<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463176.7	1	GAATTCAGTAAGAATGTTACCTATTCAGTAACATTCAAATTCTCTTCTAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106075	GAATTCAGTAAGAATGTTACCTATTCAGTAACATTCAAATTCTCTTCTAG	106124

CU463176.7	51	TATAGACAGTGAAACTAATTAGGCATTACAATTTACTCAAACAGAGCTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106125	TATAGACAGTGAAACTAATTAGGCATTACAATTTACTCAAACAGAGCTAG	106174

CU463176.7	101	AAAAGCTCAGGGCTAGTCTACATAGTAATTACTTAGGACAATAGCTGAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106175	AAAAGCTCAGGGCTAGTCTACATAGTAATTACTTAGGACAATAGCTGAGT	106224

CU463176.7	151	CACACCCAAACACAGGAATACACAATGAGCTAGGAAATAGATGGGTTGTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106225	CACACCCAAACACAGGAATACACAATGAGCTAGGAAATAGATGGGTTGTC	106274

CU463176.7	201	CCCTGAACCGTACTCAGTACTCAGTACCAGATAATGGCAACAGCCTACAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106275	CCCTGAACCGTACTCAGTACTCAGTACCAGATAATGGCAACAGCCTACAA	106324

CU463176.7	251	CTGGCCACACACAGTTAAATGCAGCATCCTAACTAACAACTGTACAGGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106325	CTGGCCACACACAGTTAAATGCAGCATCCTAACTAACAACTGTACAGGTG	106374

CU463176.7	301	TTTCCTGACAGCATTTCATTTGCATCTCTCTAACTATTAGTGATTCTTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106375	TTTCCTGACAGCATTTCATTTGCATCTCTCTAACTATTAGTGATTCTTCC	106424

CU463176.7	351	TATGCTTGCCAGCTGTGGAGGTTTCTCTTCTGAGACCTAGAGTTATGTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106425	TATGCTTGCCAGCTGTGGAGGTTTCTCTTCTGAGACCTAGAGTTATGTTA	106474

CU463176.7	401	TGTTGTGTTATATATGTCCGTGATTGTTATGTTGTATTATATACATGCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106475	TGTTGTGTTATATATGTCCGTGATTGTTATGTTGTATTATATACATGCCC	106524

CU463176.7	451	ATTTAAGGTTTAAGGGAGAAACCTAGAGTTCACCAGGGTTATGGAGCTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106525	ATTTAAGGTTTAAGGGAGAAACCTAGAGTTCACCAGGGTTATGGAGCTGG	106574

CU463176.7	501	GATTCGATCCCAGGTAGCCTGGATCTTAACCACTGCACTGTCCTGCCTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106575	GATTCGATCCCAGGTAGCCTGGATCTTAACCACTGCACTGTCCTGCCTGA	106624

CU463176.7	551	GTCCTGGCCCTTCTACCAGGGGCCGCTTACCCACCCTGCTCACCTTGACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106625	GTCCTGGCCCTTCTACCAGGGGCCGCTTACCCACCCTGCTCACCTTGACC	106674

CU463176.7	601	AGACCCCTGCTGAAAAGCATTTCCACAATCTCCTTAAGGATGGGCAGGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106675	AGACCCCTGCTGAAAAGCATTTCCACAATCTCCTTAAGGATGGGCAGGAT	106724

CU463176.7	651	GCCGCTGTGGTGCACACCCAGGCCACAGTGAAGGAGCTCCGACATGTGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106725	GCCGCTGTGGTGCACACCCAGGCCACAGTGAAGGAGCTCCGACATGTGCA	106774

CU463176.7	701	GGACCTGCAGCTCGAGGAGGGAGGAGAGGGCAATGGTCAGAGAAGATGCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106775	GGACCTGCAGCTCGAGGAGGGAGGAGAGGGCAATGGTCAGAGAAGATGCA	106824

CU463176.7	751	GATGGAACCCCTTGGCAGGAGGGGCATGTCTCAGATCACCACATCCCTAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106825	GATGGAACCCCTTGGCAGGAGGGGCATGTCTCAGATCACCACATCCCTAC	106874

CU463176.7	801	CTGCATCAGCAGGAGGGCCAGGTTTCAGATCAACACATCCCTACCTGTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106875	CTGCATCAGCAGGAGGGCCAGGTTTCAGATCAACACATCCCTACCTGTAT	106924

CU463176.7	851	TTACAGACACACACCTGGGGTAGCTGTCAGTGAGAGCCTCAGAGCCAAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106925	TTACAGACACACACCTGGGGTAGCTGTCAGTGAGAGCCTCAGAGCCAAGC	106974

CU463176.7	901	AAGGCAGCACTGCAGGAAGAGGTGGATCTCACTCTTCTCCAAGCTTGTCG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	106975	AAGGCAGCACTGCAGGAAGAGGTGGATCTCACTCTTCTCCAAGCTTGTCG	107024

CU463176.7	951	TGAGGTCTAGAGAGGTGAGGCCCATCACAGCGTCCTTGGGAGAAGGTGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107025	TGAGGTCTAGAGAGGTGAGGCCCATCACAGCGTCCTTGGGAGAAGGTGAA	107074

CU463176.7	1001	CACTACCACTGGCAACTGAGCCCGGGTCCGGAGGGAAGCCAGCAGGAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107075	CACTACCACTGGCAACTGAGCCCGGGTCCGGAGGGAAGCCAGCAGGAACA	107124

