<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU210939.14	1	GAATTCTGTGTTCTCTTTAAAAACAGCCTTTTAATTAGATCCTAGTTATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	113823	GAATTCTGTGTTCTCTTTAAAAACAGCCTTTTAATTAGATCCTAGTTATA	113872

CU210939.14	51	AAAAGATTCAGTCTTTTCTCTTTACTCTTCTGTTGTTTGAGATTGTGCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	113873	AAAAGATTCAGTCTTTTCTCTTTACTCTTCTGTTGTTTGAGATTGTGCCC	113922

CU210939.14	101	GAGGTGCCTGAGAATAGCTGCGAGCAGAAGTCAGCAGACGTGGTGGCGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	113923	GAGGTGCCTGAGAATAGCTGCGAGCAGAAGTCAGCAGACGTGGTGGCGCA	113972

CU210939.14	151	CGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	113973	CGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTT	114022

CU210939.14	201	CAAGACCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTGCCAGGACAGCCAGGGCTGCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114023	CAAGACCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTGCCAGGACAGCCAGGGCTGCAC	114072

CU210939.14	251	AGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114073	AGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	114122

CU210939.14	301	AGAAAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAAACCCAGCCCACACTCCCCTGGAAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114123	AGAAAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAAACCCAGCCCACACTCCCCTGGAAGG	114172

CU210939.14	351	TCAGCATTCCTCACCTACTTGGTGGCCCCTCAGCCCACTCCCCACCCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114173	TCAGCATTCCTCACCTACTTGGTGGCCCCTCAGCCCACTCCCCACCCCTC	114222

CU210939.14	401	TCCCTAATGACAGCCCCTTGACAGCCCCTTGATTTCATTCTGTGTGGCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114223	TCCCTAATGACAGCCCCTTGACAGCCCCTTGATTTCATTCTGTGTGGCAA	114272

CU210939.14	451	TGTTAAGAGTTCTGCTGCTCTATTCCCAAGCTTCTTTTGCAGCTGAGTGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114273	TGTTAAGAGTTCTGCTGCTCTATTCCCAAGCTTCTTTTGCAGCTGAGTGT	114322

CU210939.14	501	GTCGGGTGTCTGAGCTCTGCCCTCCAAAGCCGATCAGGTAGAGTGATGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114323	GTCGGGTGTCTGAGCTCTGCCCTCCAAAGCCGATCAGGTAGAGTGATGCA	114372

CU210939.14	551	GAGTTGATCAGGTAGAGTGACATGACGCAGAGGTTTTGACTTTCCCCGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114373	GAGTTGATCAGGTAGAGTGACATGACGCAGAGGTTTTGACTTTCCCCGCA	114422

CU210939.14	601	TGTTTGCCTTTTCTTTGTCTCTTCTTTGAGAGGCTGGTGGGACAGATGAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114423	TGTTTGCCTTTTCTTTGTCTCTTCTTTGAGAGGCTGGTGGGACAGATGAC	114472

CU210939.14	651	ACACCAGTCTCTCTTTTGCCTCAGGTTAAGGATGGTAGATCAGAAAAGCG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114473	ACACCAGTCTCTCTTTTGCCTCAGGTTAAGGATGGTAGATCAGAAAAGCG	114522

CU210939.14	701	GATGAGCCACCATAAGTACCAAGGACCTCTACAATATATATATTTTTAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114523	GATGAGCCACCATAAGTACCAAGGACCTCTACAATATATATATTTTTAAT	114572

CU210939.14	751	TAAAAAGAAAAAAAAAAAGCAAATGTATGTGTTTATTTGGGAACCAGGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114573	TAAAAAGAAAAAAAAAAAGCAAATGTATGTGTTTATTTGGGAACCAGGAA	114622

CU210939.14	801	TCAGGGACTGCACACATGCCAGTCATACAGGTCTGGAGGTCAGAGGTCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114623	TCAGGGACTGCACACATGCCAGTCATACAGGTCTGGAGGTCAGAGGTCAA	114672

CU210939.14	851	CTTGCAGGAGTGGGTTCTTTCCTTCTGCCCTGTGAGTCTTGGGGATGACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114673	CTTGCAGGAGTGGGTTCTTTCCTTCTGCCCTGTGAGTCTTGGGGATGACA	114722

CU210939.14	901	TTGGGTGGTTTGCAGCAAGCTCCTTTTTCTCCTGAGCCATCTCACTGGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114723	TTGGGTGGTTTGCAGCAAGCTCCTTTTTCTCCTGAGCCATCTCACTGGGC	114772

CU210939.14	951	TTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTATTATTATATCTAAGTACACTGTAGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114773	TTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTATTATTATATCTAAGTACACTGTAGCT	114822

CU210939.14	1001	GTCTTCAGATGCACCAGAAAAGGGTGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114823	GTCTTCAGATGCACCAGAAAAGGGTGTCAGATCTCATTACAGATGGTTGT	114872

