<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU634016.7	1	ATTCTGTATGACCATTGCTTTCCATTTCACGCCCTGCCATGCAACAGCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	148935	ATTCTGTATGACCATTGCTTTCCATTTCACGCCCTGCCATGCAACAGCTA	148984

CU634016.7	51	CAGAGCTGGGAAGCTACCCCATGCCACAGATGCAAACTGTGGCACCAAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	148985	CAGAGCTGGGAAGCTACCCCATGCCACAGATGCAAACTGTGGCACCAAGA	149034

CU634016.7	101	TAAGATCACCCTAATAGAAGATGCTCCTGTGAACACAGTTGTGGGAAAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149035	TAAGATCACCCTAATAGAAGATGCTCCTGTGAACACAGTTGTGGGAAAAG	149084

CU634016.7	151	GATGCTGCAACTACATAGGACCCAAGAAATGGGTAAGGGTAAAAAGCCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149085	GATGCTGCAACTACATAGGACCCAAGAAATGGGTAAGGGTAAAAAGCCTG	149134

CU634016.7	201	GGTCCTTAATCTCTGAGATATTAAATGGTGGCAATAATGTGGGTGCTTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149135	GGTCCTTAATCTCTGAGATATTAAATGGTGGCAATAATGTGGGTGCTTGA	149184

CU634016.7	251	AAAATTTAAAAGGTTCCCAGGTACAGGAAGGTACAGAATTTTGGCTGCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149185	AAAATTTAAAAGGTTCCCAGGTACAGGAAGGTACAGAATTTTGGCTGCAT	149234

CU634016.7	301	ATTTGTGCCTTGAGGATCTTTGGAAGGTCAATGTGGTGTCACAGAGGGAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149235	ATTTGTGCCTTGAGGATCTTTGGAAGGTCAATGTGGTGTCACAGAGGGAC	149284

CU634016.7	351	ACAGGATAAATTTTGAGTGGAGTTCATAAGAGATCTGTCAGTAGTGCATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149285	ACAGGATAAATTTTGAGTGGAGTTCATAAGAGATCTGTCAGTAGTGCATT	149334

CU634016.7	401	ATCTTTTTCACTTCTTGCCATTGTACACTTGGCATTCTATGAACATGGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149335	ATCTTTTTCACTTCTTGCCATTGTACACTTGGCATTCTATGAACATGGCC	149384

CU634016.7	451	ACTGACAAAGAAGCCAACTCCATCCTAAAGTTCTTGATCCTCTTAGGATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149385	ACTGACAAAGAAGCCAACTCCATCCTAAAGTTCTTGATCCTCTTAGGATC	149434

CU634016.7	501	TGTTTGGTCTCTGATAACCAGAAAGCTGCACATTAGTGCAATTGGACTCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149435	TGTTTGGTCTCTGATAACCAGAAAGCTGCACATTAGTGCAATTGGACTCA	149484

CU634016.7	551	GCACACCAGTCAAAAACCGTGATGTGACTAGACAATGAAACCATAGATCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149485	GCACACCAGTCAAAAACCGTGATGTGACTAGACAATGAAACCATAGATCA	149534

CU634016.7	601	GCAACAGAGATGGATATGTCAGGGAGATAGGTAGGCCTTTGTTTTCTTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149535	GCAACAGAGATGGATATGTCAGGGAGATAGGTAGGCCTTTGTTTTCTTTT	149584

CU634016.7	651	CCTTCCTTGATTCTGTCAACCAGATCAGCATCTGGGCTAGGACTCAGATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149585	CCTTCCTTGATTCTGTCAACCAGATCAGCATCTGGGCTAGGACTCAGATG	149634

CU634016.7	701	GATGTTGTCAGCAGGACAGGTATGGTGATCAGGGTAAACAACTTGTCCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149635	GATGTTGTCAGCAGGACAGGTATGGTGATCAGGGTAAACAACTTGTCCCA	149684

CU634016.7	751	AGACACTGCTCCTAGGATATATGGGACTAGAACTGAATCTGTGGTCAGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149685	AGACACTGCTCCTAGGATATATGGGACTAGAACTGAATCTGTGGTCAGGA	149734

CU634016.7	801	AGCCAGGCTATGGAGGTTTGTCCCCAATAATTAATCTTTTCATGACCCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149735	AGCCAGGCTATGGAGGTTTGTCCCCAATAATTAATCTTTTCATGACCCCT	149784

CU634016.7	851	CAGGTCTCAGTATCTCCCACTGTGTACTGTAAGAGAAGCCAATCAGCCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149785	CAGGTCTCAGTATCTCCCACTGTGTACTGTAAGAGAAGCCAATCAGCCTC	149834

CU634016.7	901	TTCCAGAAGCTCAGAAATGTATTGTGAATGGAAATCATTCTGGACTAAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149835	TTCCAGAAGCTCAGAAATGTATTGTGAATGGAAATCATTCTGGACTAAAC	149884

CU634016.7	951	CTGTACCATCATTTAGGCGGAAGACTCTGTTACCTGAAGTCCTCCTCTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149885	CTGTACCATCATTTAGGCGGAAGACTCTGTTACCTGAAGTCCTCCTCTTG	149934

CU634016.7	1001	CTGCTGGCAGCTATGCTGGCCTGAACTCTGAGATATTAAATGGTGGCATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149935	CTGCTGGCAGCTATGCTGGCCTGAACTCTGAGATATTAAATGGTGGCATC	149984

CU634016.7	1051	TGAGTATTGGAACTGAGAGAAAGAATCTCATTCTGAAGCCACAAGGATGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	149985	TGAGTATTGGAACTGAGAGAAAGAATCTCATTCTGAAGCCACAAGGATGC	150034

