<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU468049.4	1	TGTCCTGACTGGCCTAGTGCCTCCCTATCTCCTGCCCTTCAGACAGTCTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154465	TGTCCTGACTGGCCTAGTGCCTCCCTATCTCCTGCCCTTCAGACAGTCTG	154514

CU468049.4	51	TTGATGTTTAAATGGACCAATCATGTAAAACCGCGCCAATTCCTCCCCCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154515	TTGATGTTTAAATGGACCAATCATGTAAAACCGCGCCAATTCCTCCCCCA	154564

CU468049.4	101	GCCCCACCCCTTTTCTATAAAAGTCCCTAGCTTCCAAGCCTCGAAACTAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154565	GCCCCACCCCTTTTCTATAAAAGTCCCTAGCTTCCAAGCCTCGAAACTAC	154614

CU468049.4	151	TGTCTCCTGCGTGAGATACGTTTCAAACTGGAGCTCCGCCATTATGGCTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154615	TGTCTCCTGCGTGAGATACGTTTCAAACTGGAGCTCCGCCATTATGGCTC	154664

CU468049.4	201	CACCATGTGGTCGACACCTCTGTCTCCTGCGGGAGATATGTGTCGGCCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154665	CACCATGTGGTCGACACCTCTGTCTCCTGCGGGAGATATGTGTCGGCCTG	154714

CU468049.4	251	GAGCTCCGTCATTAAACTACCTCATGCTTTTACATCAAGATGGTCGTCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154715	GAGCTCCGTCATTAAACTACCTCATGCTTTTACATCAAGATGGTCGTCTG	154764

CU468049.4	301	TTCGTGATTCTTGGGTGCGCTCCGAACAGAAATTGAGTGGGGGTTTCCCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154765	TTCGTGATTCTTGGGTGCGCTCCGAACAGAAATTGAGTGGGGGTTTCCCC	154814

CU468049.4	351	ACTAGGTTCTTTCACTCTCTCGCTCTAATAATTATATTCTCTAAAATGGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154815	ACTAGGTTCTTTCACTCTCTCGCTCTAATAATTATATTCTCTAAAATGGT	154864

CU468049.4	401	TACATTATTAAATTACCTCATGCAAGGCCATCATCACCTGCCTCCTGCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154865	TACATTATTAAATTACCTCATGCAAGGCCATCATCACCTGCCTCCTGCTG	154914

CU468049.4	451	TACCTTAACTGCTTTGTTTGCTTAACTAAGAATTAGGGAAACAGATTATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154915	TACCTTAACTGCTTTGTTTGCTTAACTAAGAATTAGGGAAACAGATTATT	154964

CU468049.4	501	TAATTACTGGGAAACCTGGGTTGATGAGAAGGCTCAGTGGGTAAAGGCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	154965	TAATTACTGGGAAACCTGGGTTGATGAGAAGGCTCAGTGGGTAAAGGCAC	155014

CU468049.4	551	ATGTCGCCAAGCTTGTTCACTCTTGGACTCACCTTCTGGGTAAGAACGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155015	ATGTCGCCAAGCTTGTTCACTCTTGGACTCACCTTCTGGGTAAGAACGCA	155064

CU468049.4	601	GCCTACAGTTTGTTATCTGGCCTTACACGTGTACCGTGTACCTTGACAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155065	GCCTACAGTTTGTTATCTGGCCTTACACGTGTACCGTGTACCTTGACAAC	155114

CU468049.4	651	CACGTGCCAAATTCCTAAGAGATGTAACAAAGTTTTAAATAATGCTAAAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155115	CACGTGCCAAATTCCTAAGAGATGTAACAAAGTTTTAAATAATGCTAAAC	155164

CU468049.4	701	ATCATTTGTTGTACAAAATAAAACAATTATTGAAGTTAGCTTGACATTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155165	ATCATTTGTTGTACAAAATAAAACAATTATTGAAGTTAGCTTGACATTTT	155214

CU468049.4	751	AGTACTTTAACTAATAAATATAACTTTTCAGATTAACCACCTTAGGGACG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155215	AGTACTTTAACTAATAAATATAACTTTTCAGATTAACCACCTTAGGGACG	155264

CU468049.4	801	CTTTAATGGCAGTAAATATATCCATATCTTTGTGTGACCATCCGTACCAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155265	CTTTAATGGCAGTAAATATATCCATATCTTTGTGTGACCATCCGTACCAT	155314

CU468049.4	851	CTGTCTTCAGAACTTCTTCACCTTGTAAAACTGAAACTCTGTATCCATTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155315	CTGTCTTCAGAACTTCTTCACCTTGTAAAACTGAAACTCTGTATCCATTA	155364

CU468049.4	901	AACAGAAACTTCTCATTTCTTCCTTTGGTCGGCACCCGACAGCATCAGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155365	AACAGAAACTTCTCATTTCTTCCTTTGGTCGGCACCCGACAGCATCAGGT	155414