CU463176.7	1051	GGTACACCCTGCGGTCCTGAGGGAGGAGGGGAGGGGATAGAACTTATGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107125	GGTACACCCTGCGGTCCTGAGGGAGGAGGGGAGGGGATAGAACTTATGTG	107174

CU463176.7	1101	GAGGTGGTGAAGTCATGTTCAAGTCAGGTTTAAAACGAGCAGGACACAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107175	GAGGTGGTGAAGTCATGTTCAAGTCAGGTTTAAAACGAGCAGGACACAGA	107224

CU463176.7	1151	CCTCAAGTCCACTCCCTCCCCGCAGGGACCGGGGCTGAAAGAAGTGGACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107225	CCTCAAGTCCACTCCCTCCCCGCAGGGACCGGGGCTGAAAGAAGTGGACA	107274

CU463176.7	1201	GGATGCAGGCTTTGGCAGAGACTGAGTGCTCCCAGCCCTCACCTGTGCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107275	GGATGCAGGCTTTGGCAGAGACTGAGTGCTCCCAGCCCTCACCTGTGCAG	107324

CU463176.7	1251	GCCCACCCTGGTGCGTGGGCTGCTTGGCCCTGATGGTCTGGGTGTGCTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107325	GCCCACCCTGGTGCGTGGGCTGCTTGGCCCTGATGGTCTGGGTGTGCTTT	107374

CU463176.7	1301	CTCATCCTCTCTTTCTTGGCCTCCACTGCAGCATAGTACCTGAGCACAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107375	CTCATCCTCTCTTTCTTGGCCTCCACTGCAGCATAGTACCTGAGCACAGG	107424

CU463176.7	1351	GTGGGTGGCGTGAGACCTCGCACAGGCCCAGTCTCTGCCCCCAGCCCTGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107425	GTGGGTGGCGTGAGACCTCGCACAGGCCCAGTCTCTGCCCCCAGCCCTGA	107474

CU463176.7	1401	ACTTACTCCTGTGTGTGGAAGGCCCCTCGAGAGTCCAGCAGCAGGAAGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107475	ACTTACTCCTGTGTGTGGAAGGCCCCTCGAGAGTCCAGCAGCAGGAAGAG	107524

CU463176.7	1451	TTCACCCTCCATCTTGGGGCTGTTCCCTGTGAAGAGATAGTGTTCCAGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107525	TTCACCCTCCATCTTGGGGCTGTTCCCTGTGAAGAGATAGTGTTCCAGGG	107574

CU463176.7	1501	GGACCGGCCAGGCAACCGTGCTGATCACATAGATCTGCCTCTGCTTCAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107575	GGACCGGCCAGGCAACCGTGCTGATCACATAGATCTGCCTCTGCTTCAGC	107624

CU463176.7	1551	CACATGCAGGGAGGAGAGGGCAGTTTTTTCTGAGGCCCAGAAGTGGGGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107625	CACATGCAGGGAGGAGAGGGCAGTTTTTTCTGAGGCCCAGAAGTGGGGGC	107674

CU463176.7	1601	CATGACCTGCAGCTTGATCTCCACTTCTGATCCCACCAATTCAAGACCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107675	CATGACCTGCAGCTTGATCTCCACTTCTGATCCCACCAATTCAAGACCCA	107724

CU463176.7	1651	GCCTCTGCCCTGTCCCTTCCTCACTTAGGACCATGATTGTGCCTGTTCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107725	GCCTCTGCCCTGTCCCTTCCTCACTTAGGACCATGATTGTGCCTGTTCTT	107774

CU463176.7	1701	GCTCAGAAGTTCGGCTGCCACCATCCCATCTCAGCATGTCCCAAGTGGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107775	GCTCAGAAGTTCGGCTGCCACCATCCCATCTCAGCATGTCCCAAGTGGAC	107824

CU463176.7	1751	TCGACACCCATCCAGGTGGGGCTGTTTCCTGGCTCCCAACCCTGACCCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107825	TCGACACCCATCCAGGTGGGGCTGTTTCCTGGCTCCCAACCCTGACCCCT	107874

CU463176.7	1801	CTCCTCACTGTAATGGCCTGAGCTGCTCAACCCCAACTGAGGAAGACCAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107875	CTCCTCACTGTAATGGCCTGAGCTGCTCAACCCCAACTGAGGAAGACCAC	107924

CU463176.7	1851	AGTCTTCATCTCTCAAGCACCCAGGACATGGGTCTCACCCAATCCAGTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107925	AGTCTTCATCTCTCAAGCACCCAGGACATGGGTCTCACCCAATCCAGTCA	107974

CU463176.7	1901	GCAAACTCCAGGGCGTTGGGGATGGTGGCACTCAGAAGGATGATGGAGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	107975	GCAAACTCCAGGGCGTTGGGGATGGTGGCACTCAGAAGGATGATGGAGAC	108024

CU463176.7	1951	GTGCTCAGGAAGCATGATGAGCATCCCCTCCCACACGACCTCATGCTGAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463341.5	108025	GTGCTCAGGAAGCATGATGAGCATCCCCTCCCACACGACCTCATGCTGAA	108074

Overview

Query
CU463176.7 - 146842 bps
Hit
CU463341.5 - 108074 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link