<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463351.10	1	TGAGAAAATCAGAGCATATTGGATACTAGAGAATGACTGGAGGCACCCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201588	TGAGAAAATCAGAGCATATTGGATACTAGAGAATGACTGGAGGCACCCAA	201637

CU463351.10	51	ATTTACTGGGTAGCCCTGCAGAAAACAAATGAATAAACAAATAAATAAAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201638	ATTTACTGGGTAGCCCTGCAGAAAACAAATGAATAAACAAATAAATAAAT	201687

CU463351.10	101	ACCCCTTACTCAACCTGAGCAGTTAAAAAACAAAACATAACAAACAAACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201688	ACCCCTTACTCAACCTGAGCAGTTAAAAAACAAAACATAACAAACAAACA	201737

CU463351.10	151	AACAAACAAAAAAACAACCACACAAATCTGAGCTTTCATGAATTTTTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201738	AACAAACAAAAAAACAACCACACAAATCTGAGCTTTCATGAATTTTTTTT	201787

CU463351.10	201	TTAAATAAAATCTGAAGTATTTTCAAAAGATTTTATTGTTACTGTTTTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201788	TTAAATAAAATCTGAAGTATTTTCAAAAGATTTTATTGTTACTGTTTTCA	201837

CU463351.10	251	TCTGTGAAGAAGGGAGGGGGTATTTGCTGCATGTTTGTCTGTAAACCACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201838	TCTGTGAAGAAGGGAGGGGGTATTTGCTGCATGTTTGTCTGTAAACCACA	201887

CU463351.10	301	CTCACAAAGCCAGAAGAGGGCATCAGATGCCTTGAAAATGGAGTTACAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201888	CTCACAAAGCCAGAAGAGGGCATCAGATGCCTTGAAAATGGAGTTACAGG	201937

CU463351.10	351	CAGTTGTGTGTCACCATGGCAGTGCTTGGAATAGAATGATATTCAGCTGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201938	CAGTTGTGTGTCACCATGGCAGTGCTTGGAATAGAATGATATTCAGCTGC	201987

CU463351.10	401	TAAAGCTGCCAGTGCTTCTAACCAATGCACCATCTCTGCAGTCCTTCAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	201988	TAAAGCTGCCAGTGCTTCTAACCAATGCACCATCTCTGCAGTCCTTCAAA	202037

CU463351.10	451	AATATTTTAAAGTAAAATTGGATAGCACATAGTTTGAAAAAGAAATTCTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202038	AATATTTTAAAGTAAAATTGGATAGCACATAGTTTGAAAAAGAAATTCTT	202087

CU463351.10	501	ATAAGGGTATCTTCTCTCATTTAGGAGCAATCGTTATTTGGAATGAATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202088	ATAAGGGTATCTTCTCTCATTTAGGAGCAATCGTTATTTGGAATGAATCC	202137

CU463351.10	551	AAACTGAAATAACTAGATAGTAAGAAAATAGACACATTTACTAAATGACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202138	AAACTGAAATAACTAGATAGTAAGAAAATAGACACATTTACTAAATGACT	202187

CU463351.10	601	CCGAGAAACACTTTGAATCTTTAGACCACAACTATGTGGAATTTTGGCCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202188	CCGAGAAACACTTTGAATCTTTAGACCACAACTATGTGGAATTTTGGCCC	202237

CU463351.10	651	AGCAGGAAGGATTTTGCTGGTTTTGGCCATCTGCATTGGACCTGCCCTAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202238	AGCAGGAAGGATTTTGCTGGTTTTGGCCATCTGCATTGGACCTGCCCTAG	202287

CU463351.10	701	CTCACCACCAAAGAGCTTTCATACTCAGTTACTGCTTCTGCAGCCTTGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202288	CTCACCACCAAAGAGCTTTCATACTCAGTTACTGCTTCTGCAGCCTTGTA	202337

CU463351.10	751	GCTCAGTTGCAGGCACTGAAGGAGAGAGATTTTTCTCTTTTGACCAAGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202338	GCTCAGTTGCAGGCACTGAAGGAGAGAGATTTTTCTCTTTTGACCAAGAA	202387

CU463351.10	801	CAAAGATCTCCTCCATCATAAAGTTTAGTGTTTTAGTGTTTTCTTTTTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202388	CAAAGATCTCCTCCATCATAAAGTTTAGTGTTTTAGTGTTTTCTTTTTAA	202437

CU463351.10	851	TATCTTTTTGTTGTTTTGTTAGGAGGGGTAAATCTGTGGACTCCATGGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202438	TATCTTTTTGTTGTTTTGTTAGGAGGGGTAAATCTGTGGACTCCATGGGT	202487

CU463351.10	901	TCCATTAAAAAAATTCATTGAATAGACACTGAATCCATTTTGTACTGTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202488	TCCATTAAAAAAATTCATTGAATAGACACTGAATCCATTTTGTACTGTGT	202537

CU463351.10	951	GCACTCATACACTAGAGCATGGCCCACATTCTTCAAGAAAATAGACTCTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202538	GCACTCATACACTAGAGCATGGCCCACATTCTTCAAGAAAATAGACTCTC	202587

