<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463310.10	1	GAATTCATGAACCCTCAGTAGGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117031	GAATTCATGAACCCTCAGTAGGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTAA	117080

CU463310.10	51	GCTAATATGAAGTAAGCAGTCTCTAGGAAAAGATATGTTCTGAGCCGGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117081	GCTAATATGAAGTAAGCAGTCTCTAGGAAAAGATATGTTCTGAGCCGGGC	117130

CU463310.10	101	GTGGTGGAGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117131	GTGGTGGAGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAG	117180

CU463310.10	151	ATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTCCCAGGACAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117181	ATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTCCCAGGACAGC	117230

CU463310.10	201	CAGGGCTATAAAGAAAAATCCTGTCTCGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117231	CAGGGCTATAAAGAAAAATCCTGTCTCGAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAA	117280

CU463310.10	251	AAAAAAAGATATGTTCTGAATGTCTAGGACAGAATGCTCCACCATGAAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117281	AAAAAAAGATATGTTCTGAATGTCTAGGACAGAATGCTCCACCATGAAAT	117330

CU463310.10	301	CATCTGACAATGGCTTCCACTTTTCTACCAGCTATGTTCATCTCTGACTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117331	CATCTGACAATGGCTTCCACTTTTCTACCAGCTATGTTCATCTCTGACTC	117380

CU463310.10	351	CTCAGCTCAGATGCTTGCCTCCTTGTCATGTGGCCCACTACTTCTAAGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117381	CTCAGCTCAGATGCTTGCCTCCTTGTCATGTGGCCCACTACTTCTAAGTG	117430

CU463310.10	401	CTTCCCAGCGCTCTAGGTTGTTGGGAGTCACCCCATGGATGTGGGTGCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117431	CTTCCCAGCGCTCTAGGTTGTTGGGAGTCACCCCATGGATGTGGGTGCCG	117480

CU463310.10	451	GTAATCAAACTCCAGTTTCCCATAAGAGAAGTAATACTCTTTACCACAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117481	GTAATCAAACTCCAGTTTCCCATAAGAGAAGTAATACTCTTTACCACAAA	117530

CU463310.10	501	GCCATCTCTCTAACCCCTATGTATTAATTCTCTTCTTTTCATTTGTATCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117531	GCCATCTCTCTAACCCCTATGTATTAATTCTCTTCTTTTCATTTGTATCT	117580

CU463310.10	551	TCAGCCTTATGCTAGCTCTGGAAACTTCTCTGGACATCTCCCCAGTGAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117581	TCAGCCTTATGCTAGCTCTGGAAACTTCTCTGGACATCTCCCCAGTGAGA	117630

CU463310.10	601	ATCAGCTACTAGCAAACTGGGCTCTTCCTTATACCAGGATGCCCACAGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117631	ATCAGCTACTAGCAAACTGGGCTCTTCCTTATACCAGGATGCCCACAGAG	117680

CU463310.10	651	GATGCCTGGACTAGGGCGGTTTCTTTATTTCTTCTTTTAGTTGGACAACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117681	GATGCCTGGACTAGGGCGGTTTCTTTATTTCTTCTTTTAGTTGGACAACA	117730

CU463310.10	701	GGCTCCTGTATCTCTGCCTTATTCTGCAGAGCAAGTTCTCAAACATAACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117731	GGCTCCTGTATCTCTGCCTTATTCTGCAGAGCAAGTTCTCAAACATAACT	117780

CU463310.10	751	CGATGCTATAACTCAACTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTAAATATATTATTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117781	CGATGCTATAACTCAACTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTAAATATATTATTT	117830

CU463310.10	801	TATTTGTGTTGTTTCATTTTAGCATTCAGGCTTAGAGACAAGCACATTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117831	TATTTGTGTTGTTTCATTTTAGCATTCAGGCTTAGAGACAAGCACATTTG	117880

CU463310.10	851	CCCACTGAGCCACCTCACTGACCCTCAACAAACATTTATTGAGATCTGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117881	CCCACTGAGCCACCTCACTGACCCTCAACAAACATTTATTGAGATCTGCT	117930

CU463310.10	901	ACAAACAGGCATTGCCTTAATGTGCAAAGTACAAAAATACTCTCACTTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117931	ACAAACAGGCATTGCCTTAATGTGCAAAGTACAAAAATACTCTCACTTAA	117980

CU463310.10	951	CTCTGACGGTAACTCCAAGAAGTTAGTGTCCTCTTTTGAACGATGAAAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	117981	CTCTGACGGTAACTCCAAGAAGTTAGTGTCCTCTTTTGAACGATGAAAAA	118030

CU463310.10	1001	AGGAAACGAAACTAGGGCTACAGATAGAGCTTAGTTGTGAATTGTGAACT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118031	AGGAAACGAAACTAGGGCTACAGATAGAGCTTAGTTGTGAATTGTGAACT	118080

