<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463845.12	1	CAAAACAAGAGAAGTCCAGGTTGCCCTGGTATCACATGCCTGTCATGCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	144843	CAAAACAAGAGAAGTCCAGGTTGCCCTGGTATCACATGCCTGTCATGCTA	144892

CU463845.12	51	GTGTTTGAAAGAGCTTGAAGCAGAAGTACCTACAAATTCAAGGCCAGCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	144893	GTGTTTGAAAGAGCTTGAAGCAGAAGTACCTACAAATTCAAGGCCAGCCT	144942

CU463845.12	101	GGGCTAACTACAGAGTTCAGGACAGCCAGGCCTATGTAGAGAGACCCTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	144943	GGGCTAACTACAGAGTTCAGGACAGCCAGGCCTATGTAGAGAGACCCTAT	144992

CU463845.12	151	CTTAAGCAAAAAACAAGAAGGGGGATGGGGGCTAGTGTGGGTTGGCTGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	144993	CTTAAGCAAAAAACAAGAAGGGGGATGGGGGCTAGTGTGGGTTGGCTGGA	145042

CU463845.12	201	TGGCTGAGTATACTAGGCCTGGGCAGGCTGCATCCCACTTCCCGCAGAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145043	TGGCTGAGTATACTAGGCCTGGGCAGGCTGCATCCCACTTCCCGCAGAGC	145092

CU463845.12	251	CTCGGGAGAGTCTGGTCACAAGGCAGGAAGGCTAGAAGCCTGCATTTATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145093	CTCGGGAGAGTCTGGTCACAAGGCAGGAAGGCTAGAAGCCTGCATTTATG	145142

CU463845.12	301	ACAGTTCTCTGGGAGTGTGAGTCAACAGAGCCAACAAGGACCTGGAGTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145143	ACAGTTCTCTGGGAGTGTGAGTCAACAGAGCCAACAAGGACCTGGAGTCC	145192

CU463845.12	351	ATCTGCAGGAGTGGTTGGGTGGAAGAAGGTGGATCCCTCAAGAGGGCTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145193	ATCTGCAGGAGTGGTTGGGTGGAAGAAGGTGGATCCCTCAAGAGGGCTCC	145242

CU463845.12	401	TGGGCTCTATGAGATGGGTTTGAAGTGTCTAGATCCAAGGGCCAAGAGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145243	TGGGCTCTATGAGATGGGTTTGAAGTGTCTAGATCCAAGGGCCAAGAGCT	145292

CU463845.12	451	CCTGTGTTTCCTCTGCCAGCTTTGACTACGGTGACCGATTCTGGGACATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145293	CCTGTGTTTCCTCTGCCAGCTTTGACTACGGTGACCGATTCTGGGACATC	145342

CU463845.12	501	AAGAGCAAGTATTTCACCTGCCAGTGTGGCTCTGAGAAGTGCAAGCATTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145343	AAGAGCAAGTATTTCACCTGCCAGTGTGGCTCTGAGAAGTGCAAGCATTC	145392

CU463845.12	551	AGCGGAGGCCATCGCCCTGGAGCAGAGCCGCCTGGCCCGGCTGGACCCCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145393	AGCGGAGGCCATCGCCCTGGAGCAGAGCCGCCTGGCCCGGCTGGACCCCC	145442

CU463845.12	601	ACCCGGAGCTGCTCCCTGACCTCAGCTCCCTGCCCCCCATCAACACCTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145443	ACCCGGAGCTGCTCCCTGACCTCAGCTCCCTGCCCCCCATCAACACCTGA	145492

CU463845.12	651	GGACTCTTAAAATCCAGGCCGGGCACTGCCCTTCAGACATTTCTCCATCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145493	GGACTCTTAAAATCCAGGCCGGGCACTGCCCTTCAGACATTTCTCCATCA	145542

CU463845.12	701	GAGACCCCAGTAAGGCCTGGAAGGTCGATGGCCCCTCTCCCAGAGCTGGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145543	GAGACCCCAGTAAGGCCTGGAAGGTCGATGGCCCCTCTCCCAGAGCTGGT	145592

CU463845.12	751	TTCTCACTGGGAGTGCAAGTGACTTCAGGGCTGGCCTTCCCCACTGAGCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145593	TTCTCACTGGGAGTGCAAGTGACTTCAGGGCTGGCCTTCCCCACTGAGCC	145642

CU463845.12	801	TGGCCTCAGTTAGCTGATTGAAGTTGGGCCTCTGCCAGCTGATTTTCTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145643	TGGCCTCAGTTAGCTGATTGAAGTTGGGCCTCTGCCAGCTGATTTTCTGT	145692

CU463845.12	851	GTTCTCAATAAATGTTGGGTTTGGTAATAAACTGTCTGGTGATTGTTTCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145693	GTTCTCAATAAATGTTGGGTTTGGTAATAAACTGTCTGGTGATTGTTTCA	145742

CU463845.12	901	GGACGATGAGGACTGTGGGGCTGAGGGGACAGTTGGGTAGGAAGCAAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145743	GGACGATGAGGACTGTGGGGCTGAGGGGACAGTTGGGTAGGAAGCAAGCT	145792

CU463845.12	951	GTGGCTGTGGGGTGGAAGAGAACAGCTGTGGGGCACCCACTGGCCACAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145793	GTGGCTGTGGGGTGGAAGAGAACAGCTGTGGGGCACCCACTGGCCACAGG	145842

