<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU468138.7	1	CCAGCCTCTAGCTGCTCTTTTGATTGGTCAGACCAGTTCTGCGCAGACAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202311	CCAGCCTCTAGCTGCTCTTTTGATTGGTCAGACCAGTTCTGCGCAGACAA	202360

CU468138.7	51	ACTCTCCAAGTCCCTGAAGTGAAGTGGGAACAGCCGGTGAGGGTGAAGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202361	ACTCTCCAAGTCCCTGAAGTGAAGTGGGAACAGCCGGTGAGGGTGAAGAA	202410

CU468138.7	101	GCTCGGGTTCCTTCACCAACCCGTCCAACGGCCTCTTGAACTTTCTTTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202411	GCTCGGGTTCCTTCACCAACCCGTCCAACGGCCTCTTGAACTTTCTTTCC	202460

CU468138.7	151	TAAGGCGCCTGTGCGGCTCTGTCCCGGGCAGATGGTGGGAGCCAGCGGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202461	TAAGGCGCCTGTGCGGCTCTGTCCCGGGCAGATGGTGGGAGCCAGCGGCA	202510

CU468138.7	201	CAGGACTGCTGCTGCTAAACTGTTTCACACACATTTTATTCCTTGCTTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202511	CAGGACTGCTGCTGCTAAACTGTTTCACACACATTTTATTCCTTGCTTTC	202560

CU468138.7	251	TGTGGGACACGGGAGTTGTTGCGGAGGCGGTTAAGGCTAACTCACAGAAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202561	TGTGGGACACGGGAGTTGTTGCGGAGGCGGTTAAGGCTAACTCACAGAAT	202610

CU468138.7	301	TAGTTTGCTATTGGTGAGGCCACCTCTGTTTTTCACATCGCATCATAGTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202611	TAGTTTGCTATTGGTGAGGCCACCTCTGTTTTTCACATCGCATCATAGTC	202660

CU468138.7	351	TAAGGGACGTACATCATCCAGTTCTTCCCGGGCTCCGGCTCTTTTCTCCG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202661	TAAGGGACGTACATCATCCAGTTCTTCCCGGGCTCCGGCTCTTTTCTCCG	202710

CU468138.7	401	ACCACGTCATTTCTAAGAGCAGAGTGTGTACTGATAAAGCCCCCGGGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202711	ACCACGTCATTTCTAAGAGCAGAGTGTGTACTGATAAAGCCCCCGGGAAT	202760

CU468138.7	451	GCATGACTGTCAGTTTCCCTGTGTGCTCTTCAGTGAGTGACTCTGTGCCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202761	GCATGACTGTCAGTTTCCCTGTGTGCTCTTCAGTGAGTGACTCTGTGCCT	202810

CU468138.7	501	TCGTGTTCCGTAAAGGATGGTAACAGCCGTGGCTCCCTTGTAGCGTTGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202811	TCGTGTTCCGTAAAGGATGGTAACAGCCGTGGCTCCCTTGTAGCGTTGTT	202860

CU468138.7	551	ATAAACCTAACGATTATTAACTTACTCATGCTTGTGATGTTTTTGCATGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202861	ATAAACCTAACGATTATTAACTTACTCATGCTTGTGATGTTTTTGCATGA	202910

CU468138.7	601	GTATGGATGCACAGCCTTGTGGGAGGTAGACACCAGGAATCCTCCATCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202911	GTATGGATGCACAGCCTTGTGGGAGGTAGACACCAGGAATCCTCCATCCT	202960

CU468138.7	651	CCGTCCATCTTTCACCTCACTCACCACGACAGTCTCATTCAAACCCAGAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	202961	CCGTCCATCTTTCACCTCACTCACCACGACAGTCTCATTCAAACCCAGAG	203010

CU468138.7	701	CCCACTTCCTGGCTAGAGGCTGGGATTACTAATGCCCGACATGTATTCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203011	CCCACTTCCTGGCTAGAGGCTGGGATTACTAATGCCCGACATGTATTCCT	203060

CU468138.7	751	GGCCTCTCCATGGCTTCTGGGTATTAAATTCTGGCCCTCATGCTTGTGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203061	GGCCTCTCCATGGCTTCTGGGTATTAAATTCTGGCCCTCATGCTTGTGTG	203110

CU468138.7	801	GCAAGAGCGATCTCCCCAGCCCCTCGTGCATGCTGGGTAAGTGCTCCAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203111	GCAAGAGCGATCTCCCCAGCCCCTCGTGCATGCTGGGTAAGTGCTCCAGC	203160

CU468138.7	851	CACTTATCAGCACCCCAGTCCTTCTGTGATCTTAACCTGGGGACTGCTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203161	CACTTATCAGCACCCCAGTCCTTCTGTGATCTTAACCTGGGGACTGCTGA	203210

CU468138.7	901	GAGCAGTTTCACATAGAGGAAGGGCAGGATAACAGCATTGTCACCAACGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203211	GAGCAGTTTCACATAGAGGAAGGGCAGGATAACAGCATTGTCACCAACGG	203260

CU468138.7	951	TCTGCAGTGCCACAGAGCTTAGTGACATCAGGAACTTTCTTCTGCCTTCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203261	TCTGCAGTGCCACAGAGCTTAGTGACATCAGGAACTTTCTTCTGCCTTCA	203310