CU210939.14	1051	GAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCAGAAGAGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114873	GAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCAGAAGAGCA	114922

CU210939.14	1101	GTCAGTGCTTTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTCACTGGGTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114923	GTCAGTGCTTTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTCACTGGGTTT	114972

CU210939.14	1151	TTAAGTGAAAGAGAAATGAGCTCGTTTTTTTTCTGAAAACTTCCTTCATC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	114973	TTAAGTGAAAGAGAAATGAGCTCGTTTTTTTTCTGAAAACTTCCTTCATC	115022

CU210939.14	1201	CATGGGGTCCCTAACCCTAAGTGCCCAACCTGCAGACCAACTTCCAAGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115023	CATGGGGTCCCTAACCCTAAGTGCCCAACCTGCAGACCAACTTCCAAGAG	115072

CU210939.14	1251	ATATCTTTGTTCAAAGGATGTCCTTAGGATAGGCCTGGTCCGCTCACCAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115073	ATATCTTTGTTCAAAGGATGTCCTTAGGATAGGCCTGGTCCGCTCACCAT	115122

CU210939.14	1301	TCTTGTACAAAGAGACTCGGACAGACAGGAACATTCGCGGGGTACTCAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115123	TCTTGTACAAAGAGACTCGGACAGACAGGAACATTCGCGGGGTACTCAAG	115172

CU210939.14	1351	AAGAAGACTCTACCTTCAAGCCAGCAGAACAGCCTCATCTGCACTTCCTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115173	AAGAAGACTCTACCTTCAAGCCAGCAGAACAGCCTCATCTGCACTTCCTC	115222

CU210939.14	1401	TTGCACTCCCAACCCCAGAACTGTGAAACGGGTAGATTCTACTGTCTCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115223	TTGCACTCCCAACCCCAGAACTGTGAAACGGGTAGATTCTACTGTCTCAG	115272

CU210939.14	1451	CCATCCAGCCTGGAGTGCTCTGATACAGCGGCAGACACAGACAAACACGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115273	CCATCCAGCCTGGAGTGCTCTGATACAGCGGCAGACACAGACAAACACGG	115322

CU210939.14	1501	GCATCGGGGTAAAAGATGGTAGGACACCAGAAGCCGGCCAGCCGGGAAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115323	GCATCGGGGTAAAAGATGGTAGGACACCAGAAGCCGGCCAGCCGGGAAGT	115372

CU210939.14	1551	AGTCGTGGTAAGTCTATGAGTGGTTGCTATCATTTGTTGAGGGGTATATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115373	AGTCGTGGTAAGTCTATGAGTGGTTGCTATCATTTGTTGAGGGGTATATC	115422

CU210939.14	1601	TCTCGGACTAGATGGTTTCCCATGAAGAATCTCCACAGCTCTGTCTACAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115423	TCTCGGACTAGATGGTTTCCCATGAAGAATCTCCACAGCTCTGTCTACAC	115472

CU210939.14	1651	AGGGCACCATCCTCTGTCTACACAGGGTACCACCCCACTAAGAAACCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115473	AGGGCACCATCCTCTGTCTACACAGGGTACCACCCCACTAAGAAACCTCT	115522

CU210939.14	1701	ATCTACACAGGGTACCATCCCACTAAGAAGAGCCAGAGCCAGGCATGAAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115523	ATCTACACAGGGTACCATCCCACTAAGAAGAGCCAGAGCCAGGCATGAAC	115572

CU210939.14	1751	CAGAGAGCCAGGGAACCCCAGACAGCAGCAAGTGCCAGGCTGCAGAGACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115573	CAGAGAGCCAGGGAACCCCAGACAGCAGCAAGTGCCAGGCTGCAGAGACT	115622

CU210939.14	1801	GTGGCAAAAGGTGTGAGGAGCAGAGATATGGAAGGAAGCCCTTGTGGGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115623	GTGGCAAAAGGTGTGAGGAGCAGAGATATGGAAGGAAGCCCTTGTGGGGA	115672

CU210939.14	1851	GGGGCAGAACTGTTGGCTGAGAGTGCGAAGGCTAGGAGGTCTTGCAGCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115673	GGGGCAGAACTGTTGGCTGAGAGTGCGAAGGCTAGGAGGTCTTGCAGCCT	115722

CU210939.14	1901	TTGGCCTTGTTGAGGCCTTCCTTTTATCTTAAGCCAAGGGCCCATTTTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115723	TTGGCCTTGTTGAGGCCTTCCTTTTATCTTAAGCCAAGGGCCCATTTTGA	115772

CU210939.14	1951	AGGAATTTGGGGCTGTAGAGGTGGGGGCTGCAGGAGCCAACACTCCCAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463327.8	115773	AGGAATTTGGGGCTGTAGAGGTGGGGGCTGCAGGAGCCAACACTCCCAGC	115822

Overview

Query
CU210939.14 - 182472 bps
Hit
CU463327.8 - 115822 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link