CU463845.12	1001	GGTTTAAGGAAAAGCAAATCACAACCTAGAGGTTTGGGTGTGCCACAGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145843	GGTTTAAGGAAAAGCAAATCACAACCTAGAGGTTTGGGTGTGCCACAGTT	145892

CU463845.12	1051	GAAGTACTCTAAACAATTATGCAGTGTTTCCTTATCAAAGTACTCCGGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145893	GAAGTACTCTAAACAATTATGCAGTGTTTCCTTATCAAAGTACTCCGGTT	145942

CU463845.12	1101	TCTTCCTGCTGCGGTCCGTGGCAGACCCGGTAAGCAGCTCCTGGGACCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145943	TCTTCCTGCTGCGGTCCGTGGCAGACCCGGTAAGCAGCTCCTGGGACCCA	145992

CU463845.12	1151	GTTCTGAGCCCTGGTACCCCTGGGCTGGTCAAGAGTTGAGATCTGAAAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	145993	GTTCTGAGCCCTGGTACCCCTGGGCTGGTCAAGAGTTGAGATCTGAAAAA	146042

CU463845.12	1201	GGAACTGTAGAGGACCACAGGCAGGGGCGGGGCTGTGACGTCTGGGAGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146043	GGAACTGTAGAGGACCACAGGCAGGGGCGGGGCTGTGACGTCTGGGAGGG	146092

CU463845.12	1251	AGGGCGGGGCGGGCGGCAGGTGAGCGGCTAGGTCTCCGTGGCTCCAATCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146093	AGGGCGGGGCGGGCGGCAGGTGAGCGGCTAGGTCTCCGTGGCTCCAATCA	146142

CU463845.12	1301	CTCCGGAGACTGAGCCATGGGGAGAAAGCAGAATGAGAACGAGGCTCACG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146143	CTCCGGAGACTGAGCCATGGGGAGAAAGCAGAATGAGAACGAGGCTCACG	146192

CU463845.12	1351	GTAAGGCTAGGGGCAGAGGCCCGGGCTCTGGAGAGAGGTGGCCGGGCTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146193	GTAAGGCTAGGGGCAGAGGCCCGGGCTCTGGAGAGAGGTGGCCGGGCTCT	146242

CU463845.12	1401	GCAGCCATGGCAGCTGAGGTTGGATCCTGACAGAGGAACTGGAGTCCTGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146243	GCAGCCATGGCAGCTGAGGTTGGATCCTGACAGAGGAACTGGAGTCCTGG	146292

CU463845.12	1451	GTCTCTGAGGAGCGGCTACAGGAAAACAGGAGCCAAGGAAAAGAGACAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146293	GTCTCTGAGGAGCGGCTACAGGAAAACAGGAGCCAAGGAAAAGAGACAGA	146342

CU463845.12	1501	ATCAGGTCCTGGAAGGATGGTCTGAGCCGCCAGAAAGATCTTGCATACTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146343	ATCAGGTCCTGGAAGGATGGTCTGAGCCGCCAGAAAGATCTTGCATACTA	146392

CU463845.12	1551	AATGGAACCTGGATGAGCAGGAGTTGGGGCTGGCGTCCCTGTGTGGCCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146393	AATGGAACCTGGATGAGCAGGAGTTGGGGCTGGCGTCCCTGTGTGGCCAG	146442

CU463845.12	1601	CGGAGTGGGGAGGTCAGGCCTGGGCTGTAGGTCCCTGAGGGCAGAGCCCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146443	CGGAGTGGGGAGGTCAGGCCTGGGCTGTAGGTCCCTGAGGGCAGAGCCCT	146492

CU463845.12	1651	AGCAAACAAAGCCTGTGTGGTTAGGAGGCAGGTTAGGGTCCCGATGCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146493	AGCAAACAAAGCCTGTGTGGTTAGGAGGCAGGTTAGGGTCCCGATGCTCT	146542

CU463845.12	1701	GGACTTAGAGTCCAGCAGTGTCCTGCGCTGTGGTTGCTGGAGGGGGGGGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146543	GGACTTAGAGTCCAGCAGTGTCCTGCGCTGTGGTTGCTGGAGGGGGGGGT	146592

CU463845.12	1751	GTCTGTCAACCCACACCCTGTGAAGAGGCAGGAGCTGAGACTCCTGTTGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146593	GTCTGTCAACCCACACCCTGTGAAGAGGCAGGAGCTGAGACTCCTGTTGG	146642

CU463845.12	1801	GATCTGTGTGAAGAGTTGGGGAGATGGGCCTCTGAACTAATAAAGTCCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146643	GATCTGTGTGAAGAGTTGGGGAGATGGGCCTCTGAACTAATAAAGTCCTT	146692

CU463845.12	1851	TGAGGAGTAGGGGGCTGGAACCCCAAACTTCTGCAGTCAGCCTGCTAGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146693	TGAGGAGTAGGGGGCTGGAACCCCAAACTTCTGCAGTCAGCCTGCTAGGA	146742

CU463845.12	1901	TTCCTGTGAAATGGAGGGCCTGGGACCCTGAGCTGCTGGGGTCTGCATGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146743	TTCCTGTGAAATGGAGGGCCTGGGACCCTGAGCTGCTGGGGTCTGCATGC	146792

CU463845.12	1951	TAGAGTCCCAGAGAGGGGGGGGGGGCAGGTACCGTGGACTAAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CU463176.7	146793	TAGAGTCCCAGAGAGGGGGGGGGGGCAGGTACCGTGGACTAAAGGAATTC	146842

Overview

Query
CU463845.12 - 174361 bps
Hit
CU463176.7 - 146842 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link