<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU468137.5	1	TCTGATCGGTTTCATTAAAAGCTGACTGAGGTAACACAGCCTGTGGCAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	206737	TCTGATCGGTTTCATTAAAAGCTGACTGAGGTAACACAGCCTGTGGCAGA	206786

CU468137.5	51	ATGTAGCCTAATAGAAATAGGTGAGTTTAAGTCATACCAACTAGTGGGGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	206787	ATGTAGCCTAATAGAAATAGGTGAGTTTAAGTCATACCAACTAGTGGGGA	206836

CU468137.5	101	ACAAGCCTAAGCTGGGGCCCAGCTTCATAACTGATGAGATGTCCCAGTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	206837	ACAAGCCTAAGCTGGGGCCCAGCTTCATAACTGATGAGATGTCCCAGTGT	206886

CU468137.5	151	CATCACTTAGGAAGCTGGCTGGGGACACAGCCGGTGATAAACAACAACAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	206887	CATCACTTAGGAAGCTGGCTGGGGACACAGCCGGTGATAAACAACAACAA	206936

CU468137.5	201	AATCTATTTTCCTAAACAAGAGTGGAATCCAGGTTGCATACAAGCCTGCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	206937	AATCTATTTTCCTAAACAAGAGTGGAATCCAGGTTGCATACAAGCCTGCT	206986

CU468137.5	251	GTTACAAGTCTTAAGCTATTTGTGTATTGTTCTTGATTTTAGCCACACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	206987	GTTACAAGTCTTAAGCTATTTGTGTATTGTTCTTGATTTTAGCCACACCC	207036

CU468137.5	301	TACAAACTTACCCTGAGAAACAGAAAGTTTATTACACAATGGTCTTACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207037	TACAAACTTACCCTGAGAAACAGAAAGTTTATTACACAATGGTCTTACAA	207086

CU468137.5	351	ATATTGAGATAAAGTTTATACTTTAGCAAAAGTTCTGGAGCTCTAAGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207087	ATATTGAGATAAAGTTTATACTTTAGCAAAAGTTCTGGAGCTCTAAGAGA	207136

CU468137.5	401	ACAGAGTGATTCAGAGACAGAATTCAAGCCAAGGAGTGTGGGCTATGCAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207137	ACAGAGTGATTCAGAGACAGAATTCAAGCCAAGGAGTGTGGGCTATGCAG	207186

CU468137.5	451	CTGTAGGCTATGGGGAATACTTTACTTTTTAGCTGTTTTCGAGCACACAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207187	CTGTAGGCTATGGGGAATACTTTACTTTTTAGCTGTTTTCGAGCACACAG	207236

CU468137.5	501	CGTCTTTCTTGGCCCTTTCTGTTTTGCTCTCTTTCACCCTGTCTCAGAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207237	CGTCTTTCTTGGCCCTTTCTGTTTTGCTCTCTTTCACCCTGTCTCAGAGT	207286

CU468137.5	551	CAGGTGGCCTGCCTCACCTGGGACAGAGATTTTGGAGGAAATTTTGAAAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207287	CAGGTGGCCTGCCTCACCTGGGACAGAGATTTTGGAGGAAATTTTGAAAC	207336

CU468137.5	601	AAGCATGCTTGGTTCTGGAGAAAGCCGGGGCCATGACCTAATTCCAGAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207337	AAGCATGCTTGGTTCTGGAGAAAGCCGGGGCCATGACCTAATTCCAGAGT	207386

CU468137.5	651	CAGCCTTTTTATAGAGTAGAACAGCATAAAACAATTTAAAAAAATATTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207387	CAGCCTTTTTATAGAGTAGAACAGCATAAAACAATTTAAAAAAATATTAT	207436

CU468137.5	701	CCATATGGAAAAGCAGTGTGAATCTTTGTAAGACTGAATTTAGTGATCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207437	CCATATGGAAAAGCAGTGTGAATCTTTGTAAGACTGAATTTAGTGATCTG	207486

CU468137.5	751	ATGGCAGAACTAGTGCGAGCATGGAGCAGGGAAGGCTCCGACAGAAGGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207487	ATGGCAGAACTAGTGCGAGCATGGAGCAGGGAAGGCTCCGACAGAAGGAT	207536

CU468137.5	801	GTAAGGAGTGGTGAGCGTTTAGAGATAAGAGATTCTCGGGGGTAAAAGTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207537	GTAAGGAGTGGTGAGCGTTTAGAGATAAGAGATTCTCGGGGGTAAAAGTT	207586

CU468137.5	851	GTCACAATGTAACAGAATTTGGAGACTGAATGTTCTGGAGCCACGCAGTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207587	GTCACAATGTAACAGAATTTGGAGACTGAATGTTCTGGAGCCACGCAGTA	207636

CU468137.5	901	AAACAGGGAGGCTTTAGCGACATCTCTGAGTCTCAGGGTCTGAGGAGGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207637	AAACAGGGAGGCTTTAGCGACATCTCTGAGTCTCAGGGTCTGAGGAGGGA	207686

CU468137.5	951	AAGAGATTATGAGCCTGCAGAGCTGGGCCTCCAGGAACAAGCTGAGGGAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207687	AAGAGATTATGAGCCTGCAGAGCTGGGCCTCCAGGAACAAGCTGAGGGAC	207736