CU463310.10	1051	TAGCTTGCACCAGGCCCTGAGTTTGATTCCCAGTACCATATGAATAGGGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118081	TAGCTTGCACCAGGCCCTGAGTTTGATTCCCAGTACCATATGAATAGGGA	118130

CU463310.10	1101	AAGGTTTGGGTTTACCCCCCCCCCCCCAAGAAGTCAGGAAGGCCTTTAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118131	AAGGTTTGGGTTTACCCCCCCCCCCCCAAGAAGTCAGGAAGGCCTTTAAG	118180

CU463310.10	1151	GAGAGAGACTATGCCAACAGACCCAAGCATAAACAGGAAGTTTGTATAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118181	GAGAGAGACTATGCCAACAGACCCAAGCATAAACAGGAAGTTTGTATAGC	118230

CU463310.10	1201	CATTTGAGGATGATTAAAAGAGGTTAGCCAAGGACACTCCCTTTCTGCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118231	CATTTGAGGATGATTAAAAGAGGTTAGCCAAGGACACTCCCTTTCTGCTC	118280

CU463310.10	1251	CTAGGTCTCTGCAGGGGTGGAATGAGCATGCTTACCTGCATAGCTGCATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118281	CTAGGTCTCTGCAGGGGTGGAATGAGCATGCTTACCTGCATAGCTGCATG	118330

CU463310.10	1301	ACAACTGGAGGAGAAGGAGGAGGAGAAGGGAGAGGAAGCAGCTGGGCCAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118331	ACAACTGGAGGAGAAGGAGGAGGAGAAGGGAGAGGAAGCAGCTGGGCCAA	118380

CU463310.10	1351	GAGAAGCTCCACAAACAGGCCATCTTTATGGTTACCGGGGACAGAGTCCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118381	GAGAAGCTCCACAAACAGGCCATCTTTATGGTTACCGGGGACAGAGTCCC	118430

CU463310.10	1401	TAACAGCAGGGTCAGGCCAAGCTGAGGTCCTCCGGCTGCATGTCCCTTCC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118431	TAACAGCAGGGTCAGGCCAAGCTGAGGTCCTCCGGCTGCATGTCCCTTCC	118480

CU463310.10	1451	TCCAAGAAGCCCGAAGGGAGAATCTGGGAGGGCACTACTGCCCAAGCCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118481	TCCAAGAAGCCCGAAGGGAGAATCTGGGAGGGCACTACTGCCCAAGCCCA	118530

CU463310.10	1501	ACCTCCATGTAAGCATTACCACAGCTGTGCCCTGAGGAATGGCCCCACGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118531	ACCTCCATGTAAGCATTACCACAGCTGTGCCCTGAGGAATGGCCCCACGT	118580

CU463310.10	1551	CACCCTTGCCAGATATTTGTACAAAAGGACTACAGATCCATTGATGACCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118581	CACCCTTGCCAGATATTTGTACAAAAGGACTACAGATCCATTGATGACCA	118630

CU463310.10	1601	GGGTTTGCTTTCCGACCCAACCCCTCACAGCACTGGAGCAGTGGCTGCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118631	GGGTTTGCTTTCCGACCCAACCCCTCACAGCACTGGAGCAGTGGCTGCCT	118680

CU463310.10	1651	GGTACTGGGCATTTCTCTTTTCCCCTCCATGGATCCAGTCTTGGGAAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118681	GGTACTGGGCATTTCTCTTTTCCCCTCCATGGATCCAGTCTTGGGAAGGG	118730

CU463310.10	1701	CATGTAGTGGTTAGTCAGTGATAATCAGAGGGACTTGTTTGTAAAGTCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118731	CATGTAGTGGTTAGTCAGTGATAATCAGAGGGACTTGTTTGTAAAGTCTA	118780

CU463310.10	1751	TAAGGCTTGTTTAACTCTTTTTTGTTTGTTTGTTTCGAGACAAGGTTTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118781	TAAGGCTTGTTTAACTCTTTTTTGTTTGTTTGTTTCGAGACAAGGTTTCT	118830

CU463310.10	1801	CTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118831	CTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCT	118880

CU463310.10	1851	TGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGGTTAAAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118881	TGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGGTTAAAGG	118930

CU463310.10	1901	TGTGAGCCACCACGCTCGACTTTGTTTAACTCTTATTGTCACCAAAAACT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118931	TGTGAGCCACCACGCTCGACTTTGTTTAACTCTTATTGTCACCAAAAACT	118980

CU463310.10	1951	ATCTAGGGGAGAGTGATTAAAAAATAGAAAGCATTCAGCCTTGACTTGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463334.13	118981	ATCTAGGGGAGAGTGATTAAAAAATAGAAAGCATTCAGCCTTGACTTGCT	119030

Overview

Query
CU463310.10 - 113959 bps
Hit
CU463334.13 - 119030 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link