CU634016.7	1101	TGTGCATCACTGCAGACATGGGAAGCCTAGCTTTGGCCCTGCTTGTCCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150035	TGTGCATCACTGCAGACATGGGAAGCCTAGCTTTGGCCCTGCTTGTCCCA	150084

CU634016.7	1151	GCAACTCCAGGCTTCCCCTTTAGGCTCCCCTTGCCTGGCTTCCTATATCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150085	GCAACTCCAGGCTTCCCCTTTAGGCTCCCCTTGCCTGGCTTCCTATATCA	150134

CU634016.7	1201	TCCAGGTCCAGAGCTGGGCTCCCTGTTCACCCCCCAGCCTAGTGAACTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150135	TCCAGGTCCAGAGCTGGGCTCCCTGTTCACCCCCCAGCCTAGTGAACTTT	150184

CU634016.7	1251	CTCAGGTGCCAGGAGGAGGGCAGGGTCCCATTGCATGTTGGTTTTAGGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150185	CTCAGGTGCCAGGAGGAGGGCAGGGTCCCATTGCATGTTGGTTTTAGGCT	150234

CU634016.7	1301	CCTATGAGCTGTGTTATTTCTATGCCCTTTCTCCTGAGGCTGCCCTCCTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150235	CCTATGAGCTGTGTTATTTCTATGCCCTTTCTCCTGAGGCTGCCCTCCTG	150284

CU634016.7	1351	GAGCCCTGGGTCTCATTCATTCTTGAGTTGTGTTTCAGGCATGCAGATTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150285	GAGCCCTGGGTCTCATTCATTCTTGAGTTGTGTTTCAGGCATGCAGATTG	150334

CU634016.7	1401	TGGGAAGCAATAGAGATCTTGGACTTGCTCTTCTACTACAGGCTGAGCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150335	TGGGAAGCAATAGAGATCTTGGACTTGCTCTTCTACTACAGGCTGAGCAG	150384

CU634016.7	1451	AGATGGTGAGTGTCATCAGCTGGATTACGATAGACCAGCTAAACAGGAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150385	AGATGGTGAGTGTCATCAGCTGGATTACGATAGACCAGCTAAACAGGAGT	150434

CU634016.7	1501	ATCTGAAAAATGGCTTTGGCCCTTGATCTGGCTGAGTCCTTAAGGGAGAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150435	ATCTGAAAAATGGCTTTGGCCCTTGATCTGGCTGAGTCCTTAAGGGAGAA	150484

CU634016.7	1551	TATTTTCCATAATCTCTCCTGTTGTGGTTATTTTCAATGTTTCTACCTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150485	TATTTTCCATAATCTCTCCTGTTGTGGTTATTTTCAATGTTTCTACCTTT	150534

CU634016.7	1601	TTTTCCCTTCCCTTCTCCATTAATTAATAAATATTATTCATTTTTATTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150535	TTTTCCCTTCCCTTCTCCATTAATTAATAAATATTATTCATTTTTATTAT	150584

CU634016.7	1651	GTGTGTGACTTTTTCCTCCTGTATATATGTCTAAGCACCATGATGGTATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150585	GTGTGTGACTTTTTCCTCCTGTATATATGTCTAAGCACCATGATGGTATC	150634

CU634016.7	1701	TGATGGTTGTGGAGATCAGAAAACGGCTTCACATTCCCTGTGTTTTGAAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150635	TGATGGTTGTGGAGATCAGAAAACGGCTTCACATTCCCTGTGTTTTGAAT	150684

CU634016.7	1751	TAGATGGTTGTAGGTTGATGTGCAGGTGCTAGGAATTGAATGCGAGTCTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150685	TAGATGGTTGTAGGTTGATGTGCAGGTGCTAGGAATTGAATGCGAGTCTC	150734

CU634016.7	1801	CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTTATTACTGGGACATCTGTCCAGCCCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150735	CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTTATTACTGGGACATCTGTCCAGCCCCT	150784

CU634016.7	1851	AATTATTATTATTTATTATTATTATCTAATTATTTAGATCCCCAAATAAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150785	AATTATTATTATTTATTATTATTATCTAATTATTTAGATCCCCAAATAAT	150834

CU634016.7	1901	TCTTCCTGAAAACCTATAGCAGTATTCTGGAATTCTTTGTCTTAAACAGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150835	TCTTCCTGAAAACCTATAGCAGTATTCTGGAATTCTTTGTCTTAAACAGG	150884

CU634016.7	1951	CTTCTGACCATTACTTCTCACAGGATGGATATTTTATAGACGCACTGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463302.4	150885	CTTCTGACCATTACTTCTCACAGGATGGATATTTTATAGACGCACTGATC	150934

Overview

Query
CU634016.7 - 126610 bps
Hit
CU463302.4 - 150934 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100198720001200011489351509341
282.571443047498375286144674449771
389.32453788385484231-147994483671
489.572483782033820715147994483671
588.012023433861338955-148020483611
687.05242409738027421011408521412601
787.3824164026316583568311408531448911
884.9316093090743077739611412541443381
983.251290276411595511871811417791445181
1087.36337576775697814411444771450461
1184.22210434959139634611446371450731
1291.28469662359273658811453551460421
1388.08403659964249708211453551460421
1483.6429965011995312060211453551460391
1592.1326443783577879911455751460421
1685.77242465365803704411463531468161
1779.8411893485792308271411469651504261
1885.03188537179751910123511469651507801
1990.824534712103612138211469661473131
2092.54164225383323855611475221477491
2189.3710971673457684744011491001507831
2286.68181330829688329711504211507581
Short-link