699

CU463346.12	1351	TGTGGAATACAGAGTGCCAGCCGTTTCTGGGACGGGCGAGAGTTGCAGAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138700	TGTGGAATACAGAGTGCCAGCCGTTTCTGGGACGGGCGAGAGTTGCAGAG	138749

CU463346.12	1401	CTTCTGGGCGGCGCCATCTTCAGCTCCAGACAACCAGCCACCTTCCCTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138750	CTTCTGGGCGGCGCCATCTTCAGCTCCAGACAACCAGCCACCTTCCCTGC	138799

CU463346.12	1451	AAGAGCCACAGAGCTTCTGAGGCAGCGCCATCCTCAGCTCCAGACGGCCG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138800	AAGAGCCACAGAGCTTCTGAGGCAGCGCCATCCTCAGCTCCAGACGGCCG	138849

CU463346.12	1501	GCCTCCTTCCGGACAAGAGCCACAGAGCTTCTCAGGCGGCGACATCTTCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138850	GCCTCCTTCCGGACAAGAGCCACAGAGCTTCTCAGGCGGCGACATCTTCA	138899

CU463346.12	1551	ACTCCAGACAACTGGCCACCTTCCTGGCCAAAGCAACACAGCTTCTGGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138900	ACTCCAGACAACTGGCCACCTTCCTGGCCAAAGCAACACAGCTTCTGGGA	138949

CU463346.12	1601	AAGATCCTGTTTTGGGCCTTCACCTTCAGCCAGGAGGAGGTCCAAACACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	138950	AAGATCCTGTTTTGGGCCTTCACCTTCAGCCAGGAGGAGGTCCAAACACC	138999

CU463346.12	1651	AGATAACTGTACACCTTCCCTGAAAGAGGAGAGCTTGCCTACAGAGACTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139000	AGATAACTGTACACCTTCCCTGAAAGAGGAGAGCTTGCCTACAGAGACTG	139049

CU463346.12	1701	CTCTGACCACTGAAACTCAGAGAAGAGAGCTTGTCTCCCACGCCTGCTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139050	CTCTGACCACTGAAACTCAGAGAAGAGAGCTTGTCTCCCACGCCTGCTGA	139099

CU463346.12	1751	TAGAGGGTAACAAAATCAACAGAGGAACAATCTCTTAACAAAGACAACTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139100	TAGAGGGTAACAAAATCAACAGAGGAACAATCTCTTAACAAAGACAACTA	139149

CU463346.12	1801	TAACAACTAACTCCAGAGATTGCCAGATGGCGAAAGGTAAACGTAAGAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139150	TAACAACTAACTCCAGAGATTGCCAGATGGCGAAAGGTAAACGTAAGAAT	139199

CU463346.12	1851	CCTACTAACAGAAGCCAGGACCACTCACCATCATCAGAACCCAGAACGCC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139200	CCTACTAACAGAAGCCAGGACCACTCACCATCATCAGAACCCAGAACGCC	139249

CU463346.12	1901	CACTTCGCCCAATCCAGGACACCCTAACACACCTGAAAAGGTAGACCTGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139250	CACTTCGCCCAATCCAGGACACCCTAACACACCTGAAAAGGTAGACCTGG	139299

CU463346.12	1951	ATTTAAAAGCATATCTCATGATGATGGTAGAGGACATAAAGAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463351.10	139300	ATTTAAAAGCATATCTCATGATGATGGTAGAGGACATAAAGAAGGAATTC	139349

Overview

Query
CU463346.12 - 142129 bps
Hit
CU463351.10 - 139349 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link