CU463351.10	1001	CTTCTTCCAGTAGCTATTTAGTGCCACTTCATCTAGGGGTGGAAATTCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202588	CTTCTTCCAGTAGCTATTTAGTGCCACTTCATCTAGGGGTGGAAATTCAT	202637

CU463351.10	1051	GGATTTTTGTCTGGCTTAATCTTTTGAAAGACTGTAATTCAGTCCCAACC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202638	GGATTTTTGTCTGGCTTAATCTTTTGAAAGACTGTAATTCAGTCCCAACC	202687

CU463351.10	1101	ATTGTGAGTTCATGTGCACAACTGTGTACTCATGTCTAATGTATAGCAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202688	ATTGTGAGTTCATGTGCACAACTGTGTACTCATGTCTAATGTATAGCAAA	202737

CU463351.10	1151	CACTGTATACAGACATCTATTCCTTCACAGGAGTAGGACAGTAAACATGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202738	CACTGTATACAGACATCTATTCCTTCACAGGAGTAGGACAGTAAACATGA	202787

CU463351.10	1201	AAAGTATATAGCAGAGGAGTTGGATAATAAGGAATAAGAGGTGAATTAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202788	AAAGTATATAGCAGAGGAGTTGGATAATAAGGAATAAGAGGTGAATTAGA	202837

CU463351.10	1251	TATAAACACATGATATGAGTATAAATATTAAATATAAGTATTTAATAAAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202838	TATAAACACATGATATGAGTATAAATATTAAATATAAGTATTTAATAAAT	202887

CU463351.10	1301	AAAATTGGTTTGAAAACATCTTACCACAAGAAACACTCTCACCTTGGACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202888	AAAATTGGTTTGAAAACATCTTACCACAAGAAACACTCTCACCTTGGACT	202937

CU463351.10	1351	GTTTTCCATTGCTTGAATGGTGGTAGCTAAGTTACTCAACACTCAGAATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202938	GTTTTCCATTGCTTGAATGGTGGTAGCTAAGTTACTCAACACTCAGAATG	202987

CU463351.10	1401	TTGTTGAGACAAAAGAAGTTACTAAAGAGATTTTGAAGAGTATAGGCAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	202988	TTGTTGAGACAAAAGAAGTTACTAAAGAGATTTTGAAGAGTATAGGCAGT	203037

CU463351.10	1451	CAGATGTAAAATAACTCAACAACATTATGCTGATATATATTTGATATTTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203038	CAGATGTAAAATAACTCAACAACATTATGCTGATATATATTTGATATTTA	203087

CU463351.10	1501	CTTAATAAAGTATATTGTCTAAACTGTTTATAAAGCTGGGTGTGGTAGTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203088	CTTAATAAAGTATATTGTCTAAACTGTTTATAAAGCTGGGTGTGGTAGTA	203137

CU463351.10	1551	AATATCTATAATCCCAGCAGTTGAGAGGTGGAGGCAAGAACATGAGGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203138	AATATCTATAATCCCAGCAGTTGAGAGGTGGAGGCAAGAACATGAGGAAT	203187

CU463351.10	1601	TCAAGGACAGCTTAAGCTACAGGAGATCTGAACTCAAAAAAAATAATCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203188	TCAAGGACAGCTTAAGCTACAGGAGATCTGAACTCAAAAAAAATAATCAC	203237

CU463351.10	1651	TAATAAAAATTTTAAAATAAAAACTTATCCACTCACCATCAAAAGCTCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203238	TAATAAAAATTTTAAAATAAAAACTTATCCACTCACCATCAAAAGCTCAA	203287

CU463351.10	1701	GTTTAACTGAATCAGAATCACATATAAAAGAAATGTTTTGCCTCTGGAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203288	GTTTAACTGAATCAGAATCACATATAAAAGAAATGTTTTGCCTCTGGAAT	203337

CU463351.10	1751	TTTTAGTAGCTTTGCACCTAACTTTTCAACTGAGCAACCATAGTATTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203338	TTTTAGTAGCTTTGCACCTAACTTTTCAACTGAGCAACCATAGTATTAAT	203387

CU463351.10	1801	AATTCCTCAAAATAAGCAAGCATATTGATATTCATCCAACTAATATGAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203388	AATTCCTCAAAATAAGCAAGCATATTGATATTCATCCAACTAATATGAGT	203437

CU463351.10	1851	TGACAGATGAACAAGTGTAATTACTAGTTATACTAAACATAGGTAGTATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203438	TGACAGATGAACAAGTGTAATTACTAGTTATACTAAACATAGGTAGTATA	203487

CU463351.10	1901	AACATATTTATATACCTAGTTACATACAAGGCACATTAGAGTGTGTCCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203488	AACATATTTATATACCTAGTTACATACAAGGCACATTAGAGTGTGTCCTA	203537

CU463351.10	1951	AGTCCATGTTATCAACTAATATGTCCAAAACAAATTCAGGGACTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463311.16	203538	AGTCCATGTTATCAACTAATATGTCCAAAACAAATTCAGGGACTGAATTC	203587

Overview

Query
CU463351.10 - 139349 bps
Hit
CU463311.16 - 203587 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link