CU468137.5	1001	CAGGGAGGAGGGAGCCTGGGGCAGAGAAGGAGGAGATGGGAGTGACTTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207737	CAGGGAGGAGGGAGCCTGGGGCAGAGAAGGAGGAGATGGGAGTGACTTTA	207786

CU468137.5	1051	GGAAAGGGGCCAGCAAGGATGGGACAGAGAAGGGTAAGAATCCTGTCAGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207787	GGAAAGGGGCCAGCAAGGATGGGACAGAGAAGGGTAAGAATCCTGTCAGC	207836

CU468137.5	1101	AAGAATTTCAATTCAGGGTGTCCCCAAGTGGACTGAGAGACCTGTCAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207837	AAGAATTTCAATTCAGGGTGTCCCCAAGTGGACTGAGAGACCTGTCAGAG	207886

CU468137.5	1151	AGAGGAATGTCCCAACTGGCCAAGGTGTCCCTTTCCATGTGACAGGGTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207887	AGAGGAATGTCCCAACTGGCCAAGGTGTCCCTTTCCATGTGACAGGGTCC	207936

CU468137.5	1201	CAGTAAGGCTAGAGATGGAGCCTGTGAAACAAGCCCCAGGACTTAGGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207937	CAGTAAGGCTAGAGATGGAGCCTGTGAAACAAGCCCCAGGACTTAGGAGG	207986

CU468137.5	1251	TCCCCAGACCTTAGCACTACTGGCTCTAGGATACAAGTGCCATTCAGGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	207987	TCCCCAGACCTTAGCACTACTGGCTCTAGGATACAAGTGCCATTCAGGCT	208036

CU468137.5	1301	GTAAGGCTCAGCACAAGACAGCATCCCCTGACAAAATGTAAAGAAAGACC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208037	GTAAGGCTCAGCACAAGACAGCATCCCCTGACAAAATGTAAAGAAAGACC	208086

CU468137.5	1351	TAGTCCATCAAAGTCTGTAGTTCTGGAAATCTCTCTACCTGTGCTGACCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208087	TAGTCCATCAAAGTCTGTAGTTCTGGAAATCTCTCTACCTGTGCTGACCT	208136

CU468137.5	1401	GTGGTTTCTGTAGTTCCACTTCTGGCTAACTGTTCTTGTTAACTGAAGTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208137	GTGGTTTCTGTAGTTCCACTTCTGGCTAACTGTTCTTGTTAACTGAAGTA	208186

CU468137.5	1451	TGGCAACCCAGAACATCAATGTGCATACGTACATGCGTGCTTGCTCGTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208187	TGGCAACCCAGAACATCAATGTGCATACGTACATGCGTGCTTGCTCGTGC	208236

CU468137.5	1501	ACCACCCCCACCTCCCGCCCTTAAAAGCTCACCCTGCAAACAGCTCAATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208237	ACCACCCCCACCTCCCGCCCTTAAAAGCTCACCCTGCAAACAGCTCAATG	208286

CU468137.5	1551	CTACTGGGATCCCAAGCACACAGTGTAGTCTCTGGCTGGCACATGAAGAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208287	CTACTGGGATCCCAAGCACACAGTGTAGTCTCTGGCTGGCACATGAAGAC	208336

CU468137.5	1601	TTTCTATTGGCTTAAACCCATATCCAAGCAGATGGAGATCCAGGCTGGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208337	TTTCTATTGGCTTAAACCCATATCCAAGCAGATGGAGATCCAGGCTGGAG	208386

CU468137.5	1651	ACCACCATGTATTTTGATATGCCAATAGGTGCCACAGGTAGTCACATGTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208387	ACCACCATGTATTTTGATATGCCAATAGGTGCCACAGGTAGTCACATGTC	208436

CU468137.5	1701	CCTTCTGCCATAAGTAAGGGAAATGACTCCTTTCAGAAAATGGGAGCCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208437	CCTTCTGCCATAAGTAAGGGAAATGACTCCTTTCAGAAAATGGGAGCCAG	208486

CU468137.5	1751	ATTCACAAGTTCCCAAGGAATGCTGCCTTCAGGCTTTATCTATGAGAAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208487	ATTCACAAGTTCCCAAGGAATGCTGCCTTCAGGCTTTATCTATGAGAAAT	208536

CU468137.5	1801	CCTCCTATAGGCCAGGTGGAGCTCATTTCTGGATATTCCAACTGCCACCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208537	CCTCCTATAGGCCAGGTGGAGCTCATTTCTGGATATTCCAACTGCCACCT	208586

CU468137.5	1851	GGTGACAAGAACTTCAGTTAGCACCAGCCCCAACCAGACTAAGAGGCCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208587	GGTGACAAGAACTTCAGTTAGCACCAGCCCCAACCAGACTAAGAGGCCTG	208636

CU468137.5	1901	TTAGAGAGAAATATCCTGAGTCACAGAGGAGAGGCATCCCTTTCGTGTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208637	TTAGAGAGAAATATCCTGAGTCACAGAGGAGAGGCATCCCTTTCGTGTAG	208686

CU468137.5	1951	TAGGCGCCCGTTAGGGCGAGAGAAACTTCTTGACTCAGTGACATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463309.10	208687	TAGGCGCCCGTTAGGGCGAGAGAAACTTCTTGACTCAGTGACATGAATTC	208736

Overview

Query
CU468137.5 - 43278 bps
Hit
CU463309.10 - 208736 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link