CU468049.4	951	AGTCCCAGGTTGCAGATGTTTGCCACACACACAGTACCCGACCACTTCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155415	AGTCCCAGGTTGCAGATGTTTGCCACACACACAGTACCCGACCACTTCCT	155464

CU468049.4	1001	TTTGTTAGAATAACCTTAACTCCCCACATGTTTCTTCTAAATTTAGCGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155465	TTTGTTAGAATAACCTTAACTCCCCACATGTTTCTTCTAAATTTAGCGTT	155514

CU468049.4	1051	CACCTCCTTCTCTCTTTGTGCACCATGTGGGTACAAAGCCTGTGGAGAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155515	CACCTCCTTCTCTCTTTGTGCACCATGTGGGTACAAAGCCTGTGGAGAAA	155564

CU468049.4	1101	AAAAAGCTTGAAGCCCTAGTAAGAGATACACTCTTGGGCTGGTGAGATGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155565	AAAAAGCTTGAAGCCCTAGTAAGAGATACACTCTTGGGCTGGTGAGATGG	155614

CU468049.4	1151	CTCAGCGGGTAAGAGCACTGACTGCTCCTCCAAAGGTTCTGAGTTCAAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155615	CTCAGCGGGTAAGAGCACTGACTGCTCCTCCAAAGGTTCTGAGTTCAAAT	155664

CU468049.4	1201	CCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCGTATGACGCCCTCTTCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155665	CCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCGTATGACGCCCTCTTCTG	155714

CU468049.4	1251	GTGTGTCTGAAGCCAGCTACAGTGTACTTACATATAAGTAAATCTTAAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155715	GTGTGTCTGAAGCCAGCTACAGTGTACTTACATATAAGTAAATCTTAAAA	155764

CU468049.4	1301	AAAGAGATACACTCTTTTGTTTGTTTTATATATTTAGGTAAATCTTTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155765	AAAGAGATACACTCTTTTGTTTGTTTTATATATTTAGGTAAATCTTTGTT	155814

CU468049.4	1351	TAACATATATTTTTATTTTATGAGTGTATATTTTTGTCTGTGCACCATGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155815	TAACATATATTTTTATTTTATGAGTGTATATTTTTGTCTGTGCACCATGT	155864

CU468049.4	1401	ATGTGCCTAGAGCCAGAGTTACAAAAGCTTGTAATCTGCCATGTGGGTAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155865	ATGTGCCTAGAGCCAGAGTTACAAAAGCTTGTAATCTGCCATGTGGGTAC	155914

CU468049.4	1451	TGAGAACTGAACCCAGGTCCTCTGTAAGAATGCTCAACAATCATAGCTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155915	TGAGAACTGAACCCAGGTCCTCTGTAAGAATGCTCAACAATCATAGCTGC	155964

CU468049.4	1501	TGAGCCATCTCTCCAGCCCCTTATTTGATTTTTTTGAAACAGGGTCTCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	155965	TGAGCCATCTCTCCAGCCCCTTATTTGATTTTTTTGAAACAGGGTCTCTC	156014

CU468049.4	1551	TCGATGTAGCCCTGATTATACTAGAACTTGCCATGTAAACCAGGTCAGCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156015	TCGATGTAGCCCTGATTATACTAGAACTTGCCATGTAAACCAGGTCAGCC	156064

CU468049.4	1601	TTGAACTCACAGAGATCCGCCTGCTTCTGTCTCCTGAGTGCTGGGATTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156065	TTGAACTCACAGAGATCCGCCTGCTTCTGTCTCCTGAGTGCTGGGATTAA	156114

CU468049.4	1651	AGGCGTGTATCACTGTTCCTGGCTGAATGTAGGTTTTAAGTTTCACCAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156115	AGGCGTGTATCACTGTTCCTGGCTGAATGTAGGTTTTAAGTTTCACCAAA	156164

CU468049.4	1701	CCTTGTTGCCACCAACCTTGAGAAATATGAATTGGACCCCACAGCACACT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156165	CCTTGTTGCCACCAACCTTGAGAAATATGAATTGGACCCCACAGCACACT	156214

CU468049.4	1751	AGCAAAGATAGGAGAGATGGCTCAGTGGTCAAGAACACCGGGCTGCTCCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156215	AGCAAAGATAGGAGAGATGGCTCAGTGGTCAAGAACACCGGGCTGCTCCT	156264

CU468049.4	1801	GCAGAGGATCACACGGTGGCTCACAGCTGTCTGTCACATTTCCAGGGCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156265	GCAGAGGATCACACGGTGGCTCACAGCTGTCTGTCACATTTCCAGGGCAT	156314

CU468049.4	1851	CTGAGACCCCCTTCCAACTTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156315	CTGAGACCCCCTTCCAACTTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAA	156364

CU468049.4	1901	GTGAGTTCCAGGATAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156365	GTGAGTTCCAGGATAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA	156414

CU468049.4	1951	ACAAAACAAACAAACAAACAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAGATAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463331.8	156415	ACAAAACAAACAAACAAACAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAGATAAGAATTC	156464

Overview

Query
CU468049.4 - 18468 bps
Hit
CU463331.8 - 156464 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link