CU468138.7	1001	TTTAAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACTACTTGTTTGAGTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203311	TTTAAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACTACTTGTTTGAGTGG	203360

CU468138.7	1051	GAGTGTTTTGCCTGCCTATAATGTATGTATACACATATATGTCTGGTGCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203361	GAGTGTTTTGCCTGCCTATAATGTATGTATACACATATATGTCTGGTGCC	203410

CU468138.7	1101	TTCAGAAGCAAGGAAAAGATATCAGATCCCTTGGTTCTGGGATCACACAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203411	TTCAGAAGCAAGGAAAAGATATCAGATCCCTTGGTTCTGGGATCACACAT	203460

CU468138.7	1151	GGTTGTAAGCAGCCACATGCATACTGGGAAACAAACTCAGATCTTTTGGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203461	GGTTGTAAGCAGCCACATGCATACTGGGAAACAAACTCAGATCTTTTGGA	203510

CU468138.7	1201	AGAGCAGACTGTACTCTGGACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTGTTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203511	AGAGCAGACTGTACTCTGGACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTGTTA	203560

CU468138.7	1251	GACTTTTGACTCTATCTTTAGTATTTTGATTTTCTCCCTTGGAGATACTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203561	GACTTTTGACTCTATCTTTAGTATTTTGATTTTCTCCCTTGGAGATACTT	203610

CU468138.7	1301	TTGTTTTTATTCTCATTTTACCTGTGTGGATCTGGTCCACATCCTTTTCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203611	TTGTTTTTATTCTCATTTTACCTGTGTGGATCTGGTCCACATCCTTTTCT	203660

CU468138.7	1351	ACATTTTCCTAGTTTCTGTTCTTCTTCATATGTACCCAGCAATTTCCTTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203661	ACATTTTCCTAGTTTCTGTTCTTCTTCATATGTACCCAGCAATTTCCTTC	203710

CU468138.7	1401	CAATCAAAATGGAAAACTGACGGAGGTCTCACTGTATGGCTCTGCCCAAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203711	CAATCAAAATGGAAAACTGACGGAGGTCTCACTGTATGGCTCTGCCCAAC	203760

CU468138.7	1451	CTGAAACTTACCACGTAGACCAGGCTGATCTCAAACATACAAGAAATTTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203761	CTGAAACTTACCACGTAGACCAGGCTGATCTCAAACATACAAGAAATTTA	203810

CU468138.7	1501	CTGCCTCTGCCTCCCAACTGCTGGGACTAAAGATGTGGCACTTTTCCAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203811	CTGCCTCTGCCTCCCAACTGCTGGGACTAAAGATGTGGCACTTTTCCAGG	203860

CU468138.7	1551	TGTTCACCTGCTGTCCTTAGCTCTAGCTAACTCCTCTCTCTGGACCTTAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203861	TGTTCACCTGCTGTCCTTAGCTCTAGCTAACTCCTCTCTCTGGACCTTAG	203910

CU468138.7	1601	AGGATGGGCTTAGATTAGATGCTCACCCATTGAGTGATATGTGTGCCACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203911	AGGATGGGCTTAGATTAGATGCTCACCCATTGAGTGATATGTGTGCCACT	203960

CU468138.7	1651	CGCTCCCCAGCTGGCCTCCAGTTTGCTGTGTAGCTGAGATGATCTCCCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	203961	CGCTCCCCAGCTGGCCTCCAGTTTGCTGTGTAGCTGAGATGATCTCCCCC	204010

CU468138.7	1701	ACCCCCATCCTGGTCCTCTGCTTCCACCCCTCCCAGCTGCTGGGATTGCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	204011	ACCCCCATCCTGGTCCTCTGCTTCCACCCCTCCCAGCTGCTGGGATTGCA	204060

CU468138.7	1751	GGCAGGCACCACCCTGTTAGCCTCTTTCCTCAGCCATTCTTGCATCCAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	204061	GGCAGGCACCACCCTGTTAGCCTCTTTCCTCAGCCATTCTTGCATCCAAG	204110

CU468138.7	1801	TAAGAGCCAGGCCCACTCTGCTTAGCTTTGAGACTGGATAAGGTTGAGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	204111	TAAGAGCCAGGCCCACTCTGCTTAGCTTTGAGACTGGATAAGGTTGAGTG	204160

CU468138.7	1851	CATTAGGGTGGGGGTTCTAGGACCCCTTAACTAGAGGCATCAAAAGCTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	204161	CATTAGGGTGGGGGTTCTAGGACCCCTTAACTAGAGGCATCAAAAGCTGA	204210

CU468138.7	1901	CTTTAGCCTAGTGTTCTCTTTCCCTTTTCTTTGAGTTAAAGTCTCATGTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	204211	CTTTAGCCTAGTGTTCTCTTTCCCTTTTCTTTGAGTTAAAGTCTCATGTA	204260

CU468138.7	1951	GCCCAGGCTGGCCTTGAACTCCGGATTTAGCTCAGGATAAGTTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463333.16	204261	GCCCAGGCTGGCCTTGAACTCCGGATTTAGCTCAGGATAAGTTTGAATTC	204310

Overview

Query
CU468138.7 - 183789 bps
Hit
CU463333.16 - 204310 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link